Software Agilent MassHunter BioConfirm
Qualitative Compound Report
CARACTERIZAÇÃO APRIMORADA
DE PEPTÍDEOS E PROTEÍNAS
Data File
Intact_MyoglobinNewMyo-010012.d
Sample Name
NewMyo-01
Sample Type
Sample
Position
P1-B-03
Instrument Name
MH Instrument
User Name
wadmin
Acq Method
Intact_MyoglobinNovartis.m
Acquired Time
3/4/2014 2:08:13 PM
IRM Calibration Status
Success
DA Method
BioConfirmIntactProteinHighMass-Default.m
Comment
Column2
Sample Group
IntProt
Column3
Column2
Info.
Column3
Protein Sequence
horse_myo.txt
Mod Profile
||| Myo
Mass
16951
Protein Sequence 1
Myoglobin2.psq
Mod Profile1
||| Phospho&Ox
Mass1
16951
Custom
A,B,C
Custom1
test
Walkup Method
Description
Intact Acq + Myo-DA
Stream Name
S1
Acquisition SW
Version
6200 series TOF/6500 series
Q-TOF B.06.00 (B502)
Compound Table
Mass
16951.778
Sequence Name
Target Mass
Myoglobin (horse)
Delta ppm
16951.6073
10.07
Height
201650689
MinZ
MaxZ
6
18
Z Count
Fit Score
13
Uncertainty
0
Significance
0.05
Algorithm
100
# Hits
Peak Modeling Deconvolution
3
Spectrum
Spectrum
Algorithm
Peak Modeling Deconvolution
Mass
16951.778
Sequence Name
Myoglobin (horse)
MS Spectrum
MS Spectrum Peak List
m/z
Calc m/z
Diff(ppm)
z
Abund
998.1989
998.1704
-28.52
17
1060.5234
1060.4931
-28.53
16
64051.1
1131.1578
1131.1255
-28.53
15
121533.45
23654.5
1211.8829
1211.8483
-28.53
14
159260.59
1305.0272
1304.9899
-28.53
13
169176.91
1413.6955
1413.6552
-28.53
12
153094.25
1542.1217
1542.0777
-28.53
11
129325.84
Target mass
16951.6073
Delta ppm
10.07
MinZ
6
MaxZ
18
Z Count
13
Fit Score
0
Uncertainty
0.05
Significance
100
Rule
Intact pro
SOFTWARE AGILENT MASSHUNTER BIOCONFIRM
VISLUMBRE MAIS CONFIANÇA EM SUA
CARACTERIZAÇÃO DE PROTEÍNAS E PEPTÍDEOS
O sofisticado software Agilent MassHunter BioConfirm oferece mais confiança em suas
análises de proteínas e peptídeos. Juntamente com os sistemas (LC/MS) de cromatografia
líquida/espectrometria de massas de alto desempenho da Agilent, ele fornece uma solução
inteligente para a rápida confirmação de peptídeos sintéticos e caracterização de proteínas
e peptídeos. Agora é possível valorizar sua descoberta confirmando seus dados com
confiança e facilidade.
O software BioConfirm oferece:
• Confirmação rápida e precisa de proteínas
• Análise de lote a lote mais fácil
•Mapeamento abrangente
de peptídeos
2
VISLUMBRE A CONFIRMAÇÃO PRECISA DE PROTEÍNAS
O BioConfirm fornece deconvolução clássica por entropia máxima e modelagem de pico otimizada
(pMod) para determinar o peso molecular de proteínas intactas.
Fluxo de trabalho de proteínas intactas
Qualitative Compound Report
Data File
Intact_MyoglobinNewMyo-010012.d
Sample Name
NewMyo-01
Sample Type
Sample
Position
P1-B-03
Instrument Name
MH Instrument
User Name
wadmin
Intact_MyoglobinNovartis.m
Acq Method
Success
IRM Calibration Status
Protein Sequence
Mass
Mod Profile1
Custom
3/4/2014 2:08:13 PM
BioConfirmIntactProteinHighMass-Default.m
Column3
Column2
Info.
Column3
horse_myo.txt
Mod Profile
||| Myo
Protein Sequence 1
Myoglobin2.psq
Mass1
16951
16951
||| Phospho&Ox
A,B,C
Custom1
test
Stream Name
S1
Walkup Method
Description
Intact Acq + Myo-DA
Acquisition SW
Version
6200 series TOF/6500 series
Q-TOF B.06.00 (B502)
Compound Table
Mass
Acquired Time
DA Method
IntProt
Comment
Column2
Sample Group
Sequence Name
16951.778
Target Mass
Myoglobin (horse)
Delta ppm
16951.6073
Height
10.07
MinZ
201650689
MaxZ
6
18
Z Count
Fit Score
13
Uncertainty
0
Significance
0.05
Algorithm
100
# Hits
Peak Modeling Deconvolution
Data File
3
Rule
Intact_MyoglobinNewMyo-010012.d
Intact protein
Spectrum
Spectrum
Algorithm
Peak Modeling Deconvolution
Adquirir dados
Integrar e
extrair com MS
Combinar
sequências
de proteínas
e prever PTMs
Deconvolutar
Mass
16951.778
MS Spectrum Peak List
Calc m/z
Diff(ppm)
z
Delta ppm
10.07
MinZ
6
MaxZ
18
Z Count
13
Fit Score
0
Uncertainty
0.05
Significance
100
Rule
Intact protein
Abund
998.1989
998.1704
-28.52
17
1060.5234
1060.4931
-28.53
16
64051.1
1131.1578
1131.1255
-28.53
15
121533.45
1211.8829
1211.8483
-28.53
14
159260.59
1305.0272
1304.9899
-28.53
23654.5
13
169176.91
-28.53
12
153094.25
1542.1217
1542.0777
-28.53
11
129325.84
1696.2332
1696.1848
-28.54
10
76638.5
1884.5917
1884.5379
-28.54
9
32788.9
2120.0398
2119.9793
-28.54
8
13695.6
1413.6955
Target mass
16951.6073
Gerar
relatórios
MS Spectrum
m/z
Sequence Name
Myoglobin (horse)
1413.6552
--- End Of Report ---
A deconvolução por entropia máxima
fornece rápida resolução de massas,
especialmente para misturas de proteínas
simples. Para misturas de proteínas
complexas, o algoritmo otimizado pMod
remove artefatos do espectro e ajuda a
resolver a sobreposição de picos, mesmo
as sobreposições mais severas, fornecendo
espectros mais limpos e medição de massas
mais precisa. Isso permite a confirmação
rápida de sequências e modificações de
proteínas intactas.
x104
3.2
2.8
2.4
2.0
1.6
1.2
0.8
0.4
0
x106
2.8
2.4
2.0
1.6
1.2
0.8
0.4
0
Printed at: 3:13 PM on:3/14/2014
Page 1 of 1
(a) Máximo
144947.23
145107.68
145268.27
144786.27
145583.41
144582.58
(b) Modelagem de pico
144946.75
145106.77
144783.28
144600
145265.67
144800
145000
145200
Contagens vs. Massa deconvoluída (amu)
145400
145600
Espectros deconvoluídos. (a) Máxima entropia para espectro deconvoluído. (b) Modelagem de pico para
espectro deconvoluído.
3
VISLUMBRE UMA PODEROSA CAPACIDADE
DE MAPEAMENTO DE PEPTÍDEOS
O BioConfirm fornece processamento aprimorado de dados de MS para mapeamento
racionalizado e interpretação de dados.
Fluxo de trabalho do mapeamento de peptídeos
Adquirir dados
Combinar
sequências
de proteínas e
identificar PTMs
Extrair
compostos
O BioConfirm identifica peptídeos e PTMs
baseado em massas de peptídeos e íons
produto (b, y, e íons imônio) nos espectros
de MS/MS. Isto permite um processamento
mais rápido e racionalizado de dados MS/
MS para o mapeamento de peptídeos.
Visualizar
cobertura da
sequência
Gerar
relatórios
x104
7.2
6.6
6.0
5.4
4.8
4.2
3.6
3.0
2.4
1.8
1.2
0.6
0
100
200
300
400
500
600
700
800
Contagens vs. Massa/Carga (m/z)
4
Atribuição de íon produto do espectro de MS/MS de peptídeos.
900
1,000
1,100
VISLUMBRE UMA COMPARAÇÃO
FÁCIL DE LOTE A LOTE
O BioConfirm fornece uma comparação visual fácil entre amostras, permitindo a análise rápida
de lote a lote em níveis de proteínas e peptídeos.
A funcionalidade do gráfico espelhado
permite a comparação rápida e confiável
de duas amostras, assim como dois lotes
de uma proteína projetada ou biossimilares,
uma parte essencial da análise biofarmacêutica. As amostras podem ser alternadas
de forma rápida no gráfico espelhado, sem
reprocessamento dos dados.
x103
2.4
1.8
1.2
0.6
0
-0.6
Monitoramento de biossimilares
e variação de lote a lote
comparando amostras e
referências rapidamente
-1.2
O módulo de análise comparativa
facilita a identificação e visualização das
diferenças entre os dois lotes de dados
para fácil inspeção. As amostras podem ser
comparadas com uma referência utilizando
cromatogramas, MS, e espectros de MS/MS.
-3.6
-1.8
-2.4
-3.0
147100
1474000
147700
148000
148300
148600
Contagens vs. Massa deconvoluída (amu)
148900
Gráfico espelhado de duas proteínas projetadas.
x102
0.8
x102
1.05
0.9
0.75
0.6
0.45
0.3
0.15
0
0.5
0.2
-0.1
x102
0.8
100
0.5
400
700
1,000
1,300
100
400
700
1,000
1,300
Contagens vs. Massa/Carga (m/z)
0.2
-0.1
300
450
600
750
900
1050
1,200
1,350
1,500
1,650
Resultados de comparação do espectro de MS/MS.
Contagens vs. Massa/Carga (m/z)
Resultados de comparação do espectro de MS.
5
VISLUMBRE A ANÁLISE DE GLICANOS
DE mAb DE FORMA RÁPIDA E PRECISA
O BioConfirm fornece um fluxo de trabalho fácil e efetivo para a análise de glicanos de anticorpos
monoclonais.
Fluxo de trabalho de glicanos de anticorpos monoclonais
N
Adquirir dados
Extrair compostos
Pesquisar banco
de dados e identificar
glicanos
O BioConfirm permite aos usuários identificar e visualizar precisamente estruturas de glicanos
em suas amostras de anticorpos monoclonais usando o PCD (Personal Compound Database,
banco de dados de compostos pessoais) de glicanos da Agilent e modificações predefinidas
de glicanos abrangentes. Usando o mAb-Glyco Chip da Agilent, os clientes obtêm um fluxo de
trabalho abrangente para análises de glicanos incluindo hardware, software, e consumíveis.
Um completo fluxo de trabalho que inclui desglicosilação on-chip de anticorpos monoclonais,
assim como o enriquecimento, a separação cromatográfica e a detecção dos glicanos
clivados. Todas as atividades, incluindo o processamento de dados usando o BioConfirm,
podem ser concluídas em menos de 15 minutos.
6
Calcular
porcentagem e
gerar relatório
VISLUMBRE UMA ANÁLISE DE ACOMPANHAMENTO
PARA USUÁRIOS INEXPERIENTES
O BioConfirm é parte da solução MassHunter Walkup da Agilent.
Envio de amostras em três passos fáceis
1
Login
2
3
Inserir informações
da amostra
Colocar vial no ALS
(amostrador automático
de líquidos)
Relatórios
entregues à caixa
de entrada de
e-mails
O MassHunter Walkup fornece uma interface fácil de usar, que oferece aos usuários
iniciantes a capacidade de analisar amostras de proteínas e peptídeos em três passos
fáceis com um mínimo de treinamento. Os usuários não precisam se preocupar com
condições de espectrometria de massas complexas; em vez disso, podem executar suas
amostras com a aquisição e métodos de processamento de dados. Os resultados são
enviados diretamente aos seus e-mails.
7
Saiba mais
www.agilent.com/chem/masshunter
Encontre um centro de atendimento local ao cliente Agilent
www.agilent.com/chem/contactus
Brasil
0800-728-1405
[email protected]
Europa
[email protected]
Ásia-Pacífico
[email protected]
Somente para uso em pesquisas. As informações, descrições e especificações nesta
publicação estão sujeitas a mudanças sem aviso prévio. A Agilent Technologies não
será responsável por erros contidos neste documento ou por danos incidentais ou
consequenciais em relação ao fornecimento, desempenho ou uso deste material.
© Agilent Technologies, Inc., 2014
Publicado nos Estados Unidos, 07 de abril de 2014
5991-3643PTBR