2011/2012
“Drug2Gene reports relations (i.e. binding) between genes/proteins
and drugs/compounds including bioactivity data where available.”
É uma base de dados que
fornece informação sobre as
relações entre genes/proteínas e
drogas(fármacos)/compostos, e se
disponível sobre a bioactividade.
A informação desta base de dados é proveniente de 18 bases de dados
públicas:
CGDCP
NCBI Gene
ChEBI
Orthology Calculated
ChEMBL
PDBsum
CTD
PDSP_Ki
Drugbank
PharmGKB
HGNC
PubChem Compound
IUPHAR
PubChem Substance
Ligand Expo
TTD
MICAD
Uniprot
Permite ao utilizador:
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Actualizar as relações (entre o gene/proteína e
droga/composto).
Permite num único serviço, juntar 18 bases de dados.
Genes
Interactions
Organism
Number of Genes
Genes in Relations
Danio rerio
33326
92
Drosophila melanogaster
22265
190
Homo sapiens
29829
8556
Mus musculus
46968
1567
Rattus norvegicus
30362
1113
Saccharomyces cerevisiae
6308
643
Other
7687217
43394
Number of Compounds
Compounds in Relations
23808596
715745
Segundo Webstatsdomain, este tem um “alexa traffic rank” de 19 443 815,
que é baixo. Significando então que o site recebe poucos utilizadores/visitas.
Comparando por exemplo com o ChEBI (http://www.ebi.ac.uk/chebi/),
este tem um “alexa traffic rank” de 93 306, significando então que tem
muitas visitas.
Concluímos então que os investigadores/utilizadores continuam a preferir
usar diretamente as bases de dados, em vez de utilizarem a Drug2Gene.
http://www.drug2gene.com/
http://biowww.net/forums/viewthread.php?tid=1177
http://www.biotechnologyforums.com/thread-41.html
http://www.webstatsdomain.com/domains/drug2gene.com/
http://www.webstatsdomain.com/domains/www.ebi.ac.uk/
http://www.metalife.com/products/metalife_trinity/drug2gene.html
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Drug2Gene - Departamento de Informática da Universidade da