Identificação de Enterobactérias. Dra. Tânia Mara Ibelli Vaz Pesquisador Científico Instituto Adolfo Lutz - São Paulo Família Enterobacteriaceae Patogenia Isolamento e identificação de enterobactérias Aspecto das colônias Identificação Bioquímica ( cultura pura) Reação de VM e VP Escherichia coli Salmonella Shigella Klebsiella Enterobacter Serratia Citrobacter Proteus - Providencia - Morganella Fluxograma BGN OXIDASE Considerações finais índice Família Enterobacteriaceae Introdução Definição • • • • • Bacilos Gram negativos AAF / Fermentadores da glicose Oxidase negativa e catalase + Móveis / imóveis Cresce em meios comuns Habitat Plantas, solo, água, intestino do homem e animais Família Enterobacteriaceae Introdução Nomenclatura e Classificação • • Métodos Fenotípicos Moleculares novas espécies reclassificação Classificação • Gêneros ( 42) • Espécies ( centenas ) • biotipos e sorotipos Complexos Identificação de Enterobactérias Classificação - patogenia - Enteropatógenos - Infecções nosocomiais - espécies importantes - Outras espécies - raras em material clínico isoladas em : meio ambiente plantas animais Família Enterobacteriaceae Patogenia Enterobactérias - principal componente da flora intestinal normal do homem. • Infecções -intestinal, feridas e trato urinário • Abcessos, pneumonia, meningites • Infecções nosocomiais Família Enterobacteriaceae Patogenia Infecções intestinais Características • normalmente na comunidade • DTA – doença transmitida por alimento • surtos / casos isolados • hospitalar Patógenos entéricos clássicos Salmonella spp Shigella spp E.coli - categorias diarreiogênicas Yersinia enterocolitica Família Enterobacteriaceae Patogenia Infecções extra-intestinais Comunidade Hospitalar • Qualquer espécie • Fatores de risco: Paciente Veículos de transmissão Alimentos contaminados Espécies mais comuns Escherichia coli Klebsiella pneumoniae Klebsiella oxytoca Proteus mirabilis Enterobacter spp Salmonella ( sorotipos) Serratia marcescens Citrobacter spp Providencia spp Família Enterobacteriaceae ISOLAMENTO E IDENTIFICAÇÃO DE ENTEROBACTÉRIAS Crescem bem nos meios comuns e meios seletivos para BGN ( 18 a 24h 1 mm de diâmetro). 1- Exame macroscópico da cultura: • Aspecto morfológico das colônias ( AS, MC,SS, TSA ) • Tempo de crescimento e tamanho da colônia • Observar pureza da cultura 2-Exame microscópico da cultura: • Gram: tamanho, morfologia, reação tintorial, etc Aspecto das colônias Agar MacConkey Aspecto das colônias Salmonella. E.coli E.cloacae Salmonella. E. coli E. cloacae Aspecto das colônias Família Enterobacteriaceae Identificação Bioquímica ( cultura pura) Meios presuntivos • IAL (Pessoa e Silva) • EPM-MILI • TSI IAL Família Enterobacteriaceae Identificação Bioquímica Série completa - 47 testes Provas complementares: Fermentação de açúcares LDC- ODC - ADH CiSi Pesquisa de enzimas DNase gelatinase,lipase, NAR, ONPGase Gram Oxidase VM e VP Família Enterobacteriaceae Reação de VM e VP Enterobactérias VP+ Enterobactérias VP - • • • Maioria das espécies dos outros Gêneros • Salmonella • Shigella • E.coli • Proteus • Morganella • Providencia • Citrobacter • Kluyvera Enterobacter Klebsiella Serratia Escherichia coli Diagnóstico Diferencial lac+ CISI - K.oxytoca ( LDC+/ motil.-CiSi+) Citrato de Simmons Prova Citrobacter amalonaticus e C. diversus ( LDC-/motil.+CiSi+) Marcadores Epidemiológicos Infec. Intestinais Sorotipagem Fatores de virulência Infec. Extra-intestinais Sorotipagem Met. moleculares Glicose+/Gás+/sacarose+/urease*H2STDAindol+ LDC+/Motilidade+/- Aeromonas Salmonella Diagnóstico diferencial Citrobacter spp ( H2S + ) Proteus Prova de Fermentação glicerol Marcadores Sorotipagem Fagotipagem Moleculares Glicose+/gás v sac H2S + ureaseTDA indol LDC + Mov. + CiSi+ Lac - Shigella Diagnóstico diferencial E.coli ( LDC - / Mov.-) Lactose Ci Christ. Acetato Trab. Citrato Sódio Marcadores Sorotipagem Met.moleculares Glic.+ /gás sac urease TDA H2S indol v LDC Mov. - CiSi Lac - Klebsiella Diagnóstico diferencial Enterobacter ( LDC+ / Mov.-) ADH ODC Fermentação Marcadores Sorotipagem Met. moleculares Lac+ CiSi + Enterobacter Diagnóstico diferencial Enterobacter Klebsiella Serratia LDC,ODC,ADH Motilidade DNase Fermentação E.cloacae Marcadores Sorotipagem Met. moleculares Lac+ CiSi+ Serratia Espécies de Serratia LDC,ODC, malonato, fermentação , pigmento Marcadores: Sorotipagem Met.moleculares Glic.+ / gássac. urease H2S TDA indol LDC + Mov. + DNase + Gelatinase + Lipase + CiSi + Lac - Citrobacter Espécies de Citrobacter ODC, indol, H2S malonato fermentação Glic.+ / gássac =V CiSi + urease Lac + H2S = V TDA indol = V LDC Mov. + Proteus - Providencia - Morganella Diagnóstico diferencial Proteus Providencia Espécies H2S + BGN NF Swarming TDA, H2S, ODC, gelatinase, fermentação Glic.+/ gás sac. urease + TDA + H2S = V indol = V LDC Mov. + CiSi + Lac + Fluxograma BGN Oxidase Lac + Lac - Ágar Mac Conkey IAL IAL E.coli Enterobacter Klebsiella Kluyvera Citrobacter Shigella Salmonella Serratia Proteus Providencia Morganella + Enterobacter Klebsiella Kluyvera Citrobacter VP + Salmonella Serratia Proteus/Prov.(V) + Cit. Simmons Cit. Simmons - E.coli Shigella Morganella - IDENTIFICAÇÃO DE ENTEROBACTÉRIAS Enterobactérias em microbiologia clínica Poucas espécies Espécies incomuns , novas espécies, espécies atípicas podem ocorrer (isoladas de material clínico, ambiente, plantas e animais) PROBABILIDADES • • • • • • Tratar-se de uma espécie rara Cepa contaminada Uma ou mais testes não adequados na identificação ( turvação) Manipulação errada ( concentração do inóculo) Composição e quantidade do meio ( substrato presente) Controle de Q IDENTIFICAÇÃO DE ENTEROBACTÉRIAS O que fazer? Checar tudo: • Pureza da cultura • Repetir todos os testes no mesmo sistema ou utilizando meios anteriormente utilizados •Repetir todos os testes em outro sistema de utilizar partidas diferentes do meio. •Encaminhar para laboratórios de referência os identificação ou Considerações finais Importância da caracterização das espécies • Evitar falsos surtos • Não identificação do surto • Atenção para cepas atípicas • Atenção para espécies raras • Atenção para pureza das culturas