Universidade da Beira Interior
Licenciatura em Ciências Biomédicas
Bioinformática
» Segundo a análise da
estrutura
primária
sabemos que uma
proteína é constituída
por uma sequência de
aminoácidos.
» Para
análise
da
função da proteína e
visualização
dos
respetivos domínios
usa-se
a
forma
tridimensional.
» A base de dados PROSITE contém sequências
modelo de aminoácidos associadas aos
membros de famílias de proteínas, funções
específicas de proteínas e modificações póstraducionais.
» O prosite possui várias ferramentas tais como:
ScanProsite, PRATT, MyDomains-Image Creator
Criada em 1988 por Amos Bairoch e Philipp Bucher
(investigadores no Instituto Suíço da Bioinformática);
SWISS-PROT & PROSITE;
Base de dados mais antiga e conhecida.
Variação no número de registos ao longo dos anos
4500
4000
3500
3000
2500
2000
1500
1000
500
0
1988
1994
2006
2012
» Esta base dados é usada para descobrir informações
acerca da “nova proteína” como por exemplo:
função, estrutura 3D da proteína;
» Também é usada para descobrir modificações numa
proteína;
http://prosite.expasy.org/
Obrigado pela atenção!!!!
Alexandra Soares a24016
Cátia Rocha a23054
Vanessa Conde a23586
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