Núcleo de Pesquisa em Biodiversidade e
Computação
BioComp
Reunião geral
19/12/12
Agenda proposta







9:00 - recepção e adoção da agenda
9:10 - apresentações (< 5´ cada)
10:00 - Perguntas e discussão sobre as
atividades propostas
10:40 - café
11:00 - Discussão sobre as atividades propostas:
consolidação e calendário
11: 30 - Informações gerais do BioComp
11:40 - Encerramento
Biodiversidade e Computação
Núcleo de Apoio à Pesquisa - USP
Objetivos



Balanço das ações e resultados em 2012
Propostas para 2013
Reunião do Conselho
Biodiversidade e Computação
Núcleo de Apoio à Pesquisa - USP
Objetivo do BioComp


Criar um fórum onde pesquisa, educação e
extensão sobre conservação e uso sustentável
da biodiversidade são realizadas segundo um
enfoque multidimensional envolvendo Biologia,
Computação, Engenharia, Agricultura, Economia,
entre outras áreas.
Criar conhecimento e aplicá-lo para o benefício
da sociedade é nossa meta final.
Biodiversidade e Computação
Núcleo de Apoio à Pesquisa - USP
Fórum

Promover a interação entre as partes é o ponto principal

Novas idéias, propostas e parcerias







Pesquisa e projetos
Educação e orientação
Publicações
Extensão
Treinamento
Divulgação
Eventos
Biodiversidade e Computação
Núcleo de Apoio à Pesquisa - USP
Há muita atividade em curso !



Nem sempre amplamente visíveis
Envolvendo grupos menores
Apenas parte da equipe original


Mas com novas adesões
BioComp = grupo consolidado


Pré-existência de projetos e atividades (contrapartida)
São parte do BioComp !
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Desafios


Divulgar melhor as atividades
Aumentar as interações e a transdisciplinaridade



Em pequena escala
Em grande escala
Aumentar as atividades e a participação

comprometimento ≠ envolvimento
Biodiversidade e Computação
Núcleo de Apoio à Pesquisa - USP
Exemplos - projetos
Exemplos - projetos

Classificação de abelhas baseada em imagens


Modelagem de distribuição de espécies: estudos de caso


Anarosa, Fabiana, Saraiva
Classificação de plantas baseada em imagens


Cris Giannini, André Acosta, Vera, Saraiva
Abordagem semântica para padrões de dados de
biodiversidade


Tiago, Anna, Fabiana, André
Carlos, Anna, Luis Otávio
Redes de interação biológicas e aplicações

Tatiana, Juliana, Nancy, Saraiva
Biodiversidade e Computação
Núcleo de Apoio à Pesquisa - USP
Exemplos - projetos

Inventário e gestão ambiental & RFId


Digitalização de dados de biodiversidade


Allan, Danilo, Lucas, Etienne, Saraiva
Qualidade de dados de biodiversidade


Márcia, Carlos, Kleber, Jade,
Allan, Saraiva
Interação Abelha-planta

Garófalo, Cláudia, Hipólito, Michelle
Biodiversidade e Computação
Núcleo de Apoio à Pesquisa - USP
Exemplos - projetos

Sistemas de informação e redes de sensores


Comunicação e divulgação


Wilian, Fabiana, Carlos e Saraiva
Bruno Nunes Silva et all
Outros exemplos a relatar ??
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Exemplos – pesquisadores visitantes
Pesquisadores visitantes

Friedrich Recknagel


Universidade de Adelaide - AU
5 a 24/mar/2012
• Palestra “Área de pesquisa em Informática Ecológica: Estado da Arte
e Desafios”, 8/3/12
• Disciplina de Pós-graduação - Tópicos Especiais em Computação e
Biodiversidade
– 13 a 15/3/12
• Interação com pesquisadores em SP
• Preparação do ISEI 2012 (International Conference on Ecological
Informatics)
Biodiversidade e Computação
Núcleo de Apoio à Pesquisa - USP
Pesquisadores visitantes

Rolf A. de By




University of Twente – Netherlands
Dept of Geoinformation Processing (GIP) ITC
Faculty of Geo-information Science and Earth Observation
15/Junho/2012
• Seminário “Opportunities for research collaboration on biodiversity informatics
• Poli – SP

Outros participantes
•
•
•
•
Andrea Pignatari Drucker – Embrapa monitoramento ambiental
Laurindo Campos e Andrea Albuquerque - INPA
Dilvan Moreira -ICMC-USP
Pedro Correa e Antonio Saraiva
Biodiversidade e Computação
Núcleo de Apoio à Pesquisa - USP
Pesquisadores visitantes

Lucas Garibaldi


Universidade Nacional de Rio Negro – AR
Julho/2012
• Palestra ‘Marginal contribution of ecosystem services to agricultural
productivity’, 25/7/12
• Interação com pesquisadores em SP e RP, 19 a 27/7/12

28/novembro a 1/dezembro/2012
• Disciplina de Pós-graduação - PCS-5026
– Regresion Lineal en el software R, 29 e 30/11/12
• Interação com pesquisadores em SP
Biodiversidade e Computação
Núcleo de Apoio à Pesquisa - USP
Pesquisadores visitantes

Jacobus Biesmeijer


Naturalis Biodiversity Center, Leiden-Netherlands
Julho/2012
• Palestra “Changes in plant-flower visitor communities through time
and space”
– Encontro sobre Abelhas – 25/7/12
• Interação com pesquisadores em RP, 24 a 28/7/12
Biodiversidade e Computação
Núcleo de Apoio à Pesquisa - USP
Pesquisadores visitantes

Andrew Townsend Peterson


University of Kansas
9/agosto/2012
• Palestra “New Developments and Insights in Ecological Niche
Modeling ”
• Interação com pesquisadores em SP
• Discussão sobre proposta de projeto temático em Modelagem de
distribuição de espécies
Biodiversidade e Computação
Núcleo de Apoio à Pesquisa - USP
Pesquisadores visitantes

Jesús Aguirre Gutiérrez,


Naturalis Biodiversity Center, Leiden-Netherlands
9/outubro/2012
• Palestra “Fit-for-purpose: Species distribution model performance
depends on evaluation criteria: Dutch hoverflies as a case study”
– Eco-Encontros (IB-USP)
• Interação com pesquisadores em SP (8 a 11/10/12)
Biodiversidade e Computação
Núcleo de Apoio à Pesquisa - USP
Pesquisadores visitantes

Armando Geller


Scensei, EUA
18/outubro/2012
• Palestra “Multiagent modeling and simulation for and with
stakeholders in areas affected by armed conflict ”
– CCE-USP
Biodiversidade e Computação
Núcleo de Apoio à Pesquisa - USP
Pesquisadores visitantes

Enrique Martínez-Meyer



Instituto de Biología,
Universidad Nacional Autónoma de México
29/11 a 7/12/2012
• Palestra “The Use of Primary Biodiversity Data and Informatics Tools
for Scientific Research and Decision Making”
– Poli - SP
• Interação com pesquisadores em SP (29/11 a 1/12)
• Participação no ISEI 2012 com apoio do BioComp
Biodiversidade e Computação
Núcleo de Apoio à Pesquisa - USP
Eventos

Simpósio “Ferramentas computacionais para pesquisa
em polinizadores”

X Encontro sobre Abelhas, 25/Julho/2012
• Jacobus Biesmeijer
– Changes in plant-flower visitor communities through time and space
• Humberto Ribeiro da Rocha
– Avaliação dos serviços ambientais de polinização e qualidade do habitat
• Milton Cezar Ribeiro
– Modelos de simulação: Desafios e possibilidades para explorar efeitos da
paisagem sobre as abelhas
• Lucas Alejandro Garibaldi
– Marginal contribution of ecosystem services to agricultural productivity
• Antonio Mauro Saraiva / Tereza Cristina Giannini
– The Research Center on Biodiversity and Computing BioComp
Biodiversidade e Computação
Núcleo de Apoio à Pesquisa - USP
Eventos

ISEI - International Conference on Ecological
Informatics




3 a 7/dezembro/2012
Apoio à vinda de Enrique Martinez-Meyer
Comissão Organizadora (Pedro L.P. Correa)
participação de pesquisadores no evento
Biodiversidade e Computação
Núcleo de Apoio à Pesquisa - USP
Disciplinas de Pós-graduação

Computação e Biodiversidade




PCS – 5023
BIE – 5789
Oferecida em 2º sem 2011
Tópicos especiais em Computação e
Biodiversidade


PCS – 5026
Oferecida 2 vezes em 2012
• Fred Recknagel (1º sem)
• Lucas Garibaldi (2º sem)
Biodiversidade e Computação
Núcleo de Apoio à Pesquisa - USP
Outros eventos ou atividades ??
Administração

Técnico Procontes: Analista Administrativo


Sra. Lourdes Keiko Nagae Takigami (Fev/12)
Apoio administrativo / financeiro
• Execução e acompanhamento financeiros
– Recursos Pró-Reitoria de Pesquisa - USP
– Recursos de outras fontes (ex.: FUSP, FDTE)
• Apoio aos eventos locais, cursos, recepção visitantes
• Organização do laboratório
Biodiversidade e Computação
Núcleo de Apoio à Pesquisa - USP
GT NAPs


Grupo de trabalho dos Núcleos de Apoio à
Pesquisa
Criado pela Pró-Reitoria de Pesquisa e ViceReitoria Executiva para Assuntos Administrativos

Portaria CODAGE, nº 574, de 13.07.2012, DOE
18.07.2012
Biodiversidade e Computação
Núcleo de Apoio à Pesquisa - USP
GT NAPs

“propor medidas para regular as formas de apoio
à gestão dos projetos dos Núcleos de Apoio a
Pesquisa, de modo a estabelecer procedimentos
e rotinas, desburocratizados e eficientes, mais
adequados à realização da atividade-fim”,
abrangendo precipuamente as áreas tecnologia
da informação e comunicação, organizacional e
jurídica.
Biodiversidade e Computação
Núcleo de Apoio à Pesquisa - USP
GT NAPs

MARIA PAULA DALLARI BUCCI



PETER GREINER JR.



Coordenador de Administração Geral
OSVALDO NAKAO



Departamento de Informática
LUIZ ANTONIO TEIXEIRA


Professor da Escola Politécnica e
Diretor do Departamento de Informática
LUIS MOREIRA GOMES


Diretor do Departamento de Administração
LUIS NATAL ROSSI


Diretor do Departamento de Finanças
LUIS CARLOS CORREA DE SANTANA


Procuradora
Designada para Assessoria Técnica do Gabinete
Professor da Escola Politécnica e
Assessor da Pró-Reitoria de Pesquisa
ANTONIO SARAIVA


Presidente da Comissão de Pesquisa da Escola Politécnica e
Membro do Conselho de Pesquisa
Biodiversidade e Computação
Núcleo de Apoio à Pesquisa - USP
Apoio técnico







Edson de Souza
Suzano Bitencourt
Nilton do Carmo
Desenvolvimento dos Web sites
Hospedagem de ferramentas (CCE)
Compras de equipamentos
Manutenção
Biodiversidade e Computação
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Propostas para 2013
Pesquisadores visitantes e eventos

Lucas Garibaldi



Cursos de estatística (cont) até modelos mistos
Pesquisa – avaliação econômica
Jacobus Biesmeijer



Treinamento em modelagem e análise de dados (de
polinizadores)
Pesquisa
Pós-docs / doc
• Luisa Carvalheiro
• Chiara Polce
• Jesus Aguirre
Biodiversidade e Computação
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Pesquisadores visitantes e eventos

Rede de catálogos polínicos



Cláudia Ines
Reunião para discussão dos padrões e formação da
rede
TDWG meeting



Firenze, Outubro/Nov 13
Sessão em qualidade de dados de biodiversidade
Allan, Etienne e Saraiva
Biodiversidade e Computação
Núcleo de Apoio à Pesquisa - USP
Pesquisadores visitantes e eventos

Instituto de Estudos Avançados da USP



Grupo de Serviços de Ecossistemas
Vera L.I. Fonseca (coord)
Reuniões
• Capítulo de Políticas Públicas e Polinizadores (mar)
• Mudanças Climáticas e Polinizadores (1º e 2º sem)
• Conservação de polinizadores: apoio de ferramentas moleculares e
de coleções biológicas para políticas públicas
Biodiversidade e Computação
Núcleo de Apoio à Pesquisa - USP
Pesquisadores visitantes e eventos


Outros?
Critérios

Interesse e aproveitamento mais amplo possível
Biodiversidade e Computação
Núcleo de Apoio à Pesquisa - USP
Conselho










Cris Miyaki – IB
Vera Fonseca – IB/UFERSA
Pirani – IB
Kleber – EP
Vitor – EP
Carlos – EP
Tiago – EACH
Garófalo – FFCLRP
Lionel – FFCLRP/UFERSA
Fabiana – UFABC
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Divulgação

Web site (biocomp.org.br)

Atualização
•
•
•
•



Pessoas
Projetos
Instituições
Produção e atividades
Multilíngüe
Relatórios
Folder
Biodiversidade e Computação
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Projetos de pesquisa: financiamento

Novos financiamentos para projetos



Temático FAPESP – Open Modeller ??
FAPESP – rede de catálogos polínicos (p 2014)
Outros ??
Biodiversidade e Computação
Núcleo de Apoio à Pesquisa - USP
Tema 1
Redes de sensores aplicados à
agrobiodiversidade
Coordenadores
Carlos Cugnasca - Escola Politécnica
Vera Fonseca - Instituto de Biociências
Biodiversidade e Computação
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Tema 2
Caracterização e estudo biológico e
computacional de forma,
comportamento e comunicação em
seres vivos
Coordenadores
Anna Helena - Escola Politécnica
Tiago Francoy - EACH
Biodiversidade e Computação
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Tema 3
Modelagem, análise e tomada de
decisão em biodiversidade
Coordenadores
Cris Arias - Instituto de Biociências
Pedro Correa - Escola Politécnica
Biodiversidade e Computação
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Tema 4
Identificação de espécies e interações
biológicas: abordagens moleculares e
morfológicas
Coordenadores
Cris Miyaki - Instituto de Biociências
André Hirakawa - Escola Politécnica
Biodiversidade e Computação
Núcleo de Apoio à Pesquisa - USP
Tema 5
Diversificação, biogeografia e
conservação da biota neotropical: uma
abordagem integrativa
Coordenadores
Tatiana Torres - Instituto de Biociências
Liria Sato - Escola Politécnica
Biodiversidade e Computação
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Boas Festas !
Um 2013 com muito mais sucesso e
resultados !