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3091-3862
Sinopse
• Introdução
• Estrutura geral de um artigo científico
• Esboço de um artigo
• Título, autoria, afiliações, palavras-chave
• Resumo
• Introdução
• Materiais e Métodos
• Resultados, Discussões e
• Conclusões
• Escrever: Uma decisão!
• Escrever um artigo científico é uma
tomada de decisão e implica no
crescimento do profissional e sua
carreira (Secaf, 2001)
O profissional não escreve, ou escreve e
não divulga seu artigo científico porque
seus possíveis erros ou falhas podem
ser conhecido pelos demais. Para
aprender mais e poder crescer é
necessário escrever, mesmo que as
imperfeições existam e apareçam, pois
só assim nos aperfeiçoamos e nos
desenvolvemos (Secaf, 2001)
Há uma certa ironia no fato de
ensinarmos nossos cientistas a
utilizarem instrumentos e técnicas
complicadíssimas, muitos dos quais
jamais utilizarão em sua vida
profissional, e, no entanto não os
ensinarmos a escrever.
Escrever é o que eles precisarão fazer
todos os dias! (Barrass, 1986)
É grande o poder das palavras
corretamente escolhidas. Não há
atalhos para escrever melhor.
Aprendemos através da prática,
comentários de professores,
colegas, revisores e LENDO.
(Barrass, 1986)
Escrever: Qualidade ou Quantidade?
• O que você quer dizer?
• Escreva para pessoas não para máquinas
• Corte partes do seu trabalho. Isto é particularmente doloroso mas
usualmente melhora o resultado
• Tenha certeza que o trabalho é legível. Alguns trabalhos são
rejeitados porque eles são incompreensíveis ou desorganizados e não
porque eles não tem nada a dizer.
Papers são rejeitados, não você
ESCOLHA DO PERIÓDICO
• Escopo
• Público-alvo
• Fator de impacto
• Periódicos online – acesso irrestrito
• Cobrança de taxas para publicação
AVALIAÇÃO DA PUBLICAÇÃO
 Fator de Impacto
 (I.S.I. – Institute for Scientific Information)
Como encontrar o Índice de Impacto na Internet
entrar no site: http://www.bcq.usp.br/catalogo.htm
clicar em: ISI Journal Citation Reports (JCR)
clicar em: ISI Journal Citation Reports
 Qualidade das revistas:
CAPES (Qualis A, B, C)
Revistas Nacionais e Internacionais
• TÍTULO / PALAVRAS-CHAVE / AUTORES-AFILIAÇÕES/ RESUMO
• INTRODUÇÃO – por quê foi feito o trabalho?
• MATERIAL ( ou MATERIAIS) E MÉTODOS – como foi feito?
• RESULTADOS E DISCUSSÕES – o quê foi observado? Por quê?
• CONCLUSÕES
• AGRADECIMENTOS / REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS
• FIGURAS, TABELAS, FOTOGRAFIAS, DESENHOS
Proporciona a visualização COMPLETA
do artigo
A importância do título reside em propiciar,
juntamente com as palavras-chave, a devida
INDEXAÇÃO e, assim, uma forma fácil e
correta de recuperar a informação desejada.
Poucos lêem o artigo inteiro,
no entanto, muitos lerão o título e o resumo.
PALAVRAS-CHAVE
Keywords: solubilization, micelles, surfactant head group, ibuprofen.
Keywords: glucose-6-phosphate dehydrogenase, fed-batch fermentation,
recombinant yeast, Saccharomyces cerevisiae.
•
Quem são os autores?
•
a simples coleta de dados não justifica que os elementos que realizaram
apenas isso sejam considerados autores
•
por razões éticas, legais e boas normas de convivência, o ideal é que haja
consenso (nem que seja verbal) entre todos os participantes sobre quem
serão os autores
•
todos os autores devem ler o artigo a ser publicado
Para pensar...
•
Algum participante pode ter contribuído com um reagente muito precioso
e querer fazer parte da autoria ... Decisão de todos envolvidos!
•
Algum participante pode ter contribuído com uma nova linhagem de célula
e querer fazer parte da autoria ... Decisão de todos envolvidos!
•
Algum participante pode ter contribuído com uma técnica muito
específica e querer fazer parte da autoria ... Decisão de todos envolvidos!
AUTOR PARA CORESPONDÊNCIA
 Geralmente é o docente responsável pelo laboratório de
pesquisa
 Trabalhos em colaboração - grupo no qual surgiu a
proposta
 Ás vezes, pós-doutor ou pesquisador colaborador
Representa uma referência para o leitor que quiser
entrar em contato. É importante que o autor para
correspondência não seja “volátil”
- Pesquisador
- Orientado & Orientador
- Orientados & Orientador
- Orientados, Colaboradores & Orientador
Journal of Neuroimmunology 156 (2004) 146–152
Neutrophils as a specific target for melatonin and kynuramines:
effects on cytokine release
S.O. Silvaa,1, M.R. Rodriguesa,1, V.F. Ximenesa, A.E.B. Bueno-da-Silvab,c,
G.P. Amarante-Mendesb,c, A. Campaa,*
* Corresponding author. Tel.: +55 11 3091 3741; fax: +55 11 3813 2197.
E-mail address: [email protected] (A. Campa).
1The
contributions of these authors were equal.
RESUMOS
Resumos – Redação
Metodologia
Listar critérios ou condições
Citar/Descrever materiais e
métodos
Justificar a escolha pelos materiais
e métodos
Contexto
Declarar proeminência do tópico
Familiarizar termos, objetos e processos
Citar resultados de pesquisas anteriores
Apresentar hipóteses
Resultado
Descrever os resultados
Indicar os resultados
Comentar/Discutir os resultados
Lacuna
Citar problemas/dificuldades
Citar necessidades/requisitos
Citar a ausência ou falta da pesquisa
anterior
Conclusão
Apresentar conclusões
Apresentar contribuições/valor da
pesquisa
Apresentar recomendações
Apresentar lista de tópicos
abordados no trabalho
Propósito
Apresentar o propósito principal
Detalhar/Especificar o propósito
Apresentar mais propósitos
Apresentar o propósito com a metodologia
Apresentar o propósito com os resultados
FONTE: www.nilc.icmc.usp.br/scipo-farmacia
Página em construção: está incompleta.
http://www.nilc.icmc.usp.br/scipo-farmacia/
CONTEXTO
(Porque ?)
- informações para a compreensão e entendimento
do tópico
- afirmações amplamente aceitas sobre a área de
trabalho
- guiar o leitor em direção ao tópico do estudo.
Contexto -> Declarar proeminência do tópico
1) Oxidative injury is implicated in the development of
chronic lung disease in infants with respiratory
distress.
Citar resultados de pesquisas anteriores
1) Recent studies have suggested that antibodies can
catalyze the generation of previously unknown
oxidants including dihydrogen trioxide (H2O3) and
ozone (O3) from singlet oxygen (1O*2) and water.
Contexto -> Apresentar hipóteses
1) Given that neutrophils have the potential both to
produce 1O*2 and to bind antibodies, we
considered that these cells could be a biological
source of O3.
LACUNA
(o que falta?)
- indicar que há tópico de pesquisa que não
foi investigado
- tópico não suficientemente desenvolvido
- indicar algum tipo de falha em estudos
anteriores
- preparar o leitor para focalizar o estudo em
questão
- justifica o estudo em questão.
Lacuna -> Citar problemas/dificuldades
1) Experiments in many laboratories have been limited
by the availability of the enzyme, and its production
required at least a week of work to complete its
purification.
Lacuna -> Citar necessidades/requisitos
1) To make a colonic delivery system practical for
medical use, in vitro testing methods need to be
established in order to determine the specifications
of the preparations.
Lacuna -> Citar a ausência ou falta da pesquisa anterior
1) Although DNA codon optimization is a standard
molecular biology strategy to overcome poor gene
expression, to date no public software exists to
facilitate this process.
PROPÓSITO
- mostrar o objetivo específico do
estudo
- anunciá-lo após a lacuna - é a
resposta à lacuna
- deve ser uma afirmação clara e
objetiva.
Propósito -> Apresentar o propósito principal
1) The objective in this study was to determine if a
simple, fed-batch, process strategy-pulsed addition
of limiting-carbon source-could be used to reduce
fungal broth viscosity, and increase productivity of
an industrially relevant recombinant enzyme
(glucoamylase).
Propósito -> Apresentar o propósito com a metodologia
1) This paper presents an integrated process for the
primary recovery of intracellular glyceraldehyde 3phosphate dehydrogenase (G3PDH) and other
proteins from bakers' yeast wherein cell disruption
and aqueous two-phase systems (ATPS) were
operated simultaneously.
METODOLOGIA
(como ?)
- descrever objetivamente a
metodologia empregada
- expor de forma concisa o processo
de desenvolvimento da pesquisa
- expor os métodos, técnicas, etc.
envolvidos
Estratégia escolhida
Metodologia -> Listar condições
1) Starch-processing wastewater was anaerobically
treated to produce acetic acid in laboratory-scale,
continuously stirred tank reactors.
Metodologia -> Citar/Descrever materiais e métodos
2) To determine the effect of pulse-feeding, three
additional fermentations were carried out with limitingcarbon added in 90-second pulses, during repeated
five-minute cycles.
RESULTADOS
- não criar suspense sobre os seus
resultados
- pode-se apresentar na introdução
os principais resultados
- devem descrever os produtos
resultantes do estudo
Resultado -> Descrever os resultados
2) A yield of 40 mg/litre/day of a recombinant antibody
fragment was obtained with the fermenter, which was
15-fold more than the yield of 2.5 mg/litre/day achieved
in shake flasks.
Estratégia escolhida
Resultado -> Comentar/Discutir os resultados
1) However , the cell debris generated during the integrated
process also concentrated in the upper phase which
limited the potential application of the system.
CONCLUSÃO
- situar os resultados específicos dentro de um
contexto de pesquisa mais amplo
- indicar recomendações, contribuições
- expressar o valor/importância do trabalho
- indicar benefícios práticos que podem resultar da
aplicação dos resultados da pesquisa
- enfatizar a importância teórica do estudo no
avanço do estado da arte em uma área de pesquisa
específica.
Conclusão -> Apresentar conclusões
1) We show that the proteases are primarily
responsible for the destruction of the bacteria.
2) Extraction of the control enzyme from clarified cell
broth indicated that broth components did not
significantly interfere with partitioning.
Conclusão -> Apresentar contribuições/valor da pesquisa
1) Our results offer an explanation for the conflicting
literature reports of the effects of chelating agents and
catalase on cysteine oxidation, and emphasize the need for
buffer purification or addition of DFO in studies concerned
with the oxidation or cytotoxicity of this thiol.
2) This discovery of the production of such a powerful
oxidant in a biological context raises questions about not
only the capacity of O3 to kill invading microorganisms but
also its role in amplification of the inflammatory response
by signaling and gene activation.
Conclusão -> Apresentar recomendações
1) This information can be used to improve the
efficiency of glucose utilization even further by
metabolic engineering strategies that increase carbon
flux through the pentose phosphate pathway./
Abstracts: exercícios
Exercício 1 – solução: 4 – 1 – 3 – 5 - 7 – 6 - 2
Exercício 2 – solução: 3 – 5 – 8 – 2 - 4 – 7 – 1 - 6
Exercício 3 – solução: 4 – 5 – 2 – 8 - 6 – 7 – 1 - 3
1) O assunto que foi investigado
2) O que se sabe atualmente sobre o assunto (Estado da
Arte)
3) O que não se sabe sobre o assunto
4) Os pontos polêmicos do assunto
5) As perguntas que se pretende responder no trabalho
INTRODUÇÃO
Contexto
Declarar proeminência do tópico/área
Familiarizar termos ou objetos ou processos
Revisão da literatura
Revisão histórica da área
Tendências atuais na área
Progresso na área
Requisitos para o progresso na área
Citações de trabalhos anteriores do autor
Lacuna
Existência de conflitos ou problemas não resolvidos
Restrições em trabalhos anteriores
Questões ainda não consideradas
Propósito
Apresentar uma nova abordagem
Apresentar melhorias/avanços em um tópico da literatura
Apresentar uma extensão de um trabalho anterior do autor
Apresentar um trabalho comparativo
Metodologia
Indicar critérios ou condições
Descrever materiais e métodos
Justificar escolhas por materiais e métodos
Resultado
Apresentação de resultados
Listagem dos resultados
Comentários sobre os resultados
Justificativa/Valor
Valor da pesquisa
Estrutura
Indicar as seções do artigo
Eventualmente podem
aparecer na Introdução.
Depende dos autores
incluírem e das revistas
aceitarem.
 Citar apenas as referências relevantes e necessárias.
 Referências estrangeiras/sem significância e redundantes
não contribuem para o mérito científico do artigo, somente o
tornam mais extenso
 Assegure-se de que todas as referências listadas no final do
texto foram de fato citadas no trabalho
 Confira as datas, autores e fontes das referências
Evite citar referências de difícil acesso (de fontes não
publicadas, por exemplo)
 Obedecer as normas de citação de cada revista (nome,
número, sobrescrito, entre parênteses, etc...)
 Ler o manual de instruções – varia de acordo com a revista
Uma boa metodologia mostra
domínio e experiência sobre o
assunto.
Mostrar precisão:
especificações, unidades de
medida, pureza dos reagentes,
evitar nomes comerciais.
MATERIAIS E MÉTODOS
Materiais
Listagem dos materiais utilizados no estudo
Detalhamento da Fonte dos materiais utilizados
Fornecimento de informações a respeito dos materiais
Procedimento
Detalhamento dos procedimentos utilizados
Fornecimento de justificativa sobre os procedimentos
Equipamentos
Equipamentos utilizados
Análise dos Dados
Procedimentos de análise dos dados
Deve-se apresentar os dados
representativos da pesquisa e não
obrigatoriamente todos os dados!
A colocação dos resultados em
uma seqüência similar à que foi
usada em Materiais e Métodos
pode auxiliar seu entendimento.
A divisão do assunto, em tópicos,
indicados por sub-títulos ajuda muito o
leitor a acompanhar a leitura de uma
seção que pode, às vezes, ser um
pouco árida.
A ordem cronológica em que as
várias observações foram feitas ou
em que os experimentos foram
realizados não é mais tão importante.
O autor necessita organizar uma
seqüência
que permita ao leitor
acompanhar passo a passo o relato
das observações e assimilar os
achados de cada etapa.
Ter sempre em mente:
 incluir apenas tabelas e figuras que sejam necessárias
para a compreensão do artigo,
 assegure-se de que as tabelas e figuras são claras,
 procure utilizar apenas abreviações padrão, símbolos
que a revista usualmente emprega,
 os mesmos símbolos devem ser usados do princípio
ao fim do artigo para indicação de valores ou
ocorrências da mesma natureza.
lembrando que a maior parte das
pessoas examina as figuras sem ler o
texto
A legenda deve ser completa,
clara e concisa.
1) Análise e interpretação dos resultados.
2) Comparação com os resultados já publicados na
literatura
3) Postular hipóteses, propor explicações
4) Relevância do trabalho para o conhecimento do
problema
1) Resumo dos resultados (quando estas seções
forem separadas)
2) Análise de alguma metodologia
3) Sugestões de como resolver problemas ainda
restantes e indicação de futuros trabalhos
É permitido apresentar argumentos a favor de
uma idéia, assim como argumentos
contrários.
Naturalmente esta argumentação deve ser
SEMPRE baseada nos resultados do próprio
artigo e de outros autores.
An ambiguity is a group of words that can
have more than one meaning
We examined neat methanol
and ethanol and methanol
and ethanol with 10% water.
We examined four fuels: neat
methanol, neat ethanol,
methanol with 10% water, and
ethanol with 10% water.
Evite usar linguagem vaga, sem definir claramente
as observações
 “After the treatment with ethanol, the erythrocytes
morphology was different.
 The effect of the solvent on the protein was good.
 A clear alteration was observed after the experimental
treatment.
EXERCÍCIO
Jogo dos 7 erros
55000
50000
[produto]M
45000
40000
35000
30000
25000
20000
15000
0
2
4
6
tempo
8
10
Anatomy of a Table
Table legend
Demarcating Lines
Column Titles
Table body
Footnotes
As Figuras e Tabelas devem ser auto-explicativas, ou seja, devem ser
corretamente interpretadas sem que seja necessário recorrer ao
texto. Baseado nessa hipótese, proponha melhorias no título das
tabelas seguintes para que se tornem auto-explicativas.
EQUAÇÕES
Geralmente são apresentadas
separadamente do texto
Devem receber numeração
independente
Descrever todos os termos
presentes na equação
Always consult the Journal’s Guide for Authors
As conclusões são apresentadas no decorrer da
argumentação, assim como podem ser
novamente colocadas num item separado de
conclusões.
A seção Conclusão é a última do texto e dessa forma deve
ter a função de finalizar o assunto.
A conclusão deve proporcionar um resumo sintético, porém
completo, da argumentação.
É por isso que se diz que, em certo sentido, a conclusão é
uma volta à introdução.
Além de desempenhar o papel de fecho de
demonstração, a conclusão pode – e deve – servir para:
abrir novos horizontes,
apontar caminhos,
despertar novas questões ou dúvidas.
uma
Precisas e claras
• Devem estar “amarradas” com os objetivos
• Relacionar com os resultados obtidos
• Ao seu final, evidenciar o que foi conquistado
com o estudo
• Evidenciar a aplicação dos resultados
• Pode sugerir outros estudos para aquilo que não
foi objeto de pesquisa deste artigo
• Pode incluir recomendações de ordem prática
• 1a Fase: redação do artigo com escolha da revista e
adaptação do artigo às suas normas
• 2a
Fase:
- Preparar carta a ser enviada ao Conselho Editorial:
bem redigida, curta, esclarecedora e sem erros...
...”espero que este artigo lhes pareça excedente”, ao
invés de “excelente”
- Guardar cópia de tudo: cópia impressa do artigo,
carta, comprovante do correio ou e.mail
3a Fase:
• recebimento dos pareceres emitidos pelos
“revisores ou referees” e pelo “editor” com as
seguintes possibilidades:
• aceito sem correções
• aceito após pequenas (“minor”) correções
• aceito após muitas (“major”) correções
• recusado
• 4a Fase:
- se o artigo foi aceito:
1) fazer as correções NO TEXTO sugeridas pelos revisores e que os
autores CONCORDAM. Algumas revistas pedem que sejam feitas em cor vermelha
para facilitar a checagem.
2) responder a carta comentando TODAS as sugestões dos revisores.
Aquelas que foram incluídas no texto deverão ser novamente mencionadas e
aquelas que os autores NÃO CONCORDAM devem ser justificadas – COM
SEGURANÇA, MAS EDUCADAMENTE...
- se o artigo foi recusado:
1) fazer as correções sugeridas pelos revisores e que os autores
CONCORDAM.
2) enviar para outra revista – ajustar ao seu formato
• Etapa Final:
- revisão tipográfica – nessa etapa o artigo já saiu da mão dos revisores e já está
na gráfica (editora). Não pode ser feita correção de conteúdo.
- assinar o “Copyright Transfer Agreement” – de preferência todos os autores
EXERCÍCIO: ABSTRACTS
1) Nome ______________________________________ No USP__________
Abaixo está um abstract (apresentado na forma de recortes) de um artigo científico na área das
Ciências Farmacêuticas. Monte este abstract e escreva, abaixo, a seqüência correta em que
ele deve estar escrito.
Resposta: _______________________________________________________________
---------------------------------------------------------------------------------------------------------Pharmaceutical design of a novel colo-targeted delivery system using two-layer-coated
tablets of three different pharmaceutical formulations, supported by clinical evidence in
humans.
However, it is difficult to ensure that an oral preparation disintegrates specifically in the human
colon.
These facts strongly suggest that this novel delivery system may be useful for the delivery of drugs
to the human colon.
To make a colonic delivery system practical for medical use, in vitro testing methods need to be
established in order to determine the specifications of the preparations.
Drug delivery systems to the colon are being actively investigated in order to develop oral
preparations of peptides and treat local colonic diseases.
To achieve this objective, three pharmaceutical preparations, designed to have different tablet
disintegration times, were used to examine three buffers in seven combinations intended to
simulate pH changes in the stomach, small intestine, and colon of humans.
A three-way crossover trial by scintigraphy revealed that the three formulations---in spite of
presenting different in vitro tablet disintegration profiles---have comparable transit profiles and
excellent colon-targeting properties in the human gastrointestinal tract regardless of gender and
age.
To validate the in vitro methodology, furthermore, the fate of all the formulations was examined in
the gastrointestinal (GI) tract of healthy volunteers.
Overexpression and rapid purification of Escherichia coli formamidopyrimidineDNA glycosylase
1. Comparative studies showed that the excision of 8-hydroxyguanine, 2,6-diamino-4hydroxy-5-formamidopyrimidine, and 4,6-diamino-5-formamidopyrimidine, and to a
lesser extent, 8-hydroxyadenine was virtually identical for the Fpg purified using
this method and for the Fpg purified by the original method.
2. We have devised a new method that decreases the time and expense of
purification of Fpg that should render this protein accessible to any laboratory.
3. Formamidopyrimidine DNA glycosylase (Fpg) is a DNA glycosylase with an
associated AP lyase activity.
4. Fpg was subcloned into a k PL promoter-containing vector (pRE) and
overproduced in the appropriate Escherichia coli host cells to about 25% of the
total cellular protein.
5. As a DNA repair enzyme, Fpg excises several modified bases from DNA
associated with exposure to oxidizing agents such as free radicals.
6. Therefore, this method should prove useful for a large number of laboratories and
further research on oxidative DNA damage.
7. Fpg was purified to homogeneity in a simple two-step procedure with a 50% saving
in time when compared to the previously known procedure.
8. Experiments in many laboratories have been limited by the availability of the
enzyme, and its production required at least a week of work to complete its
purification.
Gene expression profiling provides insight into the pathophysiology of chronic
granulomatous disease
1. Notably, altered Bcl2-associated X protein synthesis accompanied defective
neutrophil apoptosis in XCGD patients.
2. In addition, XCGD patients develop tissue granulomas that obstruct vital organs, the
mechanism(s) for which are unknown.
3. We hypothesize that granuloma formation in XCGD patients reflects both increased
proinflammatory activity and defective PMN apoptosis, and we conclude that ROS
contribute directly or indirectly to the resolution of the inflammatory response by
influencing PMN gene transcription.
4. Human polymorphonuclear leukocytes (PMNs or neutrophils) kill invading
microorganisms with reactive oxygen species (ROS) and cytotoxic granule
components.
5. PMNs from individuals with X-linked chronic granulomatous disease (XCGD) do not
produce ROS, thereby rendering these individuals more susceptible to infection.
6. Genes encoding mediators of inflammation and host defense, including CD11c,
CD14, CD54, FcR1, FcR, CD120b, TLR5, IL-4R, CCR1, p47phox, p40phox, IL-8,
CXCL1, Nramp1, and calgranulins A and B, were up-regulated constitutively in
unstimulated XCGD patient PMNs.
7. By comparing transcript levels in normal and XCGD PMNs after phagocytosis, we
discovered 206 genes whose expression changed in the presence and the absence
of ROS, respectively.
8. To gain insight into the molecular processes that contribute to the pathophysiology of
XCGD, including formation of granulomas, we compared global gene expression in
PMNs from XCGD patients and healthy control individuals.
REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS
Seguir orientações da revista na qual o artigo será submetido.
Exercício
1) Você considera que a estrutura do artigo está suficientemente clara?
2) Em quais seções dos artigos estão apresentados os objetivos? Aponte-os.
3) Qual a justificativa para a realização deste trabalho científico?