"Año del Bicentenario del Perú: 200 años de Independencia"
UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
FACULTAD DE INGENIERIA
ESCUELA PROFESIONAL DE INGENIERIA
AMBIENTAL
TEMA: Practica de simulación de electroforesis en
gel de agarosa utilizando el programa SNAGENE
utilizando
los
´´Aislamiento
biorremediador
datos
de
y
del
articulo
baterías
análisis
con
de
científico
potencial
comunidades
bacterianas de zona impactada por petróleo en
condorcamqui – Amazonas – Perú´´
DOCENTE: Dr. HEBERT HERNAN SOTO
GONZALES
ESTUDIANTE: JOSHELIN SHANTAL
ALARCON MAMANI
FECHA DE ENTREGA: 29/10/2021
CURSO: BIOTECNOLOGIA
CICLO: VII
PERÚ-ILO
ÍNDICE
I.
INTRODUCCION ....................................................................................................... 2
II.
OBEJTIVOS ................................................................................................................ 4
2.1.
OBJETIVO GENERAL ............................................................................................. 4
2.2.
OBJETIVO ESPECIFICO ......................................................................................... 4
III.
MARCO TEORICO .................................................................................................... 5
3.1. GEL AGAROSA ............................................................................................................ 5
3.2. SNAPGENE................................................................................................................... 5
3.3. NUCLEOTIDO .............................................................................................................. 5
3.4. ELECTROFORESIS ...................................................................................................... 6
IV.
MARCO METODOLOGICO..................................................................................... 6
V.
RESULTADOS.......................................................................................................... 13
VI.
CONCLUSIONES ..................................................................................................... 14
VII.
CUESTIONARIO ...................................................................................................... 14
VIII. BIBLIOGRAFÍA ....................................................................................................... 19
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Escuela Profesional de Ingeniería Ambiental
I.
INTRODUCCION
La electroforesis en geles de agarosa o poliacrilamida es una de las metodologías más
utilizadas en el laboratorio en todo lo relacionado con el trabajo con ácidos nucleicos.
Mediante la electroforesis podemos separar fragmentos de ADN y ARN en función de su
tamaño, visualizarlos mediante una sencilla tinción, y de esta forma determinar el
contenido de ácidos nucleicos de una muestra, teniendo una estimación de su
concentración y grado de entereza. Podemos además extraer del gel los fragmentos de
ADN que sean de interés, para posteriormente utilizarlos en diferentes aplicaciones.
La electroforesis de ADN fue, y sigue siendo, una herramienta de importancia primordial
en el desarrollo de las técnicas del ADN recombinante o ingeniería genética.
Mediante la electroforesis en gel de agarosa, Thorne logró separar y visualizar tres formas
topológicas diferentes del ADN del polyomavirus: superenrrollada, relajada y lineal, tras
haber marcado el ADN con [3H] timidina (Thorne 1966, 1967). El trabajo de Thorne
recibió poca atención hasta principios de los años 70, cuando el empleo de enzimas de
restricción permitió el análisis de moléculas de ADN mucho más grandes que los
genomas virales.
Los geles de agarosa tienen un poder de resolución mucho menor que los de
poliacrilamida, porque no permiten separar moléculas de ADN que difieren en tamaño
menos de unas 50 pb. Sin embargo, el rango de tamaños que pueden separarse es mucho
mayor en un gel de agarosa (moléculas desde 50 pb hasta unos 40 kb) dependiendo de la
concentración del mismo (0.3-2% p/v); cuanto más baja es la concentración de agarosa
mayor es el tamaño de las moléculas que pueden separarse, y viceversa. (Fierro Fierro)
GSL Biotech SnapGene es un programa de biología molecular utilizado para documentar
secuencias de ADN. Es similar a SnapGene Viewer, que es gratuito, pero no ofrece las
mismas funciones avanzadas que SnapGene. Ambos programas están disponibles para
Windows, macOS y Linux.
SnapGene proporciona herramientas que le permiten planificar, visualizar y documentar
todos sus procedimientos de biología molecular. La herramienta de clonación In-Fusion
del programa simula fusiones de genes de sus fragmentos de ADN seleccionados.
Mientras trabaja, SnapGene resalta los sitios de restricción del ADN, marcando
automáticamente los sitios bloqueados por metilación, y le permite elegir o definir
conjuntos de enzimas personalizados.
SnapGene puede importar y exportar una variedad de formatos de archivos de
secuenciación de ADN comunes, como ApE, Gene Construction Kit, GenBank,
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DNASTAR Lasergene y MacVector. La aplicación le permite explorar grandes
secuencias de ADN y navegar rápidamente por los cromosomas con la ayuda de controles
inteligentes de búsqueda y zoom. Mientras realiza todas estas funciones, SnapGene
registra automáticamente cada paso de su proyecto de clonación, cada vez que edita una
secuencia o realiza una simulación, el procedimiento se registra en un historial gráfico.
SnapGene es una aplicación impresionante para manejar los procedimientos de biología
molecular. Proporciona una serie de útiles herramientas de análisis de secuencias de ADN
y soporta una variedad de formatos de archivo comunes. GSL Biotech SnapGene es un
gran recurso de laboratorio que le ayudará en su visualización y análisis de secuencias de
ADN. (GSL Biotech SnapGene)
Esta práctica de simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el programa
SNAP GENE utilizando los datos del articulo científico. Del articulo utilizamos las cebas
bacterianas aisladas que se encontraron en las muestras de agua contaminada y suelo
contaminado lo cual obtuvimos 13 cepas bacterianas seguidamente cada una fue buscada
en el sitio web del NCBI seguidamente cada secuencia de cada bacteria fue guarda en una
carpeta creada en el explorador de archivos y luego se abrió el programa que se instalo el
SNAPGENE y ahí se abrió cada una de las 13 cepas bacterianas guardadas pudimos
identificar y analizar lo que pudimos observar.
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II.
OBEJTIVOS
2.1. OBJETIVO GENERAL
Realizar una simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el
programa SNAGENE
utilizando
los datos del articulo
científico
´´Aislamiento de baterías con potencial biorremediador y análisis de
comunidades bacterianas de zona impactada por petróleo en condorcamqui –
Amazonas – Perú´´
2.2. OBJETIVO ESPECIFICO
 Definir los términos de la técnica de electroforesis en el gel agarosa.
 Analizar las secuencias de las 13 bandas de nucleótidos de la pagina web
NCBI con la asimilación del gel agarosa en el programa ‘‘Snap Gene’’.
 Realizar en el grafico las separaciones de las enzimas de restricción para
cada secuencia.
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III.
MARCO TEORICO
3.1. GEL AGAROSA
(Padilla Peña, Diez Dapena, Martínez Galisteo, Bárcena Ruiz, & García
Alfonso, 2017) La electroforesis en gel de agarosa es de las más utilizadas
para analizar y caracterizar ácidos nucleicos de distintas procedencias. Los
geles se comportan como un tamiz molecular y permiten separar moléculas
cargadas en función de su tamaño y forma. Así, moléculas de DNA de
diferente tamaño van a emigrar de forma distinta en una electroforesis en gel
de agarosa. Además, si en dicha electroforesis se aplican marcadores de peso
molecular (fragmentos de DNA de tamaño conocido) se puede calcular el
tamaño aproximado del DNA en estudio.
3.2. SNAPGENE
(SnapGene)Aprovechen el eficiente manejo de datos de SnapGene para
escanear grandes secuencias de ADN con miles de características
anotadas.Visualización de la proteína Vea las múltiples vistas de una
secuencia de proteínas. Personaliza la visualización de regiones, sitios,
enlaces y colores de secuencia. Edición de secuencia intuitiva Edita
fácilmente las secuencias de ADN y proteínas. Hacer inserciones,
supresiones, sustituciones y cambios de caso. Cuando se copia y se pega una
secuencia, los rasgos se transfieren automáticamente. Codificación de color
de la secuencia Poner una secuencia seleccionada de ADN o aminoácidos en
uno de diez colores. Colorear las dos cadenas de ADN o la secuencia de
proteínas. Los colores son visibles en las vistas del mapa y de la secuencia.
Anotación
de
características
Anota
las
características
comunes
automáticamente, o anota las características novedosas manualmente.
Encuentra características comunes en tu secuencia de ADN usando la extensa
base de datos de SnapGene. Se pueden añadir características adicionales de
su elección a una base de datos personalizada.
3.3. NUCLEOTIDO
(Lawrence C. , s.f.) Un nucleótido es la pieza básica de los ácidos nucleicos.
El ARN y el ADN son polímeros formados por largas cadenas de nucleótidos.
Un nucleótido está formado por una molécula de azúcar (ribosa en el ARN o
desoxirribosa en el ADN) unido a un grupo fosfato y una base nitrogenada.
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Las bases utilizadas en el ADN son la adenina (A), citosina (C), guanina (G)
y timina (T). En el ARN, la base uracilo (U) ocupa el lugar de la timina.
3.4. ELECTROFORESIS
(Austin, s.f.) La electroforesis es una técnica que se utiliza de forma
generalizada en la que, fundamentalmente, se aplica corriente eléctrica a
moléculas biológicas, ya sean ADN, proteínas o ARN, y se separan en
función de si son más grandes o más pequeñas.
Es una técnica muy utilizada en la investigación básica, muy importante para
la comprensión de la función de genes y proteínas, pero ahora ha irrumpido
en el área de diagnóstico clínico y forense. Una electroforesis se realiza
generalmente en una especie de caja que tiene una carga positiva en un
extremo y una carga negativa en el otro.
IV.
MARCO METODOLOGICO
PASO 1: En el artículo científico de ´´Aislamiento de baterías con potencial
biorremediador y análisis de comunidades bacterianas de zona impactada por
petróleo en condorcamqui – Amazonas – Perú´´ podemos observar en la tabla
1 las muestras se copiaron cada una de donde dice (N° de Accesión) y se pegó
en la página web del NCBI.
Tabla 1: Identificación de las cepas bacterianas aisladas
Fuente: http://www.scielo.org.pe/scielo.php?pid=S231329572020000300215&script=sci_arttext
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Figura 1: Se busco en el sitio web el NCBI
Fuente: Elaboración propia de Alarcon Mamani, Joshelin
PASO 2: Entrar a la página de NCBI: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ , y
colocar GENE en el primer box y luego poner NR_112010.1 en donde ay un
espacio en blanco y en la esquina dice Search hacemos clic ahí y comenzara
a buscar.
Figura 2: Se observa en que espacios se coloca la palabra Gene y NR_112010.1
Fuente: Elaboración propia de Alarcon Mamani, Joshelin
PASO 3: Despues de haber bucado nos aparecera la siguiente ventana como
podemos observar en la imagen y luego se hizo click donde dice Klebsiella
oxytoca strain JCM 1665 16S ribosomal RNA _partial sequience y nos
cargara otra ventana.
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Figura 3: Se puede observar donde se seleccionó al buscar la primera cepa bacteriana aislada
Fuente: Elaboración propia de Alarcon Mamani, Joshelin
PASO 4: Aparece esta ventana la cual realizamos un clic donde dice Sen to
y nos aparecerá 4 opciones como podemos observar en la imagen.
Figura 4: Aquí se muestra donde está ubicada la opción ´´Send to´´
Fuente: Elaboración propia de Alarcon Mamani, Joshelin
PASO 5: Después de haber observado las 4 opciones realizamos un clic en
el enunciado que dice ´´File´´ y también cambiamos en donde dice Format
seleccionamos la opción FASTA luego realizamos un clic donde dice
(créate File) tenemos que realizar estos pasos con las 13 cepas bacterianas
aisladas y guárdalas en una carpeta con el nombre de PRACTICA
SNAPGENE.
Figura 5: Aquí se observa las opciones que debemos seleccionar antes de guardar la secuencia.
Fuente: Elaboración propia de Alarcon Mamani, Joshelin
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PASO 6: Aquí podemos observar la carpeta en la que se guardo las 13 cepas
bacterianas aisladas. Cada una es una secuencia.
Figura 6: Aquí se observa la carpeta donde se guardó las 13 secuencias.
Fuente: Elaboración propia de Alarcon Mamani, Joshelin
PASO 7: Luego de que nuestras 13 secuencias estén guardadas abrimos el
programa SNAPGENE nos saldrá esta ventana como podemos observar en
la imagen.
Figura 7: Aquí se observa la ventana del SNAPGENE.
Fuente: Elaboración propia de Alarcon Mamani, Joshelin
PASO 8: Seguidamente realizamos un clic en ´´Open´´ y seleccionamos la
opción que dice ´´Open Files´´ y nos saldrá para buscar la carpeta donde
hemos guardado nuestras 13 secuenciaciones y realizamos un clic en la
primera secuencia y presionamos o hacemos clic en abrir.
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Figura 8: Se observa donde tenemos que seleccionar.
Fuente: Elaboración propia de Alarcon Mamani, Joshelin
Figura 9: Aquí vemos que se abrió la ventana de archivos y encontramos nuestra carpeta donde
están las 13 secuencias.
Fuente: Elaboración propia de Alarcon Mamani, Joshelin
PASO 9: Nos saldrá la siguiente ventana que observamos en la imagen
buscamos la opción que dice ´´ Tools´´ y nos aparecerá varias opciones
realizamos un clic donde dice ´´ Simulate Agarose Gel´´. Nos saldrá una
pequeña ventana donde presionaremos Ok.
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Figura 10: Aquí seleccionamos la simulate Agarose Gel.
Fuente: Elaboración propia de Alarcon Mamani, Joshelin
PASO 10: Nos sale la siguiente ventana la cual precionamos el ( N° 2) y
nos sale las siguientes opciones. Realizamos un clic donde dice (choose
DNA Sequences…).
Figura 11: Aquí podemos observar donde se seleccionó para abrir la carpeta de la secuencia N° 02.
Fuente: Elaboración propia de Alarcon Mamani, Joshelin
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PASO 11: Luego de haber realizado el clic nos aparece la siguiente ventana
donde hemos guardado nuestras 13 secuencias y seleccionamos la secuencia
N° 2 y presionamos Abrir.
Figura 12: Podemos observar la ventana que nos sale para seleccionar nuestra carpeta guardada de las secuencias solo
seleccionamos la secuencia dos.
Fuente: Elaboración propia de Alarcon Mamani, Joshelin
PASO 12: Seguidamente nos aparecerá una pequeña ventana donde
presionaremos ok. Y nos aparecerá la siguiente secuencia en una línea
blanca.
Figura 13: Observamos la pequeña ventana al cual realizamos un clic de ok.
Fuente: Elaboración propia de Alarcon Mamani, Joshelin
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PASO 13: Aquí podemos observar como nos aparecio y hacemos este paso
con las 13 cepas bacterianas aisladas (secuencias que hemos guardado en la
carpeta).
Figura 14: Podemos observar las dos secuencias en esas líneas color blanco que se formó.
Fuente: Elaboración propia de Alarcon Mamani, Joshelin
V.
RESULTADOS
En el siguiente grafico se muestra comportamiento de los diferentes nucleótidos
en la electroforesis con la simulación del gel agarosa en el programa
“SNAPGENE”.
Figura 15: Aquí podemos observar el resultado obtenido en esta práctica con la simulación electroforesis en gel de agarosa
utilizando el programa SNAGENE
Fuente: Elaboración propia de Alarcon Mamani, Joshelin
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VI.
CONCLUSIONES

En el programa SnapGene fue fácil de manipular con las respectivas
indicaciones, en el cual el total de muestras escogidas permitió dar a conocer
el grafico de las bandas sin ningún inconveniente, la asimilación de gel
agarosa permitió la separación de cadenas en tamaños pequeños en el grafico
en unidad de kb, también se pudo reconocer las secuencias de genes
específicas con las enzimas de restricción identificadas en el proceso final.

Conocer este programa y saber una de sus funciones que puede realizar es
muy importante para los estudiantes conocer y también conocer los términos
como gel agarosa y electroforesis fue crucial para entablar los objetivos, el
procedimiento y por ende las conclusiones finales de la práctica.

Se realizo con 13 cepas bacterianas las cuales pudimos hacer la simulación
de electroforesis en gel de agarosa utilizando el programa SNAGENE sin
ninguna dificultad.
VII.
CUESTIONARIO
1. ¿Indique diferencias entre el ADN y el ARN?
ADN
Doble cadena helicoidal
Glúcido de 5C (pentosa): desoxi-ribosa
Se encuentra en el núcleo en eucariontes y en
el citoplasma de procariontes
ARN
Una sola cadena, no helicoidal
Glúcido de 5C(pentosa): ribosa
Bases A, U, G, C
Se sintetiza en el núcleo y tiene actividad
biológica en el citoplasma de la célula.
Un solo tipo
No abandona el núcleo
Hay 3 tipos: ARNm, ARNt, ARNr
Participa en la síntesis de proteínas, saliendo
del núcleo hacia el citoplasma en células
eucariontes.
En eucariontes está asociado a proteínas
llamadas histonas.
Solo el ARNr está asociada a proteínas.
2. ¿Qué es el SNAPGENE y como nos serviría en Ingeniería Ambiental?
SnapGene es el primer software de biología molecular, genera
automáticamente un registro de cada edición de secuencia y procedimiento
de donación, por lo que no perderá la pista de cómo se hizo una construcción,
incluso después de que un miembro del laboratorio se vaya.
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También SnapGene admite una gran cantidad de formatos de archivo como
resultado.
Asimismo, nos permite la visualización de secuencias de ADN, la anotación
de secuencias, la edición de secuencias, la clonación, la visualización de
proteínas y la simulación de métodos de clonación comunes.
Podemos utilizar el SnapGene en la ingeniería ambiental para identificar la
secuencia de algunas bacterias y ver si son eficientes o no y si podemos
utilizarlo en el uso y regulación de sistemas biológicos para la remediación
de entornos contaminados como tierra, aire, agua y para procesos amigables
con el entorno natural de las tecnologías verdes y el desarrollo sustentable.
3. ¿Qué es el gel 16S y para que tipos de microorganismos sería útil?
El ARNr 16S es un polirribonucleótido de aproximadamente 1500
nucleótidos codificado por el gen rrs, también denominado ADN ribosomal
16S. Como cualquier secuencia nucleotídica de cadena sencilla, el ARNr 16S
se pliega y adquiere una estructura secundaria que se caracteriza por tener
segmentos de doble cadena que permiten la formación de asas y hélices. Esta
molécula ha sido reconocida como un poderoso marcador universal debido a
que se encuentra en todos los organismos conocidos. Su estructura parece
mantenerse por largos periodos de tiempo y, como su función no ha
cambiado, los cambios en la secuencia probablemente son aleatorios.
El gen ARNr 16S ha demostrado ser de gran utilidad para describir y
caracterizar las comunidades microbianas marinas, especialmente los
organismos no cultivados. Las nuevas técnicas de secuenciación han
contribuido al incremento exponencial de registro de secuencias, aunque
parciales, del ARNr 16S como elemento de código de barras para
microorganismos. Consecuentemente, ha sido necesaria una revisión de
conceptos y métodos de clasificación taxonómica para estos organismos.
(Valenzuela-González, dic. 2015).
Los estudios de las comunidades microbianas marinas pueden agruparse por
las características de los ambientes donde se establecen:
 Comunidades microbianas planctónicas pelágicas. Los estudios se han
centrado en determinar el patrón global de la composición de la
comunidad microbiana. Los resultados indican que en todos los océanos
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están presentes los mismos taxones, y lo que se observa en una región y
tiempo dado son los cambios en las abundancias relativas de sus
miembros.
 Comunidades microbianas planctónicas costeras. independientemente de
la influencia oceánica, estas comunidades muestran cambios en su
estructura atribuidos a las partículas en suspensión provenientes de ríos,
escurrimientos o surgencias, En estos ambientes, es posible diferenciar
una comunidad adherida a materia orgánica y otra de vida libre
 Comunidades microbianas bentónicas. Estas comunidades son muy
dinámicas con la más rica diversidad dentro de las comunidades marinas.
Esto posiblemente sea influenciado por los nutrientes, las condiciones
ambientales y la heterogeneidad del sustrato que se presentan en el bento,
lo que favorece las altas tasas de recambio de las poblaciones.
Las comunidades microbianas bentónicas son las responsables de los
procesos de nitrificación y oxidación anaeróbica de amonio.
 Comunidades
microbianas
relacionadas
con
volcanes
marinos
(fumarolas).
Estas comunidades representan un ambiente extremo y no muestran gran
diversidad. Sin embargo, como un reflejo de la gran presión evolutiva
ejercida por el medio, los miembros de los principales grupos taxonómicos
presentan mayor variación en sus secuencias del 16S.
4. ¿Describa el proceso de electroforesis para ADN?
La electroforesis es una técnica que emplean los científicos en el laboratorio
utilizada para separar el ADN, el ARN, o moléculas o proteínas en base a su
tamaño y carga eléctrica.
En el caso del ADN, el ADN es una molécula muy larga, así que no se puede
hacer un gel de una molécula entera de ADN de una célula. Es tan grande que
nunca se metería en el gel, así que lo que hacen los científicos es cortar el
ADN con cosas como las enzimas de restricción, que cortan el ADN en
pedazos más manejables, y entonces esas piezas, dependiendo de lo grande
que sean, migran más o menos por el gel y terminan más arriba o más abajo.
(Austin, s.f.)
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5. ¿Qué es la Agarosa?
La agarosa es un producto natural que forma una matriz inerte y no tóxica que
supone una herramienta indispensable en gran cantidad de técnicas
de biología molecular, bioquímica y biología celular. Su uso más extendido
es
para
construir
geles
que
permitan
separar moléculas de ADN mediante electroforesis, además de ser utilizada
para fijar moléculas a su estructura como anticuerpos, antígenos y enzimas.
Igualmente se utiliza para el cultivo celular y en microbiología. Otros usos
menos extendidos son la utilización de estos geles como matrices en la
reparación de tejidos dañados. (Agarosa, s.f.)
6. ¿Qué es un marcador de peso molecular, cuáles son sus tipos?
Los marcadores de peso molecular para ADN son una herramienta utilizada
durante la electroforesis para conocer el tamaño estimado de un fragmento y
es comúnmente usada en laboratorios de biología molecular, al igual que, en
áreas como la medicina, la agricultura, la industria, entre otras.
Los marcadores moleculares corresponden a cualquier gen cuya expresión
permite un efecto cuantificable u observable (características fenotípicas), que
además puede detectarse fácilmente. Este tipo de marcadores pueden
evaluarse desde que los individuos están en sus primeros estadios de
desarrollo, y se pueden aplicar usando a todo el individuo o sólo parte de él.
Se habla de marcadores genéticos cuando se transmiten según las leyes
básicas de la herencia mendeliana, por lo que es importante destacar que no
todos los marcadores moleculares pueden considerarse como genéticos.
Existen dos tipos de marcadores moleculares: los marcadores bioquímicos y
los marcadores de ADN.
Marcadores bioquímicos
Los marcadores bioquímicos incluyen a las proteínas y las isoenzimas o
aloenzimas y constituyen la primera generación de marcadores moleculares.
Las proteínas son los productos primarios de los genes y se forman mediante
los procesos de transcripción y traducción, por lo que se ven menos influidos
por el ambiente. Las isoenzimas fueron descubiertas por Hunter y Markert en
1957 y son diferentes variantes moleculares de una misma enzima presentes
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en una especie, las cuales desempeñan la misma actividad, pero pueden tener
diferentes propiedades.
Las
isoenzimas
se
identifican
mediante
el
proceso
denominado
“electroforesis”, que consiste en colocar un extracto proteico del material a
analizar en los pocillos de un soporte (papel de celulosa o un gel hecho de
agarosa o poliacrilamida) que se somete a un campo eléctrico durante varias
horas para que se separen las proteínas de acuerdo con su tamaño o carga
eléctrica.
Marcadores de ADN
Los marcadores de ADN constituyen la nueva generación de marcadores
moleculares y solucionaron el problema de la carencia de marcadores que
tenían las isoenzimas, pues son capaces de generar una cantidad virtualmente
infinita de marcadores. Existen varias técnicas para identificar marcadores de
ADN, las que se pueden agrupar en tres categorías: las de hibridación tipo
Southern, las de reacción de polimerización en cadena (PCR) y las que
combinan PCR o sus productos de ADN con la hibridación tipo Southern.
La hibridación consiste en la formación de una molécula de doble cadena
mediante el apareamiento o unión de bases complementarias de dos
moléculas de una sola cadena. La hibridación tipo Southern explora las
variaciones en la longitud o tamaño de los fragmentos de ADN ocasionadas
por la restricción del genoma mediada por una enzima particular
(endonucleasa). Esta técnica comprende las siguientes etapas: primero se
extrae el ADN del material que deseamos estudiar; luego se le adicionan
enzimas de restricción (endonucleasas), las cuales cortan el ADN en
fragmentos de diferente longitud; estos fragmentos son separados en geles de
agarosa, para después realizar por capilaridad o al vacío la transferencia de
los fragmentos a una membrana de papel de nitrocelulosa o de nylon
(transferencia tipo Southern). Finalmente, se hibridizan los fragmentos de la
membrana con sondas marcadas (radiactiva o no radiactivamente) para
visualizar y detectar las bandas hibridadas. La hibridación consiste en la
formación de una molécula de doble cadena mediante el apareamiento o
unión de bases complementarias de dos moléculas de una sola cadena. La
hibridación tipo Southern explora las variaciones en la longitud o tamaño de
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los fragmentos de ADN ocasionadas por la restricción del genoma mediada
por una enzima particular (endonucleasa). Esta técnica comprende las
siguientes etapas: primero se extrae el ADN del material que deseamos
estudiar; luego se le adicionan enzimas de restricción (endonucleasas), las
cuales cortan el ADN en fragmentos de diferente longitud; estos fragmentos
son separados en geles de agarosa, para después realizar por capilaridad o al
vacío la transferencia de los fragmentos a una membrana de papel de
nitrocelulosa o de nylon (transferencia tipo Southern). Finalmente, se
hibridizan los fragmentos de la membrana con sondas marcadas (radiactiva o
no radiactivamente) para visualizar y detectar las bandas hibridadas. (Solís
Ramos & Andrade Torres, 2005)
VIII. BIBLIOGRAFÍA
abrirarchivos. (s.f.). Recuperado el 21 de OCTUBRE de 2021, de abrirarchivos.:
https://abrirarchivos.info/software/gsl_biotech/snapgene
Austin, C. (s.f.). National Human Genome. Recuperado el 27 de OCTUBRE de 2021, de
National Human Genome: https://www.genome.gov/es/genetics-glossary/Electroforesis
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Lawrence C. , B. (s.f.). National Human Genome. Recuperado el 27 de OCTUBRE de 2021, de
National Human Genome: https://www.genome.gov/es/genetics-glossary/Nucleotido
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Padilla Peña, C. A., Diez Dapena, J., Martínez Galisteo, E., Bárcena Ruiz, J. A., & García
Alfonso, C. (2017). uco. Recuperado el 27 de OCTUBRE de 2021, de uco:
https://www.uco.es/organiza/departamentos/bioquimica-biolmol/pdfs/17%20ELECTROFORESIS%20ACS%20NUCLEICOS%20GELES%20AGA
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Solís Ramos , L. Y., & Andrade Torres, A. (ABRIL de 2005). cienciahombre. Recuperado el 28
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http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S018538802015000400297
WIKIPEDIA. (s.f.). Recuperado el 28 de OCTUBRE de 2021, de WIKIPEDIA:
https://es.wikipedia.org/wiki/Agarosa
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