Organização Gênica dos Seres Vivos Genes e Genomas de Procariotos e Eucariotos OS SERES VIVOS OS SERES VIVOS • Todo genoma (eucarioto ou procarioto) possui a função de servir como repositório replicativo da informação codificada pelo DNA que o constitui. • Genomas procarióticos, contudo, são relativamente mais simples que genomas eucarióticos. PROCARIOTO X EUCARIOTO Tamanho do genoma. Estrutura molecular. Distribuição de genes. CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO Cromossomo único → dsDNA circular Replicon Exceções Lineares Streptomyces lividans Rhodococcus fasciens Espiroquetas (Borrelia) CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO Tamanho do Genoma ~9,5x106pb Mycoplasma genitalium Saccharomyces cerevisiae ~0,6x106pb ~13x106pb Myxococcus xanthus PROCARIOTO ◙ Cromossomo de E. coli • Molécula de DNA fita dupla circular de 4,2 X 10³ pb. • Por ser capaz de se auto-duplicar, o cromossomo bacteriano é considerado um replicon. • Sua estrutura compacta dedica-se quase que exclusivamente à codificação de proteínas (genes estruturais). CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO ◙ Superposição de genes • Organização gênica que permite que uma mesma seqüência codifique duas proteínas diferentes. • Fenômeno freqüente em vírus, bactérias e organelas celulares (mitocôndrias). CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO Códon de Iniciação → (Start Codon) Alternativo. CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO Alteração do Quadro de Leitura. CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO ◙ Colinearidade • Equivalência entre a seqüência nucleotídica do gene e a seqüência de aminoácidos da proteína. • Eucariotos possuem nucleotídicas. interrupções em suas seqüências CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO Colinearidade: Gene Proteína 3n nucleotídeos → n aminoácidos GENES → EUCARIOTO X PROCARIOTO 5’ 3’ GENOMA → EUCARIOTO X PROCARIOTO CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO Ausência diplóide. de Praticamente complemento sem seqüências redundantes. Genoma E. coli • Colinearidade entre genes e produtos protéicos. Quase todo genoma → codificação e regulação. • Unidades acessórias. genéticas Seqüências codificantes em ambas as fitas. CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO ◙ Organização dos genes em operons • Genes que codificam produtos com funções (componentes de uma mesma rota metabólica). relacionadas • Responsáveis pelo controle da expressão gênica. • Mostram-se presentes apenas em procariotos. • Seus produtos são regulados pela presença de substrato. CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO Unidades transcricionais policistrônicas (Operons). Regiões intercistrônicas → 1 a 30 pb (até 40 pb) CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO ◙ Elementos genéticos móveis • Todo genoma de procarioto está contido num único cromossomo. • Exceção → elementos genéticos móveis. CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO 1. Bacteriófagos. 2. Plasmídeos. 3. Transposons. CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO ◙ Plasmídeos • Elementos extra-cromossomais com capacidade de replicação constituídos por uma molécula de DNA fita dupla circular. • Sua seqüência nucleotídica tem pouca ou nenhuma homologia com o cromossomo da célula hospedeira (elemento estranho a bactéria). • Conferem vantagens adaptativas às bactérias que os possuem. → produção de toxinas → produção de pilinas → produção de adesinas ■ Conferem resistência a múltiplos antibióticos (tornam problemático o tratamento quimioterápico de determinadas infecções.) autônoma CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO ◙ Bacteriófagos • Não possuem uma maquinaria própria (incapazes de se multiplicarem na ausência de um hospedeiro). • Elementos extra-cromossomais que ganharam a capacidade de sintetizar um capsídeo protéico. • Podem apresentar genomas de RNA, ssDNA circular ou dsDNA linear (colifagos). Virulentos → multiplicam-se dentro da célula hospedeira dando origem a outros que são liberados após a lise celular (ciclo lítico). Temperados → podem se integrar no genoma bacteriano (linhagem lisogênica), ou entrar em ciclo lítico. CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO ◙ Bacteriófagos → replicons potencialmente letais. ◙ Plasmídeos → replicons não letais (dentro de suas células hospedeiras). •Etapas da infecção → colisão, adsorção e injeção do ácido nucléico. Ciclo lítico → O genoma do fago é expressado. Proteínas estruturais são sintetizadas e o genoma viral é encapsidado (produção de novas partículas virais). Ciclo lisogênico → O genoma do fago se integra, por recombinação, no genoma bacteriano. O genoma do fago pode eventualmente ser liberado (sendo capaz de iniciar um ciclo lítico). # Lisógena → Bactéria que carrega uma cópia do genoma viral integrada ao seu cromossomo. CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO ◙ Transposons → seqüências de DNA inseridas em novos sítios genômicos (catalisadas a partir de enzimas específicas - transponsases). → envolvem processos de recombinação e replicação gerando 2 novas cópias do elemento genético transponível original. # uma que permanece no sítio parental. # outra que aparece num determinado sítio alvo. • Alteração da integridade de seus sítios-alvo. 1. ativação de genes inativos 2. deleções, inversões e fusões cromossômicas * Conferem significativa plasticidade genética nos genomas que as possuem. CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO ◙ Classificação Transposons simples (IS)→ carregam apenas a informação genética essencial para a transposição. Transposons complexos → carregam, também, informações não relacionadas a transposição . # resistência a antibióticos # capacidade de movimentação entre bactérias PROCARIOTO X EUCARIOTO • 97% dos genes são de regulação. • 3% São seqüências não codantes (inter-espaçadores gênicos). • 3% São seqüências não codantes • 97% dos genes são de regulação. (inter-espaçadores gênicos). → cópia única (0 – 30 pb) PROCARIOTO X EUCARIOTO COMPARAÇÕES → EUCARIOTO Número de Genes 70000 60000 50000 Número de Genes 50000 45000 40000 30000 30000 19000 20000 13600 10000 4288 6340 517 0 Mycoplama E. coli Levedura Drosofila Ascaris Humano Arroz Milho Genes não interrompidos X interrompidos COMPARAÇÕES → EUCARIOTO Tamanho dos genes em kb COMPARAÇÕES → EUCARIOTO CARACTERÍSTICAS → EUCARIOTO Existência de múltiplas cópias de algumas seqüências. Presença de complemento diplóide. Abundância de seqüências redundantes. Quase todo genoma: não codificação e regulação. Raramente apresenta unidades genéticas acessórias. Seqüências codificantes em apenas uma das fitas. CARACTERÍSTICAS → EUCARIOTO Não há Colinearidade: Gene Proteína 3n nucleotídeos n aminoácidos CARACTERÍSTICAS → EUCARIOTO Não há Operons. Exceção Caenorhabditis elegans Nematódeo: 25% dos genes CARACTERÍSTICAS → EUCARIOTO 1. DNA de (45%). cópia única 2. DNA Moderadamente Repetitivo (30%). 3. DNA Altamente Repetitivo (25%). GENOMA DE ORGANELAS Características dsDNA. Genoma Circular. Várias cópias por organela. GENOMA HUMANO Genoma Humano Genoma Nuclear 3300Mb Genoma Mitocondrial 16,6kb 37 genes 30.000 - 50.000 genes ~25% ~75% Genes e seqüências gene-relacionadas DNA extragênico Dois genes de rRNA Únicas ou moderadamente repetitivas ~10% ~90% DNA codificador Pseudogenes ~60% DNA nãocodificador Fragmentos de genes 22 genes de tRNA Único ou baixo número de cópias Íntrons, seqüências nãotraduzidas etc. 13 genes codificadores de polipeptídeos ~40% Moderado a altamente repetitivo Repetido em tandem ou repetições agrupadas Repetições dispersas CARACTERÍSTICAS → EUCARIOTO Famílias Funcionalmente Similares Relacionados mas não idênticos → Globina CARACTERÍSTICAS → EUCARIOTO Famílias gênicas codificadoras de RNA Genes de rRNA → 5 agrupamentos de 50 repetições em tandem. Genes de Trna → grande família dispersa (40 subfamílias). Genes de snRNA → grande família dispersa. CARACTERÍSTICAS → EUCARIOTO Famílias Funcionalmente Idênticas → Histonas Replicação dependente → restrito a fase S. Replicação independente → nível basal em todo CC. Replicação tecido-específico. H1 H1 CONCLUSÃO Existem diferenças significativas entre genomas procariotos e eucariotos. Procariotos → genomas pequenos, circulares, poucos genes, operons e unidades genéticas acessórias. Eucariotos → genomas grandes, lineares, muitos genes, sem operons e sem unidades genéticas acessórias. Eucariotos apresentam procariotos. genomas mais complexos que os