Amazon Basin Biodiversity Information Facility
Rede speciesLink
Sistema de Informação Distribuído para Coleções Biológicas:
A integração do Species Analyst e SinBiota
Vanderlei Perez Canhos
Alexandre Marino
Centro de Referência em Informação Ambiental, CrIA
O principal objetivo
do projeto
speciesLink foi o
de desenvolver um
sistema de buscas
distribuído
integrando diversas
coleções biológicas
e tornando seus
dados primários
disponíveis através
da Internet.
speciesLink
Sistema de Informação Distribuído para Coleções Biológicas
http://splink.cria.org.br
Coleções do Estado de São Paulo – Fase I (2 anos)
peixes: 3
ácaros: 2
herbários: 4
microrganismos: 3
inventário: SinBiota
Distribuição geográfica das coleções participantes
Suporte às coleções
• Provendo equipamentos e infraestrutura de rede
• Auxiliando na escolha do software de gerenciamento
• Auxiliando no treinamento e na importação de dados
Protocolo e Esquema de Dados
• Protocolo DiGIR (Distributed Generic Information Retrieval)
Potencial para ter aceitação global
• Componentes DiGIR (Portal Java & Provedor PHP)
Desenvolvimento colaborativo
• DarwinCore v.2
Cobre o conteúdo comum a todos os grupos taxonômicos
contemplando todos os dados básicos (identificação
taxonômica, localização e data da coleta)
Interface de
Busca Simples
Arquitetura
do Sistema
speciesLink site
Portal DiGIR
(Java)
Perl
Camada de apresentação
Conectividade rápida e estável
Coleção A
Dados
SQL
Servidor Regional
Provedor
PHP
Sistema de
Gerenciamento
da Coleção
Postgres
SQL
Provedor
PHP
SOAP Server
Conectividade baixa ou instável
Coleção B
Dados
SQL
Sistema de
Gerenciamento
da Coleção
Coleção C
Cliente
SOAP
Repositório
de Dados
Dados
SQL
Sistema de
Gerenciamento
da Coleção
Cliente
SOAP
Repositório
de Dados
Representação da rede
Servidor
Regional
Servidor
Regional
Servidor
Regional
Servidor
Regional
Arquitetura
do Sistema
speciesLink site
Portal DiGIR
(Java)
Perl
Camada de apresentação
Conectividade rápida e estável
Coleção A
Dados
SQL
Servidor Regional
Provedor
PHP
Sistema de
Gerenciamento
da Coleção
Postgres
SQL
Provedor
PHP
Servidor SOAP
Conectividade baixa ou instável
Coleção B
Dados
SQL
Sistema de
Gerenciamento
da Coleção
Coleção C
Cliente
SOAP
Repositório
deDados
Dados
SQL
Sistema de
Gerenciamento
da Coleção
Cliente
SOAP
Repositório
de Dados
Software para migrar dados
•
Independente de plataforma (java)
•
Conecta-se a qualquer banco de dados acessível via JDBC
(também suporta arquivos texto)
•
Oferece controle completo sobre os dados
•
Baixo tráfego de rede
•
Possibilidade de filtrar dados sensíveis usando expressões regulares
Resultado de busca simples
speciesLink – Fase II (+2 anos)
~40 coleções conectadas
~940.000 registros on-line
Março/2006
JBRJ
FUTURO
Rede
Capixaba
JBRJ
Rede
Paranaense
Gracias!
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