Bioquímica
Proteínas
Os aminoácidos ligam-se formando cadeias
polipeptídicas
Ligação peptídica nos seres vivos
- A ligação peptídica não ocorre por ligação direta
- Ocorre por um complexo aparato de síntese proteica
Incluí: ribossomos, ácidos nucléicos, várias
proteínas e enzimas.
A equação da ligação peptídica é um esquema didático
As ligações peptídicas tem características
intermediarias entre ligação simples e dupla
Formas de Ressonância
Planos rígidos
Pontos de dobramento
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cis-peptide group.
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trans-peptide group.
Cadeias polipeptidicas
A sequência de aminoácidos tem direção
Polipeptídios
Nomenclatura:
2 aminoácidos: dipeptídio
3 amino ácidos: tripeptídio
Até 30 aminoácidos: oligopeptídio/ peptídios
>30 : polipeptídios
Peptídios de importância biológica
Estrutura proteína
A sequência de aminoácidos determina a estrutura
espacial da proteína
Descrita em 4 níveis:
- Estrutura primária
- Estrutura secundária
- Estrutura terciária
- Estrutura quaternária
Estrutura proteína
Estrutura primária
É a sequência de aminoácidos
Determinada geneticamente
Específica para cada proteína
Exemplo hipotético:
1)
Ala – Ser – Lys
2)
Lys – Ser – Ala
Em que diferem as duas sequências acima?
Estrutura primária
Estrutura secundária
Estruturas regulares tridimensionais
Formadas por segmento de cadeia polipeptídica
1) enrolamento ao redor de um eixo
2) interação lateral de segmentos
Estabilização por pontes de hidrogênio
A maior parte das proteínas formam os dois tipos
de estrutura
Estrutura secundária
Estrutura secundária
α-hélice
Pontes de hidrogênio entre uma unidade peptídica e a
quarta unidade peptídica subsequênte.
Estrutura secundária
α-hélice
Mioglobina
Apresenta cerca de 80% da cadeia polipeptídica
organizada como α-hélice
Mioglobina
Amarelo: Aminoácidos hidrofóbicos
Azul: Aminoácidos com carga
Banco: Outros
Estrutura secundária
β-pregueada
Anti-paralela
Estrutura secundária
β-pregueada
Paralela
Estrutura secundária
β-pregueada
Mista – Paralela/ anti-paralela
Estrutura secundária
β-pregueada
Mista – Paralela/ anti-paralela
Concanavalina-A
Proteína vegetal do grupo das lectinas
Alto conteúdo de folhas β
Estrutura terciária
Estrutura terciária
Também se estabiliza por pontes dissulfeto
São catalizadas por enzimas específicas
Pontes dissulfeto:
Raramente encontrada intracelularmente
Mais frequente em proteínas secretadas
extracelularmente:
Ex. Insulina (3 pontes dissulfeto)
Pontes dissulfeto
Pontes dissulfeto
Vasopressina
Ocitocina
Cys
Cys
Phe
Ile
Cys
Arg
Cys
Leu
Pontes dissulfeto
Estrutura da insulina bovina
Estrutura terciária
Pode conter domínios:
Regiões diferenciadas
Domínio:
Organização espacial compacta
Interior hidrofóbico
Superfície polar
Geralmente cadeias com mais de 200 resíduos de aa
são as que dobram em dois ou mais domínios.
Estrutura quaternária
Associação entre duas ou mais cadeias polipeptídicas
(sub-unidades)
Mantida por ligações não covalentes entre as subunidades (mesmos tipos da terciária)
As sub-unidades podem ser iguais ou diferentes.
Estrutura quaternária