Huntington Disease
André Silva, João Ferrinho, Pedro Matos
{2121518,2121519,2121520}@my.ipleiria.pt
Abstract
Results
Conclusions & Perspectives
3.1 Gene
De acordo com a informação da base dados Genecards verificamos
que este localiza-se no cromossoma 7: 27,676,440 - 27,743,605, que
é composto por 11 ortólogos e 3 paralógos. Já no Emsembl
verificamos que o número de ortólogos sobe para 53.
3.1.1 Variabilidade genética
Introduction
Huntington disease (HD) is an autosomal dominant progressive
neurodegenerative disorder which causes a progressive and
selective neural cell loss and atrophy in the caudate and
putamen, leading to:
● Chorea (abnormal involuntary movement disorder)
● Dystonia (neurological movement disorder)
● Loss of coordination
● Cognitive Decline
● Behavioral difficulties
Currently, there is no treatment able to stop the course of the
Huntington's disease events. However, it may be possible to prevent
the death of brain cells. In fact, Borrell-Pages et al. (2006)
found
that
treatment
with
cystamine,
a transglutaminase inhibitor,
increased levels of BDNF (and levels of Hsj1b) in mouse neuronal
cells (in a mouse with HD) and showed a neuroprotective effect.
Treatment of rodent and primate models of HD with cystamine and
cysteamine resulted in a transient increase in peripheral blood levels
of BDNF in these animals.
Therefore, it is important to identify, study and characterize the
BDNF gene in order to fully understand its importance.
Através da base dados GeneCards, verificamos que o gene BRAF é
composto por 883 mutações (SNPs). Dado que praticamente todos os
SNIP’s estão incluídos no grupo dos intrões, estes não vão fazer
diferença para a tradução da proteína.
Após a pesquisa dos SNIP’s na base dados GeneCards, decidimos
pesquisar mais sobre um deles que é do tipo missense, na base
dados dbSNP, com a referência rs8192466. Com base na figura
retirada da base dados dbSNP, podemos ver que ouve uma troca de
uma citosina (C) para uma timina (T), o que fez com que houvesse
nos aminoácidos de uma Treonina [Thr] para uma Isoleucina [Ile]. Isto
faz com o funcionamento da proteína possa ser comprometido.
2.1.2 Gene / transcritos – sequências
2 Methods
2.1 Gene
Para conhecer melhor o gene utilizou-se o GeneCards com base no
nome do gene BDNF e Emsembl com acession number
ENSG00000176697. Nestes podemos identificar a localização, os
transcripts e as mutações entre outras informações.
O gene tem 20 transcriptos
3.1.3 Estrutura do gene (intrões/exões)
2.1.1 Variabilidade genética
A variabilidade genética mede a tendência dos diferentes alelos de um
mesmo gene variarem entre si, numa dada população.
Para podermos analisar essas variabilidades do gene, podemos usar a
base de dados do GeneCards no tópico “Genomic Variants”.
Para poder ver mais detalhadamente sobre cada um dos SNIP’s,
usamos a ferramenta dbSNP do NCBI, pois a partir desta podemos ver
as alterações que ocorreram nos alelos e as posições onde elas
ocorrem.
2.1.2 Gene / transcritos – sequências
Seguindo o link para a base de dados Esembl
2.1.3 Estrutura do gene (intrões/exões)
2.2 Protéina
Pronº de identificação (UniProt) – isoform/domínios (…)
3.2 Proteina,
nº de identificação (UniProt) – isoform/domínios (…)
Nº de identificação UniProt: P23560
Isoformas: 5
References
1.
2.
Borrell-Pages, M., Canals, J. M., Cordelieres, F. P., Parker, J.
A., Pineda, J. R., Grange, G., Bryson, E. A., Guillermier, M.,
Hirsch, E., Hantraye, P., Cheetham, M. E., Neri, C., Alberch, J.,
Brouillet, E., Saudou, F., Humbert, S. Cystamine and
cysteamine increase brain levels of BDNF in Huntington
disease via HSJ1b and transglutaminase. J. Clin. Invest. 116:
1410-1424, 2006.
R. PRIMACK, “Essentials of Conservation Biology,” 4th Edition,
2006.