XI Encontro da SBQ – Rio de Janeiro
Universidade Federal Fluminense, 29 a 31 de outubro de 2007
XI ENCONTRO DA SBQ – RIO DE JANEIRO
Aplicação da RMN no Estudo das Interações Intermoleculares do
Tipo: Ligante-proteína, Ligante-DNA, Proteína-DNA e Peptídeomembrana
Luzineide W. Tinoco
Núcleo de Pesquisas de Produtos Naturais – UFRJ-CCS- Av. Carlos Chagas Filho, 373--Bloco H
Laboratório de Análise e Desenvolvimento de Inibidores Enzimáticos - H010 - Cidade Universitária
- 21941-902
Resumo
A
compreensão
das
interações
intermoleculares é de grande importância em
diversos campos da Ciência sendo
fundamental para o entendimento dos
processos de sinalização celular, transcrição
e reconhecimento molecular e para o
desenvolvimento racional de compostos
farmacologicamente ativos (Carr et al., 2005).
Atualmente, a RMN é considerada uma
técnica fundamental para a descoberta de
novos fármacos, o que é demonstrado pelo
grande número de artigos encontrados na
literatura revisando este tipo de aplicação. O
objetivo deste trabalho é usar a RMN como
uma ferramenta para a compreensão das
interações intermoleculares do tipo liganteligante,
ligante-proteína,
ligante-DNA,
peptídeo-membrana e proteína-DNA. Os
estudos de complexação do p-cresol com
piperazina
foram
feitos
através
da
determinação do coeficiente de difusão
molecular e de medidas de relaxação,
usando pela primeira vez a seqüência de
pulsos NULL para medir a distância entre
2
hidrogênios em moléculas diferentes. Com
as informações obtidas dos estudos da
interação de guanil hidrazonas aromáticas
(GHA) com albumina do soro bovino foi
possível determinar que a formação de
dímeros das GHA interfere com a sua
atividade anti-chagásica3. Nos estudos da
interação das GHA com um dodecâmero de
DNA, as variações de deslocamento químico
indicam que a preferência para interação
está na região dos pares de base AT. Com o
objetivo de identificar se a proteína príon
interage com ácidos nucléicos e de mapear a
topologia desta interação foram feitos
espectros de HSQC da proteína marcada
com 15N pura e na presença de um
fragmento de dezoito pares de base do DNA.
A partir da análise da variação dos valores de
deslocamento químico foi possível mapear as
regiões da proteína que estão envolvidas na
interação com o DNA4. O peptídeo
anticoccidiano PW2 exerce sua atividade
através da interação com a membrana
plasmática
dos
protozoários
Eimeria
acervulina
e
Eimeria
tenella.
Para
compreender melhor este mecanismo de
interação foi feita a determinação estrutural
por RMN do PW2 na presença de micelas de
dodecilsulfato de sódio e dodecilfosfocolina
como meios miméticos de membrana
plasmática.5
Referências bibliográficas
1- Carr, R. A. E.; Congreve, M.; Murray, C. W.;
Rees,
D.
(2005)
Fragment-based
lead
discovery:leads by design. Drug Discovery Today
10, 14, 987-992.
2- Carvalho, Erika Martins de, Velloso, M. H. R.,
Tinoco, L. W., Figueroa-Villar, José Daniel (2003)
Formation of p-Cresol:Piperazine Complex in
Solution Monitored by Spin Lattice Relaxation
Times and Pulsed Gradient NMR Diffusion
Measurements. J. Magn. Reson., 164, 197.
3- Tinoco, L. W. e Figueroa-Villar, J. D. (1999)
Determination of Correlation Times from Selective
and Non-selective Spin –lattice Relaxation Rates
and Their Use in Drug-Drug and Drug-Albumin
Interaction Studies. J. Braz. Chem. Soc., 10, 281.
4- Lima, Luis Maurício T. R., Cordeiro, Yraima,
Tinoco, L. W., Marques, Adriana F., Oliveira,
Cristiano L. P., Foguel, Débora, Silva, Jerson
L.(2006) Structural insights into the interaction
between prion protein and nucleic acid.
Biochemistry, 45, 9180.
5- Tinoco, L. W., Silva Jr., Arnaldo Da, Leite, A.,
Valente, Ana Paula, Almeida, F. C. L. (2002) NMR
Structure of PW2 Bound to SDS Micelles: A
Tryptophan-rich Anticoccidial Peptide Selected
from Phage Display Libraries. J. Biol. Chem. , 277,
36351.