Luís Jorge A. Chorão de Q. Duarte
curriculum vitæ
Julho, 2012
Índice
Índice .........................................................................................................................................2
1. IDENTIFICAÇÃO .......................................................................................................................4
2. QUALIFICAÇÕES ACADÉMICAS ..............................................................................................4
3. ACTIVIDADE PROFISSIONAL...................................................................................................5
3.1. Carreira de investigação ......................................................................................................5
3.2. Actividade docente ..............................................................................................................5
3.3. Actividade no âmbito da Qualidade ......................................................................................6
3.4. Colaboração com a Indústria ...............................................................................................6
3.5. Experiência profissional .......................................................................................................6
3.6. Estágios no estrangeiro .......................................................................................................7
3.7. Participação em projectos de investigação ...........................................................................7
3.7.1
Como PI ....................................................................................................................7
3.7.2
Como responsável de parceiro (LNEG) .....................................................................7
3.7.3
Como membro da equipa ..........................................................................................7
3.8. Participação em Redes de Conhecimento............................................................................9
3.9. Bolsas auferidas ..................................................................................................................9
3.10. Orientação científica ........................................................................................................ 10
3.10.1
Pós-Doutoramento .................................................................................................. 10
3.10.2
Doutoramento ......................................................................................................... 10
3.10.3
Orientação Científica de bolseiros no âmbito de projectos ....................................... 11
3.10.4
Mestrado ................................................................................................................. 11
3.10.5
Licenciatura ............................................................................................................ 11
3.10.6
Estágios Pós-graduação ......................................................................................... 12
3.10.7
Estágios Ciência Viva.............................................................................................. 13
3.11. Organização de encontros científicos ............................................................................... 13
3.12. Revisão científica............................................................................................................. 14
3.13. Palestras convidadas ....................................................................................................... 14
3.13.1
Em eventos internacionais ...................................................................................... 14
3.13.2
Em instituições nacionais ........................................................................................ 14
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3.14. Participação em júris........................................................................................................ 15
4. PRÉMIOS E DISTINÇÕES ....................................................................................................... 16
5. PUBLICAÇÕES ....................................................................................................................... 16
5.1. Teses ................................................................................................................................ 16
5.2. Capítulos de livros ............................................................................................................. 17
5.3. Artigos em publicações de circulação internacional com arbitragem científica .................... 17
5.4. Patentes ............................................................................................................................ 19
5.5. Artigos em revistas de circulação nacional com arbitragem científica ................................. 20
5.6. Publicações em actas de encontros científicos................................................................... 20
5.7. Comunicações orais .......................................................................................................... 22
5.7.1
Por convite em congressos internacionais ............................................................... 22
5.7.2
Em congressos internacionais ................................................................................. 22
5.7.3
Por convite em conferências nacionais .................................................................... 24
5.7.4
Em conferências nacionais ...................................................................................... 24
5.8. Comunicações em painel ................................................................................................... 24
5.8.1
Em conferências internacionais ............................................................................... 24
5.8.2
Em conferências nacionais ...................................................................................... 30
5.9. Outros ............................................................................................................................... 31
5.9.1
Apoio à indústria – relatórios ................................................................................... 31
5.9.2
Software.................................................................................................................. 32
5.9.3
Trabalhos de divulgação ......................................................................................... 32
5.9.4
Textos de apoio aos alunos ..................................................................................... 32
6. QUALIFICAÇÕES ADICIONAIS ............................................................................................... 32
6.1. Certificação de Aptidão Pedagógica................................................................................... 32
6.2. Cursos de curta duração .................................................................................................... 32
6.3. Outras acções de formação ............................................................................................... 34
6.4. Domínio de línguas ............................................................................................................ 35
6.5. Conhecimentos de informática ........................................................................................... 35
7. SOCIEDADES CIENTÍFICAS ................................................................................................... 35
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1. IDENTIFICAÇÃO
Nome: Luís Jorge Abreu Chorão de Quelhas Duarte
Data de Nascimento: 20 de Outubro de 1970
Naturalidade: N.ª Sr.ª de Fátima - Lisboa
Filiação: João Quelhas Duarte e Maria Fernanda Abreu Chorão Quelhas Duarte
Nacionalidade: Portuguesa
Estado Civil: Casado, 2 filhos
B.I.: n.º 8910741 de 21/01/2004 – Lisboa
NIF: 196037565
Morada: Rua Pedro Álvares Cabral, n.º 5, 7º Esq.º, 2685-229 Portela LRS
Tel.: 219430387
Local de Trabalho:
Tlm.: 969069117
Laboratório Nacional de Energia e Geologia, I.P.
Unidade de Bioenergia
Estrada do Paço do Lumiar, n.º 22
1649-038 Lisboa
Tel.: 351 210924600 Ext. 4317
Fax: 351 217163636
Email: [email protected]
2. QUALIFICAÇÕES ACADÉMICAS
15/2/2008:
Provas de Acesso à categoria de Investigador Auxiliar (PPED: Provas Públicas
Equivalentes
a
Doutoramento)
na
área
de
Biotecnologia
Agro-
industrial/Microbiologia especialidade de Fisiologia Microbiana, INETI - Instituto
Nacional de Engenharia Tecnologia e Inovação.
Classificação: Distinção e Louvor por unanimidade.
9/10/1997:
Mestrado em Biotecnologia (Engenharia Bioquímica), Instituto Superior Técnico de
Lisboa.
Classificação do Curso Especializado: 17 (Dezassete) valores.
12/2/1994:
Licenciatura em Bioquímica, Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa
Classificação final: 15 (Quinze) valores.
Estágio Final de Licenciatura: 18 (Dezoito) valores, realizado na área da Fisiologia
Microbiana / Bioquímica
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3. ACTIVIDADE PROFISSIONAL
3.1. Carreira de investigação
Desde 1/1/2009
Investigador Auxiliar na Unidade de Bioenergia, LNEG com Contracto de Trabalho em
Funções Públicas por Tempo Indeterminado.
15/2/2008-31/12/2008
Investigador Auxiliar na Unidade de Bioenergia, LNEG, com nomeação definitiva.
11/8/2000-14/2/2008
Assistente de Investigação (com contrato administrativo de provimento) na Unidade de
Fisiologia Microbiana e Bioprocessos, INETI-DB.
18/1/2000–10/8/2000
Estagiário de Investigação (com contrato administrativo de provimento, precedendo
concurso) na Unidade de Fisiologia Microbiana e Bioprocessos, INETI-DB.
1/6/1998–17/1/2000
Estagiário de Investigação (contratado) na Unidade de Microbiologia IndustrialBioprocessos, INETI-DB.
1/1/1997–31/5/1998
Bolseiro FCT/JNICT (BIC) na Unidade de Microbiologia Industrial-Bioprocessos INETI-DB.
1/1/1995–31/12/1996
Bolseiro Praxis XXI, (BM) na Unidade de Microbiologia Industrial-Bioprocessos INETI-DB.
5/1/1993–31/12/1994
Bolseiro PEDIP Programa JTI, na Unidade de Microbiologia Industrial-Bioprocessos INETIDB.
12/10/1992–4/1/1993
Estagiário de Licenciatura na UMIB sob a orientação do Doutor Francisco Gírio.
3.2. Actividade docente
2006/2007
Regente da disciplina Processos e Produtos Biotecnológicos do primeiro semestre do
segundo ano da Licenciatura em Biotecnologia da Universidade Independente, como professor
convidado.
1999-2006
Regente da disciplina de Introdução à Biotecnologia do primeiro semestre do segundo ano
da Licenciatura em Biotecnologia dos Produtos Naturais da Universidade Independente, como
professor convidado.
5/35
1997-2004
Colaboração na disciplina de Engenharia de Metabolismos do primeiro semestre do quarto
ano da Licenciatura em Microbiologia da Escola Superior de Biotecnologia da Universidade
Católica Portuguesa (responsável pelas aulas teórico-práticas como Assistente Convidado pelo
regente da cadeira).
3.3. Actividade no âmbito da Qualidade
Desde 2003
Secretário da CT141-Biotecnologia da ONS-INETI-Instituto Português da Qualidade
2000-2003
Membro da CT141-Biotecnologia da ONS-INETI-Instituto Português da Qualidade.
3.4. Colaboração com a Indústria
Tem colaborado de uma forma regular com diversas empresas industriais nacionais e
estrangeiras, maioritariamente no desenvolvimento de projectos em parceria.
3.5. Experiência profissional
Actualmente encontra-se profundamente interessado nos problemas inerentes ao
aproveitamento dos materiais lenhocelulósicos no âmbito do conceito de biorrefinaria,
especificamente na vertente da valorização da fracção hemicelulósica.
As principais áreas de actuação são a valorização de pentoses por via fermentativa, a
optimização de pré-tratamentos de biomassa para a recuperação selectiva de hemiceluloses e a
modelação matemática de processos biotecnológicos.
No âmbito de diversos projectos de investigação nacionais e internacionais tem
desenvolvido trabalho na área da Fisiologia Microbiana, nomeadamente no estudo da fisiologia de
leveduras de potencial interesse industrial, como Debaryomyces hansenii, Pichia stipitis,
Kluyveromyces marxianus e Saccharomyces cerevisiae recombinante.
Está ainda particularmente interessado na modulação do fluxo intracelular de carbono em
leveduras que assimilem pentoses, como resposta a diversas condições de stress químico. Tem
um especial interesse pela regulação metabólica como base para estudos de Engenharia
Fisiológica sobre o metabolismo da D-xilose em leveduras. Os trabalhos desenvolvidos
envolveram não só uma componente experimental, como também a aplicação de modelos
matemáticos de análise de redes metabólicas, nomeadamente a Análise de Fluxos Metabólicos e
6/35
a Análise de Modos Elementares.
Na área dos pré-tratamentos da biomassa está especialmente interessado na optimização
de processos suaves, energeticamente e ambientalmente mais sustentáveis. Também aqui tem
desenvolvido algum trabalho de modelação.
Paralelamente tem desenvolvido uma actividade crescente de planeamento e supervisão
de projectos de investigação, bem como de orientação de teses académicas.
3.6. Estágios no estrangeiro
16/2/1997 - 29/3/1997
Estágio em Bioquímica Teórica na Oxford Brookes University, sob orientação do Professor
David Fell (16 de Fevereiro a 29 de Março de 1997). Neste estágio desenvolveu trabalho na área
da Análise de Modos Elementares.
3.7. Participação em projectos de investigação
3.7.1
Como PI
PTDC/AGR-ALI/122261/2010:
“SSAD - Solid (super) acids catalyzed biomass desconstruction” / “SSAD - Desconstrução
de Biomassa utilizando Super-ácidos". Aprovado. Aguarda homologação
3.7.2
Como responsável de parceiro (LNEG)
PTDC/AGR-CFL/103840 (2010-2013)
“CROPBIOREF - Valorization of the Mediterranean energy crops giant reed and cardoon
by integrated bio-chemical conversion to dissolving grade pulps, fuel ethanol, xylitol and ligninbased products – a complete LCF biorefinery concept”. / “Valorização de plantas Mediterrânicas
energéticas, a cana e o cardo, por conversão bioquímica integrada, em pastas de elevada
qualidade, etanol, xilitol e produtos à base de lenhina – um conceito complexo de biorefinaria
LCF”.
SIIDT-QREN 5450 (2009-2013)
“REFINOLEA – Integrated upgrading of olive oil extraction residues” / “REFINOLEA –
Valorização integrada de resíduos e subprodutos da extracção de azeite”.
3.7.3
Como membro da equipa
ERA-NET Industrial Biotechnology EIB.10.013 (2011-2014)
“Products from lignocellulose - Development of a process for the utilization both the
carbohydrate and the lignin content from lignocellulosic materials of annual plants for the
7/35
production of valuable products”. / Produtos da lenhocelulose – Desenvolvimento de um processo
para a utilização dos polissacáridos e da lenhina dos materiais lenhocelulósicos provenientes de
plantas anuais para a produção de produtos de valor acrescentado”.
PTDC/AGR-CFL/71792/2006 (2007-2010)
“XylitolOUT - To promote xylitol release to improve bioethanol business". / “XylitolOUT Facilitar a libertação de xilitol, para optimizar a economia do bioetanol”.
PTDC/AGR-AAM/71533/2006 (2007-2010)
“BIOREFINO - Demonstrating the feasibility of wheat straw and sweet sorghum biomass
fermentation to ethanol using the biorefinery approach" / “BIOREFINO - Demonstração da
viabilidade técnica de uma biorefinaria de bioetanol a partir das biomassas de trigo e sorgo”.
Colaboração INETI-Cliente confidencial (2007-2008)
“Production of Xylitol And Other Products From Xylose-Rich Liquor From Biomass
Fractionation”.
Programa Prime-IDEIA-AdI Projecto n.º 70/00326 (2007-2008)
“VALORALFA – Valorização da polpa de alfarroba para a produção de ingredientes
alimentares com propriedades funcionais de alto valor acrescentado”.
POCTI/ENR/63388/2004 (2005-2008)
“Valorização de pneus usados, de resíduos de plásticos e de biomassa, por pirólise, para
a produção de compostos com elevado valor económico” / “Valorization of used tyres, plastics and
biomass wastes by pyrolysis to produce valuable end products".
XILOGASTRO Programa AdI/ICPME (2003-2005)
“Xilo-oligossacáridos purificados como agentes anti-ulcerosos".
PIDDAC 520.102 (2002-2006)
“Materiais e produtos com novas funcionalidades: Nutrição e Saúde".
FAIR-CT98-3811 (1998-2001)
“Xylophone: Development of xylo-oligosacharides and xylitol for use of pharmaceutical and
food industries".
Projecto CRUP (1998-1999)
"Produção de treonina em S. cerevisiae: Validação da utilização de leveduras manipuladas
geneticamente mediante o uso de técnicas de engenharia metabólica".
Projecto Cooperação JNICT/British Council (1998-2000)
"Desenvolvimento de modelos metabólicos para a representação do metabolismo
heterotrófico de bactérias e de leveduras seleccionadas".
Projecto Cooperação JNICT/British Council (1996-1998)
"Uso da Análise de Controlo Metabólico e de modelos baseados em balanços
estequiométricos para a compreensão da estrutura de controlo de vias metabólicas em leveduras".
8/35
Projecto JNICT/PBICT/BIO2221/95 (1995-1998)
"Elucidação da estrutura de controlo do metabolismo da D-xilose em Debaryomyces
hansenii e Pichia stipitis".
COP-94/01217 (1994-1997)
"Knowledge-based control and operation of industrial productive bioprocesses".
Projecto JNICT/PBICT/BIO1283/92 (1992-1995
"Aspectos metabólicos da tecnologia de produção de xilitol".
3.8. Participação em Redes de Conhecimento
Rede Cyted 310RT0397: SIADEB (2010-2013)
“Sociedade Ibero-Americana para o Desenvolvimento das Biorrefinarias / Sociedad
Iberoamericana para el Desarollo de las Biorrefinerías”
Rede Cyted, Programa Iberoeka, IBK 04-383 (2005-2009)
“BIOVALOR: Biotecnologia de Hemiceluloses - biomoléculas de uso industrial, alimentar e
farmacêutico a partir de subprodutos lenhocelulósicos”.
Programa POS_Conhecimento Iniciativa Redes de Competência / Centros de Excelência
037/7.1/ADI/Nor (2006-2008)
“CEBio - Rede de Competência para a Bioenergia (2006-2008)".
3.9. Bolsas auferidas
Sociedade Portuguesa de Bioquímica (SPB)
Para participação no congresso internacional “Biomass Derived Pentoses – 2006”. Reims,
França. (Outubro de 2006).
Fundação Luso-Americana (FLAD)
th
Para participação no congresso internacional “26 Symposium on Biotechnology for Fuels
and Chemicals”. Chattanooga, Tennessee. USA. (Maio de 2004).
Biotechnology Studies Delft Leiden (BODL)
Para participação no Curso avançado “Microbial
Physiology and Fermentation
Technology”, Delft, Holanda. (Dezembro de 2000).
Fundação Calouste Gulbenkian
Para participação no EC Framework IV Symposium "Yeast as a cell factory", Vlaardingen,
Holanda. (Dezembro de 1998).
Federation of European Microbiological Societies (FEMS)
Para participação no EC Framework IV Symposium "Yeast as a cell factory", Vlaardingen,
Holanda. (Dezembro de 1998).
European Federation of Biotechnology
Para participação no 2nd European Symposium on Biochemical Engineering Science 9/35
comparticipação no valor da inscrição –Porto. (Setembro de 1998).
European Science Foundation
Para participação na European Research Conference on "Control of Metabolic Flux",
Giens, França. (Junho de 1997).
JNICT
Bolsa de Investigação Científica (BIC 1861) ao abrigo do Programa de Formação e
Mobilidade de Recursos Humanos (1997).
British Council
Para estágio na Oxford Brookes University (Fevereiro-Março de 1997).
Programa Praxis XXI
Bolsa de Mestrado (BM/1328/94) com a duração de 2 anos (início a 1/1/1995).
JNICT
Bolsa de Investigação Científica (BIC 1275), ao abrigo do Programa de Formação e
Mobilidade de Recursos Humanos (não usufruída por lhe ter também sido atribuída uma Bolsa de
Mestrado). 1994.
PEDIP
Bolsa com a duração de 2 anos -medida G-Programa JTI- (início a 5/1/1993).
3.10. Orientação científica
3.10.1 Pós-Doutoramento
 José Manuel Salgado, Bolseiro de Pós-Doutoramento da Universidade de Ourense, Espanha,
sob o tema “Benchmarking of detoxification processes / yeasts for upgrading hemicellulosic
hydrolysates”. 28 de Fevereiro de 2011 – 31 de Maio de 2011
3.10.2 Doutoramento
 Mohammad Suleiman Al Manasrah Bolseiro de Doutoramento Lappeenranta University of
Technology- Lappeenranta, Finlandia, sob o tema “Extraction, recovery and characterization of
phenolic compounds from carob pulp: Processes modelling, integration and scale-up”. Janeiro
2012. Em co-orientação com o Prof. João Paulo Crespo, FCT-UNL. – Em curso
 Pedro Miguel Sena da Costa Branco, Bolseiro de Doutoramento FCT em Ciências do
Ambiente, ramo de Química Analítica e Tecnológica, sob o tema “Valorização integrada de
produtos residuais das indústrias de transformação de frutas da Madeira”. Janeiro 2010. Em coorientação com a Prof.ª Paula Castilho, Universidade da Madeira. – Em curso
 Juan Daniel Rivaldi, aluno de Doutoramento, da Escola de Engenharia de Lorena –
Universidade de São Paulo (Brasil), com o tema “Caracterização das enzimas envolvidas na
assimilação de glicerol por bactérias probióticas” ao abrigo do Programa de Mobilidade
Internacional de Pós-Graduandos – Santander BANESPA, 12 Junho de 2010 -31/10/2010
16/4/2012 - 17 de Julho de 2012.
10/35
3.10.3 Orientação Científica de bolseiros no âmbito de projectos
 Ivone Torrado, Bolseira de Investigação FCT (projecto CropBioRef), 15/2/2011 – em curso
 Ivone Torrado, Bolseira de Investigação FCT (projecto XilitolOut), 1/1/2010-31/12/2010.
 Tatiana Ferreira Santos, bolseira de Iniciação à Investigação Científica como estudante
Mestrado em Biologia do Instituto Superior de Agronomia, “Quantificação do impacto de factores
abióticos seleccionados na produção de polióis”. Setembro 2008 – Setembro 2009. BII
 Gisle Berg, estagiário IASTE “Growth profile and pH range for endo--1,4-xylanase production
by Bacillus sp. 3M”. Maio - Julho 1995. Co-orientação com o Doutor Francisco Gírio.
3.10.4 Mestrado
 Filipa Sousa Bandeira, Tese de Mestrado em Processamento dos Alimentos do Instituto
Superior de Agronomia da Universidade Técnica de Lisboa. “Otimização da produção de xilitol por
estirpes de Debaryomyces hansenii em hidrolisado de Arundo donax”. 17/1/2012- em curso
 Mafalda Rosa Viegas, Tese de Mestrado em Energia e Bioenergia da Faculdade de Ciências e
Tecnologia da Universidade Nova de Lisboa. "Avaliação de métodos de pré-tratamento na
gasificação da biomassa”. 2/5/2011 – em curso.
 Cátia Rita Pinto Ferreira, Tese de Mestrado Integrado em Engenharia Biológica – Universidade
do Minho. "Produção de xilitol a partir de hidrolisados hemicelulósicos de Arundo donax”.
14/3/2011 – 28/11/2011.
 Vera Lúcia Costa Guerra, Tese de Mestrado em Engenharia Alimentar do Instituto Superior de
Agronomia da Universidade Técnica de Lisboa, "Optimização de pré-tratamento para a hidrólise
selectiva da hemicelulose de bagaço de azeitona: estudo da bioconversão dos hidrolisados para a
produção de xilitol”. 31/1/2011 – 6/12/2011.
 Pedro Ribeiro Bernardo, Tese de Mestrado Integrado em Engenharia Química e Bioquímica da
Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade Nova de Lisboa, "Optimização de prétratamentos hidrotérmicos para hidrólise selectiva das hemiceluloses de bagaço de azeitona”.
13/1/2010 – 25/7/2011.
3.10.5 Licenciatura
 Joana Mafalda da Cruz Telhada, estágio da Licenciatura em Bioquímica da Faculdade de
Ciências e Tecnologia da Universidade Nova de Lisboa, "Optimization of hemicellulose hydrolysis
using a pilot scale reactor”. 15/2/2012 - em curso.
 Zeny Isabel Klydjeneiro, estágio da Licenciatura em Química Aplicada da Faculdade de
Ciências e Tecnologia da Universidade Nova de Lisboa, "Evaluation of a hemicellulose based
medium for the production of bacterial polysaccharides”. 15/2/2012 - em curso.
 Catarina de Vasconcelos Pereira, estágio da Licenciatura em Bioquímica da Faculdade de
Ciências e Tecnologia da Universidade Nova de Lisboa, "Yeast extract production in a
11/35
hemicellulosic hydrolysate based medium”. 15/2/2012 - em curso.
 Mafalda Viegas, estágio da Licenciatura em Biotecnologia dos Produtos Naturais, "Valorização
de Cynara cardunculos”. Janeiro 2009 - Dezembro 2009.
 Joana Tadeu Matos, estágio da Licenciatura em Engenharia Agro-Industrial do Instituto
Superior de Agronomia da Universidade Técnica de Lisboa, "Estudo da tolerância de leveduras a
compostos inibidores presentes em hidrolisados lenhocelulósicos”. Março 2004 - Janeiro 2005.
 Inês Neves, estágio da Licenciatura em Engenharia Biotecnológica da Universidade do
Algarve, "Estudo em cultura descontínua do efeito de diversos inibidores no metabolismo das
pentoses em leveduras”. Março 2002 – Julho 2003. Co-orientação com a Eng.ª Florbela
Carvalheiro e o Doutor Francisco Gírio.
 Raquel Medeiros, estágio da Licenciatura em Engenharia Biotecnológica da Universidade do
Algarve, "Produção de polióis a partir da hidrolise directa de resíduos hemicelulósicos:
Optimização do meio de cultivo.” Março 2002 – Outubro 2003. Co-orientação com a Eng.ª Florbela
Carvalheiro e o Doutor Francisco Gírio.
 Sara Esteves, estágio da Licenciatura em Engenharia Biotecnológica da Universidade do
Algarve, "Caracterização das respostas fisiológias de leveduras Kluyveromyces sp. a stress
nutricional na presença de D-xilose”. Março 2001 – Abril 2002. Co-orientação com o Doutor
Francisco Gírio.
 Sónia Lopes, estágio da Licenciatura em Engenharia Biotecnológica da Universidade Lusófona,
“Optimização do meio de cultivo para a produção de polióis pela levedura Debaryomyces hansenii
em hidrolisados hemicelulósicos“. Fevereiro 2001 – Dezembro 2001. Co-orientação com a Eng.ª
Florbela Carvalheiro e o Doutor Francisco Gírio.
 Patrícia Carapeto, estágio da Licenciatura em Engenharia Biotecnológica da Universidade
Lusófona, “Fisiologia de leveduras assimiladoras de D-xilose em quimiostato''. Outubro 1997 –
Setembro 1998. Co-orientação com o Doutor Francisco Gírio.
 João Tavares, estágio da Licenciatura em Bioquímica da Faculdade de Ciências da
Universidade de Lisboa, “Caracterização das respostas fisiológicas da levedura D. hansenii a
stress nutricional na presença de D-xilose”. Outubro 1996 – Setembro 1997. Co-orientação com o
Doutor Francisco Gírio.
 Regina Massano, estágio da Licenciatura em Química Aplicada da Faculdade de Ciências e
Tecnologia (UNL), “Determinação simultânea de nucleótidos e dinucleótidos de adenina em
células de levedura por HPLC” e “Produção de xilitol por células de levedura imobilizadas”.
Outubro 1995 - Setembro de 1996. Co-orientação com o Doutor Francisco Gírio.
3.10.6 Estágios Pós-graduação
 Ana Margarida Pala, estágio profissional, Colaboradora Residente no LNEG, "Valorização de
subprodutos da biomassa vegetal - Alfarroba”. 1 de Março-15 de Abril de 2010.
 Taciane Marques da Silva, estágio profissional, Colaboradora Residente no LNEG, "Avaliação
12/35
da suplementação de hidrolisados hemicelulósicos na produção biotecnológica de xilitol por
Debaryomyces hansenii”. 4 de Janeiro a 12 de Fevereiro 2010.
 Andreia Pereira, estágio profissional, Colaboradora Residente no LNEG, "Valorização de
subprodutos da biomassa vegetal - Alfarroba”. 9 de Novembro de 2009 a 14 de Julho de 2010.
 Sérgio Almeida, estágio profissional, aluno do Mestrado em Engenharia Química do Instituto
Superior de Engenharia de Lisboa, "Desenvolvimento e optimização do processamento upstream
de um meio de cultura industrial”. Maio 2007 - Setembro 2008.
 Vanessa Oliveira, estudante do Bacharelato em Biotecnologia da Universidade Lusófona,
“Fisiologia de leveduras recombinantes hiper-produtoras de aminoácidos em quimiostato''.
Novembro 1998 – Julho 1999. Co-orientação com o Doutor Francisco Gírio.
 Luís Fortes, Bolseiro licenciado do ICAT (Lisboa). Realizou um curto estágio na UMIB sobre
técnicas de cultura contínua. Dezembro 1997 – Fevereiro 1998. Co-orientação com o Doutor
Francisco Gírio.
 Gisle Berg, estagiário IASTE “Growth profile and pH range for endo--1,4-xylanase production
by Bacillus sp. 3M”. Maio - Julho 1995. Co-orientação com o Doutor Francisco Gírio.
3.10.7 Estágios Ciência Viva
 Tiago André Campos Costa Barata estagiário Ciência Viva “BIOENERGIA V: Lixo ou Lucro?
Recuperação de produtos de valor acrescentado a partir de resíduos de anona” (10º Ano). 28 de
Junho a 9 de Julho 2010.
 Mónica Andreia Teixeira do Amaral estagiária Ciência Viva “Sustentabilidade V: Lixo ou Lucro?
No aproveitar é que está o ganho” (11º Ano). 6 a 17 de Julho 2009.
 Diogo dos Santos das Neves Pinheiro Gonçalves, estagiário Ciência Viva “Sustentabilidade V:
Lixo ou Lucro? No aproveitar é que está o ganho” (11º Ano). 6 a 17 de Julho 2009.
 Cheila Vanessa Piedade Nogueira estagiária Ciência Viva “Sustentabilidade V: Lixo ou Lucro?
No aproveitar é que está o ganho” (12º Ano). 6 a 17 de Julho 2009.
 Joana Marta Costa Simões do Paço estagiária Ciência Viva “Sustentabilidade V: Lixo ou
Lucro? No aproveitar é que está o ganho” (12º Ano). 6 a 17 de Julho 2009.
 Melissa Piedade Nogueira estagiária Ciência Viva “Sustentabilidade V: Lixo ou Lucro? No
aproveitar é que está o ganho” (11º Ano). 6 a 17 de Julho 2009.
3.11. Organização de encontros científicos
 Membro da Comissão Organisadora do "1-CIAB - 1st Iberoamerican Congress on Biorefineries",
24 – 26/10/2012. Los Cabos, Baja California, Mexico. (www.ciab2012.org/)
 Membro da Comissão Científica do worshop internacional “Valorization of Mediterranean
Biowastes and Effluents”, 5 - 8 junho 2012, Santarém, Portugal
 Membro da Comissão Organizadora do Curso Avançado SIADEB “A transformação da
biomassa na plataforma bioquímica da biorrefinaria”, Escola de Engenharia de Lorena 13/35
Universidade de S. Paulo, 29 de Novembro a 3 de Dezembro de 2010.
 Pertenceu à Comissão Organizadora das 7as Jornadas de Biologia de Leveduras “Professor
Nicolau van Uden”, INETI, 21-22 de Maio de 1999.
 Pertenceu à Comissão Organizadora das “Jornadas de Biotecnologia”, Oeiras, 6 a 9 de Maio
de 1993.
3.12. Revisão científica
 Tem colaborado regularmente como revisor de artigos científicos para algumas revistas
internacionais com corpo editorial, nomeadamente:
o
Applied Biochemistry and Biotechnology –2004, 2005 (3), 2007 (2), 2009 (2).
o
Biochemical Engineering Journal – 2007, 2008, 2009 (2).
o
Biosystems Engineering - 2011
o
Biotechnology Progress – 2005 (2).
o
Bioresources – 2009
o
Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology – 2009 (4)
3.13. Palestras convidadas
3.13.1 Em eventos internacionais
4. Carvalheiro, F., Duarte, L.C. “Biomass pre-treatments and their role in the biorefineries” In:
AFORE training school “Analytics for wood biorefineries”. Lisbon, Portugal, 16/4/2012
3. Duarte, L.C., Moniz, P., Silva-Fernandes, T., Torrado, Roseiro, L.B., Bogel-Lukasik, R.,
Carvalheiro, F. “Upgrading and valorization routes for hemicellulose streams” In: 1st European
Summer School on Biorefining: Principles and Technologies, Paris, France, 31/8/2011.
2. Duarte, L.C., Moniz, P., Silva-Fernandes, T., Torrado, Roseiro, L.B., Bogel-Lukasik, R.,
Carvalheiro, F. “Alternativas para a Valorização de Pentoses” In: Curso Avançado SIADEB “A
transformação da biomassa na plataforma bioquímica da biorrefinaria”, Escola de Engenharia de
Lorena - Universidade de S. Paulo, Lorena, Brazil, 29/11/2010.
1. Duarte, L.C., Carvalheiro, F. “Conceitos de Biorrefinarias: Enquadramento e Evolução” In:
Curso Avançado SIADEB “A transformação da biomassa na plataforma bioquímica da
biorrefinaria”, Escola de Engenharia de Lorena - Universidade de S. Paulo, Lorena, Brazil,
1/12/2010.
3.13.2 Em instituições nacionais
 Aula “Dos Resíduos Agro-industriais ao Conceito de Biorrefinaria”, FCTUL, 29 de Maio de
2011.
 Aula “Conceitos de Biorrefinarias: Enquadramento e Evolução”, ISA-UTL, 16 de Maio de 2011.
14/35
 Aula prática: “Produção de biomassa de levedura em cultura descontínua”. Universidade de
Évora, Mestrado em Química Analítica, disciplina de Processos Biotecnológicos, a convite do
Professor Doutor José Arteiro. (Setembro, 2003).
 Aula prática: “Operação de biorreactores laboratoriais”. Universidade de Évora, Mestrado em
Química Analítica, disciplina de Processos Biotecnológicos, a convite do Professor Doutor José
Arteiro. (Setembro, 2003).
 Aula prática: “Optimização da produção de celulases e xilanases por Trichoderma reesei em
fermentação em estado sólido”. Universidade de Évora, Mestrado em Química Analítica, disciplina
de Processos Biotecnológicos, a convite do Professor Doutor José Arteiro. (Setembro, 2003).
 Aula teórico-prática: “Análise de Fluxos Metabólicos”. Oficinas de Fisiologia Microbiana II,
Departamento de Biotecnologia-INETI, a convite da organização, Doutor J. C. Roseiro e F.M.
Gírio. (Janeiro, 2003)
 Aula prática: “Produção de xaropes fermentescíveis por hidrólise ácida de resíduos agroindustriais”. Universidade de Évora, Licenciatura em Bioquímica, disciplina de Conversão Química
da Biomassa, a convite do Professor Doutor José Arteiro. (Junho, 2002).
 Aula teórico-prática: “Algumas Questões Sobre Cultura Contínua”. Universidade de Évora,
Licenciatura em Bioquímica, disciplina de Conversão Química da Biomassa, a convite do
Professor Doutor José Arteiro. (Junho, 2002).
3.14. Participação em júris
11. Tese de Mestrado em Engenharia Biológica – Ramo de Tecnologias Ambientais – Universidade
do Minho com o título “Produção de xilitol a partir de hidrolisados hemicelulósico de Arundo
donax”, da candidata Cátia Rita Pinto Ferreira, na qualidade de orientador externo – 28 de
Novembro de 2011.
10. Tese de Mestrado em Engenharia Química e Bioquímica – Universidade Nova de Lisboa –
Faculdade de Ciências e Tecnologia com o título “Optimização de Pré-tratamentos Hidrotérmicos
para a Hidrólise Selectiva das Hemiceluloses de Bagaço de Azeitona Extractado”, do candidato
Pedro Ribeiro Bernardo, na qualidade de orientador externo – 25 de Julho de 2011.
9. Tese de Mestrado em Bioquímica – Universidade de Évora, com o título “Valorização da
biomassa lenhocelulósica: Estudo de sacarificação enzimática de resíduos de bagaço de
Azeitona”, da candidata Susana Alexandra Carapinha Sengo, na qualidade de arguente externo –
17 de Março de 2011.
8. Seminário de Doutoramento em Engenharia Alimentar - Instituto Superior de Agronomia da
Universidade Técnica de Lisboa, com o título “Processos de fraccionamento de resíduos agroindustriais para obtenção de hemiceluloses e lenhina de elevada qualidade para aproveitamento
integrado no âmbito de uma biorrefinaria”, da candidata Patrícia Maria Azevedo Moniz, na
qualidade de arguente externo – 10 de Fevereiro de 2011.
7. Tese de Mestrado em Engenharia Biomédica - Instituto Superior Técnico da Universidade
15/35
Técnica de Lisboa, com o título “Modeling of the Physiology of D. hansenii Using Population-based
Search Methods for Parameter Estimation”, da candidata Dulce Isabel Viegas Calçada, na
qualidade de arguente externo – 23 de Novembro de 2009.
6. Tese de Mestrado em Engenharia Alimentar e Nutrição - Instituto Piaget de Almada, com o
título “Estudo da Produção de Manitol a partir de Xaropes de Alfarroba”, da candidata Patrícia
Maria Azevedo Moniz, na qualidade de arguente externo – 16 de Fevereiro de 2009.
5. Estágio de Licenciatura em Engenharia Agro-Alimentar - Instituto Superior de Agronomia da
Universidade Técnica de Lisboa, da candidata Joana Tadeu Matos, na qualidade de orientador
externo – 6 de Janeiro de 2005.
4. Estágio de Licenciatura com o título “Detecção de espécies de Legionella utilizando ITSARDRA” da Licenciatura em Biotecnologia dos Produtos Naturais - Universidade Independente, da
candidata Joana Carvalho, na qualidade de arguente – 6 de Janeiro de 2004.
3. Estágio de Licenciatura em Engenharia Biotecnológica - Universidade do Algarve, da candidata
Inês Neves, na qualidade de orientador externo – 2003.
2. Estágio de Licenciatura em Biotecnologia dos Produtos Naturais - Universidade Independente,
do candidato Luís Costa, na qualidade de orientador interno – 2003.
1. Estágio de Licenciatura em Biotecnologia dos Produtos Naturais - Universidade Independente
da candidata Maria Ivone Barneto, na qualidade de orientador interno – 2003.
4. PRÉMIOS E DISTINÇÕES
 Vencedor do Green Project Awards 2010 na categoria de Investigação e Desenvolvimento com
o Projecto “ValorAlfa” - membro da equipa LNEG. Este prémio é promovido pela Agência
Portuguesa do Ambiente, a Quercus e a GCI.
5. PUBLICAÇÕES
5.1. Teses
3.
Duarte L.C. 2008. Valorization of agro-industrial byproducts in a biorefinery framework:
Brewery’s spent grain as a model material. Dissertação para as provas de acesso à categoria
de Investigador Auxiliar. INETI. Lisboa
2.
Duarte L.C. 1997. Aplicação de modelos metabólicos para o estudo do metabolismo da Dxilose em leveduras. Tese de Mestrado, Instituto Superior Técnico. Lisboa.
1.
Duarte L.C. 1994. Estudos teórico-práticos sobre o metabolismo da D-xilose em
Debaryomyces hansenii em Quimiostato. Tese de Licenciatura. Fac. Ciências de Lisboa.
Lisboa.
16/35
5.2. Capítulos de livros
3.
Duarte, L.C., Moniz, P., Silva-Fernandes, T., Torrado, Roseiro, L.B., Bogel-Lukasik, R.,
Carvalheiro, F. 2011. Upgrading and valorization routes for hemicellulose streams. Manuscript
2.
Gírio, F.M., Carvalheiro, F., Duarte, L.C., Bogel-Lukasik, R. Deconstruction of the
hemicellulose fraction from lignocellulosic materials into simple sugars. Accepted.
1.
Amaral-Collaço, M.T., Esteves, M.P., Duarte, L.C. 2003. Segurança e Regulamentação em
Biotecnologia. in Biotecnologia: Fundamentos e aplicações. Lima, N.; Mota, M. (editores). pp.
474-494. Lidel - Edições Técnicas. Lisboa, Portugal.
5.3. Artigos em publicações de circulação internacional com arbitragem
científica
27. Brás, T., Guerra,V., Torrado,I., Lourenço, P., Carvalheiro, F., Duarte, L.C., Neves, L.A. 2012.
Detoxification of extracted olive pomace dilute acid hydrolysate by diananofiltration.
BioFactors. Submitted.
26. Oliveira, D., Costabile, A, Wilbey, R.A., Gradison, A.S., Duarte, L.C., Roseiro, L.B. 2012. In
vitro evaluation of the fermentation properties and potential prebiotic activity of caprine cheese
whey oligosaccharides in batch culture systems. BioFactors. Accepted.
25. Oliveira, D., Wilbey, R.A., Gradison, A.S., Duarte, L.C., Roseiro, L.B. 2012. Separation of
oligosaccharides from caprine milk whey, prior to prebiotic evaluation. International Dairy
Journal. 24:102-106. http://dx.doi.org/doi:10.1016/j.idairyj.2011.12.012
24. Bernardo-Gil, M.G., Roque, R., Roseiro, L.B., Duarte, L.C., Gírio, F.M., Esteves, M.P. 2011.
Supercritical extraction of carob kibbles (Ceratonia siliqua L.). The Journal of Supercritical
Fluids. 59:36-42. http://dx.doi.org/10.1016/j.supflu.2011.08.007
23. Santos, J.L.C., Fernandes, M.C., Lourenço, P.M.L., Duarte, L.C., Carvalheiro, F., Crespo, J.G.
(2011) Removal of inhibitory compounds from olive stone autohydrolysis liquors by
nanofiltration, Desalination. 27:90-96. http://dx.doi.org/10.5004/dwt.2011.2063
22. Carvalheiro, F., Moniz, P., Duarte, L.C., Esteves, M.P., Gírio, F.M. (2011) Mannitol production
by lactic acid bacteria grown in supplemented carob syrup. Journal of Industrial Biotechnology.
38:221-227. http://dx.doi.org/10.1007/s10295-010-0823-5
21. Calçada, D., Rosa, A., Duarte, L.C., Lopes, V.V. 2010. Comparison of GA and PSO
performance in parameter estimation of microbial growth models: A case-study using
experimental data. in Proceedings of 2010 IEEE Congress on Computational Intelligence.
http://dx.doi.org/10.1109/CEC.2010.5586489
20. Gírio, F. M., Fonseca, C., Carvalheiro, F., Duarte, L.C., Marques, S., Bogel-Lukasik, R. 2010.
Hydrolysis of hemicelluloses for fuel ethanol: A review. Bioresource Technology. 101:477517/35
4800. http://dx.doi.org/10.1016/j.biortech.2010.01.088.
19. Duarte L.C., Silva-Fernandes T., Carvalheiro F., Gírio F.M. 2009. Dilute acid hydrolysis of
wheat straw oligosaccharides. Applied Biochemistry and Biotechnology. Applied Biochemistry
and Biotechnology. 153:116-126. http://dx.doi.org/10.1007/s12010-008-8426-6
18. Carvalheiro F., Silva-Fernandes T., Duarte L.C., Gírio F.M. 2009. Wheat straw autohydrolysis:
Process optimization and products characterization. Applied Biochemistry and Biotechnology.
153:84-93. http://dx.doi.org/10.1007/s12010-008-8448-0
17. Carvalheiro F., Duarte L.C., Gírio F.M. 2008. Hemicellulose Biorefineries: a review on biomass
pretreatments. Journal of Scientific & Industrial Research. 67:849-864.
16. Duarte, L.C.; Carvalheiro, F.; Lopes, S.; Neves, I.; Gírio, F.M. 2008. Yeast biomass production
in brewery's spent grains hemicellulosic hydrolyzate. Applied Biochemistry and Biotechnology.
148:119-129. http://dx.doi.org/10.1007/s12010-007-8046-6
15. Duarte, L.C., Esteves, M.P., Carvalheiro, F., Gírio, F.M. 2007. Biotechnological Valorization
Potential Indicator for lignocellulosic materials. Biotechnology Journal. 2:1556-1563.
http://dx.doi.org/10.1002/biot.200700183
14. Carvalheiro, F., Duarte, L.C., Medeiros, R., Gírio, F.M. 2007. Xylitol production by
Debaryomyces
hansenii
in
brewery
spent
grain
dilute-acid
hydrolysate:
effect
of
supplementation. Biotechnology Letters. 29: 1887-1891. http://dx.doi.org/10.1007/s10529-0079468-5
13. Duarte, L.C., Carvalheiro, F., Tadeu, J., Gírio, F.M. 2006. The combined effects of acetic acid,
formic acid and hydroquinone on Debaryomyces hansenii physiology. Applied Biochemistry
and Biotechnology. 130: 461-475. http://dx.doi.org/10.1385/ABAB:130:1:461
12. Carvalheiro, F., Duarte, L.C., Lopes, S., Parajó, J.C., Pereira, H., Gírio, F.M. 2006.
Supplementation requirements of brewery's spent grain hydrolysate for biomass and xylitol
production by Debaryomyces hansenii CCMI 941. Journal of Industrial Microbiology and
Biotechnology. 33:646-654. http://dx.doi.org/10.1007/s10295-006-0101-8
11. Duarte, L.C., Carvalheiro, F., Neves, I., Gírio, F.M. 2005. Effects of aliphatic acids, furfural and
phenolic compounds in Debaryomyces hansenii CCMI 941. Applied Biochemistry and
Biotechnology. 121:413-425. http://dx.doi.org/10.1385/ABAB:121:1-3:0413
10. Carvalheiro, F., Duarte, L.C., Lopes, S., Parajó, J.C., Pereira, H., Gírio, F.M. 2005. Evaluation
of detoxification methods on brewery's spent grain hydrolysate for xylitol production by
Debaryomyces
hansenii
CCMI
941.
Process
Biochemistry.
40:1215-1223.
http://dx.doi.org/10.1016/j.procbio.2004.04.015
9.
Duarte, L.C., Carvalheiro, F., Lopes, S., Marques, S., Parajó, J.C., Gírio, F.M. 2004.
Comparison of two post-hydrolysis processes of brewery’s spent grain autohydrolysis liquor to
produce a pentose-containing culture media. Applied Biochemistry and Biotechnology. 11318/35
116: 1041-1058. http://dx.doi.org/10.1385/ABAB:115:1-3:1041
8.
Carvalheiro, F., Duarte, L.C., Medeiros, R., Gírio, F.M. 2004. Optimization of brewery’s spent
grain dilute-acid hydrolysis for the production of pentose-rich culture media. Applied
Biochemistry and Biotechnology. 113-116: 1059-1072. http://dx.doi.org/10.1385/ABAB:115:13:1059
7.
Timóteo, C.G., Tavares, P., Goodhew, C.F., Duarte, L.C., Jumel, K., Gírio, F.M., Harding, S.,
Pettigrew, G.W., Moura, I. 2003. Ca2+ and the bacterial peroxidases – The cytochrome c
peroxidase from Pseudomonas stutzeri. Journal of Biological Inorganic Chemistry. 8: 29-37.
http://dx.doi.org/10.1007/s00775-002-0382-y
6.
Nobre, A.P., Duarte, L.C., Roseiro, J.C., Gírio, F.M. 2002. Physiological and enzymatic study
of Debaryomyces hansenii growth on xylose and oxygen limited chemostats. Applied
Microbiology and Biotechnology. 59:509-516. http://dx.doi.org/10.1007/s00253-002-1050-4
5.
Tavares, J.M., Duarte, L.C., Amaral-Collaço, M.T., Gírio, F.M. 2000. The influence of hexoses
addition on the fermentation of D-xylose in Debaryomyces hansenii under continuous
cultivation.
Enzyme
Microbiology
and
Technology.
26:743-747.
http://dx.doi.org/10.1016/S0141-0229(00)00166-6
4.
Albergaria, H., Duarte, L.C., Amaral-Collaço, M.T., Gírio, F.M. 2000. Study of Saccharomyces
uvarum CCMI 885 Physiology under Fed-Batch, Chemostat and Accelerostat Cultivation
Techniques. Food Technology and Biotechnology. 38:33-38. http://www.ftb.com.hr/38-33.pdf
3.
Alves, T., Besson, S., Duarte, L.C., Pettigrew, G.W., Gírio, F.M., Devreese, B., Vandenberghe,
I., Van Beeumen, J., Fauque, G., Moura, I. 1999. A cytochrome c peroxidase from
Pseudomonas nautica 617 active at high ionic strength: expression, purification and
characterization. Biochemistry et Biophysica Acta - Protein Structure and Molecular
Enzymology. 1434:248-259. http://dx.doi.org/10.1016/S0167-4838(99)00188-0
2.
Tavares, J.M., Duarte, L.C., Amaral-Collaço, M.T., Gírio, F.M. 1999. Phosphate limitation
stress induces xylitol overproduction by Debaryomyces hansenii. FEMS Microbiology Letters.
171: 115-120. http://dx.doi.org/10.1111/j.1574-6968.1999.tb13420.x
1.
Duarte, L.C., Nobre, A.P., Gírio, F.M., Amaral-Collaço, M.T. 1994. Determination of the kinetic
parameters in continuous cultivation by Debaryomyces hansenii grown on D-xylose.
Biotechnology Techniques. 8: 859-864. http://dx.doi.org/10.1007/BF02447728
5.4. Patentes
10. Duarte, L.C., Branco, P., C., Torrado, I., Klydjeneiro, Z., Pereira, C., Roseiro, L., Roseiro, J.C.,
Castilho, P., C., Carvalheiro, F.2012 PPP nº 106355
9.
Duarte, L.C., Branco, P., C., Torrado, I., Klydjeneiro, Z., Pereira, C., Roseiro, L., Roseiro, J.C.,
Castilho, P., C., Carvalheiro, F.2012 PPP nº 106354
19/35
8.
Duarte, L.C., Branco, P., C., Torrado, I., Klydjeneiro, Z., Pereira, C., Roseiro, L., Roseiro, J.C.,
Castilho, P., C., Carvalheiro, F. 2012PPP nº 106353
7.
Duarte, L.C., Seara, J.M., Santana, I., Guerra, V., Ferreira, C., Silva-Fernandes, T., Branco,
P.M., Carvalheiro, F., Roseiro, L.B., Lourenço, P.M.L. (2011) Pedido Provisório de Patente
PT105977
6.
Duarte, L.C., Carvalheiro, F., Lopes, S., Corvo, M.L., Gírio, F.M. (2011) Pedido Provisório de
Patente PT105976
5.
Roseiro, L.B., Lourenço, P.M.L., Duarte, L.C., Falé, P., Serralheiro, M.L., Rauter, A.P. (2011)
Pedido Provisório de Patente PT105914
4.
Roseiro, L.B., Duarte, L.C., Oliveira, D., Roque, R., Bernardo-Gil, M.G., Martins, A.I.,
Sepúlveda, C., Almeida, J., Meireles, M.M., Rauter, A.P. (2011) Pedido de Patente PT105731
3.
Carvalheiro, F., Moniz, P., Duarte, L.C., Esteves, M.P., Moura, P., Pereira, J., Gírio, F.M.,
Roseiro, M.L., Gil, M.G.B. (2011) Processo para a produção de manitol por fermentação de
um extracto aquoso da polpa de alfarroba triturada. PT Nº104633 B.
2.
Moura, P., Esteves, M.P., Duarte, L.C., Pereira, J., L.C., Carvalheiro, F., Roseiro, M.L., Gírio,
F.M., Gil, M.G.B. (2011) Bebida polifuncional não-alcoólica obtida por fermentação do extracto
aquoso da polpa de alfarroba triturada e processo para a sua preparação. PT Nº104632 B.
1.
Gil, M.G.B., Roque, R., Esteves, M.P., Duarte, L.C., Roseiro, M.L., Gírio, F.M, Carvalheiro, F.,
Moura, P., (2011). Produtos naturais antioxidantes obtidos por extracção supercrítica aplicada
à fracção insolúvel que fica após a extracção com água da polpa de alfarroba triturada e seu
método de produção. PT Nº104631 B.
5.5. Artigos em revistas de circulação nacional com arbitragem científica
1.
Duarte, L.C., Esteves, M. P., Carvalheiro, F., Vicente, P., Gírio, F.M. 2007. Os subprodutos
agro-industriais de natureza lenhocelulósica: caracterização da situação portuguesa.
Engenharia Química. 5: 56-62. http://www.deb.uminho.pt/EngQuimica/Num05/56.pdf
5.6. Publicações em actas de encontros científicos
9.
Duarte, L.C., Guerra, V., Salgado, J.,M., Torrado, I., Ferreira, C., Silva-Fernandes, T., Branco,
P.,C., Brás, T., Neves, L., A., Lourenço, P., Carvalheiro, F. 2012 Evaluation of detoxification
methods on Extracted Olive Pomace hydrolysate for xylitol production by Debaryomyces
hansenii strains. in Proceedings of 1st Iberoamerican Congress on Biorefineries, Los Cabos,
Baja California, México. (Submitted)
8.
Duarte, L.C., Ferreira, C., Torrado, I., Carvalheiro, F., Guerra, V., Salgado, J., M., 2012
Identification of the main factors affecting xylitol production by Debaryomyces hansenii from
Arundo donax acid hydrolysate. in Proceedings of 1st Iberoamerican Congress on
20/35
Biorefineries, Los Cabos, Baja California, México. (Submitted)
7.
Brás, T., Guerra,V., Torrado,I., Lourenço, P., Carvalheiro, F., Duarte, L.C., Neves, L.A. 2012.
Diananofiltration studies to detoxify extracted olive pomace dilute acid hydrolysates. in
Proceedings of 1st Iberoamerican Congress on Biorefineries, Los Cabos, Baja California,
México. (accepted)
6.
Fernandes, M.C., Brás, T.S., Lourenço, P.M.L., Duarte, L.C., Carvalheiro, F., Bernardo, P.,
Marques, S., Neves, L.A. 2012. The effect of autohydrolysis pretreatment on the production of
th
second generation bioethanol from extracted olive pomace. in “Proceedings of the 4
International Conference on Engineering for Waste and Biomass Valorisation”. Porto,
Portugal.
5.
Carvalheiro, F., Duarte, L.C., Silva-Fernandes, T., Lopes, S., Moura, P., Pereira, H., Gírio,
F.M. 2009. Hydrothermal processing of hardwoods and agro-industrial residues: evaluation of
xylo-oligosaccharides production. in Proceedings of the “NWBC-2009: The 2nd Nordic Wood
Biorefinery Conference”. (Kuokka-Ihalainen, A., editor). Vol. II. pp. 96-102. VTT, Helsinkii,
Finland.
4.
Silva-Fernandes, T., Duarte, L.C., Almeida, S., Carvalheiro, F., Gírio, F.M. 2008. Identification
of the most relevant factors affecting xylitol production by D. hansenii from wheat straw
hydrolysates. in Proceedings of the “Bioenergy: Challenges and Opportunities” International
Conference and Exhibition on Bioenergy. Vol. II. pp. 179-184. Universidade do Minho,
Guimarães, Portugal.
Seleccionado para Comunicação Oral, mas só apresentado como
poster.
3.
Duarte, L.C., Gírio, F.M. 2001. Metabolic engineering of xylose metabolism by Debaryomyces
hansenii: Development of a metabolic network model. in Proceedings of the 1st World
Conference and Exhibition on Biomass for Energy and Industry held in Seville. (Kyritsis, S.,
Beenackers, A.A.C.M., Helm, P., Grassi, A., and Chiaramonti, D., editores). pp. 1171-1174.
James & James (Science Publishers) Ltd., London, UK.
2.
Duarte, L.C., Massano, R., Gírio, F.M., Amaral-Collaço, M.T. 1996. Engenharia Metabólica do
Metabolismo da D-Xilose em Debaryomyces hansenii, in Comunicaciones del III Congreso
Ibérico de Biotecnología. (Fernández-Polanco, F., Benito, G.G., Encina, P.A.G., Miranda,
M.M.P., editores). pp. 77-80. Valladolid, Espanha.
1.
Comunicação Oral
Duarte, L.C., Nobre, A.P., Gírio, F.M., Amaral-Collaço, M.T. 1996. "Estudo do Efeito da
Adição de Pulsos de D-xilose a Culturas Contínuas de Debaryomyces hansenii CCMI941 em
Diferentes Condições Fisiológicas", in Comunicaciones del III Congreso Ibérico de
Biotecnología. (Fernández-Polanco, F., Benito, G. G., Encina, P.A.G., Miranda, M.M.P.,
editores). pp. 313-314. Valladolid, Espanha.
21/35
5.7. Comunicações orais
5.7.1
5.
Por convite em congressos internacionais
Duarte, L.C., Moniz, P., Silva-Fernandes, T., Torrado, Roseiro, L.B., Bogel-Lukasik, R.,
Carvalheiro, F. 2011. Co-productos en las biorefinerías. Tercer Seminario Internacional:
“Desarrollo y Perspectivas de Biorefinerías en Iberoamérica”. Viña del Mar, Chile
4.
Duarte, L.C., Gírio, F.M. 2011. A SIADEB – Sociedade Ibero-Americana para o
Desenvolvimento das Biorrefinarias. Seminário Internacional SIADEB: “Residuos para
Biocombustibles y Bio-refinerias: impactos, logística y simulación”, Santiago de Cali,
Colômbia.
3.
Duarte, L.C., Carvalheiro, F., Silva-Fernandes, T., Moniz, P., Torrado, I, Gírio, F.M. 2010.
Hemicelluloses recovery and upgrading into food ingredients, biofuels, chemicals and
biomaterials. Workshop internacional “Biomass Refinery and Sustainable Development”
Universidad de Vigo, Campus de Orense. Ourense, Spain
2.
Carvalheiro, F., Duarte, L.C., Gírio, F.M. 2008. Oligossacáridos: Re-integração de valor na
fileira agro-industrial a partir dos seus resíduos e subprodutos. 7th Brazilian Meeting on
Chemistry of Food and Beverages (BMCFB). Lorena, SP, Brazil
1.
Gírio, F.M., Duarte, L.C., Carvalheiro, F. 2004. 1981-2004: O que mudou na conversão
enzimática de materiais lenhocelulósicos para produção de etanol e xilitol. VI Seminário
Brasileiro de Tecnologia Enzimática Enzitec 2004. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.
5.7.2
Em congressos internacionais
14. Branco, P.C., Duarte, L.C., Torrado, I., Roseiro, L.B., Pereira, C., Klydjeneiro, Z., Carvalheiro,
F., Castilho, P.C. 2012 Annona cherimola mill seeds as a potential feedstock for the
production of biofuels and bioproducts. Workshop internacional “Valorization of Mediterranean
biowastes and effluents” IAMAW - The International Association of Mediterranean AgroIndustrial Wastes. Santarém, Portugal.
13. Lourenço, P., Martins, C., Carvalheiro, F., Torrado, I., Telhada, J., Duarte, J.C., Duarte, L.C.,
Roseiro, L.B., Viegas, M,. Moniz, P., Bernardo, P., Branco, P., C., Bogel-Lukasik, R., Morais,
R., Marques, S., Silva-Fernandes, T., Guerra, V., Pinto, F., Lopes, H., Duarte, F., Neves, L.,
Fernandes, M., Ramos, P., Sengo, S., Brás, T. 2012 Valorization strategy for by-products of
olive oil extraction industry. Workshop internacional “Valorization of Mediterranean biowastes
and effluents” IAMAW - The International Association of Mediterranean Agro-Industrial
Wastes. Santarém, Portugal
12. Moniz, P., Duarte, L.C., Lino, J., Roseiro, L.B., Pereira, H., Carvalheiro, F. 2012 Fractionation
of agricultural residues to obtain high quality hemicelluloses and lignin. Workshop
internacional “Valorization of Mediterranean biowastes and effluents” IAMAW - The
International Association of Mediterranean Agro-Industrial Wastes. Santarém, Portugal
22/35
11. Calçada, D.; Rosa, A.; Duarte, L.C.; Lopes, V.V. 2010. Comparison of GA and PSO
performance in parameter estimation of microbial growth models: A case-study using
experimental data WCCI2010: 2010IEEE World Congress on Computational Intelligence.
Barcelona, Spain.
10. Duarte, L.C., Silva-Fernandes, T. Pinheiro, N., Costa, A., Maçãs, B., Carvalheiro,F., Gírio,
F.M. 2009. Evaluation of three sorghum varieties as biorefinery feedstock. International
Biorefinery Conference. Syracuse, New York, USA. Seleccionado para apresentação oral,
mas não apresentado por falta de verba.
9.
Silva-Fernandes, Carvalheiro,F., Duarte, L.C., Gírio, F.M. 2009. Autohydrolysis of Sorghum
Straw: Process Modelling and Optimization. International Biorefinery Conference. Syracuse,
New York, USA.
Seleccionado para apresentação oral, mas não apresentado por falta de
verba.
8.
Duarte, L.C., Carvalheiro,F., Silva-Fernandes, T. Gírio, F.M. 2009. The pros and cons of the
dedicated upgrade of the hemicellulosic sugar stream in a biorefinery framework.
Carbohydrates as organic raw materials V: Building a sustainable future. Lisboa, Portugal.
7.
Duarte, L.C., Carvalheiro,F., Esteves, M.P., Gírio, F.M. 2008. Agro-industrial byproducts: A
critical assessment of their Biotechnological Valorization Potential. Bioenergy: Challenges and
Opportunities - International Conference and Exhibition on Bioenergy. Guimarães, Portugal.
6.
Carvalheiro, F., Duarte, L.C., Moura, P., Esteves, M.P., Gírio, F.M. 2007. Hemicellulosic
oligosaccharides: Production processes, properties and applications. 29th Symposium on
Biotechnology for Fuels and Chemicals. Denver, Colorado, USA.
5.
Carvalheiro F., Duarte L.C., Parajó J.C., Pereira H., Gírio F.M. 2006. Production of xylooligosaccharides and polyols from brewery's spent grain hemicelluloses: an integrated
approach. Biomass-derived pentoses: from biotechnology to fine chemistry. Reims, France.
4.
Gírio F.M., Corvo L., Cruz E., Campos C., Lopes S., Lopes R., Carvalheiro F., Duarte L.C.,
Simões S., Marruz M.J., Ratilal P., Reduto dos Reis A.C. 2006. Isolation of xylooligosaccharides as anti-ulcer agents. Biomass-derived pentoses: from biotechnology to fine
chemistry. Reims, France.
3.
Gírio, F.M., Melzoch, K., Duarte, L.C., Alonso, J.L., Roseiro, J.C. 1998. Xylitol production
using a chemostat with total biomass retention by Debaryomyces hansenii CCMI 941. In
Biotec’98 Abstract Book, M. Mota and E. C. Ferreira (eds.), pp. 228.
2.
Carvalheiro, F., Tavares, J.M., Duarte, L.C., Roseiro, J.C., Gírio, F.M. 1998. On-line control of
xylose fermentation by Debaryomyces hansenii CCMI 941: Evaluation of a strategy. In
Biotec’98 Abstract Book, M. Mota e E. C. Ferreira (eds.), pp. 215.
1.
Duarte, L.C., Gírio, F.M., Amaral-Collaço, M.T. 1994. Algumas considerações sobre a
determinação das constantes de Monod em cultura contínua. Biotec'94-II Congresso Ibérico
23/35
de Biotecnologia. Vilamoura, Portugal.
5.7.3
1.
Por convite em conferências nacionais
Gírio, F.M., Fonseca, C., Oliveira, C., Pinto, F., Carvalheiro, F., Marques, I., Gouveia, L.,
Duarte, L.C., Lukasik, R.. 2012. O papel das Biorrefinarias de biomassa como estratégia de
sustentabilidade industrial e do território. 2ª Conferência Anual Energy-IN “Contributos para o
Relançamento da Economia Portuguesa”. Lisboa. Portugal.
5.7.4
7.
Em conferências nacionais
Carvalheiro, F., Esteves, M.P., Duarte, L.C., Garrote, G., Lourenço, P., Gírio, F.M. 2003. A
autohidrólise: Uma alternativa para a obtenção de produtos de valor acrescentado.
Biotec’2003: X Congresso Nacional de Biotecnologia. Lisboa. Portugal.
6.
Esteves, S., Duarte, L.C., Gírio, F.M. 2003. Kluyveromyces marxianus responses to nutrient
limitation stress grown on D-xylose. Congresso Nacional de Microbiologia Micro’2003. Tomar.
Portugal.
5.
Duarte, L.C., Carvalheiro, F., Gírio, F.M. 2001. Caracterização dos fluxos intracelulares de
carbono no metabolismo da D-xilose em Debaryomyces hansenii. Congresso Nacional de
Microbiologia Micro’2001. Póvoa de Varzim. Portugal.
4.
Albergaria, H., Duarte, L.C., Amaral-Collaço, M.T., Gírio, F.M. 1999. Estudo da fisiologia da
levedura Saccharomyces uvarum em quimiostato, A-stat e semi-descontínuo. 7as Jornadas
de biologia de leveduras Professor Nicolau van Uden, Lisboa, Portugal.
3.
Duarte, L.C., Woods, J.H., Fell, D.A., Gírio, F.M. 1997. A aplicação da Análise de Modos
Elementares ao desenvolvimento e optimização de bioprocessos. Congresso Nacional de
Microbiologia Micro’97. Tomar. Portugal.
2.
Tavares, J.M., Duarte, L.C., Gírio, F.M. 1997. A limitação de fosfato induz a sobreprodução de
xilitol em culturas de Debaryomyces hansenii. Congresso Nacional de Microbiologia Micro’97.
Tomar. Portugal.
1.
Nobre, A.P., Duarte, L.C., Gírio, F.M., Roseiro, J.C, Amaral-Collaço, M.T. 1994. Metabolismo
da D-xilose em Debaryomyces hansenii crescida em cultura contínua. 2ª Jornadas de biologia
de leveduras Professor Nicolau van Uden. Braga. Portugal.
5.8. Comunicações em painel
5.8.1
Em conferências internacionais
62. Duarte, L.C., Bernardo, P.R., Bogel-Lukasik, R., Moniz, P., Silva-Fernandes, T., Viegas, M.,
Lourenço, P., Carvalheiro, F. 2012. Autohydrolysis: A search for an on-line monitoring
strategy. COST Action CM0903 (UBIOCHEM) 3rd Workshop, Thessaloniki, Greece.
(Submitted).
24/35
61. Carvalheiro, F., Guerra, V., Bogel-Lukasik, R., Lourenço, P., Duarte, L.C. 2012 Optimization of
dilute acid hydrolysis of Extracted Olive Pomace. COST Action CM0903 (UBIOCHEM) 3rd
Workshop, Thessaloniki, Greece. (Submitted).
60. Roseiro, L.B., Martins, A.I., Duarte, L.C. Rauter, A.P. 2012. Added-value polyphenols from
plant biomass: Options in product valorization within the biorefinery approach. Paris
Polyphenols 2012. Paris. France
59. Fernandes, M.C., Brás, T.S., Lourenço, P.M.L., Duarte, L.C., Carvalheiro, F., Bernardo, P.,
Marques, S., Neves, L.A. 2012. The effect of autohydrolysis pretreatment on the production of
th
second generation bioethanol from extracted olive pomace. 4 International Conference on
Engineering for Waste and Biomass Valorisation. Porto, Portugal.
58. Baeta-Hall, L., Eusébio, A., Ribeiro, B., Gonçalves, M., Chaves, S., Sàágua, M.C., Duarte,
L.C., Tenreiro, R., Almeida-Vara, E., Marques, I.P., Duarte, J.C. 2012. Portuguese olive oil
wastewaters: Looking for a unifying model. Workshop internacional “Valorization of
Mediterranean biowastes and effluents” IAMAW - The International Association of
Mediterranean Agro-Industrial Wastes. Santarém, Portugal
57. Moniz, P.; Duarte, L.C.; Pereira, H.; Carvalheiro, F. 2012. Hydrothermal pretreatment of corn
residues and rice straw. AFORE Workshop. Lisboa, Portugal.
56. Salgado, J.M., Guerra, V., Lourenço, P., Ferreira, C., Silva-Fernandes, T., Branco, P.C.,
Torrado, I., Carvalheiro, F., Domínguez, J.M., Duarte, L.C. 2011. Simple one stage
detoxification procedure of hemicellulosic acid hydrolysates using activated charcoal. 12th
Mediterranean Congress of Chemical Engineering. Barcelona. Spain.
55. Roseiro, L.B.; Lourenço, P.M.L.; Duarte, L.C.; Falé, P.L.; Serralheiro, L.M.; Rauter, A.P.
2011a. Acetylcholinesterase inhibition by an olive pomace extract rich in hydroxytyrosol 5th
International Conference on Polyphenols and Health. Barcelona, Spain.
54. Roseiro, L.B.; Duarte, L.C.; Oliveira, D.L.; Roque, R.; Bernardo-Gil, M.G.; Martins, A.I.;
Sepúlveda, C.; Almeida, J.; Meireles, M.; Rauter, A.P. 2011b. Antiproliferative activity and
comparative phenolics profile of different extracts from carob kibbles (Ceratonia siliquoa L.)
5th International Conference on Polyphenols and Health. Barcelona, Spain.
53. Duarte, L.C.; Ribeiro, B.; Paixão, S.; Baeta-Hall, L.; Sàágua, M.C.; Silva-Fernandes, T.;
Carvalheiro, F.; Duarte, J.C. 2011. Bioenergy from wheat straw: Pretreatment, enzymatic
hydrolysis and ethanol productivity. Italic6 - Italian Meeting on Lignocellulosic Chemistry Final Workshop COST FP0602
52. Moniz, P.; Duarte, L.C.; Pereira, H.; Carvalheiro, F. 2011. Optimization of hemicellulose
hydrolysis from rice straw under very dilute acid conditions BBEST - 1st Brazilian BioEnergy
Science and Technology Conference. Campos do Jordão, SP, Brazil.
51. Silva-Fernandes, T.; Carvalheiro, F.; Duarte, L.C.; Gírio, F.M. 2011. Pretreatment of
25/35
lignocellulosic materials for high pentose recovery BBEST - 1st Brazilian BioEnergy Science
and Technology Conference. Campos do Jordão, SP, Brazil.
50. Carvalheiro, F.; Torrado, I.; Duarte, L.C.; Raposo, S.; Gírio, F.M. 2011. Selective recovery of
hemicellulosic sugars from high-biomass sorghum a potential energy crop. XIX ISAF. Verona,
Italy. (Aceite, mas não apresentado por falta de fundos)
49. Carvalheiro, F.; Torrado, I.; Duarte, L.C.; Raposo, S.; Gírio, F.M. 2011. Optimization of dilute
acid hydrolysis for the selective recovery of hemicellulosic sugars from sorghum straw. 33rd
Symposium on Biotechnology for Fuels and Chemicals. Seattle, WA, USA. (Aceite, mas não
apresentado por falta de fundos)
48. Moniz, P.; Duarte, L.C.; Pereira, H.; Carvalheiro, F. 2011. Recovery of oligosaccharides
obtained from agricultural residues using preparative chromatography. 33rd Symposium on
Biotechnology for Fuels and Chemicals. Seattle, WA, USA.
47. Silva-Fernandes, T.; Duarte, L.C.; Carvalheiro, F.; Gírio, F.M. 2011. Optimization of
autohydrolysis of biomass mixtures: a modeling assessment. 33rd Symposium on
Biotechnology for Fuels and Chemicals. Seattle, WA, USA.
46. Torrado, I.; Carvalheiro, F.; Duarte, L.C.; Gírio, F.M. 2011. Xylitol production by
Debaryomyces hansenii using sorghum straw hydrolyzates. 33rd Symposium on Biotechnology
for Fuels and Chemicals. Seattle, WA, USA. (Aceite, mas não apresentado por falta de
fundos)
45. Silva-Fernandes, T.; Carvalheiro, F.; Duarte, L.C.; Gírio, F.M. 2010. Autohydrolysis of
sorghum straw: Process modelling and optimization. Biomass derived pentoses: From
biotechnology to fine chemistry. Reims, France.
44. Silva-Fernandes, T.; Carvalheiro, F.; Duarte, L.C.; Gírio, F.M. 2010. The autohydrolysis of
different combinations of wheat straw, eucalyptus residues and olive tree prunings. Biomass
derived pentoses: From biotechnology to fine chemistry. Reims, France.
43. Branco, P.C.; Torrado, I.; Carvalheiro, F.; Castilho, P.C.; Duarte, L.C. 2010. Optimisation and
mathematical modelling of custard apple seeds dilute acid hydrolysis. Biomass derived
pentoses: From biotechnology to fine chemistry. Reims, France.
42. Duarte, L.C.; Silva-Fernandes, T.; Torrado, I.; Pinheiro, N.; Costa, A.; Maçãs, B.; Carvalheiro,
F.; Gírio, F.M. 2010. Potential of sorghum as a biorefinery feedstock for southern Europe. The
4th Annual Workshop of COST FP0602: Biotechnical processing of lignocellulosic raw
materials. Cesme, Izmir, Turkey.
41. Branco, P.C.; Torrado, I.; Roseiro, L.B., Rodrigues, A. I., Silva, T.L., Carvalheiro, F.; Castilho,
P.C.; Duarte, L.C. 2010. Annona (Annona cherimola Mill.) seeds: A novel biorefinery
feedstock? The 4th Annual Workshop of COST FP0602: Biotechnical processing of
lignocellulosic raw materials. Cesme, Izmir, Turkey.
26/35
40. Moniz, P.; Pereira, H.; Duarte, L.C.; Gírio, F.M.; Carvalheiro, F. 2010. The upgrade of rice
straw using autohydrolysis. The 4th Annual Workshop of COST FP0602: Biotechnical
processing of lignocellulosic raw materials. Cesme, Izmir, Turkey.
39. Silva-Fernandes, T.; Duarte, L.C.; Carvalheiro, F.; Gírio, F.M. 2010. The effect of temperature
on the autohydrolysis treatment of mixtures of wheat straw-eucalyptus residues. The 4th
Annual Workshop of COST FP0602: Biotechnical processing of lignocellulosic raw materials.
Cesme, Izmir, Turkey.
38. Crone, C.; Scigelova, M.; Scheibner, O.; Hornshaw, M.; Duarte, L.C.; Roseiro, L.; Gírio, F.M.;
Bernardo-Gil, M.G. 2010. Antioxidants in Carob Bean Extracts: Evaluation of Extraction
Methods Using High Resolution Mass Spectrometry. 58th ASMS Conference on Mass
Spectrometry. Salt lake City, UT, USA.
37. Santos, J.L.C.; Fernandes, M.C.; Lourenço, P.M.L.; Duarte, L.C.; Carvalheiro, F.; Crespo, J.G.
2010. Removal of inhibitory compounds from olive stone autohydrolysis liquors by
nanofiltration. VII Ibero-American Conference on Membrane Science and Technology (CITEM
2010). Sintra, Portugal.
36. Duarte, L.C., Carvalheiro, F., Pereira, P., Gírio, F.M. 2009. Physiologic diversity in
Debaryomyces hansenii. BioMicroWorld2009. Lisbon, Portugal
35. Moniz, P., Carvalheiro, F., Duarte, L.C., Moura, P., Esteves, M.P, Gírio, F.M. 2009.
Development of a carob based medium for mannitol production by Leuconostoc fructosum
NRRL B-2041. BioMicroWorld2009. Lisbon, Portugal
34. Carvalheiro, F., Moniz, P., Duarte, L.C., Moura, P., Esteves, M.P, Gírio, F.M. 2009.
Physiological characterization of mannitol overproducing strains in carob based medium.
BioMicroWorld2009. Lisbon, Portugal
33. Moniz, P., Carvalheiro, F., Moura, P., Pereira, J., Duarte, L.C., Esteves, M.P, Gírio, F.M. 2009.
Screening and characterization of lactic acid bacteria for the production of mannitol in carob
based syrups. BioMicroWorld2009. Lisbon, Portugal
32. Crone,C., Scigelova, M., Hornshaw, M., Duarte, L.C., Roseiro, L.B., Gírio, F.M., Bernardo-Gil,
M.G. 2009. Antioxidants in Carob bean extracts: Evaluation of extraction methods using High
Resolution Mass Spectrometry. Advances in Metabolic Profiling. Barcelone. Spain.
31. Carvalheiro, F., Duarte, L.C., Silva-Fernandes, T., Lopes, S., Moura, P., Pereira, H., Gírio,
F.M. 2009. Hydrothermal processing of hardwoods and agro-industrial residues: Evaluation of
xylo-oligosaccharides production. N W B C - 2 0 0 9 :
W o o d
Bi or efi n e r y
T h e
2 nd
N or di c
C o n f e r e n c e . Helsinkii, Finland.
30. Silva-Fernandes, T., Duarte, L.C., Carvalheiro,F., Gírio, F.M. 2009. Simplex optimization and
mathematical modeling of wheat straw dilute acid hydrolysis. 31st Symposium on
Biotechnology for Fuels and Chemicals. San Francisco, Ca, USA.
27/35
29. Duarte, L.C., Silva-Fernandes, T., Carvalheiro,F., Gírio, F.M. 2008. Dilute acid hydrolysis of
wheat straw oligosaccharides. 30th Symposium on Biotechnology for Fuels and Chemicals.
New Orleans, Louisiana, USA.
28. Carvalheiro,F., Silva-Fernandes, T., Duarte, L. C, Gírio, F.M. 2008. Wheat straw
th
autohydrolysis: process optimization and products characterization. 30
Symposium on
Biotechnology for Fuels and Chemicals. New Orleans, Louisiana, USA.
27. Silva-Fernandes, T., Duarte, L.C., Almeida, S., Carvalheiro,F., Gírio, F.M. 2008. Identification
of the most relevant factors affecting xylitol production by D. hansenii from wheat straw
hydrolysates. Bioenergy: Challenges and Opportunities - International Conference and
Exhibition on Bioenergy. Guimarães, Portugal.
Seleccionado para Comunicação Oral,
mas só apresentado como poster
26. Silva-Fernandes, T., Carvalheiro,F., Duarte, L.C., Gírio, F.M. 2008. Selective recovery of
wheat straw hemicellulose towards a bioethanol biorefinery. Bioenergy: Challenges and
Opportunities - International Conference and Exhibition on Bioenergy. Guimarães, Portugal.
25. Duarte, L.C., Carvalheiro,F., Lopes, S., Neves, I., Gírio, F.M. 2007. Yeast biomass production
in brewery's spent grains hemicellulosic hydrolysate. 29th Symposium on Biotechnology for
Fuels and Chemicals. Denver, Colorado, USA.
24. Duarte, L.C., Carvalheiro, F., Gírio F.M. 2006. The impact of lignocellulose-derived
compounds on yeasts pentoses to pentalditols conversion: a review. Biomass-derived
pentoses: from biotechnology to fine chemistry. Reims, France.
23. Duarte, L.C., Esteves, M.P.; Carvalheiro, F., Gírio, F.M. 2006. The upgrade of Agro-food
industries by-products and wastes in European Mediterranean countries: The Portuguese
current situation and future prospects. 28th Symposium on Biotechnology for Fuels and
Chemicals. Nashville, Tennessee, USA.
22. Duarte, L.C., Carvalheiro, F. Tadeu, J., Gírio, F.M. 2005. Combined effects of acetic acid,
th
formic acid and hydroquinone on Debaryomyces hansenii physiology. 27
Symposium on
Biotechnology for Fuels and Chemicals. Denver, Colorado, USA.
21. Carvalheiro, F., Duarte, L.C., Gírio, F.M. 2005. Kinetic modeling of xylo-oligosaccharides
th
production from brewery’s spent grains autohydrolysis. 27 Symposium on Biotechnology for
Fuels and Chemicals. Denver, Colorado, USA.
20. Duarte, L.C., Esteves, S., Carvalheiro, F., Gírio, F.M. 2004. Kluyveromyces marxianus as an
alternative yeast cell factory for upgrading lignocellulosic hydrolysates. 26th Symposium on
Biotechnology for Fuels and Chemicals. Chattanooga, Tennessee, USA.
19. Duarte, L.C., Carvalheiro, F., Neves, I., Gírio, F.M. 2004. Study of relevant naturally pentoseassimilating yeasts tolerance to Brewery’s Spent Grain hydrolysate. 26th Symposium on
Biotechnology for Fuels and Chemicals. Chattanooga, Tennessee, USA.
28/35
18. Duarte, L.C., Carvalheiro, F., Neves, I., Gírio, F.M. 2004. Quantifying Debaryomyces hansenii
tolerance to selected inhibitor compounds found in hemicellulosic hydrolysates. 26th
Symposium on Biotechnology for Fuels and Chemicals. Chattanooga, Tennessee, USA.
17. Carvalheiro, F., Duarte, L.C., Lopes, S., Parajó, J.C., Pereira, H., Gírio, F.M. 2004. Effect of
brewery’s spent grain hydrolysate detoxification on xylitol production by Debaryomyces
hansenii CCMI 941. 26th Symposium on Biotechnology for Fuels and Chemicals. Chattanooga,
Tennessee, USA.
16. Carvalheiro, F., Duarte, L.C., Parajó, J.C., Pereira, H., Gírio, F.M. 2004. Fractionation of
th
brewery’s spent grain using autohydrolysis. 26 Symposium on Biotechnology for Fuels and
Chemicals. Chattanooga, Tennessee, USA.
15. Duarte, L.C., Carvalheiro, F., Neves, I., Gírio, F.M. 2003. Comparison of the tolerance to
selected inhibitor compounds found in hemicellulosic hydrolysates in relevant naturally
pentose-assimilating yeasts. 11th European Congress on Biotechnology. Basileia, Suíça.
14. Duarte, L.C., Carvalheiro, F., Lopes, S. Marques, S., Parajó, J.C., Gírio, F.M. 2003. Evaluation
of post-hydrolysis processes of brewery’s spent grain autohydrolysis liquor to produce a
pentose-containing culture media. 25th Symposium on Biotechnology for Fuels & Chemicals.
Breckenridge, Colorado, USA.
13. Carvalheiro, F., Duarte, L.C., Medeiros, R., Gírio, F.M. 2003. Optimization of brewery’s spent
grain dilute-acid hydrolysis for the production of pentose-rich culture media. 25th Symposium
on Biotechnology for Fuels & Chemicals. Breckenridge, Colorado, USA.
12. Carvalheiro, F., Duarte, L.C., Medeiros, R., Gírio, F.M. 2003. Development of a brewery’s
spent grain dilute-acid hydrolyzate media for polyols production by Debaryomyces hansenii
CCMI 941. 25th Symposium on Biotechnology for Fuels & Chemicals. Breckenridge, Colorado,
USA.
11. Duarte, L.C., Carvalheiro, F., Gírio, F.M. 2002. Metabolic Fluxes Analysis of xylose
metabolism in Debaryomyces hansenii. Advanced Technologies for Metabolic Engineering in
Biotechnology and Medicine. FEBS Advanced Course. Carcavelos, Portugal.
10. Duarte, L.C., Tavares, J.M., Gírio, F.M. 1998. Physiological studies under xylose-excess
chemostat on D-xylose metabolism by Debaryomyces hansenii. In Abstracts of EC Framework
IV Symposium "Yeast as a cell factory", P. Osseweijer e J.P. van Dijken (eds), pp.177.
9.
Tavares, J.M., Duarte, L.C., Gírio, F.M. 1998. Simultaneous metabolism of xylose and
hexoses under xylitol production conditions by Debaryomyces hansenii. In Abstracts of EC
Framework IV Symposium "Yeast as a cell factory", P. Osseweijer e J.P. van Dijken (eds),
pp.176.
8.
Fell, D.A., Duarte, L.C., Gírio, F.M. 1998. Using Elementary Modes Analysis from a
biotechnological point of view. Metabolic Engineering II. Elmau. Germany.
29/35
7.
Duarte, L.C., Woods, J.H., Fell, D.A., Gírio, F.M. 1998. Bioprocess development and
optimisation using Elementary Modes Analysis. In Proceedings of the 2nd European
Symposium on Biochemical Engineering Science, S. Feyo de Azevedo, E. C. Ferreira, K. Ch.
A. M. Luyben, P. Osseweijer, (eds.).pp. 290.
6.
Albergaria, H., Duarte, L.C., Gírio, F.M., Amaral-Collaço, M.T. 1998. Study of Saccharomyces
uvarum physiology in continuous culture with smooth change of dilution rate (A-Stat). 19th
ISSY International specialized symposium on yeasts: Yeasts in the production and spoilage of
food and beverages. Braga. Portugal.
5.
Tavares, J.M., Duarte, L.C., Gírio, F.M., 1998. The effect of hexoses as co-substrates on
xylitol production by Debaryomyces hansenii CCMI 941. In Biotec’98 Abstract Book, M. Mota e
E. C. Ferreira (eds.), pp. 173.
4.
Duarte, L.C., Carvalheiro, F., Roseiro, J.C., Gírio, F.M. 1997. Metabolic Flux Analysis of fedbatch
cultivation
of
xylitol-producing
Debaryomyces
hansenii.
European
Research
Conference: Control of Metabolic Flux: Metabolic pathway engineering in yeasts. Giens,
França.
3.
Gírio, F.M., Nobre, A.P., Duarte, L.C., Roseiro, J.C., Amaral-Collaço, M.T. 1995. In vivo and in
vitro analysis of the metabolism of D-xylose by Debaryomyces hansenii. European Research
Conference: Control of Metabolic Flux: Metabolic Pathway Engineering in Yeasts. Granada.
Espanha.
2.
Duarte, L.C., Nobre, A.P., Gírio, F.M., Amaral-Collaço, M.T. 1994. Determination of the kinetic
constants of Debaryomyces hansenii grown in continuous culture using D-xylose as sole
Carbon and energy source. 7th International Congress of Mycology Division. Praha. Czech
Republic.
1.
Nobre, A.P., Duarte, L.C., Gírio, F.M., Roseiro, J.C, Amaral-Collaço, M.T. 1993. The
measurement of Carbon fluxes in the xylitol-producing Debaryomyces hansenii yeast under
chemostat cultivation. 6th European Congress on Biothecnology. Firenze. Italy.
5.8.2
Em conferências nacionais
10. Rodrigues, D.C.G.A., Duarte, L.C., Silva, S.S., Gírio, F.M., Vitolo, M. 2006. Análise de Fluxos
Metabólicos em Candida guilliermondii durante a bioconversão de xilose em xilitol.
Enzitec2006: VII Seminário Brasileiro de Tecnologia Enzimática. Caxias do Sul, Brasil
9.
Duarte, L.C., Carvalheiro, F., Tadeu, J., Gírio, F.M. 2005. The combined effects of acetic acid,
formic acid and hydroquinone on Debaryomyces hansenii physiology. MicroBiotec 2005.
Póvoa do Varzim, Portugal.
8.
Lopes, S., Duarte, L.C., Carvalheiro, F., Marques, S., Gírio, F.M. 2003. Comparação de dois
processos de pós-hidrólise de licores de auto-hidrólise de dreche cervejeira para a produção
de um meio de cultura contendo pentoses. Biotec’2003: X Congresso Nacional de
30/35
Biotecnologia. Lisboa. Portugal.
7.
Lopes, S., Duarte, L.C., Carvalheiro, F., Gírio, F.M. 2003. Avaliação de métodos de
destoxificação do hidrolisado de dreche cervejeira para a produção de xilitol por
Debaryomyces hansenii CCMI 941. Biotec’2003: X Congresso Nacional de Biotecnologia.
Lisboa. Portugal.
6.
Carvalheiro, F., Duarte, L.C., Medeiros, R., Gírio, F.M. 2003. Optimização da hidrólise ácida
diluída de dreche cervejeira para a obtenção de um meio de cultura rico em pentoses.
Biotec’2003: X Congresso Nacional de Biotecnologia. Lisboa. Portugal.
5.
Carvalheiro, F., Duarte, L.C., Medeiros, R., Gírio, F.M. 2003. Efeito da adição de suplementos
na produção de polióis por Debaryomyces hansenii CCMI 941 em hidrolisados ácidos de
dreche cervejeira. Biotec’2003: X Congresso Nacional de Biotecnologia. Lisboa. Portugal.
4.
Neves, I., Duarte, L.C., Carvalheiro, F., Gírio, F.M. 2003. Physiological responses of
Debaryomyces hansenii to selected inhibitor compounds found in hemicellulosic hydrolysates.
Congresso Nacional de Microbiologia Micro’2003. Tomar. Portugal.
3.
Rodrigues, D.C.G.A., Duarte, L.C., Silva, S.S., Gírio, F.M., Vitolo, M. 2002. Nível das
atividades enzimáticas da levedura Candida guilliermondii FTI20037 durante o metabolismo
de xilose. V Seminário Brasileiro de Tecnologia Enzimática Enzitec 2002. Brasília, DF. Brasil.
2.
Duarte, L.C., Carapeto, P., Gírio, F.M. 1999. A limitação de fosfato induz a produção de xilitol
em culturas de Pichia stipitis. Congresso Nacional de Microbiologia Micro’99. Luso. Portugal.
1.
Carvalheiro, F., Duarte, L.C., Roseiro, J.C., Gírio, F.M. 1997. Aplicação da Análise de Fluxos
Metabólicos ao metabolismo da D-xilose em culturas descontínuas de Debaryomyces
hansenii à escala piloto. Congresso Nacional de Microbiologia Micro’97. Tomar. Portugal.
5.9. Outros
5.9.1
7.
Apoio à indústria – relatórios
Duarte, L.C., Carvalheiro, F., Silva-Fernandes, T., and Gírio, F.M. 2009. Avaliação do teor de
amido de diferentes variedades de milho cultivadas em Portugal e perspectivas para a sua
utilização na produção de bioetanol – Campanha de 2008. INETI-UFMB. ANPROMIS.
6.
Duarte, L.C.; Almeida, S.; Carvalheiro, F.; and Gírio, F.M. 2008. D. hansenii growth from …
liquor posthydrolysate. INETI-UFMB. Cliente Confidencial
5.
Duarte, L.C.; Almeida, S.; Carvalheiro, F.; and Gírio, F.M. 2008. Optimization of Acid
Posthydrolysis Conditions. INETI-UFMB. Cliente Confidencial
4.
Duarte, L.C., Carvalheiro, F., Silva-Fernandes, T., and Gírio, F.M. 2008. Avaliação do teor de
amido de diferentes variedades de milho cultivadas em Portugal e perspectivas para a sua
utilização na produção de bioetanol. INETI-UFMB. ANPROMIS.
31/35
3.
Duarte, L.C., Esteves, M.P., Carvalheiro, F., and Gírio, F.M. 2006. Inventário nacional de
subprodutos agro-industriais de natureza vegetal. INETI-UFMB. FIPA.
2.
Duarte, L.C., Esteves, M.P., Gírio, F.M. 2006. New products from carob pulp for the functional
food market: A first round assessment. INETI-UFMB. Cliente confidencial.
1.
Duarte, L.C., Carvalheiro, F., Esteves, M.P., Gírio, F.M. 2005. Avaliação de potenciais
tecnologias de valorização biotecnológica da casca de arroz. INETI-UFMB. Cliente
confidencial.
5.9.2
1.
Duarte, L.C. 2007. Models Contribution to the GOSA-Fit software.
5.9.3
2.
Software
Trabalhos de divulgação
Duarte, L.C., Gírio, F.M. 1998. Micróbios na NET: IBM Patent Server/European Patent Office.
Boletim de Microbiologia. n.º3. pp. 11.
1.
Duarte, L.C., Alves, L., Pires, F. 1996. BioFuturo. Impaciência. n.º 3: 18-21.
5.9.4
3.
Textos de apoio aos alunos
Lopes, S. Torrão, R., Duarte, L.C. 2004 Protocolos laboratoriais da disciplina de Introdução à
Biotecnologia. Universidade Independente.
2.
Duarte, L.C. 2002 Sebenta de Apoio à disciplina de Introdução à Biotecnologia. Universidade
Independente.
1.
Duarte, L.C. 2002 Caderno de exercícios para a disciplina de Introdução à Biotecnologia.
Universidade Independente.
6. QUALIFICAÇÕES ADICIONAIS
6.1. Certificação de Aptidão Pedagógica
26/2/2007:
Certificado de Aptidão Pedagógica (CAP) n.º EDF 436352/2007 DL válido até
26/2/2012
6.2. Cursos de curta duração
Microbiologia Molecular: Explorando a Proteómica Quantitativa
Curso de Pós-Graduação organizado pelo Instituto Superior Técnico, de 13 a 16 de Julho
de 2004 (28 horas), IST, Lisboa, Portugal.
Responsável científico:
Doutora Isabel Sá-Correia, Instituto Superior Técnico, Universidade Técnica de Lisboa,
Portugal
32/35
Advanced Technologies for Metabolic Engineering in Biotechnology and Medicine
Curso avançado organizado pela FEBS, de 7 a 13 de Setembro de 2002, ITQB,
Carcavelos, Portugal.
Responsáveis científicos:
Doutora Ana Ramos, Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Universidade Nova de
Lisboa, Portugal
Prof. Helena Santos, Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Universidade Nova de
Lisboa, Portugal
Prof. Matthias Reuss, Institute of Biochemical Engineering, University of Stuttgart,
Germany
Prof. Francesc Gódia, Universitat Autonòma de Barcelona, Spain
Microbial Physiology and Fermentation Technology
Curso avançado organizado por Biotechnology Studies Delft Leiden (BODL), de 4 a 15 de
Dezembro de 2000, Kluyver Laboratory for Biotechnology, Delft University of Technology, Delft,
Holanda.
Responsáveis científicos:
Prof. J. G. Kuenen, Delft University of Technology.
Prof. J. J. Heijnen, Delft University of Technology.
Metabolic Control Analysis and Metabolic Engineering
Curso organizado pelo INETI-DB, Lisboa, 21 a 22 Outubro de 1997.
Responsável científico:
Prof. David Fell, Oxford Brookes University.
Metodologia da Investigação Experimental
Curso Avançado organizado pela NOPRAI, INETI e Université d'Aix-Marseille III, Lisboa,
28 a 31 Outubro de 1996.
Responsável científico:
Prof. Roger Phan-Tan-Luu, Université d'Aix-Marseille III.
Biorreactors and Environmental Applications
Curso de Verão organizado pela Forbitec, Lisboa, 13 a 15 de Setembro de 1995.
Director do Curso:
Doutor José Cardoso Duarte, INETI
Effluent Treatment of the Pulp and Paper Industry
Curso de Verão organizado pela Forbitec, Lisboa, 11 e 12 de Setembro de 1995.
Director do Curso:
Doutor José Cardoso Duarte, INETI
33/35
Applications of Biothecnology in the Food and Chemical Industries
Curso de Verão organizado pela Forbitec, Lisboa, 26 a 30 de Julho 1993.
Director do Curso:
Doutor José Cardoso Duarte, INETI
Bioquímica e Genética de Leveduras
Curso Pós-Graduado (Seminários), organizado pelo Instituto de Investigaciones
Biomédicas de Madrid e Departamento de Biologia da Universidade do Minho, Braga, 19 a 28 de
Abril de 1993.
Coordenadores:
Prof. Cecília Leão, Universidade do Minho
Prof. Carlos Gancedo, Instituto de Investigaciones Biomédicas
6.3. Outras acções de formação
Como escrever “Ciência”: Metodologias de Apresentação de Resultados de I&D
Acção de Formação Interna organizada pelo Conselho Científico do INETI, 24 de Maio de
2005, num total de 4 horas. INETI, Lisboa.
Curso de Introdução ao Matlab e Simulink
Acção de Formação Interna organizada pelo Conselho Científico do INETI, 22 a 26 de
Novembro de 2004, com a duração de 12 horas presenciais e 9 horas de “e-learning” num total de
21 horas. INETI, Lisboa.
Aplicações da Citometria de Fluxo Multivariada em Estudos de Fisiologia Microbiana
Acção de Formação Interna organizada pelo Conselho Científico do INETI, 15 a 17 de
Dezembro de 2003, com a duração total de 12 horas. INETI, Lisboa.
Breve Introdução à Formulação e Resolução de Problemas de Programação Matemática em
GAMS
Acção de Formação Interna organizada pelo Conselho Científico do INETI, 24 de Junho
de 2003, com a duração total de 7 horas. INETI, Lisboa.
Curso de introdução ao BioEdit
Curso de formação em software para processamento de dados de Biologia Molecular
(BioEdit). Acção de Formação Interna organizada pelo Departamento de Biotecnologia do INETI,
31 de Janeiro de 2002, com a duração total de 4 horas. INETI, Lisboa.
Segurança e Organização de Laboratórios de Microbiologia
Acção de Formação Interna organizada pelo Departamento de Biotecnologia do INETI, 21
de Janeiro de 2002, com a duração total de 7 horas. INETI, Lisboa.
Normalização em Biotecnologia: Aplicação à Indústria
Seminário organizado pela ONS.DB, 29 de Fevereiro 2000, INETI, Lisboa.
34/35
Protecção e Segurança Radiológica
Curso organizado pelo INETI/ITN, 2 de Fevereiro de 2000, INETI, Lisboa.
Fisiologia e Bioquímica de Bactérias Metilotróficas: Fundamentos e Aplicações
Workshop organizado por NOPRAI / INETI-DB, Lisboa, 27 de Fevereiro de 1996.
O Impacto das Tecnologias Biológicas no Desenvolvimento e Qualidade Industrial
Jornadas organizadas por NOPRAI / INETI, Lisboa, 3 de Novembro de 1994.
A Influência da Microbiologia na Produção, no Controlo e na Higiene do Vinho
Seminário organizado por NOPRAI / INETI, Lisboa, 13 de Abril de 1994.
6.4. Domínio de línguas
 Inglês: Conhecimentos elevados. Obteve aprovação no curso "First Certificate in English" da
Universidade de Cambridge - Instituto Britânico, em Junho de 1988.
 Francês: Nível médio-alto de leitura e razoável de conversação e escrita.
6.5. Conhecimentos de informática
 Conhecimentos elevados dos Sistemas Operativos MS-DOS, Windows 95/98, 2000 e XP, bem
como das suas principais aplicações.
 Conhecimentos elevados dos softwares específicos: SigmaPlot, Simnon, Plas, Millennium32
(Waters), Chromelean (Dionex), H7000 HSM (Hitachi), Fermentor Control Program (Foxy Logic).
 Conhecimentos elevados de navegação e pesquisa de informação na Internet. Conhecimentos
de edição em HTML.
 Conhecimentos básicos de programação e codificação (QBASIC, MATLAB e Simulink).
 Conhecimentos básicos de hardware.
7. SOCIEDADES CIENTÍFICAS
 Sócio Fundador da SIADEB – Sociedade Ibero-Americana para o Desenvolvimento das
Biorrefinarias, 2010
 Sócio da Sociedade Portuguesa de Microbiologia, desde 1998.
 Sócio da Sociedade Portuguesa de Biotecnologia, desde 1992.
o
Colaborou na edição do Boletim de Biotecnologia da Sociedade Portuguesa de
Biotecnologia entre 1994 e 2000.
 Sócio da Sociedade Portuguesa de Bioquímica, desde 1992.
35/35