Introdução à Bioinformática
Prof. Dr. Francisco Prosdocimi
Questionário inicial
• Apresentação
• Você já ouviu falar em bioinformática?
• O que é a bioinformática, no seu ponto de vista?
• Sobre o que trata a bioinfo?
• São precisos computadores
potentes e sequenciadores
de larga-escala para fazer
a bioinformática?
O que é a bioinformática?
• Desenvolvimento dos conceitos de ciência
• Plasticidade do desenvolvimento científico
• Exemplos:
– Análise de prognóstico para cárie baseado em
radiografias
– Estudos comportamentais através
de análises complexas de
dados de EEG
– Genômica comparativa
– Estrutura de proteínas
Sinônimos ou antônimos?
• Bioinformática, quimioinformática, neuroinformática
• Biologia computacional
• Genômica, transcriptômica, proteômica, lipidômica e outras
ômicas
• Algoritmos
• Análise estatística de dados
biológicos
• Biologia digital
• Biologia de sistemas
• Data mining
– Text mining
Sugestão?
• Todo o tipo de estudo ou de ferramenta que se
pode produzir para obter informação biológica
usando seqüências de biomoléculas
• Pouco importa...
• Definição pragmática
– Bioinformática é o que os bioinformatas fazem
O que queremos...
Systems
biology
Integrative
biology
O que faz um bioinformata?
• Abordagem pragmática
• No Brasil: faz tudo!
– Sabe utilizar, configurar e gerenciar sistemas
operacionais LINUX
– Sabe programar em uma ou mais linguagens de
programação
– Sabe utilizar e montar bancos de dados em larga
escala
– Tem um grande conhecimento em biologia
molecular, estatística
– Escreve o artigo, responde o revisor, consegue
dinheiro...
Área estratégica de pesquisa
• Os bancos de dados genômicos disponíveis gratuitamente na
internet hoje contêm mais informação biológica do que todos
os cientistas do mundo serão capazes de analisar, não
importa quanto tempo se dediquem
• Dados gratuitos e de qualidade
– Muitas vezes pobremente analisados: a corrida genômica
– Brasil: pra quê financiar pesquisas tão caras?
• Não seria melhor investir na educação?
• Tarefa do bioinformata: ser criativo e produtivo ao mesmo
tempo
– Não perde o tempo da produção do dado
– Economiza “50%” do esforço científico
• Faça da bioinformática o seu ócio criativo
• E vcs, o que fazem?