ENZIMAS 9Estrutura 9Função 9Regulação 9Cinética enzimática 9Inibidores b do es “ Many enzymes have been named by adding the suffix “-ase” to the name of their substrate or to a word or phrase describing their activity. Thus urease catalyzes hydrolysis of urea.” Each enzyme is assigned a four-part classification number and a systematic name, which identifies the reaction ti it catalyzes. t l As A an example, l the th formal f l systematic t ti name off the th enzyme catalyzing t l i the th reaction: ti ATP + D-glucose ADP + D-glucose 6-phosphate is ATP:glucose phosphotransferase, which indicates that it catalyzes the transfer of a phosphoryl group from ATP to glucose. Its Enzyme Commission number (E.C.number) is 2.7.1.1. the first number (2) denotes the class name (transferase); the second number (7), the subclass (phosphotransferase); the third number (1), a phosphotransferase with a hydroxyl group as acceptor; and the fourth number (1), D-glucose as the phosphoryl group acceptor. Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology (www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme) 1 ¾ Apoenzima e Holoenzima ¾ Cofatores ‐ íons metálicos, coenzimas (moléculas metaloorganicas ou orgânicas complexas), ligadas de modo não covalentemente a enzima ¾ Grupos prostéticos ‐cofatores ligados covalentemente a enzima ¾ Coenzimas – origem a partir de vitaminas hidrossolúveis ¾ Isoenzimas – catalisam a mesma reação química, mas podem apresentar propriedades cinéticas (km e Vmax) e/ou regulatórias diferentes ENZIMAS COMO CATALISADORES BIOLÓGICOS 9Catalisam reações em condições compatíveis com a vida (velocidade, (velocidade pH, pH temperatura, temperatura pressão) 9 São estéreo‐seletivas 9 São capazes de acoplar reações endergônicas e exergônicas, tornando‐as espontâneas (exergônicas) 9 sua atividade é passível de controle, tornando possível a modulação do fluxo de vias metabólicas, em função de necessidades celulares ou do organismo. 2 TERMODINÂMICA DE UMA REAÇÃO QUIMICA K1 K-1 EM CONDIÇÃO PADRÃO K = K1 -1 ENDERGÔNICA Ô EXERGÔNICA K’eq = [C] / [B] Assumindo que a K K’eq eq da reação acima é 1: E a condição inicial é [C] / [B] = 1 ([C] = [B] ) – CONDIÇÃO PADRÃO reação em equilíbrio IPC: Em condição inicial padrão a reação estaria em equilíbrio E a condição inicial é [C] / [B] = 0,1 0 1 (10X mais B que C) - CONDIÇÃO HIPOTÉTICA 1 reação expontânea : B Æ C E a condição inicial é [C] / [B] = 10 (10X mais C que B) - CONDIÇÃO HIPOTÉTICA 2 reação expontânea : C Æ B 3 ACOPLAMENTO DE REAÇÕES A C 32 kJ/mol B D 22 kJ/mol 10 kJ/mol AS ENZIMAS AUMENTAM A VELOCIDADE DE REAÇÕES QUIMICAS 4 RELAÇÃO: VELOCIDADE DE REAÇÃO X ENERGIA DE ATIVAÇÃO REAÇÃO CATALISADA X NÃO CATALISADA K1 K-1 9 As enzimas aumentam os valores l d K1 e K‐1 na de mesma intensidade. Portanto, alteram a velocidade reação sem interferir na Keq (equilíbrio da reação) 9Um valor de k igual a 0.03s‐1, no caso de cinética de primeira ordem, ordem significa que 3% do reagente é convertido em produto por segundo 9As enzimas não são consumidas pela reação química 5 AS ENZIMAS ACELERAM A VELOCIDADE DE UMA REAÇÃO, POIS REDUZEM A SUA ENERGIA DE ATIVAÇÃO. Mas, como explicar isto? INTERAÇÃO ENZIMA-SUBSTRATO Modelo CHAVE-FECHADURA (Emil Fischer, 1894) PROXIMIDADE e ORIENTAÇÃO dos substratos 6 Haladane (1930)/ Pauling (1946) Induced fit and substrate strain Koshland, 1958 7 Modulação da Atividade Enzimática (enzimas regulatórias): A. Em relação a quantidade de enzima Síntese e degradação de enzimas B. Em relação a atividade da enzima ¾ Reversível > Não Covalente Alosteria (formas ou conformações distintas) Proteínas regulatórias (PKA e calmodulina) > Covalente Fosforilação de proteínas ¾Irreversível > Ativação proteolítica Irreversible activation/ inactivation PKA: - Regulação alostérica por cAMP - Regulação da atividade catalitica pela associação da subunidade regulatória 8 REGULAÇÃO DA ATIVIDADE ENZIMÁTICA POR ALOSTERIA REGULAÇÃO DA ATIVIDADE ENZIMÁTICA POR ALOSTERIA: MODELOS 9 MODELOS DE COOPERATIVIDADE ALOSTÉRICA SIMÉTRICO (Tudo ou Nada) Monod, Wiman, Changeaux, 1965 ASSIMÉTRICO (Sequencial – Koshland, 1966) ATIVIDADE ENZIMÁTICA E MODIFICAÇÕES COVALENTES DA ESTRUTURA PRIMÁRIA 10 REGULAÇÃO DA ATIVIDADE ENZIMÁTICA POR FOSFORILAÇÃO REGULAÇÃO DA ATIVIDADE ENZIMÁTICA IRREVERSIVEL, POR ATIVAÇÃO PROTEOLÍTICA Ex: Ativação de zimogênios (proteases) 11 Temperature profile of na enzyme 12