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UTILIZAÇÃO DE ENSAIOS VIRTUAIS PARA A IDENTIFICAÇÃO DE
MOLÉCULAS DE ORIGEM VEGETAL COM POTENCIAL INIBIDOR FRENTE
A BETACETOACIL SINTASE DO Mycobacterium tuberculosis
THIAGO FERREIRA NASCIMENTO MIRANDA1; MANOELITO COELHO DOS
SANTOS JUNIOR1
1 LABORATÓRIO
DE MODELAGEM MOLECULAR, UNIVERSIDADE
ESTADUAL DE FEIRA DE SANTANA
Introdução: A diversidade estrutural das moléculas oriundas de fontes vegetais
torna os mesmos como promissoras fontes para ensaios farmacológicos. A
utilização de ferramentas virtuais torna possível simular as interações de várias
moléculas em um curto espaço de tempo. O ponto de partida estudos de
descoberta de fármacos é a escolha do alvo molecular, assim, a escolha desse
trabalho foi a enzima chave Betacetoacil sintase (MtBCeS) do Mycobacterium
tuberculosis (agente etiológico da tuberculose), esta enzima atua na etapa
limitante na síntese de ácidos micólicos. Objetivos: Identificar compostos
oriundos de fontes vegetais com potencial inibidor da MtBCeS do M.
tuberculosis. Métodos: A etapa inicial para a triagem virtual foi a seleção do
banco de dados, assim, foi utilizado o NatProDB, que é um acervo de
estruturas químicas extraídas de vegetais do semiárido baiano. A estrutura da
MtBCeS foi extraída do Protein Data Bank (4C6X) e preparada no programa
Chimera 1.8.1 (módulo dockprep). Utilizando o programa DOCK 6.5 foi avaliado
o grau de interação entre as moléculas do NatProDB e a enzima alvo, para isso
os seguintes parâmetros foram utilizados: raio de acoplamento=8Å, caixa de
acoplamento=5Å, função de pontuação: GRIDSCORE+HAWKINS GB/SA.
Resultados: Das 530 moléculas depositadas no NatProDB, apenas 391
moléculas foram selecionadas pelo DOCK 6.5. A molécula metil-2-hidroxi-6eicosil-4-methoxibenzoato (-54,88 kcal/mol) foi a mais bem pontuada, esta
molécula é oriunda da espécie Schinopsis brasiliensis, família das
Anacardiaceae. O complexo formado entre a molécula mais bem raqueada e a
enzima mostrou principalmente interações do tipo hidrofóbica, foi possível
observar também uma interação de hidrogênio do tipo doadora entre a hidroxila
do grupamento benzoato do ligante e uma amina da Phe401.Conclusões: A
utilização da triagem virtual possibilitou selecionar moléculas que possam
futuramente serem utilizadas em estudos in vitro para a inibição da MtBCeS, as
próximas etapas do trabalho tem por objetivo obter as moléculas com melhor
ranqueamento para estudos de inibição.
Palavras-chave: Vegetal; Ensaio Virtual; NatProDB.
Apoio Financeiro: PROBIC/UEFS.