Please note: This is a scientific communication for personal use only. All data is an intellectual property of Ana I. S. Esteves. Please do not copy or use without consent. For more info or to obtain permission, please email me at [email protected] Thank you Marine Sponges: Potential for Biotechnological Applications Ana I. S. Esteves 6º Ciclo Seminários CCMAR, 16 Março 2011 As Esponjas Marinhas Bactérias Cianobactérias Archea Eucariotas Vírus Animais Multicelulares Primitivos Alimentação por filtração Sem diferenciação celular <0,1% 6% 5% 3% Totipotência 86% Elevada densidade génica Grande diversidade de morfologias e habitats Extremamente sociáveis! Defesa essencialmente química Esponjas Marinhas: Potenciais Aplicações Biotecnológicas 6º Ciclo Seminários CCMAR, 16 Março 2011 Biotecnologia Marinha As esponjas são os mais prolíficos produtores de novos compostos Diversas Aplicações: - Farmacêutica Actividades antivirais, antitumorais, antibióticas, analgésicas, anti-inflamatórias - Tecnológica Anti-’fouling’, biomateriais, bioremediação Problema de ‘scale-up’ Blunt et. al. 2009 Nat. Prod. Rep. 26, 170-244 Hospedeiro ou Simbionte? Esponjas Marinhas: Potenciais Aplicações Biotecnológicas 6º Ciclo Seminários CCMAR, 16 Março 2011 Aplicações Biotecnológicas Dois casos de estudo: 1.Erylus discophorus e Inibição do VIH-1 2. Família Clionidae e Bioacumulação de Níquel Esponjas Marinhas: Potenciais Aplicações Biotecnológicas 6º Ciclo Seminários CCMAR, 16 Março 2011 Erylus discophorus e Inibição do VIH-1 Extracção e isolamento de macromoléculas com actividade anti-VIH Potencial aplicação farmacêutica Esponjas Marinhas: Potenciais Aplicações Biotecnológicas 6º Ciclo Seminários CCMAR, 16 Março 2011 Erylus discophorus e Inibição do VIH-1 VIH e SIDA “AIDS continues to be a major global health priority.” UNAIDS 2009 1 nova infecção/12s 1 morte/15s UNAIDS – AIDS Epidemic Report 2009 Urgente!!! Novos fármacos, novos alvos terapêuticos, vacinas. Esponjas Marinhas: Potenciais Aplicações Biotecnológicas 6º Ciclo Seminários CCMAR, 16 Março 2011 Erylus discophorus e Inibição do VIH-1 1951-Werner Bergman extrai os análogos de nucleósidos Spongotimidina e Spongouridina, da esponja Tethya crypta AZT (zidovudine) Até 2003, reportadas: - 35 espécies de esponja com metabolitos anti-VIH; - 15 classes distintas de compostos; - 9 actividades de inibição diferentes. Esponjas Marinhas: Potenciais Aplicações Biotecnológicas 6º Ciclo Seminários CCMAR, 16 Março 2011 Erylus discophorus e Inibição do VIH-1 ‘Screening’ actividade anti-VIH % Inibição do VIH-1 inhibition % 100 100 95 94 90 94 90 86 90 80 77 80 67 70 60 56 60 55 56 48 50 40 34 36 34 29 30 23 20 7 10 0 5 0 6 5 1 0 0 Erylus discophorus Esponjas Marinhas: Potenciais Aplicações Biotecnológicas 6º Ciclo Seminários CCMAR, 16 Março 2011 Erylus discophorus e Inibição do VIH-1 M.M. > 2000 kDa Natureza glicídica Molécula aniónica Esponjas Marinhas: Potenciais Aplicações Biotecnológicas 6º Ciclo Seminários CCMAR, 16 Março 2011 Erylus discophorus e Inibição do VIH-1 Conclusões: Actividade ‘Species-specific’ e independente da localização Inibição do VIH-1 ao nível da fusão Molécula (parcialmente?) glicídica, hidrofílica, M.M.>2000 kDa, aniónica a pH = 6.0 Perda de actividade: -efeito sinergístico - problema de concentração - perda de estabilidade - impedimento estereoquímico Esteves A.I.S., Nicolai M., Humanes M., Goncalves J. “Sulfated Polysaccharides in Marine Sponges: Extraction Methods and Anti-HIV Activity.” Marine Drugs. 2011; 9(1):139-153. Esponjas Marinhas: Potenciais Aplicações Biotecnológicas 6º Ciclo Seminários CCMAR, 16 Março 2011 Erylus discophorus e Inibição do VIH-1 Perspectivas futuras: Elucidação da origem biológica: hospedeiro ou simbionte? Testes de toxicidade; aplicação em géis vaginais Actividade antiviral de largo espectro? Esponjas Marinhas: Potenciais Aplicações Biotecnológicas 6º Ciclo Seminários CCMAR, 16 Março 2011 Família Clionidae e Bioacumulação de Níquel Estudo do mecanismo de bioacumulação Potencial aplicação em bioremedição Esponjas Marinhas: Potenciais Aplicações Biotecnológicas 6º Ciclo Seminários CCMAR, 16 Março 2011 Família Clionidae e Bioacumulação de Níquel Estados oxidação mais comuns: Ni2+, Ni3+ Ni2+ poderoso oxidante raio iónico Ni2+ semelhante a Zn2+ Esponjas Marinhas: Potenciais Aplicações Biotecnológicas 6º Ciclo Seminários CCMAR, 16 Março 2011 Família Clionidae e Bioacumulação de Níquel Reacções redox na célula podem danificar proteínas, lípidos e ADN Entrada, transporte, armazenamento e concentração intracelular de níquel altamente reguladas! Transportadores Metalochaperon e Proteína reguladora Permeases Metalochaperones Ni2+ Permeases Proteínas reguladoras Apoenzima Transportadores Enzima de Níquel Esponjas Marinhas: Potenciais Aplicações Biotecnológicas 6º Ciclo Seminários CCMAR, 16 Março 2011 Família Clionidae e Bioacumulação de Níquel Cataliza reacções metabólicas essenciais 6 enzimas de níquel bem estudados Glioxalase I, aciredutona dioxigenase, cis/trans-isomerase Esponjas Marinhas: Potenciais Aplicações Biotecnológicas 6º Ciclo Seminários CCMAR, 16 Março 2011 Família Clionidae e Bioacumulação de Níquel Esponjas marinhas como bioindicadores de contaminação ambiental Acumulação de metais: Poluição ou bioacumulação? ? Esponjas Marinhas: Potenciais Aplicações Biotecnológicas 6º Ciclo Seminários CCMAR, 16 Março 2011 Família Clionidae e Bioacumulação de Níquel Composição elementar de esponjas marinhas recolhidas na Reserva Natural das Berlengas (EDXRF) Specie 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 n=3 n=3 n=1 n=5 n=2 n=4 n=4 n=3 n=3 n=2 n=5 Al (%) 0.04-0.07 n.d.-0.02 n.d. n.d.-0.14 0.12-0.40 0.27-0.76 n.d.-0.32 0.10-0.86 n.d.-0.40 0.30-0.91 0.11-0.49 Si (%) 13.16-7.83 0.74-10.33 10.64 6.49-10.56 9.81-10.32 0.18-0.79 0.95-6.43 0.17-1.20 0.40-1.47 4.04-6.85 0.20-1.35 K (%) 0.64-0.70 0.19-0.72 0.78 0.76-1.36 0.43-0.54 0.49-0.61 0.73-0.91 0.48-0.68 0.61-1.38 0.59-1.16 0.21-0.91 Ca (%) 0.58-0.89 0.10-0.47 0.35 0.50-0.56 0.31-0.95 0.57-1.25 0.61-1.50 0.54-1.45 1.15-3.13 1.06-4.52 0.85-2.18 Ti 15-22 <10 14 <10-26 10-42 n.d.-14 39-100 n.d.-21 14-139 95-222 n.d.-56 Mn 45-102 <10 11 15-20 <10-12 21-34 12-95 n.d.-100 78-767 39-57 36-118 Fe 3600-5300 102-317 156 154-218 170-569 285-1800 523-3200 260-4900 816-1900 2100-12500 354-15900 Ni 2700-3500 <10-12 35 30-46 62-89 19-32 13-28 22-34 37-68 14-21 17-59 Cu 12-16 11-37 15 10-13 <10-11 17-28 14-29 20-25 31-35 18-25 25-66 Zn 4700-6700 49-58 42 31-56 255-362 40-97 34-81 37-80 71-108 24-83 60-89 As 25-32 12-47 73 60-99 16-21 33-65 47-83 47-64 64-119 31-65 14-134 0.14-0.23 0.07-0.11 0.06 0.05-0.08 0.27-0.29 0.53-0.58 0.17-0.36 0.39-0.50 0.18-0.32 0.16-0.25 0.35-0.62 Rb 25-34 13-27 11 <10-23 37-41 37-68 53-101 46-61 40-63 60-118 26-99 Sr 108-130 39-71 57 67-84 29-97 61-111 58-123 56-97 145-259 98-368 102-195 Br (%) Species: 1 - Cliona viridis; 2 - Cliona celata; 3 - Myriastra anancora; 4 - Erylus discophorus; 5 - Adocia sp; 6 - Spongia nitens; 7 - Spongia agaricina; 8 - Spongia officinalis; 9 - Cacospongia scalaris; 10 - Ircinia fasciculata; 11 - Sarcotragus spinosula n.d. = not detected n = number of samples Araújo, M. F., Conceição, A., Barbosa, T., Lopes, M. T., Humanes, M. (2003) X-Ray Spectrom., 32:428-433 Esponjas Marinhas: Potenciais Aplicações Biotecnológicas 6º Ciclo Seminários CCMAR, 16 Março 2011 Família Clionidae e Bioacumulação de Níquel Elemental composition of sediments in mg kg-1, unless otherwise stated Sediment I Sediment II Average shale Mean Sediment Mg (%) 0.58 0.53 1.5 1.4 Al (%) 2.03 2.11 8.0 7.2 Si (%) 15.07 14.41 27.3 24.5 464 208 700 670 P S (%) 0.35 0.31 - - Cl (%) 0.48 0.44 - - K (%) 1.74 2.03 2.7 2.0 Ca (%) 18.68 19.02 2.2 6.6 Ti (%) 0.025 0.020 0.5 0.4 Cr 20 17 90 72 Mn 35 29 850 770 0.35 0.14 4.7 4.1 Ni <10 <10 68 52 Cu <10 <10 45 33 Zn 12 <10 95 95 As <10 <10 13 8 Br 20 21 - - Rb 84 90 - - Sr 1200 1100 140 320 Y <10 <10 - - Zr 13 25 160 150 I 154 - - - 13 <10 20 19 Fe Pb (%) Esponjas Marinhas: Potenciais Aplicações Biotecnológicas 6º Ciclo Seminários CCMAR, 16 Março 2011 Família Clionidae e Bioacumulação de Níquel Bioacumulação: • Mineral - grânulos - adsorção • Orgânica - metalotioninas, fitoquelatinas, etc. Esponjas Marinhas: Potenciais Aplicações Biotecnológicas 6º Ciclo Seminários CCMAR, 16 Março 2011 Família Clionidae e Bioacumulação de Níquel Estratégia de Fraccionamento Composição Elementar (ICP-AES) Ni-Mt Migração ≈ NiCl2 Extracto bruto Extracto com choque térmico (h.s.e.) SDS-PAGE Cromatografia de filtração em gel Simes, D. C.; Bebiano, M. J.; Moura J. J. (2003) Aquat.Toxicol. 63(3): 307-18 Esponjas Marinhas: Potenciais Aplicações Biotecnológicas 6º Ciclo Seminários CCMAR, 16 Março 2011 Família Clionidae e Bioacumulação de Níquel Composição Elementar (ICP-AES) Na Cliona viridis ̴1425 mg Ni/kg esponja Fracção tem 6 ̴ 6% do conteúdo inicial de Ni na esponja Fracção tem 8 ̴ 7% do Ni presente no h.s.e. Esponjas Marinhas: Potenciais Aplicações Biotecnológicas 6º Ciclo Seminários CCMAR, 16 Março 2011 Família Clionidae e Bioacumulação de Níquel “Complexo Cliona viridis” – esponjas bioerosivas da família Clionidae com zooxanthellae associados 98% homologia entre sequências deste estudo 86% com sequências da base de dados (NCBI) ? Symbiodinium sp. potencial acumulador de Ni Esponjas Marinhas: Potenciais Aplicações Biotecnológicas 6º Ciclo Seminários CCMAR, 16 Março 2011 Família Clionidae e Bioacumulação de Níquel Conclusões Bioacumulação de níquel em esponjas do “Complexo Cliona viridis” independente da localização e contaminação Bioindicador de contaminação ambiental Teores médios de níquel ~1300 ppm; >100xs acima das concentrações nos sedimentos Níquel na forma íonica livre ou associado a molécula de baixa M.M. (<3000 Da), catiónica, não proteíca, provavelmente extracelular Níquel acumulado por dinoflagelados? Função de defesa? Esponjas Marinhas: Potenciais Aplicações Biotecnológicas 6º Ciclo Seminários CCMAR, 16 Março 2011 Conclusões Gerais Esponjas Marinhas: Potenciais Aplicações Biotecnológicas 6º Ciclo Seminários CCMAR, 16 Março 2011 Conclusões Gerais Extensão da plataforma continental portuguesa: 3 027 408 km2 10ª maior ZEE do mundo! Faz sentido a exploração científica dos recursos marinhos! Erylus discophorus e actividade anti-VIH: aplicação profiláctica em géis ou lubrificantes Família Clionidae e bioacumulação de níquel: utilização de microrganismo bioacumulador ou inspiração molecular no tratamento de águas e solos contaminados Esponjas Marinhas: Potenciais Aplicações Biotecnológicas 6º Ciclo Seminários CCMAR, 16 Março 2011 Microbial Ecology and Evolution Microbial Ecology and Evolution “Unlocking the bacterial diversity encrypted in the metagenomes of marine sponges” Irciniidae in a bottle: culturable bacteria from Ircinia sp. and Sarcotragus sp. 353 Isolates 1.67% 2.68% 0.33% 5.69% Alphaproteobacteria - 182 sequences Gammaproteobacteria - 86 sequences 28.76% 60.87% Pseudovibrio (125) Ruegeria (44) Vibrio (36) Flavobacteria - 17 sequences Bacilli - 8 sequences Actinobacteria - 5 sequences Sarcotragus spinosulus most diverse sponge Sphingobacteria - 1 sequence PKS+ => Biotechnological Potential Microbial Ecology and Evolution “Unlocking the bacterial diversity encrypted in the metagenomes of marine sponges” Future Research: Explore the biotechnological potential of marine sponge isolates -PKS/NRPS Screening - Antagonistic Activity - Fractionation, isolation and characterization of metabolites from most promising isolates Agradecimentos BIOINMAR – DQB/CQB FCUL Prof. Madalena Humanes Marisa Nicolai André Natálio Rute André ICAT/BIOFIG FCUL Prof. Rogério Tenreiro Sandra Chaves URIA-CPM FFUL João Gonçalves Biólogos de estimação: Joana Xavier Sven Zea Jean Vacelet Emma Cebrian CCMAR Rodrigo Costa Prof. Margarida Reis Jorge Gonçalves & Group CCMAR/BPD/0002/2011 €€€€ FCT €€€€€ SFRH/BD/17874/2004 PTDC/MAR/101431/2008 Thank You!