O RNA-Mensageiro
Boletim Electrónico da
Sociedade Portuguesa de Genética
(edição não periódica)
Agosto/Setembro de 2007
Indice
1. Inscrições em Reuniões Científicas com Desconto para Sócios da
SPG
2. II Workshop Sobre Microarrays: “POR ALGUNS MICROARRAYS
MAIS”, Vila Real 3-6 Outubro 2007
3. Os Estados Unidos Seleccionaram o Genoma do Eucalipto para ser
sequenciado e Caracterizado. Duas Instituições Portuguesas
Participam.
4. Reacções ao relançamento de “O RNA-mensageiro”
1. Inscrições em Reuniões Científicas com Desconto para
Sócios da SPG
Duas organizações científicas vão realizar-se em breve, o II Workshop Sobre
Microarrays: POR ALGUNS MICROARRAYS MAIS, e MICROBIOTEC+XXXIII
Jornadas Portuguesas de Genética.
Em ambas os sócios da SPG auferem de descontos na inscrição.
No II Workshop Sobre Microarrays: POR ALGUNS MICROARRAYS MAIS, os
sócios pagarão 120 Euros em vez do preço de 150 Euros, e na reunião
organizada conjuntamente pelas Sociedades Portuguesa de Microbiologia,
Portuguesa de Biotecnologia e Portuguesa de Genética, os sócios pagarão de
inscrição 235 € em vez dos 275 € pagos por não sócios.
A Direcção da SPG promoverá sempre em todas as reuniões científicas que
organize ou que dê o seu patrocínio científico uma política de descontos para os
seus sócios.
2. II Workshop Sobre Microarrays, Organizado pelo Centro de
Genética e Biotecnologia-UTAD/IBB, Vila Real 3-6 Outubro
2007
DEPOIS DE
SE ASSISTIU AO I WORKSHOP
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(Tudo o que sempre desejou saber sobre Microarrays e nunca ousou
perguntar)
Ou se lamenta ter perdido essa oportunidade
NAO PERCA AGORA O
II WORKSHOP
POR UNS MICROARRAYS
MAIS
(Tudo o que AINDA deseja saber sobre Microarrays e nunca ousou
perguntar)
Vila Real, de 3 a 6 de e Outubro de 2007
Auditório do Edifício de Ciências Florestais da
Universidade de Tras-os-Montes e Alto Douro
Parte Básica do Curso (2 dias)
A cargo do o Prof Doutor David Galbraith, Institute of BIOSCIECE, The
University of Arizona, Tucson, USA
Parte Complementar (1 dia):
Prof Doutor David Galbraith, The University
of Arizona, USA, na parte Microarrays
aplicados ao estudo do arroz.
Prof Doutor Jose Luis Castrillo, da Centro de
Biología Molecular Severo Ochoa (CSICUAM), Universidad Autónoma de Madrid,
Espanha, na parte de Microarrays em
humanos.
Doutora Ramona atacha Pena (a confirmar),
do Centre Udl-IRTA, Lleida, Espanha, na
parte de Microarrays aplicados ao estudo do
porco.
Demonstracao prática de hibridação de
microarrays, e de interpretação estatística
dos dados (1 dia).
Prof. Doutores do Curso com apoio das Prof.
Doutoras Estela Basto, Paula Lopes e
Alexandra Mendes Ferreia, CGB-UTAD/IBB.
UMA ORGANIZAÇÃO DO
CGB
CGB
CENTRO DE GENÉTICA E BIOTECNOLOGIA DA UNIVERSIDADE DE
TRÁS-OS-MONTES E ALTO DOURO/INSTITURO DE BIOTECNOLOGIA E
BIOENGENHARIA
COM O PATROCÍNIO CIENTÍFICO DA
Sociedade Portuguesa de Genética
PROGRAMA :
(leccionado em inglês)
II WORKSHOP SOBRE MICROARRAYS:
POR ALGUNS
MICROARRAYS MAIS
Draft Program
Day 1, Oct 3, 2007.
9:00-10:00
Welcome by the Director of the CGB-UTAD/IBB
Prof. David Galbraith : Lecture 1. Introduction to the workshop
and to microarrays.
10:00- 10:15 Questions and comments.
10:15-10:30 Coffee Break
10:30-11:00 Lecture 2. Introduction to statistical issues in
microarrays.
11:00- 11:15 Questions and comments.
11:15-12:00 Lecture 3. Microarray printing.
12:30-14:30 Lunch
14:30-17:00 Laboratory methods description and discussion 1.
Target Preparation (RNA isolation and cleanup). Quality Checking
by RNA gel electrophoresis and Bioanalyzer and Quantification of
RNA using spectrophotometers. Total RNA Labeling with RNA
amplification and indirect labeling. Target Purification (removal of
unincorporated aa-dUTP). Dye coupling and clean-up. Target
validation (NanoDrop).
17:00-18:30 Microarray hybridization demonstration.
18:30-19:00 Questions and comments.
Day 2, Oct 4, 2007.
9:00 - 10:00 Lecture 4. Microarray Hybridization and Scanning.
10:00- 10:15 Questions and comments.
10:15-10:30 Coffee Break
10:30-12:30 Laboratory methods description and discussion 2.
Microarray post-hybridization processing. Slide scanning. Feature
extraction.
12:30-14:30 Lunch
14:30-17:00
17:00-17:30
Feature extraction (continued).
Questions and comments.
Day 3, Oct 5,
9:00 - 10:00
10:00- 10:15
10:15-10:30
10:30-11:30
12:30-14:30
14:30-17:00
(continued).
17:00-17:30
2007.
Lecture 5. Analyzing microarray data.
Questions and comments.
Coffee Break
Laboratory activity. Analyzing microarray data.
Lunch
Laboratory activity.
Analyzing microarray data
Questions and comments.
Day 4, Oct 6, 2007.
Day 4 will comprise three lectures, describing
applications in Plants, Animals and Humans.
microarray
PREÇO DAS INSCRIÇÕES:
Inscrições limitadas a 60.
Preço de inscrição:
150 euros + 50 euros (jantar do curso e passeio ao Douro)
Sócios da Sociedade Portuguesa de Genética (SPG):
120 euros + 50 euros (jantar do Curso e passeio ao Douro)
Alunos de Licenciatura (mediante declaração do estabelecimento de
ensino superior ou cartão comprovativo da sua inscrição como alunos
do 1º Ciclo ou de Licenciatura):
75 euros + 50 euros (jantar do Curso e passeio ao Douro)
PAGAMENTO E RESERVA DE HOTEL
Através da Agencia REALVITUR
http://www.realvitur.pt/portal/
(Disponível dentro de 1 semana inscrição on-line)
MAIS INFORMAÇÕES ATRAVÉS DO EMAIL:
PROF DOUTOR HENRIQUE GUEDES-PINTO [email protected]
3. Os Estados Unidos Seleccionaram o Genoma do
Eucalipto para ser sequenciado e Caracterizado.
Duas Instituições Portuguesas Participam
OAK RIDGE, Tenn (EUA), 3 Julho 2007 – Reconhecendo o singular mérito do
género eucalipto e o conhecimento genómico já gerado por uma rede de
investigadores internacionais, o U.S. Department of Energy Joint Genome Institute
(DOE-JGI) decidiu, através do seu Community Sequencing Program (CSP)
sequenciar e disponibilizar publicamente os 600-milhões de nucleótidos do DA do
genoma de Eucalyptus grandis. Pretende-se maximizar o potencial internacional de
diversas espécies de eucalipto para a produção de pasta e papel, captação de
carbono atmosférico e produção de bioenergia.
A proposta para sequenciar o genoma de eucalipto concorreu com 120 trabalhos e
tem um custo estimado em US$ 10 milhões. O esforço científico para propor a
sequenciação do genoma do eucalipto, reuniu contribuições científicas de mais de
vinte instituições internacionais e foi liderado pelo Professor Alexander Myburg da
Universidade de Pretória (África do Sul), tendo como colaboradores próximos o
Professor Dário Grattapaglia da EMBRAPA e Universidade Católica de Brasília
(Brasil) e o Doutor Jerry Tuskan do Oak Ridge ational Laboratory (EUA). A
partilha da informação de bibliotecas privadas de sequências de eucalipto
produzidas pela rede Genolyptus e pela empresa ArborGen contribuíram
significativamente para a decisão final do DOE-JGI.
A rede de pesquisa genómica de eucalipto, Genolyptus, agrega 13 empresas
Brasileiras, 8 instituições públicas de investigação Brasileiras e o RAIZ – o Instituto
de Investigação da Floresta e Papel (Portugal). Esta rede aporta a este ambicioso
esforço de descodificação do genoma de eucalipto, mais de 120 000 sequências e
recursos de mapeamento genético necessários para a ordenação e anotação da
compilação final. A empresa ArborGen LLC, com sede nos Estados Unidos, e a sua
associada Rubicon Limited, com sede na ova Zelândia, vão disponibilizar mais de
240 000 sequências de eucalipto, assim como conhecimento que permitirá a
transformação do clone modelo de E. grandis que vai ser sequenciado, para fins de
confirmação da função de genes candidatos.
O género Eucalyptus é um dos mais disseminados, em termos de plantação
florestal, no mundo inteiro, agrupando mais de 700 espécies diferentes e incluindo
algumas das espécies lenhosas de crescimento mais rápido no mundo. Existem
cerca de 18 milhões de hectares de eucalipto no mundo, em 90 países, cuja
exploração permite aliviar significativamente a pressão sobre a extensão e
biodiversidade das florestas tropicais. O Eucalyptus globulus é considerada a
espécie de eleição para a produção de pasta e papel e Portugal alberga cerca de
32% da área mundial onde esta espécie consegue crescer. Para além disso o género
Eucalyptus é candidato de eleição no esforço internacional de sequestro de carbono
da atmosfera, conseguindo fixa-lo a uma taxa de 10 toneladas/hectare/ano,
resultando num balanço positivo de carbono, mesmo quando a madeira é usada
para gerar energia ou para a produção de pasta e papel.
O genoma do eucalipto será o segundo genoma de uma espécie florestal, e o sexto de
uma planta a ser integralmente sequenciado. Segundo o Professor Myburg, a
descodificação do genoma do eucalipto vai permitir revelar o circuito molecular
responsável pela sua excepcional adaptabilidade e produtividade. O professor
Tuskan acrescenta que para além disso, a informação produzida permitirá
aprofundar o conhecimento actual sobre as vias metabólicas e o entendimento dos
processos de tolerância ao stress biótico e abiótico, abrindo também oportunidades
únicas de análise genómica comparativa com o choupo (Populus), a primeira
árvore a ser sequenciada também pelo DOE-JGI e colaboradores, em 2006. O
Professor Brad Potts da Universidade da Tasmânia (Austrália), defende que a
história evolutiva dos eucaliptos, o seu papel de espécie fundadora e a sua
capacidade de adaptação a ambientes marginais tornam este género um modelo
ideal para expandir os conhecimentos fundamentais da biologia adaptativa de
outras plantas perenes.
A coordenação e disseminação da informação resultante deste projecto será feita
pela rede internacional de investigadores de genómica de eucalipto, EUCAGE
(www.eucagen.org). Esta rede foi estabelecida em 2004 com o objectivo de
promover a geração de recursos públicos necessários à investigação genómica. Dela
fazem parte mais de 140 cientistas de 82 instituições de investigação públicas e
privadas, incluindo duas Portuguesas. Espera-se que este número aumente
significativamente, uma vez que a disponibilização da sequência completa de uma
espécie de eucalipto, e as ferramentas daí resultantes, abrirão múltiplas
oportunidades para a exploração dos recursos deste organismo ímpar. Face à
indústria, recursos biológicos e capacidade científica já instalada no país, a
comunidade científica Portuguesa está numa posição privilegiada para poder
aproveitar, com benefício fundamental e aplicado este recurso, que se prevê estar
disponível dentro de três anos.
Para mais informações contactar:
Alexander Myburg, University of Pretoria, [email protected], Tel +27 12 420
4945 http://fabinet.up.ac.za/eucgenomics/
Dario Grattapaglia, EMPRAPA, [email protected], Tel +55 61 4484652
http://www.ucb.br/posgraduacao/biotecnologia/dario.htm
Gerald Tuskan, Oak Ridge National Laboratory, [email protected], Tel +1 865 576 8141
http://www.esd.ornl.gov/PGG/
Cristina Marques, Raiz – Inst. Investigação da Floresta e Papel, [email protected],
Tel +351 21 4469537 http://www.Raiz-iifp.pt/index.html
4. Reacções ao relançamento de “O RNA-mensageiro”.
De vários sócios da SPG recebemos Emails de apreço e estímulo ao relançamento
do boletim “O RA-mensageiro” agora em edição eletrónica.
A todos agradecemos as palavras de apoio e incentivo e queremos deixar expresso
que este espaço está a disposição de todos para divulgação de reuniões científicas
que organizem, opiniões e notas sobre assuntos relevantes na área da Genética, que
nos podem ser remetidas através dos Emails: XXXXXX ou
[email protected]
Sociedade Portuguesa de Genética
Endereço Oficial:
Departamento de Genética, Estação Agronómica Nacional,
Quinta do Marquês
2780 Oeiras, Portugal
Endereço da Actual Direcção
Centro de Genética e Biotecnologia
Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro
Apdo. 1013,
5001-801 Vila Real, Portugal
Email: [email protected]
Telefone: (351)-259-350595
Fax: (351)-259-350572