Universidade Federal do Rio de Janeiro Centro de Ciências da Saúde Instituto de Bioquímica Médica Curso: Enfermagem e Obstetrícia T ÉCNICAS DE DIAGNÓSTICO T ÉCNICAS USADAS EM DIAGNÓSTICO ELISA Western Blot PCR Sequenciamento Já utilizadas Menos difundida A NTÍGENO X A NTICORPO T ÉCNICAS COM ANTICORPO W ESTERN B LOT Western Blotting é um poderoso método para a detecção de uma determinada proteína em uma mistura complexa. Ele combina o poder de resolução da eletroforese em gel, a especificidade dos anticorpos, e a sensibilidade dos ensaios de enzima. Chamado Western blotting, ou immunoblotting, este procedimento é comumente usados para separar proteínas e, em seguida, identificar uma proteína de interesse. W ESTERN B LOT W ESTERN B LOT ELISA ( ENZYME - LINKED IMMUNOSORBENT ASSAY ) ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay) permite uma rápida triagem e quantificação da presença de um antígeno em uma amostra. -Proteínas em uma amostra são adsorvidas a uma superfície inerte - A superfície é lavada com uma solução de uma proteína inespecífica -A superfície é tratada com uma solução contendo o anticorpo contra a proteína de interesse -A superfície é tratada com uma solução contendo anticorpos contra o anticorpo -O substrato da enzima ligada ao anticorpo é adicionado - Formação do produto (monitorado como intensidade de cor) é proporcional a concentração da proteína de interesse na amostra. ELISA ELISA ELISA antígeno ELISA anticorpo ELISA antígeno sanduíche W ESTERN B LOT E ELISA: DIAGNÓSTICO DO HIV ELISA primeira técnica utilizada no diagnóstico da infecção pelo HIV Testes de terceira geração só detectavam a presença de anticorpos (IgG e IgM) três ou quatro semanas após o contato Testes de quarta geração já detectam tanto anticorpos quanto um dos antígenos do HIV (a proteína p24), diminuiu sensivelmente o período de janela imunológica, podendo chegar a apenas duas semanas. Um resultado positivo num teste de HIV por ELISA é sempre confirmado por outros testes específicos: Western blot - detecta o anticorpo anti-HIV na amostra de soro humano PCR - detecta os ácidos nucleícos virais W ESTERN BLOT E E LISA : OUTRAS APLICAÇÕES Western blot é um teste definitivo para a doença da vaca louca. ELISA Entre as doenças passíveis de diagnóstico pelo teste, estão várias doenças infecciosas (a maioria dos agentes patológicos desencadeia a produção de imunoglobulinas). Também pode ser usado no diagnóstico de doenças auto-imunes ou alergias e para se detectar outras substâncias de interesse como, por exemplo, hormônios. Pelo fato do radioimunoensaio ser muito caro, o teste ELISA pode ser uma alternativa muito mais simples e barata. PCR ( REAÇÃO DA P OLIMERASE EM C ADEIA - Método de isolamento e amplificação de um segmento de DNA - envolve a produção "in vitro" de milhões de cópias do segmento em estudo - Foi desenvolvido por Kary Mullis (Cetus Corporation, Emeryville). Ele recebeu $20,000 de bonus e depois o Prêmio Nobel. Mais tarde, a patente foi vendida para Hoffman-LaRoche por $300,000,000 - Reação de PCR: 1. Pequenos "primers" de DNA que se ligam às extremidades 3' ends do DNA 2. Os 4 nucleotídeos: A, C, G, T 3. DNA polimerase especial (Taq polimerase): funciona em altas temperaturas; isolada de micoorganismos que vivem em fontes termais (Termus aquaticus ) - Ocorre em 3 etapas: 1. A desnaturação da dupla fita do DNA, em alta temperatura (90oC ) 2. O pareamento dos "primers", a baixa temperatura - 37o C 3. A duplicação do segmento isolado através da reação da DNA polimerase O processo é cíclico e pode ser repetido "n" vezes, dependendo do grau de amplificação que se deseja Kary B. Mullis Prêmio Nobel de Química 1993 PCR Taq é uma enzima, que foi isolada pela primeira vez em 1971 de uma bactéria termófila (Thermus aquaticus) que vive nos geisers do Parque Nacional de Yellowstone!!! Perfeita para resistir as variações de temperatura nas reações de PCR!!! Máquina de PCR PCR PCR PCR F ILME PCR PCR: -HIV, detecta os ácidos nucleícos virais. - Doença infecto parasitária - Anemia falciforme APLICAÇÕES S EQUENCIAMENTO Qualquer tipo de ácido nucléico pode ser seqüenciado, amostras de RNA, DNA genômico, plasmídeos, cromossomas artificiais e produtos de PCR. O primeiro método de sequenciamento de DNA foi desenvolvido em meados dos anos 70 e ficou conhecido como Seqüenciamento Químico ou Maxam-Gilbert Sequencing. O segundo método de sequenciamento de DNA ficou conhecido como Sequenciamento Enzimático, Dideoxi ou Sanger-Coulson Sequencing. S EQUENCIAMENTO Método Enzimático, Dideoxi ou Sanger Nesse método o princípio básico é a síntese de uma nova fita pela DNA polimerase. O primer é marcado na sua extremidade 5` com 32P. A Dna pol, os dNTPs e os ddNTPs são adicionados em quatro tubos juntamente com o DNA e o primer. A síntese da nova fita acontece até ser adicionado um dideoxinucleotídeo, que impede a continuidade da síntese. Os fragmentos resultantes são analisados pela migração eletroforética. S EQUENCIAMENTO Método Enzimático, Dideoxi ou Sanger Exemplo de fragmentos resultantes: S EQUENCIAMENTO AUTOMÁTICO Ao longo dos anos o método Sanger se tornou o método mais reprodutível e utilizado. O avanço da tecnologia solucionou parte das limitações apresentadas por esse método. O que permitiu que fosse utilizado nos dias atuais. O sequenciamento automático utiliza os mesmos dideoxinucleotídeos utilizados em Sanger, marcados com fluorescência. Sendo que o seu maior avanço encontra-se no fato de utilizar laser e programas de computador específicos para detectar o sinal dos ddNTPs. Quando os ddNTPs são excitados com laser, emitem fluorescência num comprimento de onda específico para cada ddNTP. Este comprimento de onda é detectado pelo Sequenciador, que gera a seqüência do DNA. Com isso, não a necessidade de reações em tubos diferentes para cada fragmento a ser seqüenciado. Foto do Sequenciador S EQUENCIAMENTO AUTOMÁTICO Exemplo de Eletroferograma S EQUENCIAMENTO DE 2 º G ERAÇÃO Pirosequenciamento Solexa/Illumina Roche (454) ABI SoliD S EQUENCIAMENTO DE 2 º G ERAÇÃO - C OMPARAÇÃO P ROJETO G ENOMA A estratégia... O início... As primeiras propostas para se mapear o genoma humano surgiram em 1985, quando um grupo de cientistas pretendiam detectar mutações em humanos. Com isso foi criado o Projeto Genoma Humano. Mais tarde Craig Venter funda a empresa Celera Genomics, tendo como um dos principais objetivos seqüênciar todo o genoma humano antes do Projeto Genoma Humano. Em 2000 a Celera anuncia a conclusão do sequenciamento. P ROJETO G ENOMA Em 2001 duas montagens do genoma humano foram publicadas: SINTOMAS DA DOENÇA Farmacogenômica busca as causas da doença com ferramentas de engenharia genética TRATAMENTO COM DROGA ESPECÍFICA NO FUTURO A IDÉIA SERÁ? O QUE PENSAR ?? Remédios personalizados ( ↓ efeito colateral x ↑ eficiência). Terapia gênica: substituição do gene defeituoso Aconselhamento genético: prognóstico prévio de doenças, pré-natal