MSc in Biochemistry
Dissertation Project – 2nd Cycle
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Supervisor(s): Sofia Pauleta
Supervisor(s) email address: [email protected] ; [email protected]
Lab/Institution: Lab 617/613 REQUIMTE, Dep. Química, FCT-UNL
Scientific area: Biologia Estrutural, Bioquímica, Microbiologia, Biologia Molecular
TITLE: Novo sistema de divisião celular em bactérias anaeróbias
BACKGROUND
Este estudo está incluido num projecto recentemente financiado pela Fundação para a
Ciência e Tecnologia, FCT-ANR/BBB-MET/0023/2012, e por uma acção bilateral entre
Portugal-França/Marselha. O aluno poderá ter uma bolsa de investigação para realizar a tese
de mestrado.
Recentemente foi descoberto um operão (ver Figura), conservado em bactérias anaeróbias e
essencial para que elas possam manter este modo de vida (na ausência deste operão a
divisão celular não é correcta).
No entanto, a função/estrutura das proteínas/enzimas codificadas por este operão ainda não é
conhecida, sabendo-se por estudos in vivo que estão envolvidas na divisão celular. Este
operão constitui portanto um novo sistema de divisão celular.
Uma das proteínas é a proteína Laranja, cuja estrutura já é conhecida, e que apresenta um
cluster heterometálico Cu-Mo que é único na natureza. O/a(s) aluno/a(s) irão caracterizar
bioquímicamente algumas das proteínas deste operão: o seu regulador da transcrição e uma
proteína ATPase que tem um novo centro Fe-S. O trabalho de investigação será efectuado
em colaboração com o laboratório no CNRS, Marseille, França, da Dr. Corinne Aubert.
OBJECTIVES
Assim, é proposto o isolamento heterólogo destas duas proteínas, e a sua caracterização
bioquímica, e enzimática. No caso do regulador da transcrição pretende-se descobrir qual o
sinal ambiental que irá induzir o início deste operão que é conservado neste tipo de bactérias.
A caracterização do regulador da transcrição irá incluir estudo por Real-Time PCR, interacção
com o DNA, e caracterização bioquímica.
No caso da proteína ATPases com um centro Fe-S pretende-se caracterizar as suas
propriedades bioquímicas e espectroscópicas, a sua interacção com a proteína laranja e as
suas propriedades enzimáticas como ATPase.
Desta forma, esperamos obter novas informações que nos permitam determinar como é que
este novo sistema de divisão celular funciona.
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MSc in Biochemistry
Dissertation Project – 2nd Cycle
Methodologies
Expressão heteróloga e homóloga de proteínas e sua purificação (diversas cromatografias),
espectroscopia de visível, determinação de estrutura por NMR, RT-PCR, actividades
enzimáticas.
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