UNIVERSIDADE COMUNITÁRIA DA REGIÃO DE CHAPECÓ ÁREA DE CIÊNCIAS DA SAÚDE * Professora: Greicy Michelle Conterato * VISÃO GERAL 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. CONCEITO COMPOSIÇÃO E ESTRUTURA ELEMENTOS ENVOLVIDOS NA REAÇÃO ENZIMÁTICA CARACTERÍSTICAS GERAIS DAS ENZIMAS NOMENCLATURA ELEMENTOS ENVOLVIDOS NA CATÁLISE ENZIMÁTICA CINÉTICA ENZIMÁTICA FATORES QUE AFETAM A VELOCIDADE DAS REAÇÕES MECANISMOS CATALÍTICOS INIBIÇÃO ENZIMÁTICA ENZIMAS REGULADORAS * CONCEITO * São catalisadores biológicos que aumentam a velocidade das reações e portanto, comandam TODAS as vias metabólicas. * Formadas por longas cadeias de aminoácidos. Exceção: RIBOZIMAS. COMPOSIÇÃO E ESTRUTURA Estrutura Enzimática Holoenzima Proteína Cofator Ribozimas Apoenzima ou Apoproteína RNA Pode ser: • íon inorgânico • molécula orgânica Coenzima Se covalente Grupo Prostético ELEMENTOS ENCONTRADOS REAÇÃO ENZIMÁTICA * Substrato; * Enzima; * Sítio ativo; * Cofator EM UMA CARACTERÍSTICAS GERAIS DAS ENZIMAS * Possuem todas as características das proteínas: * Conformação nativa atividade catalítica * Estabilidade * EFICIÊNCIA CATALÍTICA * ESPECIFICIDADE Geralmente, as reações catalisadas por enzimas ocorrem de 103 a 108 vezes mais rápidas do que as reações não catalisadas. RELATIVA ABSOLUTA ESTEREOESPECIFICIDADE * REGULAÇÃO * LOCALIZAÇÃO DENTRO DA CÉLULA lisossomas, mitocõndrias, núcleo, citoplasma. * NOMENCLATURA E CLASSIFICAÇÃO Adição do sufixo “ase” ao nome do substrato, à palavra ou frase que descreve sua atividade; Comissão de Enzimas → IUB •Número classificatório de 4 dígitos identificando a reação. 1º = 6 classes que a enzima pertence 2º = tipo de ligação que a enzima atua 3º = subclassificação do tipo de ligação 4º = número de série → * NOMENCLATURA E CLASSIFICAÇÃO Principais classes das enzimas Oxidorredutases ⇒ reações de oxidaçãoredução ou transferência de elétrons (NADH, NADPH, FAH2) Transferases ⇒ transferem grupos funcionais entre moléculas (Grupos: com um carbono, aldeído ou cetona, acil, glicosil, fosfatos, enxofre) Hidrolases ⇒ reações de hidrólise (Ésteres, ligações glicosídicas, ligações peptídicas, outras ligações C-N, anidridos ácidos) * NOMENCLATURA E CLASSIFICAÇÃO Principais classes das enzimas Liases ⇒ catalisam a quebra de ligações covalentes e a remoção de moléculas de água, amônia e gás carbônico (=C=C=, =C=O, =C=N-) Isomerases ⇒ transferência de grupos dentro da mesma molécula para formar isômeros (racemases) Ligases ⇒ catalisam reações de formação de novas moléculas a partir da ligação entre duas pré-existentes, sempre às custas de energia (C-O, C-S, C-N, C-C) * NOMENCLATURA E CLASSIFICAÇÃO Exemplo ATP + D-glicose ADP + D-glicose-6-fosfato Nome formal → ATP: glicose fosfotransferase Número → 2.7.1.1 1º = transferase 2º = fosfotransferase 3º = fosfotransferases → grupo hidroxila como receptor 4º = D-glicose receptor do grupo fosfato Nome Trivial: HEXOQUINASE *MECANISMOS DA REAÇÃO ENZIMÁTICA: *COMO AS ENZIMAS FUNCIONAM??? ►O mecanismo da reação enzimática pode ser descrito em duas perspectivas diferentes: 1) Alterações de energia que ocorrem durante a reação; 2) Como o sitio ativo facilita quimicamente a catálise. * ELEMENTOS ENVOLVIDOS NA CATÁLISE ENZIMÁTICA COMO AS ENZIMAS FUNCIONAM? * ELEMENTOS ENVOLVIDOS NA CATÁLISE ENZIMÁTICA COMO AS ENZIMAS FUNCIONAM? 1) Alterações de energia que ocorrem durante a reação: * Para uma reação química hipotética (na ausência de enzima): S T* P ↑↑↑ energia de ativação Velocidade da reação muito lenta!! * ELEMENTOS ENVOLVIDOS NA CATÁLISE ENZIMÁTICA COMO AS ENZIMAS FUNCIONAM? 1) Alterações de energia que ocorrem durante a reação: * Para uma reação enzimática: Rota de reação alternativa com menor energia de ativação ↑↑↑ velocidade Diagrama de coordenadas de reação comparando uma reação catalisada enzimaticamente com uma não catalisada. * ELEMENTOS ENVOLVIDOS NA CATÁLISE ENZIMÁTICA COMO AS ENZIMAS FUNCIONAM? * O aumento na velocidade das reações e a diminuição da energia de ativação podem ser explicados por 2 princípios: A) Rearranjo das ligações covalentes durante a reação; B)Interações não-covalentes entre a enzima e o substrato FORMAÇÃO DO COMPLEXO ES: interações hidrofóbicas, iônicas e pontes de hidrogênio a formação de cada interação fraca libera a energia (energia de ligação) necessária para a enzima reduzir a energia de ativação da reação. INTERAÇÕES FRACAS SÃO OTIMIZADAS NO ESTADO DE TRANSIÇÃO. 2) Como o sitio ativo facilita quimicamente a catálise: * Modelos de Complexo Enzima-Substrato Emil Fischer (1894) chave e fechadura Koshland (1958): encaixe induzido 2) Como o sitio ativo facilita quimicamente a catálise: CONCLUINDO: Figura :Uma enzima imaginária (“bastonase” ) projetada para catalisar a quebra de um bastão de metal. *Concluindo: * Uma enzima complementar ao substrato é uma enzima pouco eficiente, pois: *O sítio ativo deve atuar como um molde flexível, ou seja, possuir uma geometria estruturalmente semelhante ao estado de transição ativado da molécula. * As interações ótimas (ligações fracas) entre a enzima e o substrato ocorrem somente no estado de transição. * * ESTUDANDO PARÂMETROS CINÉTICOS DAS REAÇÕES ENZIMÁTICAS EM LABORATÓRIO * EQUAÇÃO DE MICHAELIS-MENTEM [S]>>km, a v da reação é de ordem zero Concentrações relativas de E e S; Características do Km (alto ou baixo); O km não varia com a concentração da enzima. V x [E] [S]<<km, a v da reação é de primeira zero Ordem da reação * Transformações da equação de Michaelis-Menten: * Gráfico de Lineweaver-Burk: Utilidade do gráfico: 1. Serve para calcular precisamente Vmáx e Km; 2. Determinar mecanismos de inibição enzimática 8) FATORES QUE AFETAM A VELOCIDADE DAS REAÇÕES ENZIMÁTICAS: CONCENTRAÇÃO DO SUBSTRATO; pH ionização do sítio ativo desnaturação da enzima TEMPERATURA * 1) CATÁLISE ÁCIDO-BÁSICA: * Aminoácidos do centro ativo, com cadeias laterais ionizáveis, são capazes de liberar prótons durante a catálise. * 2) CATÁLISE COVALENTE: * Formação transitória de uma ligação covalente entre o catalisador (grupo nucleofílico) e o substrato (grupo eletrofílico). * Envolve com freqüência a participação de coenzimas * 3) CATÁLISE POR ÍONS METÁLICOS * Metais ligados firmemente à enzima ou captados da solução junto com o substrato; * Ligam-se ao substrato; * Medeiam reações de oxi-redução; * Estabilização eletrostática ou proteção de cargas negativas. * * O QUE SÃO INIBIDORES? * Inibidores reversíveis (competitivos e não competitivos); * Inibidores irreversíveis. * 10.1 INIBIDORES REVERSÍVEIS: * COMPETITIVO: MALONATO X SUCCINATO COM SUCCINATO DESIDROGENASE; METANOL X ETANOL COM ÁLCOOL DESIDROGENASE; SINVASTATINA INIBE HMG-COA REDUTASE * 10.1 INIBIDORES REVERSÍVEIS: * NÃO-COMPETITIVO: Organofosforados inibem a acetilcolinesterase * 10.1 INIBIDORES REVERSÍVEIS: * MISTO: * 10.2 INIBIDORES IRREVERSÍVEIS: I se combina com um grupo funcional, na molécula da E, que é essencial para sua atividade. Podem promover a destruição do grupo funcional Forma-se uma ligação COVALENTE entre o I e a E. Participam dos primeiros passos químicos da reação enzimática normal. São relativamente pouco reativos até se ligarem ao sítio ativo de uma enzima específica. Vmax ↓ → parte da E é completamente removida do sistema e Km permanece a mesma. E + S + I EI K1 ES K2 E + P * * A) REGULAÇÃO ALOSTÉRICA * B) REGULAÇÃO POR MODIFICAÇÃO COVALENTE * C) INDUÇÃO E REPRESSÃO DA SÍNTESE DA ENZIMA * D) PROTEÓLISE * * Modulador efetor positivo ou negativo; * Efetores homotrópicos e heterotrópicos; * Ligação não-covalente efetor + enzima; * Enzimas com múltiplas subunidades e catalisam os passos iniciais de uma via metabólica. * EXEMPLO DE EFETOR HETEROTRÓPICO INIBIÇÃO POR RETROALIMENTAÇÃO * * Efetores homotrópicos: geralmente é um efetor positivo COOPERATIVIDADE dos sítios ativos curva sigmóide Efetores Heterotrópicos: pode ser diferente do substrato; inibição por feedback * * Adição ou remoção de grupo fosfato (geralmente por ligação covalente) em resíduos de serina, treonina, tirosina da enzima. * Para atuar como mecanismo eficiente fosforilação deve reversível. um a ser * * INDUÇÃO E REPRESSÃO DA SÍNTESE DA ENZIMA * São aquelas necessárias em um estágio do desenvolvimento ou em condições fisiológicas selecionadas. Ex: o aumento nos níveis de insulina promove um aumento na síntese de enzimas chaves no metabolismo da glicose. * Não influenciam a eficiência das moléculas de enzimas existentes; * Tempo requerido para a alteração: dias a semanas. * *É a ativação de enzimas por meio de clivagem proteolítica. Ex: zimogênios (precursor inativo) são clivados para formar a enzima ativa (tripsina e quimiotripsina).