Interpretação brasileira de
genotipagem – Algoritmo
Brasileiro
Anderson Alvarenga Pereira
Ministério da Saúde
Departamento de DST/Aids e Hepatites Virais
Introdução

Contexto
◦ Criação da Rede Nacional de Genotipagem –
RENAGENO (2001).
 23 Laboratórios.
◦ Necessidade de criar um algoritmo próprio –
(2003).
◦ Oferecer recursos para os laboratórios da
RENAGENO.
2
Motivação
Aumento da demanda por exames de
genotipagem.
 Demora na utilização dos algoritmos
públicos e privados.
 Necessidade de adequação a realidade
brasileira.

◦ Interpretação em português;
◦ Características locais da circulação do HIV.
3
Objetivos
Validar a qualidade das sequências
produzidas;
 Subtipar as sequências com simplicidade e
eficiência;
 Desenvolver o algoritmo baseado nas
regras do comitê da RENAGENO.

Contaminação
Subtipo
Algoritmo
Brasileiro
4
Desafios

Conhecimentos avançados envolvidos.
◦
◦
◦
◦
◦
Biológicos;
Computacionais;
Modelos matemáticos e estatísticos;
Modelagem do conhecimento em formação;
Simplificação para o uso de não especialistas;
5
Algoritmos de resistência à drogas

Baseado em Regras:
◦ Analisam a presença ou ausência de mutações específicas;
◦ Atribuem níveis de resistência a cada droga.

Baseado em penalidades/score:
◦ Atribuem penalidades presença ou ausência de mutações
específicas.

Público – Acesso livre via internet, mantido por universidades
ou órgãos governamentais.
◦
◦
◦
◦

HIVdb – Universidade de Stanfort;
ANRS – Agence Nationale de Recherches Sur le Sida;
Rega – Rega Institute;
Algoritmo Brasileiro.
Privados
◦ Mantidos por empresas.
6
Diferença entre Algoritmos
Baseado em Regras ou Penalidades
Níveis de resistência conferidos
◦ ANRS e REGA
 Sensível;
 Intermediário;
 Resistente.
◦ HIVdb





Sensível;
Potencial baixo nível de resistência;
Baixo Nível de Resistência;
Resistência intermédiária;
Alto nível de resistência.
◦ Algoritmo Brasileiro




Sensível;
Intermediário;
Resistente;
NA (Não se aplica).
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Diferença entre Algoritmos

Drogas avaliadas pelo algoritmo;
◦ Brasileiro = 22 drogas
◦ HIVdb e REGA = 13 drogas
◦ ANRS = 10 drogas

10 drogas estão nos 4 algoritmos;
◦ 3TC, ABC, ATV/r, D4T, DDI, DRV, EFV,
NFV, SQV/r, TDF
Interpretação da relação entre mutações
e resistência à droga.
 Resultados divergentes.

8
Algoritmo Brasileiro

Abrange as características
específicas do HIV no Brasil;

Baseado nas regras de
resistência a drogas criadas
pelo comitê da RENAGENO;

Maior quantidade de drogas
avaliadas;

Entre 10.000 a 15.000 exames
ano.

Validado pelo banco da
RENAGENO com mais de
20.000 sequências.

Mais de 400 médicos de
referência em genotipagem
treinados para interpretar os
laudos;
Página de acesso e resultado do Algoritmo Brasileiro de Genotipagem
http://aids.gov.br/genotipagem
9
Algoritmo Brasileiro
Revisão periódica;
 Atualização sempre que necessário;
 Processo de atualização:

◦
◦
◦
◦
◦
◦
Definição da regra pelo comitê;
Desenvolvimento da nova versão;
Teste da nova versão pelo comitê;
Comparação do Impacto das versões;
Treinamento dos médicos (MRG’s);
Liberação da nova versão.
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