Serviços em Bioinformática de Alta Performance – Laboratório Genômica Integrativa
O Laboratório Genômica Integrativa (LGI) do Instituto de Biociências da UNESP (Campus de
Botucatu), via seu core computacional, coloca os seguintes serviços em biologia computacional
para uso da comunidade, de acordo com as especificações e custos abaixo. Dúvidas e detalhes
de projetos específicos, enviar email para Cesar Martins ([email protected]).
Serviços&
Montagem de transcriptoma (de novo)
Duração
sob consulta
Análise de expressão de transcriptomas
(com referência).
Montagem de genoma (de novo)
Montagem de genoma (com
referência)
Análise de expressão de
MicroRNAomas
Análise de ncRNAs
sob consulta
Análise de DNAs repetitivos e
elementos transponíveis
Instalação softwares
Suporte/Administração
remota/unidade computacional (use
como referência o Computador SGI UV
2000)
Suporte/Administração unidade
computacional
Consultoria
Outros serviços
sob consulta
R$ 2.000,00* + R$ 50
por biblioteca
R$ 2.000,00* + R$ 50
por biblioteca
sob consulta
sob consulta
R$ 500,00*
RS 15.000,00**
Hora atividade
R$200,00
Hora atividade
sob consulta
R$200,00
sob consulta
sob consulta
sob consulta
sob consulta
sob consulta
Custo
R$ 3.000,00* + R$ 70
por biblioteca
RS 2.000,00* + R$ 70
por biblioteca
R$ 3.000,00*
R$ 2.000,00*
(&) Inclui participação do interessado no serviço em acompanhar os trabalhos para fins de
aprendizado.
(*) Valores por serviço com base em bibliotecas de 30 milhões de reads para transcriptomas e
300 milhões de reads para genomas. Estes valores podem variar dependendo do número de
reads.
(**) valor por ano
1
Treinamentos (individual e sob
agendamento)
Montagem de transcriptoma (de novo)
Análise de expressão de transcriptomas (com
referência)
Montagem de genoma (de novo)
Montagem de genoma (com referência)
Análise de expressão de microRNAomas
Análise de ncRNAs
Análise de DNAs repetitivos e elementos
transponíveis
Instalação softwares
Treinamentos em grupo
Outros treinamentos
Utilização de equipamentos com suporte
técnico LGI
Pacote 1:8 threads;30 GB RAM;500 GB disco.
Pacote 2:16 threads;40 GB RAM;1 TB disco.
Pacote 3: Customizado
Servidor para base de dados
Horas de
treinamento
40
40
Custo
40
40
40
40
40
R$ 3.000,00
R$ 3.000,00
R$ 3.000,00
R$ 3.000,00
R$ 3.000,00
20
R$ 1.500,00
sob consulta
sob consulta
Horas de
utilização
168
168
168
Sob consulta
R$ 3.000,00
RS 3.000,00
Custo
Sob consulta
Sob consulta
Sob consulta
Sob consulta
Estrutura computacional disponível
Computador SGI UV 2000: 64 núcleos em 8 soquetes. 8 processadores Intel
Xeon Eight-core E5-4650L de 2.6GHz, com 20MB de cache, 8.0GT/s; 1024GB
de memória RAM DDR3 1600MHz; dois discos SAS de 160GB. SGI MIS GBOD;
45 discos SAS de 3TB a 7200rpm; 1 controladora RAID9280-8E com duas
portas SAS de 6Gbps; Sistema SUSE Linux.
Computador desktop Workstation T7600:16 núcleos em dois soquetes. Dois
processadores Intel Xeon Eight-core E5-2687 de 3.1GHz; Vídeo NVIDIA 1GB;
128GB de memória RAM; 4 discos SATA de 3TB.
Computador desktopWorkstation T7600: 12 núcleos em dois soquetes. Dois
processadores Intel Xeon Six-core E5-2667 de 2.9GHz; Vídeo NVIDIA 1GB;
64GB de memória RAM; 4 discos SATA de 3TB.
Servidor para base de dados (SCG C2108-RP2) configurado com: 16 núcleos em dois
soquetes. Dois processadores Intel Xeon Eight-core E5-2670 de 2.6GHz; 64GB de
memória RAM; 5 discos SATA de 3TB.
Dúvidas ou maiores esclarecimentos, preencher formulário em anexo e enviar via email aos
cuidados de Cesar Martins ([email protected]).
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