Desenho de Fármacos & Modelagem Molecular Osmar NORBERTO DE SOUZA, PhD E-mail: [email protected] Laboratório de Bioinformática, Modelagem e Simulação de Biossistemas (LABIO) Laboratório de FarmInformática (FarmInf) Faculdade de Informática & Faculdade de Farmácia Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul – PUCRS Porto Alegre - RS 19 de março de 2015 Estrutura Básica dos Aminoácidos • Os 20 tipos de aminoácidos constituem os monômeros a partir dos quais as proteínas são produzidas Estrutura Básica dos Aminoácidos • Os 20 tipos de aminoácidos constituem os monômeros a partir dos quais as proteínas são produzidas Estrutura Básica dos Aminoácidos • Os 20 tipos de aminoácidos constituem os monômeros a partir dos quais as proteínas são produzidas A Formação de Peptídeos e Proteínas • Dois aminoácidos são ligados através da extremidade amina de uma molécula e da extremidade carboxila da outra. A liberação de uma molécula de água permite a formação de uma ligação covalente chamada ligação peptídica. Hierarquia Estrutural das Proteínas •A seqüência de aminoácidos apenas constitui a estrutura primária de uma proteína. Ela está diretamente relacionada à seqüência de informação no mRNA que, por sua vez, é uma cópia do DNA . •Devido à presença de grupos doadores e receptores de pontes de hidrogênio, a estrutura primária pode dobrar, formando padrões estruturais periódicos como hélices ou fitas (folhas) β. Esses padrões estruturais são denominados estruturas secundárias da proteínas. •Quando essas estruturas secundárias se dobram (enovelam), permitindo a interação entre as cadeias laterais dos aminoácidos (grupos R nas figuras acima), forma-se um tipo de estrutura denominado estrutura terciária ou tridimensional (3D) da proteína. É esse o nível de estrutura que determina a função da proteína. •Porém, em muitos exemplos, estruturas terciárias são agrupadas para formar as estruturas quaternárias. Muitas proteínas somente são funcionais neste nível estrutural.