Biotecnología
Universidad Nacional de Moquegua
“Año del bicentenario del Perú 200 años de independencia “
Escuela Profesional de Ingeniería Ambiental
TEMA:
ANALISIS DE SECUENCIAS DEL GEN 16S
Presentado por:
Joshelin Shantal Alarcon Mamani
Docente:
Prof. Dr. Hebert H. Soto Gonzales
Ciclo: VII
Fecha: 18/09/2021
ILO - Perú
2021
UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUGUA
Escuela Profesional de Ingeniería Ambiental
ÍNDICE
I.INTRODUCION ......................................................................................................................................... 3
II.OBJETIVOS .............................................................................................................................................. 5
2.1. OBJETIVO GENERAL ..................................................................................................................... 5
2.2. OBJETIVO ESPECIFICO ................................................................................................................. 5
III.MATERIALES Y METODOS ................................................................................................................ 6
3.1. MATERIALES .................................................................................................................................. 6
3.2. METODOS ........................................................................................................................................ 8
IV.RESULTADOS......................................................................................................................................15
V.CONCLUCIONES ..................................................................................................................................19
VI.BIBLIOGRAFIA ...................................................................................................................................20
VII.ANEXOS ..............................................................................................................................................21
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I.INTRODUCION
La Bioinformática ha demostrado obtener mejoras en la investigación en áreas afines. Biólogos
usan programas para alinear secuencias y crear estructuras, que son de importancia para analizar
los resultados dados por dichos programas de software. Para identificar una muestra, debe hacerse
una extracción de ADN, y una vez obtenidas sus secuencias, efectuar el análisis con ayuda de
programas como bioEdit, genDoc, Mega, Autodimer, Dnasp5 (para alinear y analizar secuencias
de ADN), PAUP, Mr. Bayes, Beast y Dambe (para la creación de árboles filogenéticos). Luego,
los resultados obtenidos se analizan.
Alineamiento de secuencias de ADN
Según el modelo propuesto por Watson y Crick, la molécula de ADN está compuesta por dos
hebras helicoidales (Torres, 2007), cada una siguiendo una secuencia de nucleótidos {A;T;C;G},
y formando parejas de {C;G} y {A;T} entre las dos hélices (Ferrández, Hernández & Pastor, 2003).
Una vez extraído ADN de una muestra, se obtienen dos secuencias de ADN (forward y reverse).
Deben guardarse cada una en un documento con formato FASTA. Se debe realizar un BLAST a
la secuencia forward, que consiste en hacer una búsqueda en una base de datos de secuencias de
ADN, para encontrar datos similares y verificar si el amplificador es correcto (Altschul, Madden,
Schäffer1, Zhang, Zhang2, Miller2 & Lipman, 1997).
Bioedit
Bioedit es un editor de alineamiento de secuencias, sumamente amigable con el usuario (Hall,
1999). Con este programa, se realizaron tres pasos importantes: reverso complementario,
algoritmo Smith-Waterman y algoritmo Needleman-Wunsch. (Madrigal-Valverde, 2017)
En la ventana principal de BioEdit, el alineamiento de nuestras secuencias, por defecto cada
aminoácido es resaltado en un color diferente, este esquema de colores puede ser cambiado en
cualquier momento mediante la utilización de las diferentes opciones en la barra de herramientas.
(Calvo G., García M., & Rojas M., s.f.)
NCBI
El Centro Nacional para la Información Biotecnológica (NCBI) es parte de la Biblioteca Nacional
de Medicina de Estados Unidos, una rama de los Institutos Nacionales de Salud. Está localizado
en Bethesda (Maryland) y fue fundado el 4 de noviembre de 1988 con la misión de ser una
importante fuente de información de biología molecular. Almacena y constantemente actualiza la
información
referente
a
secuencias genómicas en GenBank,
un
índice
de artículos
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científicos referentes a biomedicina, biotecnología, bioquímica, genética y genómica en PubMed,
una recopilación de enfermedades genéticas humanas en OMIM, además de otros datos
biotecnológicos de relevancia en diversas bases de datos. El NCBI ofrece además algunas
herramientas bioinformáticas para el análisis de secuencias de ADN, ARN y proteínas,
siendo BLAST una de las más usadas.
NCBI alberga genoma secuenciado en GenBank, y un índice de los artículos biomédicos de
investigación en PubMed Central y PubMed, así como otra información relevante a la
biotecnología . Todas estas bases de datos son accesibles en línea con el motor de búsqueda
de Entrez.
El NCBI dirigido por David Lipman, uno de los autores originales del programa de alineación de
secuencias BLAST y una figura extensamente respetada en bioinformática.
Desde 1992 , NCBI ha crecido para proporcionar otras bases de datos además de GenBank. NCBI
proporciona Herencia
Mendeliana
en
el
Hombre en
línea,4
la Molecular
Modeling
Database (estructuras 3D de proteínas), dbSNP (una base de datos de polimorfismos de
nucleótidos simples, la Unique Human Gene Sequence Collection, un mapa de genes del genoma
humano, un buscador taxonómico, y se coordina con el Instituto Nacional del Cáncer para
proporcionar el Cancer Genome Anatomy Project. El NCBI asigna un identificador único (número
de identificación de la taxonomía) a cada especie de organismo.
Herramienta básica de búsqueda de alineación local (BLAST)
BLAST es un algoritmo utilizado para calcular la similitud de secuencia entre secuencias
biológicas como secuencias de nucleótidos de ADN y secuencias de aminoácidos de proteínas.
BLAST es una herramienta poderosa para encontrar secuencias similares a la secuencia de consulta
dentro del mismo organismo o en diferentes organismos( alineamiento de secuencias). Busca la
secuencia de consulta en las bases de datos y servidores de NCBI y envía los resultados al
navegador de la persona en el formato elegido. Las secuencias de entrada al BLAST están
principalmente en formato FASTA o Genbank, mientras que la salida se puede entregar en una
variedad de formatos como HTML, formato XML y texto sin formato. HTML es el formato de
salida predeterminado para la página web de NCBI. Los resultados de NCBI-BLAST se presentan
en formato gráfico con todos los aciertos encontrados, una tabla con identificadores de secuencia
para los aciertos que tienen datos relacionados con la puntuación, junto con las alineaciones para
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la secuencia de interés y los aciertos recibidos con puntuaciones BLAST análogas para estos.
(Centro Nacional para la Información Biotecnológica, s.f.)
II.OBJETIVOS
2.1. OBJETIVO GENERAL

Analizar la secuenciación del Gen 16S mediante la aplicación de software libre Bioedit.
2.2. OBJETIVO ESPECIFICO

Revisar los fundamentos de las técnicas de secuenciación de ácidos nucleicos.

Efectuar el análisis y la selección de electroferogramas automatizados de secuenciación
mediante la aplicación de software libre BIOEDIT en específico el estudio del gen
ribosomal 16S.
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III.MATERIALES Y METODOS
3.1. MATERIALES
LAPTOP
Un computador portátil o laptop es un equipo
personal que puede ser transportado fácilmente.
Muchos de ellos están diseñados para
soportar software y archivos igual de robustos a
los que procesa un computador de
escritorio. Dado que los portátiles se han
diseñado para ser transportados fácilmente de un
Figura: 1 Laptop
Fuente: https://www.hp.com/us-en/shop/pdp/hp-laptop- sitio a otro. (Computadores portátiles o laptops,
s.f.)
pc-15-dw3000-(1a3y1av)
NCBI
Figura: 2 Centro Nacional para la información
Biotecnológica
Fuente:
https://update.lib.berkeley.edu/2016/01/22/ncbibioinformatics-tools-an-introduction-2/
BLAST
NCBI.- Almacena y constantemente actualiza la
información
referente
a
secuencias genómicas en GenBank, un índice
de artículos
científicos referentes
a biomedicina, biotecnología, bioquímica, gené
tica y genómica en PubMed, una recopilación
de enfermedades genéticas humanas en OMIM,
además de otros datos biotecnológicos de
relevancia en diversas bases de datos. (Centro
Nacional para la Información Biotecnológica,
s.f.)
BLAST. - El programa es capaz de comparar una
secuencia problema. Por lo general, cuando una
nueva secuencia es obtenida, se usa el BLAST para
compararla con otras secuencias que han sido
previamente caracterizadas, para así poder inferir
su función. (BLAST, s.f.)
Figura: 3 BLAST (Basic Local Alignment Search Tool)
Fuente: https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
EXCEL
Excel es un programa computacional incluido
en el paquete Microsoft Office, y sirve para
la creación, manejo y modificación de hojas de
cálculo. Se puede utilizar en varios dispositivos
y sistemas operativos. (Microsoft Office Excel,
s.f.)
Figura: 4 Excel
Fuente:https://es.wikipedia.org/wiki/Microsoft_Excel
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WORD
Figura: 5 Word
Fuente: https://es.wikipedia.org/wiki/Microsoft_Word
BIOEDIT
Microsoft Word Es un software
informático procesador de texto, uno de los más
utilizados a la hora de trabajar con documentos
digitales, que nació de la mano de IBM en 1981.
El Word automatizó y mejoró la tarea de escribir
manuscritos ya que permitió revisar las veces
necesarias lo escrito, para editarlo y
reformularlo antes de la etapa de impresión.
(Word, s.f.)
Bioedit es un programa gratuito para edición de
alineamientos y análisis de secuencias que
funciona
únicamente
sobre
ambiente
MS/Windows. Es, sin lugar a duda, uno de los
progrmas más conocidos para edición de
secuencias para dicho sistema operativo.
(Pinzón V., 2006)
Figura: 6 Bioedit
Fuente: https://filehonor.com/bioedit/
ARCHIVO DE SECUENCIACION DEL
GEN 16S
Son tres archivos que contienen una secuencia
del Gen 16S para hacer analizada en programa
gratuito del Bioedith y el NCBI y también se
utilizara el BLAST el programa es capaz de
comparar una secuencia problema.
Figura: 7 Archivo de secuenciación del Gen 16S
Fuente: Elaboración propia Alarcon Mamani Joshelin
BUSCADOR GOOGLE
Google es quizás uno de los aspectos más
básicos a la hora de hablar de Internet, aunque
existen otros buscadores que tienen un buen
nivel de efectividad, Google se ha convertido en
la referencia más importante en buscadores.
(Qué es Google, s.f.)
Figura: 8 Buscador
Google
Fuente: https://www.xataka.com/basics/25-codigosfunciones-trucos-para-buscar-google-exprimiendo-almaximo-su-motor-busqueda
pág. 7
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BLOC DE NOTAS
El Bloc de notas nos permite hacer tareas
sencillas de edición de texto como: Escribir,
copiar, pegar, cortar texto, buscar y remplazar
texto; es decir, lo que normalmente hacemos en
el Word de Office o WordPad. Pero el Bloc de
notas se diferencia de los otros editores porque
permite abrir de manera rápida los archivos de
texto, que además ocupan poco espacio. (Qué es
el bloc de notas y para que sirve, 2019)
Figura: 9 Bloc de Notas
Fuente:
https://www.formacionprofesional.info/el-bloc-denotas-de-windows-10/
3.2. METODOS
PRIMER PASO. – Se abre el Excel y seguidamente se realiza un cuadro donde se coloca en
una columna el código, en la siguiente la calidad, donde se hace tres
divisiones si es buena, mala, regular, y en la siguiente columna se coloca
el tamaño de secuencia y el siguiente el organismo (N.C.) y por último en
la siguiente columna se coloca el % de identidad.
Figura: 10 El cuadro realizo en el Excel
Fuente: Elaboración propia Alarcon Mamani, Joshelin Shantal
SEGUNDO PASO. – Se abre el archivo donde se tiene las secuenciaciones y se identifica el
nombre el cual se copia y pega en el cuadro de Excel en la columna
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código al hacer click en el primer nombre se abre automáticamente el
programa BIOEDIT sirve para la edición de alineamientos y análisis de
secuencias que funciona únicamente sobre ambiente MS/Windows.
Para ello lo tienes que tener descargado en tu laptop o computadora.
Figura: 11 Se observa el programa BIOEDIT con la secuenciación para analizar
Fuente: Elaboración propia Alarcon Mamani, Joshelin Shantal
TERCER PASO. – Una vez de analizar la secuenciación en el BIOEDIT se coloca en el cuadro
Excel la calidad se marca con una X si es buena mala o regular
seguidamente en el programa BIOEDIT hacemos click donde dice File y
colocamos la opción que dice Export as Fasta Saldrá una ventana Mediana
donde bueno se creara una carpeta para guardar la secuenciación y se
guardara con su nombre (código) ya que este procedimiento se hará con
las demás secuencias que ay en el archivo.
Figura: 12 Se observa el procedimiento de guardar en Export as Fasta
Fuente: Elaboración propia Alarcon Mamani, Joshelin Shantal
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Figura: 13 Podemos ver la ventana que se abrió para guardar en la carpeta con el nombre de la
secuencia.
Fuente: Elaboración propia Alarcon Mamani, Joshelin Shantal
CUARTO PASO. – Ir al explorador de archivos y buscar nuestra carpeta donde guardamos la
secuencia seguidamente hacer en el nombre de la secuencia guardada un
doble clik izquierdo y aparecerá como lo queremos abrir el archivo y lo
abrimos en block de notas y aparecerá una ventana mediana donde se verá
una secuenciación como podemos observar en la figura (14).
Figura: 14 Se observa que se abrió la secuencia guardada en block de notas
Fuente: Elaboración propia Alarcon Mamani, Joshelin Shantal
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Figura: 15 Se observa la secuenciación en el block de notas
Fuente: Elaboración propia Alarcon Mamani, Joshelin Shantal
QUINTO PASO. – Se pondrá en el navegador Google la palabra NCBI y seleccionaremos
click donde dice BLAST aparecerá una ventana y le daremos click donde
dice Nucleotide BLAST seguidamente aparecerá una ventana que se
muestra en la figura 17.
Figura: 16 Aquí se observa la opción del BLAST a la que se le dará doble click
Fuente: Elaboración propia Alarcon Mamani, Joshelin Shantal
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Figura: 17 Esta es la ventana donde le aremos click al Nucleotide Blast
Fuente: Elaboración propia Alarcon Mamani, Joshelin Shantal
Figura: 18 Aquí se muestra el BLAST donde se hace la consulta
Fuente: Elaboración propia Alarcon Mamani, Joshelin Shantal
SEXTO PASO. – Seguidamente se abre la ventana del block de notas que contiene la
secuencia y se copia todo y abrimos la ventana del Blast y en el recuadro
donde dice ingresar secuencia consulta observamos un recuadro abajo ahí
pegamos la secuencia seguidamente abajo vamos a observar donde dice
seleccionar el programa le damos en la última casilla que dice Somewhat
similar sequences (blastn) luego más abajo le damos un click en Show
results in a new window y finalmente presionamos BLAST.
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Figura: 19 Aquí podemos que se pegó la secuencia en ese recuadro de color piel
Fuente: Elaboración propia Alarcon Mamani, Joshelin Shantal
Figura: 20 se observa a que opción le daremos clcik
Fuente: Elaboración propia Alarcon Mamani, Joshelin Shantal
Figura: 21 Esta en la ventana que aparece cuando presionas BLAST
Fuente: Elaboración propia Alarcon Mamani, Joshelin Shantal
SEPTIMO PASO. – Una vez que haya cargado aparecerá la siguiente ventana donde podemos
observar la longitud de la consulta a su costa un numero ese número
colocaremos en nuestra tabla de Excel en algunas secuencias aparecerá que
no se encontró ninguna similitud significativa. Pero en otras secuencias
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aparecerá el organismo (N.C.) y el porcentaje de identidad lo cual se
colocará en nuestra de Excel que podemos observas en la figura 22.
Figura: 22 Esta aparece cuando el Blast ha realizado su búsqueda se observa todos los datos correspondientes
Fuente: Elaboración propia Alarcon Mamani, Joshelin Shantal
Figura: 23 Podemos Identificar el organismo y el % de identidad
Fuente: Elaboración propia Alarcon Mamani, Joshelin Shantal
OCTAVO PASO. - Aquí podemos observar cómo queda nuestro cuadro de Excel los pasos
anteriores se repetirán sucesivamente para todas las secuencias.
Figura: 24 Podemos observar el cuadro de Excel
Fuente: Elaboración propia Alarcon Mamani, Joshelin Shantal
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IV.RESULTADOS
Tabla 1: Aquí podemos observar el primer Archivo al que se realizó el análisis
TAMAÑO
DE LA
SECUENCIA
ORGANISMO (N.C.)
% IDENTIDAD
978
Negativo
X
X
908
Herbaspirillum
seropedicae
88,73%
X
1007
Pseudomonas putida
83,21%
X
925
Bacteria no cultivada
86,14%
X
1163
Negativo
X
X
944
Negativo
X
957
Leclercia adecarboxylata
85.62%
939
1020
993
Klebsiella oxytoca
Negativo
Negativo
84.01%
X
X
X
963
Enterobacter sp. NA10140
92.53%
X
965
Enterobacter sp. NA10140
92.51%
X
944
979
950
Phytobacter diazotrophicus
Negativo
Negativo
86.91%
X
X
X
928
uncultured bacterium
90.18%
X
963
uncultured bacterium
85.40%
X
983
Phytobacter diazotrophicus
89.23%
986
Pseudomonas putida
81,82%
926
Negativo
X
932
Paraburkholderia
silvatlantica
79,97%
CALIDAD
CODIGO
BUENA MALA REGULAR
DIVERSOS_A07_1H_01.ab1
DIVERSOS_A08_9H_02.ab1
DIVERSOS_A09_1_01.ab1
DIVERSOS_A10_9_02.ab1
DIVERSOS-_A11_17_01
DIVERSOS_B07_2H_03
DIVERSOS_B08_10H_04
DIVERSOS-_B09_2_03
DIVERSOS-_B10_10_04
DIVERSOS-_B11_18_03
DIVERSOS_C07_3H_05
DIVERSOS_C08_11H_06
DIVERSOS-_C09_3_05
DIVERSOS-_C10_11_06
DIVERSOS-_C11_19_05
DIVERSOS_D07_4H_07
DIVERSOS_D08_12H_08
DIVERSOS-_D09_4_07
DIVERSOS_D10_12_08.ab1
DIVERSOS_E07_5H_09.ab1
DIVERSOS_E08_13H_10.ab1
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
pág. 15
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DIVERSOS_E09_5_09.ab1
DIVERSOS_E10_13_10.ab1
DIVERSOS_F07_6H_11.ab1
DIVERSOS_F09_6_11.ab1
DIVERSOS_F10_14_12.ab1
DIVERSOS_G07_7H_13.ab1
DIVERSOS_G09_7_13.ab1
DIVERSOS_G10_15_14.ab1
DIVERSOS_H07_8H_15.ab1
DIVERSOS_H09_8_15.ab1
DIVERSOS_H10_16_16.ab1
X
981
Enterobacter ludwigii
88,43%
X
1057
bacteria no cultivada
67,47%
X
915
Enterobacter ludwigii
95,89%
X
956
Klebsiella sp.
81,75%
1204
Negativo
X
X
931
Enterobacter sp. ICBR 189
91,07%
X
935
Enterobacter sp.
73,78%
X
950
Enterobacter asburiae
93.40%
X
1101
Negativo
X
X
1262
Negativo
X
948
Enterobacter sp. IICDBZ9
84,42%
X
X
Fuente: Elaboración propia Alarcon Mamani, Joshelin Shantal
Como podemos observar en esta secunsiación del archivo Hernan3 la amyoria de las secuencias
fueron buenas con un tamaño de secuenciacion de 925 para adelante y el organismo son bacterias
y un porcentaje de identidad entre los 80 y 90 % y uno que tiene una identidad de 67, 47% se
realizo el analisis de estas secuencias usando el programa BIOEDIT y el NCBI utilizando el
BLAST para hacer la consulta de cada secuencia y se obtuvo los resultados de secuencias similares
por que el BLAST encontro en su GenBank dentro del mismo organismo o en diferentes
organismos( alineamiento de secuencias).
Tabla 2 Aquí observamos la tabla del segundo archivo
CALIDAD
CODIGO
BUENA
15-456NZ_G02_14.ab1
14-483H_F02_12.ab1
X
X
TAMAÑO
DE LA
SECUENCIA
ORGANISMO
% IDENTIDAD
877
947
Klebsiella variicola
Enterobacter
86,71%
86,09%
MALA REGULAR
pág. 16
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13-483NZ_E02_10.ab1
12-526YZ_D02_08.ab1
11-375NZ_C02_06.ab1
10-88H_B02_04.ab1
09-419YZ_A02_02.ab1
08-375H_H01_15.ab1
07-419Y1_G01_13.ab1
06-526Y1_F01_11.ab1
X
X
X
X
891
880
976
971
896
1002
980
989
05-88AZ_E01_09.ab1
X
839
04-88NZ_D01_07.ab1
X
872
03-419AZ_C01_05.ab1
02-526NZ_B01_03.ab1
01-419NZ_A01_01.ab1
X
X
895
877
950
X
X
X
X
X
Enterobacter sp
Klebsiella
Negativo
Negativo
Bacteria no cultivada
Negativo
Enterobacter
Klebsiella pneumoniae
Klebsiella pneumoniae
cepa
Klebsiella pneuonia
cepa
Klebsiella grimontii
Klebsiella variicola
Negativo
89,55%
95,25%
96,45%
95,91%
98,61%
93,07%
94,39%
97,35%
86,71%
-
Fuente: Elaboración propia Alarcon Mamani, Joshelin Shantal
Esto es el segundo archivo (SeqsHerbert.zip) el cual se realizó el análisis aquí podemos observar
que la mayoría de las secuencias fueron buenas hubo como 4 que estuvieron malas y el tamaño de
la secuenciación mas baja fue 839 y la mas alta fue 1002 y aquí también se realizo la consulta para
cada secuencia en el programa de NCBI utilizando el Nucleotide BLAST el cual podemos observar
que los organismos son bacterias y en el porcentaje de identidad esta en un promedio de 80 y 90
% no llegan al 100% se pudo obtener esos resultados realizando el análisis a este archivo.
Tabla 3 Aquí observamos la tabla del tercer archivo
CALIDAD DE LA
SECUENCIA
CODIGO
TAMAÑO
DE LA
SECUENCIA
ORGANISMO
%IDENTIDAD
BUENA MALA REGULAR
user_12set2007_01_A03_01.ab1
user_12set2007_02_B03_03.ab1
user_12set2007_03_C03_05.ab1
user_12set2007_04_D03_07.ab1
user_12set2007_05_E03_09.ab1
user_12set2007_06_F03_11.ab1
X
942
X
X
X
X
X
1024
997
983
921
1347
Kosakonia
radicinci
Negativo
Klebsiella variicola
Kosakonia oryzae
Enterobacter sp.
Negativo
81.90%
75.12%
81.30%
89.23%
-
pág. 17
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user_12set2007_07_G03_13.ab1
user_12set2007_08_H03_15.ab1
user_12set2007_09_A04_02.ab1
X
X
X
user_12set2007_10_B04_04.ab1
user_12set2007_11_C04_06.ab1
user_12set2007_12_D04_08.ab1
user_12set2007_13_E04_10.ab1
user_12set2007_14_F04_12.ab1
user_12set2007_15_G04_14.ab1
user_12set2007_16_H04_16.ab1
1185
991
1163
X
X
X
X
X
usuarios_12set2007_1Y2_F04_12.ab1
X
usuarios_12set2007_2Y2_G04_14.ab1
X
X
X
X
X
X
X
866
Negativo
964
959
860
928
977
944
959
X
X
usuarios_12set2007_3Y2_H04_16.ab1
usuarios_12set2007_17_A04_02.ab1
usuarios_12set2007_18_B04_04.ab1
usuarios_12set2007_19_C04_06.ab1
usuarios_12set2007_20_D04_08.ab1
usuarios_12set2007_21_E04_10.ab1
1005
1006
1056
951
1116
949
Negativo
Negativo
Negativo
uncultured
Treponema clone
RsDiSp8
Negativo
Negativo
Negativo
Pantoea deleyi
Klebsiella variicola
Negativo
proteobacterias no
cultivadas
Herbaspirillum
seropedicae
Negativo
Negativo
Enterobacter sp.
Negativo
Negativo
984
77.06%
94.92%
89.38%
81.62%
81.20%
79.83%
-
Fuente: Elaboración propia Alarcon Mamani, Joshelin Shantal
Aquí podemos observar el tercer archivo (SeqsHerbert_9.zip) el cual se realizó el análisis las
secuencias la gran mayoría fueron malas y algunas buenas y otras regulares con un gran número
de tamaño de secuencia que el mas bajo fue el de 866 y el mas alto es el que tiene 1185 y los
organismos como la gran mayoría fue mala no se encontró las que fueron buenas y regulares el
programa que se utilizo nos dio como resultado organismos similares y ellos son bacterias las
cuales alcanzaron un porcentaje de identidad 81.20% el mas bajo y el mas alto fue de 94.92% nos
se llego a un 100% de identidad.
pág. 18
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V.CONCLUCIONES

Es importante conocer esta aplicación software libre BIOEDIT ya que con este programa
podemos realizar alineamientos y análisis de secuencias saber de este programa es de
mucha importancia nos ayudara mucho.

Saber del programa BLAST el cual podemos consultar la secuencia y nos mostrara los
resultados encontrados en su GenBank y podemos realizar muchas consultas de secuencia
nos va ayudar en futuros trabajos conocer el manejo y utilizaciones de este programa.

Al realizar este informe se dio a conocer los materiales que fueron utilizados para realizar
el análisis de la secuenciación del Gen 16S como también se dio conocer el método sé que
realizo para el análisis de esta secuenciación del Gen 16S y como se utilizó los programas
del BIOEDIT y el Nucleotide BLAST.

En el análisis que se realizó había secuencias que fueron buenas otras que fueron malas y
otras regulares.
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UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUGUA
Escuela Profesional de Ingeniería Ambiental
VI.BIBLIOGRAFÍA
(10 de Enero de 2019). Recuperado el 17 de Setiembre de 2021, de
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%C3%B3gica
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https://es.wikipedia.org/wiki/BLAST
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Escuela Profesional de Ingeniería Ambiental
VII.ANEXOS
Figura: 25 Se observa la página BLAST
Fuente: https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
Figura: 26 Se observa el programa BIOEDIT
Fuente: Elaboración propia Alarcon Mamani, Joshelin Shantal
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