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Swiss-Prot Brasil:
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Estado da arte e perspectivas futuras
Claudia B. Monteiro-Vitorello
Swiss-Prot/LABINFO/LNCC
1
1
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National Laboratory of Scientific Computation (LNCC)
Ministry of Science and Technology (MCT)
 The National Council for Scientific and
Technological Development (CNPq) - foundation
linked to MCT, to support Brazilian research.
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Petrópolis, Rio
de Janeiro
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2
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• Started August 1 , 2004
st
4 annotators:
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• Claudia nível
B. Monteiro-Vitorello
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• Marisa Fabiana Nicolas
• Luciane
Prioli Ciapina
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The Human Proteomics Iniciative
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Proteome
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The Virus Annotation Project
5
5
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ofto
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microbial
proteomes
in style
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6
6
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Brazil
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adaptation of pathogenic bacteria.
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Staphylococcus
aureus
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7
7
GLOBAL REGULATION OF Staphylococcus aureus VIRULENCE FACTORS
sarH1
lytS-lytR
sar locus
arlS-arlR
rot
saeS-saeR
mgrA
P2
R
P3
P1
S
sarA
sarC
sarB
?
RNA III
B
P3
Cell
membrane
D
C
sarR
A
P2
cna
arg locus
RNA III
Antigens
Enzymes
sspC
fnbB
Toxins
Staphostatin B
Collagen adhesin
nuc
lip
fibronectin-binding protein
nuclease
spa
lipase
protein A
sspA, sspB
hla, hld, hlg
clfA,cflB
serine - cysteine
protease
hemolysin
clumping factor
Virulence factor genes
www.hamapbrazil.lncc.br
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SIB, EBI
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Amos
isb-sib.ch
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lncc.br
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CLAUDIA
MARISA
LUIZ
LUCIANE
LNCC
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10
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Perspectivas futuras:
Anotação de proteínas de protozoários patogênicos:
 Plasmodium falciparum
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 Leishmania
Trypanosoma
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Third level
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Fourthnível
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nível
Fifth level
12
12
Tritryps
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Dra. Angela Cruz – USP/Riberão Preto
Dr. Samuel Goldenberg – Instituto de Biologia Molecular do Paraná, FIOCRUZ.
Theileria
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Dr. Trushar Shah - The International Livestock Research Institute (ILRI), Kenya.
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Swiss-Prot
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Fourthnível
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Anotação de proteinas de protozoários patogênicos
13
13
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Fifth level
14
14
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Perspectivas futuras