Global Biodiversity Information Facility
Workshop Braga, 5 a 7 Julho
A experiência do Herbário João de Carvalho e
Vasconcellos (LISI)
Pedro ARSÉNIO1; Maria Dalila ESPÍRITO SANTO2
[email protected]
[email protected]
1-Secção
Autónoma de Arquitectura Paisagista
2-Departamento de Protecção de Plantas e Fitoecologia
Instituto Superior de Agronomia
Tapada da Ajuda 1349-017 Lisboa
GBIF - A experiência do Herbário João de Carvalho e Vasconcellos (LISI)

O projecto “Spanish and Portuguese Platform
for Botanical Diversity Data Online”

O Herbário João de Carvalho e Vasconcellos
(LISI)

A informatização do HJCV

Perspectivas Futuras
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
O projecto “Spanish and Portuguese Platform
for Botanical Diversity Data Online”

O Herbário João de Carvalho e Vasconcellos
(LISI)

A informatização do HJCV

Perspectivas Futuras
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
Iniciativa AHIM - 17 instituições associadas ao projecto
Dados de ≈400 000 espécimes na Internet em 18 meses
Dotação orçamental de 50.000 USD


FCO
BIO
ARAN
16
HGI
SANT
JACA
BCN
SALA
MA
11
MAF
Madeira
MADJ
VAL - Coordenação
LISI
COA
6
GDA
ABH
HUAL
Instituições
associadas
ao projecto
1
0
5
10
15
20
Herbarios não informatizados
Informatização em curso com HERBAR
Informatização em curso com outros programas
25
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Objectivos

Disponibilização pela Internet de dados já informatizados

Validacão e controlo de qualidade

Transformação de dados para sistemas intercompativeis e
recuperação de dados em sistemas obsoletos

Formação

Uniformização da nomenclatura

Avaliação e registo das “experiências adquiridas”
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Objectivos
Grupos de plantas visados no projecto:
 Pteridophyta
– todas as famílias;
 Gymnospermae
– todas as famílias;
 Cistaceae;
 Cruciferae;
 Rosaceae;
 Leguminosae;
 Scrophulariaceae.
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Projecto “Spanish and Portuguese Platform for Botanical
Diversity Data Online” - Resultados
Instituição
Prometidos
Disponíveis
Portugal
LISI
MADJ
14.040
2.500
11.209
---
España
ABH
ARAN
BCN
BIO
COA
FCO
GDA
HGI
HUAL
JACA
MA
MAF
SALA
SANT
VAL
TOTAL
11.031
17.635
3.843
12.500
11.620
6.236
47.500
4.209
1.080
39.900
177.916
4.110
27.290
3.850
35.997
11.111
12.338
4.958
9.158
22.140
6.819
44.896
4.310
4.018
50.939
190.347
4.971
26.756
13.081
39.545
421.258
456.596
Fonte: GBIF-ES Nodo Nacional de Información sobre Biodiversidad
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As
potencialidades
de
consulta
são
inúmeras,
permitindo obter distribuições
geográficas por taxóne e
listagens várias.
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
O projecto “Spanish and Portuguese Platform
for Botanical Diversity Data Online”

O Herbário João de Carvalho e Vasconcellos
(LISI)

A informatização do HJCV

Perspectivas Futuras
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
O projecto “Spanish and Portuguese Platform
for Botanical Diversity Data Online”

O Herbário João de Carvalho e Vasconcellos
(LISI)

A informatização do HJCV

Perspectivas Futuras
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O Herbário João de Carvalho e Vasconcellos (LISI)

1910 – Fundação do ISA
– O herbário reúne então cerca de 3.800
espécimes da flora vascular espontânea
portuguesa e 658 espécimes de plantas
cultivadas como ornamentais, sob a
coordenação do Prof. D. António Xavier
Pereira Coutinho;

1926 – Entrada do Prof. João de Carvalho e
Vasconcellos no Gabinete de Botânica do
ISA
– Os trabalhos executados por este botânico,
designadamente os estudos fitogeográficos
que se desenvolveram no Douro sobre a flora
messícola, flora aquática e flora ribeirinha,
propiciam o rápido crescimento da colecção
natural do herbário do ISA.
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O Herbário João de Carvalho e Vasconcellos (LISI)

1980
– A colecção de plantas vasculares portuguesas contava com cerca de
60.000 espécimes. Um grande avanço foi dado ao Herbário com as
colheitas efectuadas pelo Prof. João do Amaral Franco e, mais
tarde, também
pela Invª. Maria
da Luz Rocha
Afonso, com os
estudos para a
“Nova Flora de
Portugal”. Todos
os holotypus
destes
classificadores
encontram-se
aqui arquivados;
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O Herbário João de Carvalho e Vasconcellos (LISI)

1990
– A contagem feita para o Index Herbariorum em 1990 aponta para
96.500 espécimes, no total do material arquivado, número que reflecte
bem o trabalho de colheita efectuado pelos actuais investigadores da
Secção de
Fitoecologia e
Herbologia,
principalmente
por Mário
Lousã, Dalila
Espírito Santo,
José Carlos
Costa, Ilídio
Moreira e
Teresa
Vasconcelos;
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O Herbário João de Carvalho e Vasconcellos (LISI)
A realização de projectos financiados
pela Comunidade Europeia, de modo a
dar resposta a Convenções
internacionais, permitiu que desde 1995
o Herbário sofresse novos incrementos.

2000
– O herbário do ISA, único na
Universidade Técnica de Lisboa,
obtém o estatuto de “Unidade
especial” do Instituto Superior de
Agronomia, com o nome de
“HERBÁRIO JOÃO DE
CARVALHO E VASCONCELLOS”.
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Os espécimes herborizados encontram-se distribuídos pelas colecções:

Plantas Espontâneas da Península Ibérica, reunindo as plantas espontâneas
de Portugal continental, Espanha continental e as provenientes das exsiccata
anuais da Associação Ibero-Macaronésica de Herbários.

Plantas dos Açores, proveniente em 80% das colheitas efectuadas pelo Eng.º
Siv. Ilídio Botelho Gonçalves, com cerca de 5000 espécimes, distribuídos por
1131 taxa.

Plantas da Madeira, colecção recentemente enriquecida pelas colheitas
efectuadas por J. C. Costa e Mário Lousã.

Plantas Cultivadas e Ornamentais, de que se destaca a contribuição de Lisete
Caixinhas.

“Herbário mundial”, para o qual contribuem as excursões
geobotânicas efectuadas durante as reuniões internacionais e
uma colecção de plantas de Timor herborizada por Ruy Cinatti.
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O Herbário João de Carvalho e Vasconcellos (LISI)
Considera-se o actualmente o quarto maior herbário nacional,
a seguir aos importantes herbários do Instituto Botânico Júlio
Henriques da Universidade de Coimbra, do Centro de
Botânica do Instituto de Investigação Científica Tropical
(apenas de plantas da África tropical) e do Herbário, Jardim
Botânico e Museu da Faculdade de Ciências de Lisboa, sendo
certamente dos mais actualizados em plantas vasculares de
Portugal continental.
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
O projecto “Spanish and Portuguese Platform
for Botanical Diversity Data Online”

O Herbário João de Carvalho e Vasconcellos
(LISI)

A informatização do HJCV

Perspectivas Futuras
GBIF - A experiência do Herbário João de Carvalho e Vasconcellos (LISI)

O projecto “Spanish and Portuguese Platform
for Botanical Diversity Data Online”

O Herbário João de Carvalho e Vasconcellos
(LISI)

A informatização do HJCV

Perspectivas Futuras
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Anteriores experiências de informatização do HJCV

1993-1994
– Sob a supervisão da Eng.ª Teresa Vasconcelos procede-se à
informatização do herbário com recurso ao aplicativo FileMaker Pro
vs. 2.0 (para Macintosh), totalizando 50.412 registos. Carregamento
directo na tabela de registos, nenhum tipo de customização.

1998
– Informatização da colecção dos Açores. Constituição de uma base de
dados em MS Access 97 com cerca de 4.948 registos. Interfaces de
carregamentos de dados preparadas, mas rudimentares.
Os registos acima referidos foram recuperados na totalidade (55.360 registos)
e encontram-se parcialmente carregados no aplicativo HERBAR vs 3.4g
(12.866 registos), com o qual se trabalha actualmente.
Dentro das famílias incluídas no projecto AHIM,
foram ainda inseridos 371 novos registos
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A presente experiência de informatização do HJCV
Percentagem do financiamento atribuída
 Adopção
do software
Herbar, indicado como
standard para a
informatização dos
Herbários da Península
Ibérica
 Aquisição
de equipamento
informático (pc);
 Recurso
a um Bolseiro FCT
para carregamento de
dados (2004);
ABH
3%
VAL
19%
BCN
2%
BIO
3%
COA
3%
FCO
3%
SANT
2%
GDA
8%
SALA
6%
MAF
2%
HGI
2%
MADJ
2%
JACA
7%
 Recuperação
e integração
dos dados presentes em
anteriores iniciativas de
informatização;
ARAN
4%
MA
27%
HUAL
2%
LISI
4% ≈ 1.900 €
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Resultados
Informatização do HJCV em curso:
 13.239
registos actualmente
inseridos no aplicativo
 Recuperação
de informação
retida em formatos obsoletos
ainda decorre
 Participação
regular em
programas de formação
 Colaboração
com a GBIF.es,
assegurando a salvaguarda
da proveniência nacional dos
dados
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Dificuldades
 Número
de Herbário: três séries de números em vigor
–1910-1944;
–1944-1999;
– 2000-?
 Recuperação
de informação dificultada pela mudança do sistema
operativo (Macintosh  Windows)
Exemplo:
–‘Desdobramento’ do nome científico dos ficheiros antigos (conflitos com
codepage)
 Completagem
do catálogo de nomes
(Scrophulariaceae)
 Exportação
 Tradução
para DarwinCore v2.0
do aplicativo (prevista)
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
O projecto “Spanish and Portuguese Platform
for Botanical Diversity Data Online”

O Herbário João de Carvalho e Vasconcellos
(LISI)

A informatização do HJCV

Perspectivas Futuras
GBIF - A experiência do Herbário João de Carvalho e Vasconcellos (LISI)

O projecto “Spanish and Portuguese Platform
for Botanical Diversity Data Online”

O Herbário João de Carvalho e Vasconcellos
(LISI)

A informatização do HJCV

Perspectivas Futuras
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Perspectivas futuras

Constituição de um
banco de imagens
dos espécimes
depositados no
HJCV, com
prioridade para os
Holotypos;
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Perspectivas futuras

Georeferenciação das colheitas
– Em que tipo de coords?
Geodésicas vs. cartográficas
– Sobre que datum?
WGS84; Dt73; DtLx
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Perspectivas futuras

Catálogo de nomes
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Perspectivas futuras

Expansão a outros herbários
nacionais

Reforço da colaboração e circulação
de informação (gestão de
empréstimos)
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Perspectivas futuras

Colecções vivas
– Jardins botânicos
– Index Seminum
– Bancos de Germoplasma
–…
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Agradecimentos:
À Universidade do Minho, pelo convite
À GBIF.es, pelo apoio prestado
A toda a equipa do HJCV
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Obrigado pela atenção
dispensada