51º Congresso Brasileiro de Genética Resumos do 51º Congresso Brasileiro de Genética • 7 a 10 de setembro de 2005 Hotel Monte Real • Águas de Lindóia • São Paulo • Brasil www.sbg.org.br - ISBN 85-89109-05-4 [email protected] Palavras-chave: cana-de-açúcar, promotor, tecido-especificidade Hoshino, AA1; Maia, IG1; Gimenes, MA1, 2 1 Departamento de Genética, Instituto de Biociências, Universidade Estadual Paulista, Botucatu, SP. 2Centro de Pesquisa e Desenvolvimento de Recursos Genéticos Vegetais, Instituto Agronômico de Campinas, Campinas, SP. Isolamento e caracterização parcial da região promotora de um gene com expressão tecidoespecífica em raiz de cana-de-açúcar A cana-de-açúcar é uma espécie de grande importância econômica pela produção de açúcar e álcool e, o Brasil é o seu maior produtor mundial. A produção de plantas geneticamente modificadas tem permitido o melhoramento de genótipos pela introdução de genes de interesse e pelas alterações nos padrões de expressão dos mesmos. O promotor é uma região de grande importância na produção de transgênicos por ser o processador central da regulação de um gene contendo os sítios de ligação para as RNA polimerases e fatores de transcrição, ele determina a freqüência em que um gene é transcrito. Visando identificar genes com expressão tecido-específica em cana de açúcar para a posterior clonagem de suas sequências promotoras, uma análise “in silico” no banco de sequências expressas (EST) do projeto SUCEST foi realizada. Nesta análise foram selecionados 15 candidatos para a validação da tecido-especificidade por RT-PCR e dentre esses, dois tiveram confirmada a expressão específica em raiz. Oligonucleotídeos foram desenhados com base na seqüência de um dos ESTs validados e os mesmos foram utilizados no isolamento da região promotora pela técnica de TAIL-PCR. Esta consiste na amplificação de regiões adjacentes à seqüência conhecida por meio de iniciadores arbitrários. Um fragmento de aproximadamente 400 pb foi amplificado empregando DNA genômico de cana-deaçúcar e a sua seqüência de nucleotídeos determinada. O alinhamento da referida seqüência com a seqüência do EST disponível no SUCEST demonstra que a mesma está situada a montante (5’) do transcrito usado para o desenho dos oligonucleotídeos. Tal seqüência não apresenta similaridade com seqüências depositadas nos bancos do SUCEST ou GenBank, tratando-se portanto de uma porção inédita do genoma da cana-de-açúcar ainda não caracterizada. Análises em bancos de dados de seqüências regulatórias indicam a presença de vários sítios regulatórios putativos. Novos oligonucleotídeos estão sendo desenhados para emprego na técnica de TAIL-PCR visando estender esta seqüência promotora putativa antes do início da análise funcional. Apoio financeiro: FAPESP, CNPq. 556