UNIVERSIDADE DA BEIRA INTERIOR Covilhã | Portugal Bioinformática omim Pedro Silveira nº25836 Bioengenharia – Bioinformática 2011/2012 1 Online Mendelian Inheritance in Man • O Online Mendelian Inheritance in Man é uma base de dados que cataloga todas as doenças humanas que tenham uma componente genética. • Quando possível faz a ligação dessas doenças aos respectivos genes; • OMIM é uma das bases de dados situadas nos EUA, no National Center for Biotechnology Information (NCBI). Bioengenharia – Bioinformática 2011/2012 2 Figura 1: Dr. Victor A. McKusick • O Mendelian Inheritance in Man foi iniciado no ano de 1960 pelo Dr. Victor A. McKusick e está disponível em livro actualmente na sua 12 ª edição; • A versão online do OMIM, foi criada em 1985 , ficando apenas disponível em 1987; • Em 1995, OMIM foi desenvolvido para a World Wide Web pelo NCBI ; • Actualmente o OMIM tem na sua base de dados mais de 12.000 genes. Bioengenharia – Bioinformática 2011/2012 3 O código OMIM • A cada doença e gene é atribuído um dígito com seis algarismos. O primeiro algarismo reflecte o tipo de hereditariedade. Tipo de hereditariedade Tabela 1: Código OMIM Bioengenharia – Bioinformática 2011/2012 4 Figura 2 :Pagina principal OMIM Bioengenharia – Bioinformática 2011/2012 5 BRCA1 Figura 3: Estrutura BRCA1 • BRCA1 ( cancro da mama, tipo1) é um dos genes humanos que pertence à classe de genes conhecida como genes supressores de tumores, ou seja regula o ciclo celular e previne a proliferação descontrolada da célula; • No caso do BRCA1 estar danificado aumenta o risco de aparecimento de cancro. Bioengenharia – Bioinformática 2011/2012 6 • O gene BRCA1 está localizado no braço (q) do cromossoma 17 na banda 21, a partir de pares de bases 38.449.840 para 38.530.994 pares de bases. Figura 4 :Localização do gene BRCA1 Bioengenharia – Bioinformática 2011/2012 7 Localização Número do gene OMIM no Bioengenharia – Bioinformática 2011/2012 Número do Fenótipo 8 FIM Bioengenharia – Bioinformática 2011/2012 9