fCIÊNCIAt
f CIÊNCIAt
Nº 6
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Editorial
Bem vindos de volta.
Espero que todos tenham aproveitado as férias da melhor forma possível.
Vista a quantidade de apresentações em congresso nestes meses acho que sim.
As notícias interessantes foram o habitual bloqueio da página da Fundação nos últimos
dias do prazo para submissão de projectos e a divulgação dos resultados das candidaturas a
bolsas de pós-doutoramento e doutoramento. Não foram atribuídas muitas bolsas mas
esperemos que este represente a volta à normalidade e regularidade destes concursos.
Nas Perguntas & Respostas temos a contribuição da Profª Leonor Cruzeiro do
Departamento de Física que nos mostra a visão de quem fez a maior parte da carreira
científica no estrangeiro.
Nestes dois meses tivemos onze publicações indexadas no “Web of Science” o que não é
totalmente satisfatório, mas se as vinte e três apresentações em congresso se traduzirem em
publicações os próximos meses devem ser produtivos. Gostaríamos de dar os parabéns ao
Prof. António Ruano que foi editor de uma edição especial do International Journal of Systems
Science. Este tipo de contribuições também é muito importante para afirmar a Universidade do
Algarve no âmbito da ciência.
Saudações Académicas,
José Paulo Pinheiro
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PERGUNTAS & RESPOSTAS
I&D
CV resumido da Professora Leonor Cruzeiro
Concluiu (com distinção) a licenciatura em Física, ramo de microfísica, da Faculdade de Ciências da Universidade de
Lisboa, em Março de 1981. Entre Abril de 1981 e Outubro de 1985 trabalhou no Instituto Gulbenkian de Ciências, em
Oeiras, sob a supervisão do Eng. Kelo Correia da Silva, primeiro como estudante estagiária e depois como assistente
de investigação. O tema era transporte passivo e activo através de membranas biológicas. De Outubro de 1985 a
Setembro de 1988 esteve no Laboratório de Física Matemática Aplicada da Universidade Técnica da Dinarmarca, como
estudante de doutoramento do Prof. Peter Christiansen, sendo os Prof. Ole Mouritsen e o Eng. Correia da Silva cosupervisores do doutoramento em “Solitons and a model for Active Transport”. O financiamento resultou de três
bolsas, a primeira de 7 meses, ao abrigo de um acordo cultural entre Portugal e a Dinamarca, a última foi de dois
anos, da Fundação Gulbenkian e uma bolsa de cinco meses que fez a ponte entre as outras duas, do Governo
Dinamarquês.
De Outubro de 1988 a Setembro de 1993 esteve no Birkbeck College, onde fez dois pós-doutoramentos: o primeiro
com o Prof. John Finney, sobre transferência de electrões em proteínas e o segundo com a Prof. Júlia Goodfellow
sobre a influência da metilação da timina sobre a estrutura e dinâmica do ADN. Em 1993, obteve uma Advanced
Fellowship do então Science and Engineering Research Council, UK, para estudar mecanismos de transferência de
energia em proteínas e ADN. Em Dezembro de 1998 foi para a Universidade de Heriot-Watt, em Edimburgo, para
estudar interacções de cargas com vibrações da rede, no âmbito de um modelo não-linear, com o Prof. Chris Eilbeck.
Foi também cientista visitante no Institute of Biophysics em Krasnoyarsk na Sibéria, em 1991, no departamento de
Física e Astronomia na Universidade de Albuquerque em New México, USA, em 1993 e no Osaka Institute of
Technology em Osaka, no Japão, em 1996. Finalmente, em Abril de 2000, regressou a Portugal, como professora
auxiliar na Universidade do Algarve, onde a actividade de ensino e gestão académica têm sido dominantes.
A sua área de especialização é a Biofísica e as suas abordagens envolvem geralmente a simulação numérica, tendo
escrito a maior parte dos programas que corre. Os modelos que tem usado vêm da Física Não Linear e da Física do
Estado Sólido. Os seus interesses actuais centram-se nos fenómenos mediados por proteínas, como os fenómenos
enzimáticos, a contracção muscular e as proteínas de transporte. Outros interesses são fenómenos da matéria
condensada, como os breathers em redes cristalinas não lineares e a supercondutividade a alta temperatura.
É membro de 7 sociedades científicas: a Sociedade Portuguesa de Física (desde os tempos de estudante), a Sociedade
Portuguesa de Bioquímica, a Sociedade Portuguesa de Biofísica, a British Biophysical Society, a European Physical
Society (Individual Ordinary Member), The European Exo/Astrobiology Network Association e a American Association
for the Advancement of Science. É revisor de várias revistas científicas: Physical Review Letters, Physical Review E,
Journal of Biological Physics e esteve envolvida na organização de 4 encontros científicos, 3 dos quais internacionais.
Foi coordenadora de 9 projectos e participante em outros 3. Tem 47 artigos publicados em revistas internacionais com
arbitragem, 7 em proceedings com arbitragem científica, 10 outras contribuições em revistas com arbitragem
científica, 2 artigos por convite e 11 artigos em livros e proceedings. Deu 25 conferências por convite, além de 60
comunicações orais ou em painel.
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P&R
1. Defina a sua área de investigação.
A minha área principal de investigação é a Biofísica, entendida como a aplicação de conceitos e teorias
físicas a sistemas biológicos. Além desta, tenho umas áreas de investigação secundárias, como a Física do
Estado Sólido e a Física Não Linear.
2. Qual a recordação mais agradável da sua investigação?
Para mim, o prazer da investigação é o prazer da descoberta. Algo que começa por se sentir enquanto
estudante quando, após algum esforço, de repente, a mente se ilumina com a compreensão de um aspecto
até então obscuro. A investigação proporciona estes momentos várias vezes e todos eles são imensamente
agradáveis. Por exemplo, gosto do trabalho lógico, de detective, que é preciso fazer para detectar bugs em
programas de computador e em particular, neste momento, gosto das ideias que estou a tentar
desenvolver sobre como funcionam as proteínas.
3. Qual a recordação mais desagradável da sua investigação?
Os momentos desagradáveis têm estado relacionados com a manifestação, que não deixa nunca de me
surpreender, do conservadorismo científico de alguns cientistas.
4. Qual o rumo presente da sua investigação?/Em que é que está interessado agora?
Aquilo que mais me interessa neste momento é provar ou refutar a ideia de base da investigação que faço
em proteínas, e a que chamei a hipótese VES (abreviatura de Vibrational Excited States), segundo a qual a
formação da estrutura nativa das proteínas e as mudanças de conformação que elas sofrem para realizar as
suas funções resultam do uso de energia armazenada sob a forma de um modo normal de vibração dos
grupos peptídicos, chamado Amido I. A investigação que faço mostra que as proteínas são meios
excelentes para o armazenamento e propagação de energia sob esta forma. O Paulo Silva, que está a
terminar o doutoramento, anda a explorar modelos que possam demonstrar a forma como esta energia
pode ser usada para gerar mudanças de conformação nas proteínas. Quem quiser saber mais pode ver o
site http://w3.ualg.pt/~lhansson.
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5. Qual foi a descoberta/invenção que mais o impressionou nos últimos tempos?
Nos últimos tempos não foram os avanços científicos que mais me impressionaram e sim os avanços
técnicos: técnicas experimentais de manipulação individual das moléculas biológicas, como as pinças
ópticas (optical tweezers) e o microscópio de força atómica; técnicas experimentais para arrefecer sistemas
(laser
cooling)
que
permitem
realizar
condensados
de
Bose-Einstein
no
laboratório;
técnicas
espectroscópicas ultra-rápidas e sofisticadas que permitem seguir temporalmente reacções químicas e até
interferir na evolução das funções de onda dos sistemas; a extracção e uso de células estaminais e as suas
possíveis aplicações médicas.
6. Quais as suas colaborações internacionais mais activas neste momento?
Tenho uma colaboração com o grupo de Física Não Linear da Universidade de Sevilha para investigar a
influência de efeitos térmicos nas proteínas e uma outra colaboração com o Prof. Chris
Eilbeck, da
Universidade de Heriot-Watt em Edimburgo para investigar uma teoria da Física Não Linear sobre a
supercondutividade a alta temperatura.
7. Como avalia o impacto dessas colaborações no seu trajecto científico?
Outro dos privilégios de fazer investigação é a participação nestas colaborações que não só contribuem
para que o progresso seja mais rápido, como tornam o trabalho mais agradável. Gostaria também de ter
colaborações com experimentalistas (bioquímicos e espectroscopistas) para testar experimentalmente
algumas previsões dos modelos de funcionamento das proteínas.
8. Quais os maiores obstáculos ao desenvolvimento da sua investigação?
Nos últimos seis anos, os maiores obstáculos têm sido três: falta de tempo, falta de tempo e… falta de
tempo.
9. Como é que a Faculdade o pode ajudar a vencer esses obstáculos?
Pode promover a contratação de mais docentes para o departamento de Física. Pode promover a fusão das
três Faculdades de Ciências existentes na Universidade do Algarve (a FCMA, a FERN e a FCT) numa só
faculdade, com todos os físicos num departamento de Física, todos os matemáticos num departamento de
Matemática e assim sucessivamente. Penso que a consequente diminuição de cargos e reorganização do
serviço docente seriam, por si só, uma grande ajuda.
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10.Considera
que
a
sua
investigação
pode
ser
aplicável
em
projectos
de
desenvolvimento tecnológico?
Espero bem que sim! As proteínas são as máquinas da vida, o seu mau funcionamento está relacionado
com a maior parte das doenças e a compreensão sobre a forma como funcionam é fundamental para as
indústrias farmacêutica e biotecnológica. Devo no entanto confessar que pertenço à velha escola segundo a
qual o conhecimento tem um valor inestimável em si próprio e não precisa de ter aplicações à vista para se
justificar.
11.
Sugira o próximo membro da FCT a entrevistar, mas que não seja do seu
Departamento.
Stefan Samko.
Comentário
12. Como gostaria de ver a Faculdade/Universidade evoluir nos próximos 5 anos?
Já respondi parcialmente a esta pergunta na minha resposta à pergunta 9, ou seja, penso que seria uma
boa ideia que na Universidade do Algarve não existissem três pequenas faculdades de ciências a competir
entre si e que tudo funcionaria melhor se remássemos todos na mesma direcção no âmbito de uma única
faculdade de maior dimensão.
6
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ARTIGOS PUBLICADOS EM REVISTAS INTERNACIONAIS
Título
Autores
Special issue on the 6th
Editorial
Revista
Ruano AE
INTERNATIONAL JOURNAL OF
Portuguese Conference on
SYSTEMS
Automatic
493-494 JUN 20 2006
Control
SCIENCE
37
(8):
(Controlo 2004)
1
Time-variable
blood
flow
averaged waveforms
Leiria A, Moura MMM, Evans DH,
INTERNATIONAL JOURNAL OF
Ruano MG
SYSTEMS
SCIENCE
37
(8):
493-494 2006
2
Neural
network
approach
to
collision free path-planning for
Pashkevich
A,
Kazheunikau
M,
Ruano AE
robotic manipulators
3
The
general
computer
analysis
are
SYSTEMS
SCIENCE
37
(8):
555-564 2006
purpose
and
INTERNATIONAL JOURNAL OF
analog
computable
two
Bournez O, Campagnolo ML, Graca
LECTURE
DS, Hainry E
COMPUTER
equivalent
NOTES
IN
SCIENCE
3959:
631-643 2006
paradigms of analog computation
4
The effect of pre-adsorbed atoms
Barros RB, Garcia AR, Iharco LM
on the reactivity of methanold(4) on Ru(001):
SURFACE SCIENCE 600 (12):
2425-2433 2006
Comparison
between hydrogen and oxygen
5
Correlations and discreteness in
Armesto N, Milhano JG
nonlinear QCD evolution
6
Art. No. 114003 2006
The effect of water related traps
Gomes HL, Stallinga P, Colle M,
JOURNAL OF NON-
on the reliability of organic based
Biscarini F, de Leeuw DM
CRYSTALLINE SOLIDS 352 (9-
transistors
7
20): 1761-1764 2006
Surface
photochemistry:
benzophenone as a probe for the
study
of
silica
and
Ferreira LFV, Machado IF, Da
PHOTOCHEMICAL &
Silva JP, Branco TJF
PHOTOBIOLOGICAL
reversed-
SCIENCES 5 (7): 665-673
phase silica surfaces
8
PHYSICAL REVIEW D 73 (11):
Amodiaquine
2006
resistant
Plasmodium falciparum malaria
in
vivo
is
associated
with
Holmgren G, Gil JP, Ferreira PM,
INFECTION GENETICS AND
Veiga MI, Obonyo CO, Bjorkman A
EVOLUTION 6 (4): 309-314
2006
selection of pfcrt 76T and pfmdr1
86Y
7
fCIÊNCIAt
9
10
PLD
of
Fe3O4
thin
films:
Parames
ML,
Mariano
N,
252 (13): 4610-4614 2006
Viskadourakis
surface
Rogalski MS, Giapintzakis J, Conde
and
magnetic properties
O
Braneworlds and dark energy
Neves R, Vaz C
Popovici
APPLIED SURFACE SCIENCE
Influence of background gas on
morphology
Z,
J,
JOURNAL OF PHYSICS AMATHEMATICAL AND GENERAL
39 (21): 6617-6625 2006
11
Evaluation of thermal comfort in
Conceicao
EZE,
Lucio
slightly warm ventilated spaces
Lourenco TMC, Brito AIPV
MMJR,
HVAC&R RESEARCH 12 (3):
451-475 2006
in nonuniform environments
APRESENTAÇÕES
Evento
Título da Apresentação
11th Marcel Grossmann Meeting on
Gravity
General Relativity
symmetry breaking
13º International Humic Substances
Speciation
Society Meeting
Complexes with Humic Matter by
Stripping
from
Autores
Analysis
of
Metal
Chronopotentiometry
Scanned
Deposition
(SSCP):
Complex
spontaneous
Diffusion
Stability
V.A. Kostelecký e R. Potting
Rocio Lopéz, Rute Domingos,
José Paulo Pinheiro
at
Potential
Coefficients,
and
Dynamic
Information
13th ILAS Conference
On the commutativity of arbitrary
Maria da Graça Marques e
matrix patterns
Charles R. Johnson
18th IUPAC Conference on Physical
Reductive
Cleavage
of
Maria de Lurdes S. Cristiano
Organic Chemistry
Heteroaromatic
Naphthyl
Ethers:
Nuna Araújo Paula Pena Luís
Structural Effects on Reactivity
Frija
19th International symposium on Gas
The ground state water molecule
J. Brandão, C. M. A. Rio e W.
Kinetics
and the reactions O(1D)+H2/D2/HD
Wang
and
H+OD
that
occur
in
this
system
30st
Annual
Meeting
of
the
The student teacher and the others:
Nélia
International Group for the Psychology
multimembership on the process of
Carreira
of Mathematics Education (PME 30).
introducing
technology
in
Amado
Susana
the
classroom
8
fCIÊNCIAt
7th Conference on Real Numbers and
The ordinary differential equation
Daniel S. Graça, Ning Zhong,
Computers (RNC'7)
defined by a computable function
Jorge Buescu
whose maximal interval of existence
is non-computable
8th
European
Biological
Inorganic
Chemistry Conference
Decavanadate
interactions
with
actin inhibit G-polymerisation
Susana
Ramos,
Miguel
manuel, Teresa Tiago, Rui O.
Duarte, Jorge Martins, Carlos
Gutiérrez-Merino,
José
J.G.Moura, Manuel Aureliano
8th
European
Biological
Inorganic
Chemistry Conference
Decavanadate
effects
on
cardiac
and hepatic mitochondria
Sandra S. Soares, Josefina
Coucelo,
Carlos
Gutiérrez-
Merino and Manuel Aureliano
8th
European
Biological
Inorganic
Chemistry Conference
Decameric
vanadate
stabilization
upon binding to target proteins
Teresa Tiago, Susana Ramos,
Migel Manuel, Jorge Martins
carlos Gutiérrez-Merino and
Manuel Aureliano
8th
European
Biological
Inorganic
Chemistry Conference
Vanadate
oligomers
affect
fish
mineralization in vitro
Daniel
M.
Tiago,
Vincent
Laizé, Manuel Aureliano and
M. Leonor Cancela
Category Theory Conference
Cohomology without projectives
Diana Rodelo
COMPSTAT'06
The Bootstrap Methodology in time
Clara
series forecasting
Manuela Neves, UTL
The Application of PLS, Bootstrap
Clara
and Time Series methods to infer
Alexandra Machás, IPL
COMPSTAT'06
the
efficiency
of
Marketing
Cordeiro,
Ualg
Cordeiro,
M.
Ualg
and
Communication activity.
European
Bioinorganic
Chemistry
Conference
Electron
paramagnetic
resonance
Andreia S. Fernandes Filipa L.
studies of the iron-sulfur centers
Sousa
Miguel
from complex I of Rhodothermus
Manuela M. Pereira
Teixeira
marinus
IEEE
World
Congress
on
Computational Intelligence
An
Improved
Algorithm
for
Dimension-Sweep
the
Hypervolume
Indicator
ILAS 2006
On
the
algorithm
Carlos
M.
Paquete
Fonseca
Luis
Manuel
López-
Pires
Viktor
Ibáñez
block
for
Complementarity
principal
the
Problem
pivotal
Marília
Linear
Kravchenko
with
strictly diagonal dominant matrix
International Conference on Science
'Modeling electrical characteristics
and Technology of Synthetic Metals
of thin-film field-effect transistors',
P. STallinga, H.L. Gomes
9
fCIÊNCIAt
(ICSM)
'Metal contacts of thin-film fieldeffect
transistors',
dependence
'Temperature
of
characteristics
of
electrical
thin-film
field-
object
role
effect transistors'
IPMU'06
Formalizing
fuzzy
António Rosado, Rita Ribeiro
modeling schemas in the FConQuer
system
PIERS 2006
An
Antenna
Propagation
Array
of
Aproach
for
António M.E.S. Casimiro
Electromagnetic
Waves in Different Media
The 11th International meeting on
”Interaction between biological cells
H.L Gomes, P. Stallinga, R.B.
chemical sensors
monitored
Leite L. Cancela.
by
microelectrode
impedance techniques”, e Thin film
organic
transistors
sensors
for
as
nitro
chemical
aromatic
compounds
UDT 06
AOB
-
Acoustic
Oceanographic
Buoy: concept and feasibility
S.M. JESUS, C. SOARES, A.
SILVA, J.-P. HERMAND and E.
COELHO
XIX
International
Conference
Physical Organic Chemistry
on
Reductive
Cleavage
of
Maria de Lurdes S. Cristiano
Heteroaromatic
Naphthyl
Ethers:
Nuna Araújo Paula Pena Luís
Structural Effects on Reactivity
Frija
PARTICIPAÇÕES EM JÚRIS
Doutoramento: Vítor Manuel Basto Fernandes, 13 de Julho de 2006, Universidade do Minho, Portugal- Prof.
Doutor Vasco Freitas
Doutoramento: Ana Godoy, 18 de Julho de 2006, Facultad de Química da Universidade de Santiago de
Compostela, Espanha- Prof. Doutor José Moreira
10