Serviços de genotipagem em plataforma
iScan/Illumina: colaboração entre a
DEOXI & EMBRAPA
Rodrigo Alonso
Deoxi Biotecnologia
Diretor Executivo
Empresa Privada – Fundada em Araçatuba/SP – Out/2008
“Spin Off”
Campus de Araçatuba
NOSSA MISSÃO
Desenvolver produtos e processos inovadores em
biotecnologia, através da integração do conhecimento
científico, tecnologias avançadas e gestão estratégica.
Serviços
MiSeq (NGS)
Coleta
iScan - Illumina
Golden
Gate
Armazenamento
Extração
de DNA
Infinium
Teste de
Paternidade
por SNP
Farmacogenômica
Diagnóstico Genético
Pré -Implantacional
Soluções em
Genômica
Rastreabilidade
Elaboração e
Gerenciamento
de Projetos
Análises Genômicas
Bioinformática
Laboratórios
Histórico de P&D
• Pesquisa Inovativa em Pequenas Empresas – PIPE/FAPESP (Fase I e II)
- Diagnóstico genético pré-implantacional em embriões bovinos
produzidos in vitro.
• Programa PRIME – Primeira Empresa Inovadora – FINEP
- Aplicação da seleção assistida por marcadores moleculares nos programas de
transferência de embriões bovinos.
• Pesquisa Inovativa em Pequenas Empresas – PIPE/FAPESP (FASE I)
- Desenvolvimento de teste de DNA para seleção de touros de alta fertilidade.
• Subvenção Econômica - FINEP
- DNAids: Diagnóstico rápido da predisposição genética aos efeitos adversos em
pacientes HIV+ submetidos à terapia anti-retroviral.
Histórico de P&D
• RHAE – Pesquisador na Empresa – CNPq
- Desenvolvimento de “NanoChips Genômicos” para aplicação em saúde humana,
agropecuária e meio ambiente.
• Pesquisa Inovativa em Pequenas Empresas – Subvenção 2012 PAPPE/PIPE
– FAPESP/FINEP – Desenvolvimento de linhagem congênica de bovinos da raça
Nelore com mutação no gene da miostatina.
• Pesquisa Inovativa em Pequenas Empresas (PIPE – FAPESP)
- Uso de arrays genômicos de alta resolução e “Next Generation Sequencing” no
diagnóstico de deficiência intelectual e anomalias congênitas – PIPE Fase II.
Clientes: Genômica Animal
Clientes: Genômica Humana
Plataformas Illumina…
Low to mid-plex
molecular
testing.
Dedicated
array
instrument.
Sequencingcompatible array
instrument.
Two proven technologies.
One powerful platform.
BeadXpress
iScan
HiScan
HiScanSQ
Tecnologia Bead Array…
Bead Arrays
Tecnologia Bead Chip…
iScan
INFINIUM
BeadArray
Technology
GOLDENGATE
Golden Gate X Infinium
GOLDENGATE
Painéis Customizados
De 96 – 3072 SNPs
INFINIUM
Diversos produtos prontos
para serem utilizados
De 3K – 5 milhões SNPs
 Alta Sensibilidade
 Dados de alta qualidade
 Alto limite de detecção
 Call Rate > 99%
 Alta reprodutibilidade
 Plataforma robusta
Aplicações no Agronegócio
PorcineSNP60 BeadChip
- 62,163 informative SNP markers
OvineSNP50 BeadChip
- 54,241 informative SNP markers
CanineHD
- 170,000 SNP markers
Maize SNP50 BeadChip
- 56,110 informative SNP markers
Qual a vantagem de terceirizar
serviços de genotipagem?
 Alto Custo dos Equipamentos
Alta capacidade de análise
Mão de obra especializada
Comprometimento com o resultado
Comprometimento com prazos
Poder de negociação
 Custo-benefício
PARCERIA DE SUCESSO!!!
-
Marcos Vinícius Barbosa da Silva
Maria Gabriela Peixoto
Marta Martins
Marco Antônio Machado
João Cláudio Panetto
- Fernando Flores Cardoso
- Monica Correa Ledur
- Ricardo Zanella
- Rodrigo Torres (BRF)
- Fabiane Siqueira
- Andrea do Egito
“Next-Generation Sequencing”
MiSeq/Illumina
[email protected]
www.deoxi.com.br