Quick-Zol – Trizol Reagente Condição de estoque: 4°C Apresentação: frasco de 100 ml 1.0 Introdução Trizol Reagente é um reagente de fácil uso para o isolamento simultâneo de DNA, RNA e proteínas de amostras de tecidos ou células de animais, plantas, bactérias, vírus e leveduras. Trizol é uma mistura de tiocianato de guanidina e fenol em uma solução monofásica capaz de lisar e/ou homogeneizar amostras de tecidos, dissolvendo todo o seu conteúdo: DNA, RNA e Proteínas. Com a adição de clorofórmio e após uma centrifugação, três fases distintas são geradas na mistura: Fase aquosa menos densa, contendo RNA; Fase Intermediária ou interfase contendo DNA e Fase Orgânica mais densa contendo as proteínas celulares. Cada fase pode ser isolada, assim como o conteúdo de cada uma destas, com a utilização de protocolos específicos. Uma quantidade de 1 ml de Trizol é suficiente para isolar RNA, DNA e proteínas de 100 mg de tecidos. O método para o isolamento de RNA total é bastante simples e pode ser realizado em menos de uma hora. Todo o procedimento é bastante eficiente para o isolamento de moléculas de RNA total intactas, com baixa ou nenhuma contaminação de DNA e proteínas. O RNA isolado por este método pode ser utilizado em ensaios de Northern blots, isolamento de mRNA, tradução in-vitro, Ensaios livre de RNase, clonagem e PCR. O DNA isolado por este método pode ser utilizado em PCR, Southern blotting e digeridos com enzimas de restrição. 2.0 Componentes Trizol Reagente 100ml Conteúdo: Tiocianato de Guanidina, Fenol e Reagentes não tóxicos 3.0 Procedimento de Uso 3.1 Preparação das Amostras (Etapa 1) 3.1.1 Lise e Homogeneização das amostras Tecidos Adicionar 1 ml de Trizol para cada 100 mg de tecido. Homogeneizar a amostra em um homogeneizador adequado. Células de camada única Lisar as células diretamente na placa de cultura, adicionando 1ml de Trizol para cada 3,5 cm de diâmetro (aproximadamente 1x106 células), utilizar apenas placas de cultura de vidro, Trizol não é compatível com placas de plástico. Homogeneizar a amostra ressuspendendo várias vezes com o auxílio de uma pipeta. Recomenda-se lavar as células de camada única com PBS ou meio sem soro antes de adicionar o Trizol. Células em Suspensão Centrifugar as células (aproximadamente 5x106 células). Lisar as células adicionando diretamente 1 ml de Trizol para células animais, cogumelos, plantas ou de bactérias. Recomenda-se lavar as células de camada única com PBS ou meio sem soro antes de adicionar o Trizol. 3.1.2 Separação das Fases Para assegurar uma completa dissociação do complexo proteína- ácido nucléico, deixar a amostra por 5 minutos à temperatura ambiente. Adicionar 200 µl de clorofórmio para cada 1 ml de Reagente Trizol utilizado. Misturar vigorosamente em vortex a solução por 15 segundos e deixar de 2-15 min em temperatura ambiente. Centrifugar a 12.000 x g por 15 minutos à 4ºC. Observa-se uma abundante interfase, repetir este passo de extração. 3.2 Separação do RNA (Etapa 2) 1 - Transferir a fase aquosa, adquirida na preparação das amostras, para um tubo limpo e adicionar 500 µl de isopropanol (misturar por inversão). 2 - Deixar a amostra repousar por 10 minutos a temperatura ambiente e centrifugar a 12.000 x g por 10 minutos à 4ºC 3 - Descartar o sobrenadante e lavar o RNA sedimentado com 1 ml de etanol 75% (misturar por inversão). 4 - Centrifugar a 7.500 x g por 5 minutos à 4ºC 5 - Descartar o sobrenadante e dissolver o RNA em 25 µl de água livre de RNAse. Utilizar uma pipeta para facilitar a dissolução. 6-Quantificar o RNA por espectrofotometria a 260 nm. Considerar 1 unidade de OD= 40 µg/ml A amostra pode ser estocada à 4ºC por no máximo 1 semana ou por 1 ano à -20ºC. 3.3 Separação do DNA / Proteínas (Etapa 3) 1 - Descartar cuidadosamente a fase aquosa da amostra lisada e homogeneizada. Adicionar 1,5ml de Água livre de nuclease para cada 2 ml de Trizol utilizado na preparação das amostras. 2 - Agitar a amostra em vortex e centrifugar a 3.000 x g por 5 minutos a 4ºC. 3 - Descartar a fase aquosa e adicionar 150 μl de solução de CsCl 4,5 M e Citrato de Sódio 0,5 M e 1,5 ml de etanol para cada 2 ml de Reagente Trizol utilizado. 4 - Misturar por inversão por 15 segundos e centrifugar a 3.000 x g por 5 minutos à 4ºC. 5 - Separar o sobrenadante (fase orgânica protéica impura) do precipitado (DNA sedimentado impuro) e guardar a 4ºC até o início das etapas de purificações do DNA / Proteínas. Iniciar a etapa 4 utilizando o DNA sedimentado impuro obtido nesta etapa para a purificação do DNA ou iniciar a etapa 5 utilizando o sobrenadante obtido nesta etapa para o isolamento das proteínas. 3.4 Purificação do DNA (Etapa 4) 1 - Lavar o DNA sedimentado (adquirido na Etapa 3) com 3 ml de etanol 75% para cada 2 ml de Trizol Reagente utilizado na etapa de preparação da amostra. 2 - Centrifugar a 3.000 x g por 3 minutos à 4ºC. 3 - Descartar o sobrenadante e suspender o DNA sedimentado com etanol 100%. 4 - Centrifugar a 3.000 x g por 3 minutos à 4ºC. 5 - Descartar o sobrenadante e ressuspender o DNA precipitado com Água Livre de Nuclease. Estocar o DNA à -20ºC. 3.5 Separação de Proteínas (Etapa 5) 1 - Precipitar a proteína (adquirida na Etapa 3) com 6 ml de isopropanol para cada 2 ml de Trizol Reagente utilizado na preparação da amostra. Deixar a amostra em repouso por 5 minutos à temperatura ambiente. 2 - Centrifugar a amostra a 10.000 x g por 10 minutos à 4ºC. 3 - Descartar o sobrenadante e ressuspender o precipitado com 3 ml de etanol para cada 2 ml de Trizol reagente utilizado na preparação da amostra. Deixar a amostra em repouso por 5 minutos à temperatura ambiente. Centrifugar a 10.000 x g por 10 minutos à 4ºC. 4 - Repetir o procedimento 3 por mais 2 vezes. 5 - Descartar o sobrenadante e deixar a proteína sedimentada secar por 10 minutos à temperatura ambiente. Dissolver em Água Destilada. Utilizar a proteína imediatamente para Western blotting ou estocar à 20ºC.