CBIS 2010 - Painel 6 : Pesquisa Translacional e seus Benefícios para o Paciente O ecossistema translacional Stefan Schulz Centro Médico da Universidade de Freiburg, Alemanha “translational research requires a knowledgedriven ecosystem” Ecossistema Organismos diversificados Habitat definido Interdependência Fluxo de energia e nutrientes Fatores abióticos O Ecossistema translacional Organismos diversificados Sistema de saúde, centros de pesquisa indústrias etc. Interdependência Habitat definido Fluxo de Dados Informação Conhecimento Pacientes, familiares, médicos, enfermeiros, farmacêuticos, empresários, pesquisadores, docentes, ... Fatores abióticos Equipamentos, espaços físicos, infra-estrutura Fluxo de energia e nutrientes Habitantes do Dados Informação Ecossistema translacional Conhecimento Dados, Informação, Conhecimento Origem Profissionais de saúde Pacientes Pesquisadores Dados, Informação, Conhecimento Origem Profissionais de saúde Pacientes Pesquisadores Estruturas Infra-estrutura de dados Infra-estrutura de informação Infra-estrutura de conhecimento Dados, Informação, Conhecimento Linguagens Origem Profissionais de saúde Histologisches Gutachten Pacientes Makroskopie: "Resektat nach Whipple": Ein noch nicht eröffnetes Resektat, bestehend aus einem distalen Magen mit einer kleinen Kurvaturlänge von 9,5 cm und einer großen Kurvaturlänge von 13,5 cm, sowei einem duodenalen Anteil von 14 cm Länge. 2 cm aboral des Pylorus zeigt die Dünndarmwandung eine sanduhrartige Stenose. Im Lumen sowohl Histologisches des Magens Gutachten als auch des Duodenums reichlich zähflüssiger Schleim, sangoinolent; die Schleimhaut ist insgesamt livide. Anhängend ein 7,5 x 4 x 1,5 cm großes Pankreaskopfsegment sowie ein 4 cm langer derber und Makroskopie: bis 2,5 cm durchmessender "Resektat nach knotiger Whipple": Gewebsstrang, Ein noch nicht der eröffnetes an seinem Ende Resektat, einebestehend aus einem distalen Fadenmarkierung aufweist. MagenHier mit einer auf lamellierenden kleinen Kurvaturlänge Schnittenvon zähfestes 9,5 cmweißliches, und einer großen teilweise Kurvaturlänge nodulär von 13,5 cm, sowei einem konfiguriertes Gewebe, duodenalen ohne das Gallengänge Anteil von 14manifest cm Länge. werden. 2 cm Der aboral distale des Pylorus Anteil des zeigt Ductus die Dünndarmwandung pankreaticus ist eine sanduhrartige leicht erweitert und von Stenose. der Papilla Im Lumen vateri aus sowohl 4,5 cm desweit Magens sondierbar, als auchwobei des Duodenums er hier in einer reichlich peripankreatischen zähflüssiger Schleim, sangoinolent; Narbenzone abbricht.die DieSchleimhaut Mündung eines ist insgesamt Gallenganges livide.läßt Anhängend sich makroskopisch ein 7,5 x 4 nicht x 1,5 abgrenzen. cm großes Die Pankreaskopfsegment sowie ein 4 berichtete Stenose imcm Duodenum langer derber liegt 2,5 undcm bisoral 2,5 cm der durchmessender Papilla vateri undknotiger steht mitGewebsstrang, der beschriebenen der an seinem Ende eine Narbenzone in direktem Fadenmarkierung Zusammenhang. aufweist. Teilweise Hier istauf dielamellierenden Dünndarmschleimhaut Schnittenimzähfestes Stenosebereich weißliches, polypoid teilweise nodulär vorgewölbt. Der kleinen Kurvatur anhängend ein bis 4 Gallengänge cm durchmessendes einzelne konfiguriertes Gewebe, ohne das manifestFettgewebe. werden. DerDarin distale Anteil des Ductus pankreaticus ist knotige Indurationen von leicht biserweitert zu 1 cmund größe. von1.der Oraler Papilla Resektionsrand vateri aus 4,5Magenkorpus. cm weit sondierbar, 2. Magenantrum. wobei er hier 3. in einer peripankreatischen Bulbus duodeni. 4. Stenosezone Narbenzonemit abbricht. angrenzendem Die Mündung Pankreas eines undGallenganges tuschemarkierten läßt sich äußeren makroskopisch Resektionsrändern nicht abgrenzen. Die und einem Lymphknoten. berichtete 5. Papilla Stenose vateri im- Duodenum Mündung des liegt Ductus 2,5 cm pankreaticus. oral der Papilla 6. Distales vateri und Ende steht desmit Ductus der beschriebenen pankreaticus im Narbengebiet. Narbenzone 7. Intraparenchymaler in direktem Zusammenhang. Absetzungsrand Teilweise Pankreas. ist die Dünndarmschleimhaut 8. Peripankreatisches im Stenosebereich polypoid Gewebe. 9. bis 12. Fadenmarkierter vorgewölbt. Der Fortsatz kleinenanKurvatur der Arteria anhängend hepaticaein communis bis 4 cmvon durchmessendes Fettgewebe. Darin einzelne knotige Indurationen von bis zu 1 cm größe. 1. Oraler Resektionsrand Magenkorpus. 2. Magenantrum. 3. Bulbus duodeni. 4. Stenosezone mit angrenzendem Pankreas und tuschemarkierten äußeren Resektionsrändern und einem Lymphknoten. 5. Papilla vateri - Mündung des Ductus pankreaticus. 6. Distales Ende des Ductus pankreaticus im Narbengebiet. 7. Intraparenchymaler Absetzungsrand Pankreas. 8. Peripankreatisches Gewebe. 9. bis 12. Fadenmarkierter Fortsatz an der Arteria hepatica communis von Pesquisadores Estruturas Infra-estrutura de dados Infra-estrutura de informação Infra-estrutura de conhecimento Exemplo 1: codificação CID / procedimentos Exemplo 1: codificação CID / procedimentos Linguagens Origem Profissionais de saúde Histologisches Gutachten Pacientes Makroskopie: "Resektat nach Whipple": Ein noch nicht eröffnetes Resektat, bestehend aus einem distalen Magen mit einer kleinen Kurvaturlänge von 9,5 cm und einer großen Kurvaturlänge von 13,5 cm, sowei einem duodenalen Anteil von 14 cm Länge. 2 cm aboral des Pylorus zeigt die Dünndarmwandung eine sanduhrartige Stenose. Im Lumen sowohl Histologisches des Magens Gutachten als auch des Duodenums reichlich zähflüssiger Schleim, sangoinolent; die Schleimhaut ist insgesamt livide. Anhängend ein 7,5 x 4 x 1,5 cm großes Pankreaskopfsegment sowie ein 4 cm langer derber und Makroskopie: bis 2,5 cm durchmessender "Resektat nach knotiger Whipple": Gewebsstrang, Ein noch nicht der eröffnetes an seinem Ende Resektat, einebestehend aus einem distalen Fadenmarkierung aufweist. MagenHier mit einer auf lamellierenden kleinen Kurvaturlänge Schnittenvon zähfestes 9,5 cmweißliches, und einer großen teilweise Kurvaturlänge nodulär von 13,5 cm, sowei einem konfiguriertes Gewebe, duodenalen ohne das Gallengänge Anteil von 14manifest cm Länge. werden. 2 cm Der aboral distale des Pylorus Anteil des zeigt Ductus die Dünndarmwandung pankreaticus ist eine sanduhrartige leicht erweitert und von Stenose. der Papilla Im Lumen vateri aus sowohl 4,5 cm desweit Magens sondierbar, als auchwobei des Duodenums er hier in einer reichlich peripankreatischen zähflüssiger Schleim, sangoinolent; Narbenzone abbricht.die DieSchleimhaut Mündung eines ist insgesamt Gallenganges livide.läßt Anhängend sich makroskopisch ein 7,5 x 4 nicht x 1,5 abgrenzen. cm großes Die Pankreaskopfsegment sowie ein 4 berichtete Stenose imcm Duodenum langer derber liegt 2,5 undcm bisoral 2,5 cm der durchmessender Papilla vateri undknotiger steht mitGewebsstrang, der beschriebenen der an seinem Ende eine Narbenzone in direktem Fadenmarkierung Zusammenhang. aufweist. Teilweise Hier istauf dielamellierenden Dünndarmschleimhaut Schnittenimzähfestes Stenosebereich weißliches, polypoid teilweise nodulär vorgewölbt. Der kleinen Kurvatur anhängend ein bis 4 Gallengänge cm durchmessendes einzelne konfiguriertes Gewebe, ohne das manifestFettgewebe. werden. DerDarin distale Anteil des Ductus pankreaticus ist knotige Indurationen von leicht biserweitert zu 1 cmund größe. von1.der Oraler Papilla Resektionsrand vateri aus 4,5Magenkorpus. cm weit sondierbar, 2. Magenantrum. wobei er hier 3. in einer peripankreatischen Bulbus duodeni. 4. Stenosezone Narbenzonemit abbricht. angrenzendem Die Mündung Pankreas eines undGallenganges tuschemarkierten läßt sich äußeren makroskopisch Resektionsrändern nicht abgrenzen. Die und einem Lymphknoten. berichtete 5. Papilla Stenose vateri im- Duodenum Mündung des liegt Ductus 2,5 cm pankreaticus. oral der Papilla 6. Distales vateri und Ende steht desmit Ductus der beschriebenen pankreaticus im Narbengebiet. Narbenzone 7. Intraparenchymaler in direktem Zusammenhang. Absetzungsrand Teilweise Pankreas. ist die Dünndarmschleimhaut 8. Peripankreatisches im Stenosebereich polypoid Gewebe. 9. bis 12. Fadenmarkierter vorgewölbt. Der Fortsatz kleinenanKurvatur der Arteria anhängend hepaticaein communis bis 4 cmvon durchmessendes Fettgewebe. Darin einzelne knotige Indurationen von bis zu 1 cm größe. 1. Oraler Resektionsrand Magenkorpus. 2. Magenantrum. 3. Bulbus duodeni. 4. Stenosezone mit angrenzendem Pankreas und tuschemarkierten äußeren Resektionsrändern und einem Lymphknoten. 5. Papilla vateri - Mündung des Ductus pankreaticus. 6. Distales Ende des Ductus pankreaticus im Narbengebiet. 7. Intraparenchymaler Absetzungsrand Pankreas. 8. Peripankreatisches Gewebe. 9. bis 12. Fadenmarkierter Fortsatz an der Arteria hepatica communis von Pesquisadores Estruturas Infra-estrutura de dados Infra-estrutura de informação Infra-estrutura de conhecimento Classes CID-10 uso principal: faturamento Exemplo 1: codificação CID / procedimentos Linguagens Origem Profissionais de saúde Histologisches Gutachten Pacientes Pesquisadores Makroskopie: "Resektat nach Whipple": Ein noch nicht eröffnetes Resektat, bestehend aus einem distalen Magen mit einer kleinen Kurvaturlänge von 9,5 cm und einer großen Kurvaturlänge von 13,5 cm, sowei einem duodenalen Anteil von 14 cm Länge. 2 cm aboral des Pylorus zeigt die Dünndarmwandung eine sanduhrartige Stenose. Im Lumen sowohl Histologisches des Magens Gutachten als auch des Duodenums reichlich zähflüssiger Schleim, sangoinolent; die Schleimhaut ist insgesamt livide. Anhängend ein 7,5 x 4 x 1,5 cm großes Pankreaskopfsegment sowie ein 4 cm langer derber und Makroskopie: bis 2,5 cm durchmessender "Resektat nach knotiger Whipple": Gewebsstrang, Ein noch nicht der eröffnetes an seinem Ende Resektat, einebestehend aus einem distalen Fadenmarkierung aufweist. MagenHier mit einer auf lamellierenden kleinen Kurvaturlänge Schnittenvon zähfestes 9,5 cmweißliches, und einer großen teilweise Kurvaturlänge nodulär von 13,5 cm, sowei einem konfiguriertes Gewebe, duodenalen ohne das Gallengänge Anteil von 14manifest cm Länge. werden. 2 cm Der aboral distale des Pylorus Anteil des zeigt Ductus die Dünndarmwandung pankreaticus ist eine sanduhrartige leicht erweitert und von Stenose. der Papilla Im Lumen vateri aus sowohl 4,5 cm desweit Magens sondierbar, als auchwobei des Duodenums er hier in einer reichlich peripankreatischen zähflüssiger Schleim, sangoinolent; Narbenzone abbricht.die DieSchleimhaut Mündung eines ist insgesamt Gallenganges livide.läßt Anhängend sich makroskopisch ein 7,5 x 4 nicht x 1,5 abgrenzen. cm großes Die Pankreaskopfsegment sowie ein 4 berichtete Stenose imcm Duodenum langer derber liegt 2,5 undcm bisoral 2,5 cm der durchmessender Papilla vateri undknotiger steht mitGewebsstrang, der beschriebenen der an seinem Ende eine Narbenzone in direktem Fadenmarkierung Zusammenhang. aufweist. Teilweise Hier istauf dielamellierenden Dünndarmschleimhaut Schnittenimzähfestes Stenosebereich weißliches, polypoid teilweise nodulär vorgewölbt. Der kleinen Kurvatur anhängend ein bis 4 Gallengänge cm durchmessendes einzelne konfiguriertes Gewebe, ohne das manifestFettgewebe. werden. DerDarin distale Anteil des Ductus pankreaticus ist knotige Indurationen von leicht biserweitert zu 1 cmund größe. von1.der Oraler Papilla Resektionsrand vateri aus 4,5Magenkorpus. cm weit sondierbar, 2. Magenantrum. wobei er hier 3. in einer peripankreatischen Bulbus duodeni. 4. Stenosezone Narbenzonemit abbricht. angrenzendem Die Mündung Pankreas eines undGallenganges tuschemarkierten läßt sich äußeren makroskopisch Resektionsrändern nicht abgrenzen. Die und einem Lymphknoten. berichtete 5. Papilla Stenose vateri im- Duodenum Mündung des liegt Ductus 2,5 cm pankreaticus. oral der Papilla 6. Distales vateri und Ende steht desmit Ductus der beschriebenen pankreaticus im Narbengebiet. Narbenzone 7. Intraparenchymaler in direktem Zusammenhang. Absetzungsrand Teilweise Pankreas. ist die Dünndarmschleimhaut 8. Peripankreatisches im Stenosebereich polypoid Gewebe. 9. bis 12. Fadenmarkierter vorgewölbt. Der Fortsatz kleinenanKurvatur der Arteria anhängend hepaticaein communis bis 4 cmvon durchmessendes Fettgewebe. Darin einzelne knotige Indurationen von bis zu 1 cm größe. 1. Oraler Resektionsrand Magenkorpus. 2. Magenantrum. 3. Bulbus duodeni. 4. Stenosezone mit angrenzendem Pankreas und tuschemarkierten äußeren Resektionsrändern und einem Lymphknoten. 5. Papilla vateri - Mündung des Ductus pankreaticus. 6. Distales Ende des Ductus pankreaticus im Narbengebiet. 7. Intraparenchymaler Absetzungsrand Pankreas. 8. Peripankreatisches Gewebe. 9. bis 12. Fadenmarkierter Fortsatz an der Arteria hepatica communis von Características: • Estruturada • Não abrangente • Inespecífico • Susceptível a erros • Contextos implícitos Estruturas Infra-estrutura de dados Infra-estrutura de informação Infra-estrutura de conhecimento Exemplo 2: Texto livre em PEP Exemplo 2: Texto livre em PEP Linguagens Origem Profissionais de saúde Histologisches Gutachten Pacientes Makroskopie: "Resektat nach Whipple": Ein noch nicht eröffnetes Resektat, bestehend aus einem distalen Magen mit einer kleinen Kurvaturlänge von 9,5 cm und einer großen Kurvaturlänge von 13,5 cm, sowei einem duodenalen Anteil von 14 cm Länge. 2 cm aboral des Pylorus zeigt die Dünndarmwandung eine sanduhrartige Stenose. Im Lumen sowohl Histologisches des Magens Gutachten als auch des Duodenums reichlich zähflüssiger Schleim, sangoinolent; die Schleimhaut ist insgesamt livide. Anhängend ein 7,5 x 4 x 1,5 cm großes Pankreaskopfsegment sowie ein 4 cm langer derber und Makroskopie: bis 2,5 cm durchmessender "Resektat nach knotiger Whipple": Gewebsstrang, Ein noch nicht der eröffnetes an seinem Ende Resektat, einebestehend aus einem distalen Fadenmarkierung aufweist. MagenHier mit einer auf lamellierenden kleinen Kurvaturlänge Schnittenvon zähfestes 9,5 cmweißliches, und einer großen teilweise Kurvaturlänge nodulär von 13,5 cm, sowei einem konfiguriertes Gewebe, duodenalen ohne das Gallengänge Anteil von 14manifest cm Länge. werden. 2 cm Der aboral distale des Pylorus Anteil des zeigt Ductus die Dünndarmwandung pankreaticus ist eine sanduhrartige leicht erweitert und von Stenose. der Papilla Im Lumen vateri aus sowohl 4,5 cm desweit Magens sondierbar, als auchwobei des Duodenums er hier in einer reichlich peripankreatischen zähflüssiger Schleim, sangoinolent; Narbenzone abbricht.die DieSchleimhaut Mündung eines ist insgesamt Gallenganges livide.läßt Anhängend sich makroskopisch ein 7,5 x 4 nicht x 1,5 abgrenzen. cm großes Die Pankreaskopfsegment sowie ein 4 berichtete Stenose imcm Duodenum langer derber liegt 2,5 undcm bisoral 2,5 cm der durchmessender Papilla vateri undknotiger steht mitGewebsstrang, der beschriebenen der an seinem Ende eine Narbenzone in direktem Fadenmarkierung Zusammenhang. aufweist. Teilweise Hier istauf dielamellierenden Dünndarmschleimhaut Schnittenimzähfestes Stenosebereich weißliches, polypoid teilweise nodulär vorgewölbt. Der kleinen Kurvatur anhängend ein bis 4 Gallengänge cm durchmessendes einzelne konfiguriertes Gewebe, ohne das manifestFettgewebe. werden. DerDarin distale Anteil des Ductus pankreaticus ist knotige Indurationen von leicht biserweitert zu 1 cmund größe. von1.der Oraler Papilla Resektionsrand vateri aus 4,5Magenkorpus. cm weit sondierbar, 2. Magenantrum. wobei er hier 3. in einer peripankreatischen Bulbus duodeni. 4. Stenosezone Narbenzonemit abbricht. angrenzendem Die Mündung Pankreas eines undGallenganges tuschemarkierten läßt sich äußeren makroskopisch Resektionsrändern nicht abgrenzen. Die und einem Lymphknoten. berichtete 5. Papilla Stenose vateri im- Duodenum Mündung des liegt Ductus 2,5 cm pankreaticus. oral der Papilla 6. Distales vateri und Ende steht desmit Ductus der beschriebenen pankreaticus im Narbengebiet. Narbenzone 7. Intraparenchymaler in direktem Zusammenhang. Absetzungsrand Teilweise Pankreas. ist die Dünndarmschleimhaut 8. Peripankreatisches im Stenosebereich polypoid Gewebe. 9. bis 12. Fadenmarkierter vorgewölbt. Der Fortsatz kleinenanKurvatur der Arteria anhängend hepaticaein communis bis 4 cmvon durchmessendes Fettgewebe. Darin einzelne knotige Indurationen von bis zu 1 cm größe. 1. Oraler Resektionsrand Magenkorpus. 2. Magenantrum. 3. Bulbus duodeni. 4. Stenosezone mit angrenzendem Pankreas und tuschemarkierten äußeren Resektionsrändern und einem Lymphknoten. 5. Papilla vateri - Mündung des Ductus pankreaticus. 6. Distales Ende des Ductus pankreaticus im Narbengebiet. 7. Intraparenchymaler Absetzungsrand Pankreas. 8. Peripankreatisches Gewebe. 9. bis 12. Fadenmarkierter Fortsatz an der Arteria hepatica communis von Pesquisadores Infra-estrutura de dados Infra-estrutura de informação Infra-estrutura de conhecimento Exemplo 2: Texto livre em PEP acrónimos, abreviações neologismos # HAS # DM # Miocardiopatia dilatada chagásica (FE 35%) # Ca de prostata orquiectomia (2004) # Cardiopatia isquêmica - IAM em 2005, com colocação de stent em DA e lesão severa inoperável em CD Pct vem a emergência em 20/03 com quadro de dor torácica típica, sem elevação enzimática, com diagnóstico de angina instável e fibrilação atrial não identificada em avaliações prévias. Adicionalmente, apresentava descompensação do erros diabetes de com estilo telegráfico sindrome hiperosmlar não cetótica. Recebe tratamento clínico para otimização pontuação do quadro e é submetido a novo cateterismo em 28/03, que demonstra CD ocluída no terço proximal, DA com stent rpoximal com lesão de 40% no seu interior e Mg de Cx com lesão de 60-65%. Recebe alta em bom estado geral, sem dor torácica, anticoagulado, com plano de retorno ambulatorial para equipe de cardiopatia isquêmica e para o ambluatório de anticoagulação. erros de digitação Exemplo 2: Texto livre em PEP Linguagens Origem Profissionais de saúde Histologisches Gutachten Pacientes Pesquisadores Makroskopie: "Resektat nach Whipple": Ein noch nicht eröffnetes Resektat, bestehend aus einem distalen Magen mit einer kleinen Kurvaturlänge von 9,5 cm und einer großen Kurvaturlänge von 13,5 cm, sowei einem duodenalen Anteil von 14 cm Länge. 2 cm aboral des Pylorus zeigt die Dünndarmwandung eine sanduhrartige Stenose. Im Lumen sowohl Histologisches des Magens Gutachten als auch des Duodenums reichlich zähflüssiger Schleim, sangoinolent; die Schleimhaut ist insgesamt livide. Anhängend ein 7,5 x 4 x 1,5 cm großes Pankreaskopfsegment sowie ein 4 cm langer derber und Makroskopie: bis 2,5 cm durchmessender "Resektat nach knotiger Whipple": Gewebsstrang, Ein noch nicht der eröffnetes an seinem Ende Resektat, einebestehend aus einem distalen Fadenmarkierung aufweist. MagenHier mit einer auf lamellierenden kleinen Kurvaturlänge Schnittenvon zähfestes 9,5 cmweißliches, und einer großen teilweise Kurvaturlänge nodulär von 13,5 cm, sowei einem konfiguriertes Gewebe, duodenalen ohne das Gallengänge Anteil von 14manifest cm Länge. werden. 2 cm Der aboral distale des Pylorus Anteil des zeigt Ductus die Dünndarmwandung pankreaticus ist eine sanduhrartige leicht erweitert und von Stenose. der Papilla Im Lumen vateri aus sowohl 4,5 cm desweit Magens sondierbar, als auchwobei des Duodenums er hier in einer reichlich peripankreatischen zähflüssiger Schleim, sangoinolent; Narbenzone abbricht.die DieSchleimhaut Mündung eines ist insgesamt Gallenganges livide.läßt Anhängend sich makroskopisch ein 7,5 x 4 nicht x 1,5 abgrenzen. cm großes Die Pankreaskopfsegment sowie ein 4 berichtete Stenose imcm Duodenum langer derber liegt 2,5 undcm bisoral 2,5 cm der durchmessender Papilla vateri undknotiger steht mitGewebsstrang, der beschriebenen der an seinem Ende eine Narbenzone in direktem Fadenmarkierung Zusammenhang. aufweist. Teilweise Hier istauf dielamellierenden Dünndarmschleimhaut Schnittenimzähfestes Stenosebereich weißliches, polypoid teilweise nodulär vorgewölbt. Der kleinen Kurvatur anhängend ein bis 4 Gallengänge cm durchmessendes einzelne konfiguriertes Gewebe, ohne das manifestFettgewebe. werden. DerDarin distale Anteil des Ductus pankreaticus ist knotige Indurationen von leicht biserweitert zu 1 cmund größe. von1.der Oraler Papilla Resektionsrand vateri aus 4,5Magenkorpus. cm weit sondierbar, 2. Magenantrum. wobei er hier 3. in einer peripankreatischen Bulbus duodeni. 4. Stenosezone Narbenzonemit abbricht. angrenzendem Die Mündung Pankreas eines undGallenganges tuschemarkierten läßt sich äußeren makroskopisch Resektionsrändern nicht abgrenzen. Die und einem Lymphknoten. berichtete 5. Papilla Stenose vateri im- Duodenum Mündung des liegt Ductus 2,5 cm pankreaticus. oral der Papilla 6. Distales vateri und Ende steht desmit Ductus der beschriebenen pankreaticus im Narbengebiet. Narbenzone 7. Intraparenchymaler in direktem Zusammenhang. Absetzungsrand Teilweise Pankreas. ist die Dünndarmschleimhaut 8. Peripankreatisches im Stenosebereich polypoid Gewebe. 9. bis 12. Fadenmarkierter vorgewölbt. Der Fortsatz kleinenanKurvatur der Arteria anhängend hepaticaein communis bis 4 cmvon durchmessendes Fettgewebe. Darin einzelne knotige Indurationen von bis zu 1 cm größe. 1. Oraler Resektionsrand Magenkorpus. 2. Magenantrum. 3. Bulbus duodeni. 4. Stenosezone mit angrenzendem Pankreas und tuschemarkierten äußeren Resektionsrändern und einem Lymphknoten. 5. Papilla vateri - Mündung des Ductus pankreaticus. 6. Distales Ende des Ductus pankreaticus im Narbengebiet. 7. Intraparenchymaler Absetzungsrand Pankreas. 8. Peripankreatisches Gewebe. 9. bis 12. Fadenmarkierter Fortsatz an der Arteria hepatica communis von • Conteúdo confiável, focalizado, compacto, mas ambíguo • Erros de grafia / digitação Estruturas Infra-estrutura de dados Infra-estrutura de informação Infra-estrutura de conhecimento Exemplo 3: Prontuários mantidos por pacientes Exemplo 3: Prontuários mantidos por pacientes Linguagens Origem Profissionais de saúde Histologisches Gutachten Pacientes Makroskopie: "Resektat nach Whipple": Ein noch nicht eröffnetes Resektat, bestehend aus einem distalen Magen mit einer kleinen Kurvaturlänge von 9,5 cm und einer großen Kurvaturlänge von 13,5 cm, sowei einem duodenalen Anteil von 14 cm Länge. 2 cm aboral des Pylorus zeigt die Dünndarmwandung eine sanduhrartige Stenose. Im Lumen sowohl Histologisches des Magens Gutachten als auch des Duodenums reichlich zähflüssiger Schleim, sangoinolent; die Schleimhaut ist insgesamt livide. Anhängend ein 7,5 x 4 x 1,5 cm großes Pankreaskopfsegment sowie ein 4 cm langer derber und Makroskopie: bis 2,5 cm durchmessender "Resektat nach knotiger Whipple": Gewebsstrang, Ein noch nicht der eröffnetes an seinem Ende Resektat, einebestehend aus einem distalen Fadenmarkierung aufweist. MagenHier mit einer auf lamellierenden kleinen Kurvaturlänge Schnittenvon zähfestes 9,5 cmweißliches, und einer großen teilweise Kurvaturlänge nodulär von 13,5 cm, sowei einem konfiguriertes Gewebe, duodenalen ohne das Gallengänge Anteil von 14manifest cm Länge. werden. 2 cm Der aboral distale des Pylorus Anteil des zeigt Ductus die Dünndarmwandung pankreaticus ist eine sanduhrartige leicht erweitert und von Stenose. der Papilla Im Lumen vateri aus sowohl 4,5 cm desweit Magens sondierbar, als auchwobei des Duodenums er hier in einer reichlich peripankreatischen zähflüssiger Schleim, sangoinolent; Narbenzone abbricht.die DieSchleimhaut Mündung eines ist insgesamt Gallenganges livide.läßt Anhängend sich makroskopisch ein 7,5 x 4 nicht x 1,5 abgrenzen. cm großes Die Pankreaskopfsegment sowie ein 4 berichtete Stenose imcm Duodenum langer derber liegt 2,5 undcm bisoral 2,5 cm der durchmessender Papilla vateri undknotiger steht mitGewebsstrang, der beschriebenen der an seinem Ende eine Narbenzone in direktem Fadenmarkierung Zusammenhang. aufweist. Teilweise Hier istauf dielamellierenden Dünndarmschleimhaut Schnittenimzähfestes Stenosebereich weißliches, polypoid teilweise nodulär vorgewölbt. Der kleinen Kurvatur anhängend ein bis 4 Gallengänge cm durchmessendes einzelne konfiguriertes Gewebe, ohne das manifestFettgewebe. werden. DerDarin distale Anteil des Ductus pankreaticus ist knotige Indurationen von leicht biserweitert zu 1 cmund größe. von1.der Oraler Papilla Resektionsrand vateri aus 4,5Magenkorpus. cm weit sondierbar, 2. Magenantrum. wobei er hier 3. in einer peripankreatischen Bulbus duodeni. 4. Stenosezone Narbenzonemit abbricht. angrenzendem Die Mündung Pankreas eines undGallenganges tuschemarkierten läßt sich äußeren makroskopisch Resektionsrändern nicht abgrenzen. Die und einem Lymphknoten. berichtete 5. Papilla Stenose vateri im- Duodenum Mündung des liegt Ductus 2,5 cm pankreaticus. oral der Papilla 6. Distales vateri und Ende steht desmit Ductus der beschriebenen pankreaticus im Narbengebiet. Narbenzone 7. Intraparenchymaler in direktem Zusammenhang. Absetzungsrand Teilweise Pankreas. ist die Dünndarmschleimhaut 8. Peripankreatisches im Stenosebereich polypoid Gewebe. 9. bis 12. Fadenmarkierter vorgewölbt. Der Fortsatz kleinenanKurvatur der Arteria anhängend hepaticaein communis bis 4 cmvon durchmessendes Fettgewebe. Darin einzelne knotige Indurationen von bis zu 1 cm größe. 1. Oraler Resektionsrand Magenkorpus. 2. Magenantrum. 3. Bulbus duodeni. 4. Stenosezone mit angrenzendem Pankreas und tuschemarkierten äußeren Resektionsrändern und einem Lymphknoten. 5. Papilla vateri - Mündung des Ductus pankreaticus. 6. Distales Ende des Ductus pankreaticus im Narbengebiet. 7. Intraparenchymaler Absetzungsrand Pankreas. 8. Peripankreatisches Gewebe. 9. bis 12. Fadenmarkierter Fortsatz an der Arteria hepatica communis von Pesquisadores Estruturas Infra-estrutura de dados Infra-estrutura de informação Infra-estrutura de conhecimento Exemplo 3: Prontuários mantidos por pacientes Linguagens Origem Profissionais de saúde Histologisches Gutachten Makroskopie: "Resektat nach Whipple": Ein noch nicht eröffnetes Resektat, bestehend aus einem distalen Magen mit einer kleinen Kurvaturlänge von 9,5 cm und einer großen Kurvaturlänge von 13,5 cm, sowei einem duodenalen Anteil von 14 cm Länge. 2 cm aboral des Pylorus zeigt die Dünndarmwandung eine sanduhrartige Stenose. Im Lumen sowohl Histologisches des Magens Gutachten als auch des Duodenums reichlich zähflüssiger Schleim, sangoinolent; die Schleimhaut ist insgesamt livide. Anhängend ein 7,5 x 4 x 1,5 cm großes Pankreaskopfsegment sowie ein 4 cm langer derber und Makroskopie: bis 2,5 cm durchmessender "Resektat nach knotiger Whipple": Gewebsstrang, Ein noch nicht der eröffnetes an seinem Ende Resektat, einebestehend aus einem distalen Fadenmarkierung aufweist. MagenHier mit einer auf lamellierenden kleinen Kurvaturlänge Schnittenvon zähfestes 9,5 cmweißliches, und einer großen teilweise Kurvaturlänge nodulär von 13,5 cm, sowei einem konfiguriertes Gewebe, duodenalen ohne das Gallengänge Anteil von 14manifest cm Länge. werden. 2 cm Der aboral distale des Pylorus Anteil des zeigt Ductus die Dünndarmwandung pankreaticus ist eine sanduhrartige leicht erweitert und von Stenose. der Papilla Im Lumen vateri aus sowohl 4,5 cm desweit Magens sondierbar, als auchwobei des Duodenums er hier in einer reichlich peripankreatischen zähflüssiger Schleim, sangoinolent; Narbenzone abbricht.die DieSchleimhaut Mündung eines ist insgesamt Gallenganges livide.läßt Anhängend sich makroskopisch ein 7,5 x 4 nicht x 1,5 abgrenzen. cm großes Die Pankreaskopfsegment sowie ein 4 berichtete Stenose imcm Duodenum langer derber liegt 2,5 undcm bisoral 2,5 cm der durchmessender Papilla vateri undknotiger steht mitGewebsstrang, der beschriebenen der an seinem Ende eine Narbenzone in direktem Fadenmarkierung Zusammenhang. aufweist. Teilweise Hier istauf dielamellierenden Dünndarmschleimhaut Schnittenimzähfestes Stenosebereich weißliches, polypoid teilweise nodulär vorgewölbt. Der kleinen Kurvatur anhängend ein bis 4 Gallengänge cm durchmessendes einzelne konfiguriertes Gewebe, ohne das manifestFettgewebe. werden. DerDarin distale Anteil des Ductus pankreaticus ist knotige Indurationen von leicht biserweitert zu 1 cmund größe. von1.der Oraler Papilla Resektionsrand vateri aus 4,5Magenkorpus. cm weit sondierbar, 2. Magenantrum. wobei er hier 3. in einer peripankreatischen Bulbus duodeni. 4. Stenosezone Narbenzonemit abbricht. angrenzendem Die Mündung Pankreas eines undGallenganges tuschemarkierten läßt sich äußeren makroskopisch Resektionsrändern nicht abgrenzen. Die und einem Lymphknoten. berichtete 5. Papilla Stenose vateri im- Duodenum Mündung des liegt Ductus 2,5 cm pankreaticus. oral der Papilla 6. Distales vateri und Ende steht desmit Ductus der beschriebenen pankreaticus im Narbengebiet. Narbenzone 7. Intraparenchymaler in direktem Zusammenhang. Absetzungsrand Teilweise Pankreas. ist die Dünndarmschleimhaut 8. Peripankreatisches im Stenosebereich polypoid Gewebe. 9. bis 12. Fadenmarkierter vorgewölbt. Der Fortsatz kleinenanKurvatur der Arteria anhängend hepaticaein communis bis 4 cmvon durchmessendes Fettgewebe. Darin einzelne knotige Indurationen von bis zu 1 cm größe. 1. Oraler Resektionsrand Magenkorpus. 2. Magenantrum. 3. Bulbus duodeni. 4. Stenosezone mit angrenzendem Pankreas und tuschemarkierten äußeren Resektionsrändern und einem Lymphknoten. 5. Papilla vateri - Mündung des Ductus pankreaticus. 6. Distales Ende des Ductus pankreaticus im Narbengebiet. 7. Intraparenchymaler Absetzungsrand Pankreas. 8. Peripankreatisches Gewebe. 9. bis 12. Fadenmarkierter Fortsatz an der Arteria hepatica communis von Pacientes Pesquisadores Infra-estrutura de dados • • • • Recurso emergente Subjetivo Relevância / validade ? Terminologia médica vs. terminologia de leigos • Erros de grafia / digitação Infra-estrutura de informação Estruturas Infra-estrutura de conhecimento Exemplo 4: Texto livre em publicação científica Exemplo 4: Texto livre em publicação científica Linguagens Origem Profissionais de saúde Histologisches Gutachten Pacientes Makroskopie: "Resektat nach Whipple": Ein noch nicht eröffnetes Resektat, bestehend aus einem distalen Magen mit einer kleinen Kurvaturlänge von 9,5 cm und einer großen Kurvaturlänge von 13,5 cm, sowei einem duodenalen Anteil von 14 cm Länge. 2 cm aboral des Pylorus zeigt die Dünndarmwandung eine sanduhrartige Stenose. Im Lumen sowohl Histologisches des Magens Gutachten als auch des Duodenums reichlich zähflüssiger Schleim, sangoinolent; die Schleimhaut ist insgesamt livide. Anhängend ein 7,5 x 4 x 1,5 cm großes Pankreaskopfsegment sowie ein 4 cm langer derber und Makroskopie: bis 2,5 cm durchmessender "Resektat nach knotiger Whipple": Gewebsstrang, Ein noch nicht der eröffnetes an seinem Ende Resektat, einebestehend aus einem distalen Fadenmarkierung aufweist. MagenHier mit einer auf lamellierenden kleinen Kurvaturlänge Schnittenvon zähfestes 9,5 cmweißliches, und einer großen teilweise Kurvaturlänge nodulär von 13,5 cm, sowei einem konfiguriertes Gewebe, duodenalen ohne das Gallengänge Anteil von 14manifest cm Länge. werden. 2 cm Der aboral distale des Pylorus Anteil des zeigt Ductus die Dünndarmwandung pankreaticus ist eine sanduhrartige leicht erweitert und von Stenose. der Papilla Im Lumen vateri aus sowohl 4,5 cm desweit Magens sondierbar, als auchwobei des Duodenums er hier in einer reichlich peripankreatischen zähflüssiger Schleim, sangoinolent; Narbenzone abbricht.die DieSchleimhaut Mündung eines ist insgesamt Gallenganges livide.läßt Anhängend sich makroskopisch ein 7,5 x 4 nicht x 1,5 abgrenzen. cm großes Die Pankreaskopfsegment sowie ein 4 berichtete Stenose imcm Duodenum langer derber liegt 2,5 undcm bisoral 2,5 cm der durchmessender Papilla vateri undknotiger steht mitGewebsstrang, der beschriebenen der an seinem Ende eine Narbenzone in direktem Fadenmarkierung Zusammenhang. aufweist. Teilweise Hier istauf dielamellierenden Dünndarmschleimhaut Schnittenimzähfestes Stenosebereich weißliches, polypoid teilweise nodulär vorgewölbt. Der kleinen Kurvatur anhängend ein bis 4 Gallengänge cm durchmessendes einzelne konfiguriertes Gewebe, ohne das manifestFettgewebe. werden. DerDarin distale Anteil des Ductus pankreaticus ist knotige Indurationen von leicht biserweitert zu 1 cmund größe. von1.der Oraler Papilla Resektionsrand vateri aus 4,5Magenkorpus. cm weit sondierbar, 2. Magenantrum. wobei er hier 3. in einer peripankreatischen Bulbus duodeni. 4. Stenosezone Narbenzonemit abbricht. angrenzendem Die Mündung Pankreas eines undGallenganges tuschemarkierten läßt sich äußeren makroskopisch Resektionsrändern nicht abgrenzen. Die und einem Lymphknoten. berichtete 5. Papilla Stenose vateri im- Duodenum Mündung des liegt Ductus 2,5 cm pankreaticus. oral der Papilla 6. Distales vateri und Ende steht desmit Ductus der beschriebenen pankreaticus im Narbengebiet. Narbenzone 7. Intraparenchymaler in direktem Zusammenhang. Absetzungsrand Teilweise Pankreas. ist die Dünndarmschleimhaut 8. Peripankreatisches im Stenosebereich polypoid Gewebe. 9. bis 12. Fadenmarkierter vorgewölbt. Der Fortsatz kleinenanKurvatur der Arteria anhängend hepaticaein communis bis 4 cmvon durchmessendes Fettgewebe. Darin einzelne knotige Indurationen von bis zu 1 cm größe. 1. Oraler Resektionsrand Magenkorpus. 2. Magenantrum. 3. Bulbus duodeni. 4. Stenosezone mit angrenzendem Pankreas und tuschemarkierten äußeren Resektionsrändern und einem Lymphknoten. 5. Papilla vateri - Mündung des Ductus pankreaticus. 6. Distales Ende des Ductus pankreaticus im Narbengebiet. 7. Intraparenchymaler Absetzungsrand Pankreas. 8. Peripankreatisches Gewebe. 9. bis 12. Fadenmarkierter Fortsatz an der Arteria hepatica communis von Pesquisadores Estruturas Infra-estrutura de dados Infra-estrutura de informação Infra-estrutura de conhecimento Exemplo 4: Texto livre em publicação científica The developing vertebrate hindbrain is transiently subdivided along the anterior-posterior axis into metameric units, called rhombomeres (r).These segments constitute units of lineage restriction and display specific gene expression patterns. The transcription factor gene Krox-20 is restricted to r3 and r5, and is required for the development of these rhombomeres. We present evidence that Krox-20 transcriptional activity is under the control of a negative feedback mechanism in the hindbrain, which involves two closely related proteins, Nabl and Nab2, previously identified as antagonists of Krox20 transcriptional activity in cultured cells. Here we show that in the mouse hindbrain, Nab1 and Nab2 recapitulate the Krox-20 expression pattern and that their expression is dependent on Krox-20 function. Furthermore, misexpression of Nab1 or Nab2in zebrafish embryos leads to alterations in the expression patterns of several hindbrain markers. Exemplo 4: Texto livre em publicação científica Linguagens Origem Profissionais de saúde Histologisches Gutachten Pacientes Pesquisadores Infra-estrutura de dados Makroskopie: "Resektat nach Whipple": Ein noch nicht eröffnetes Resektat, bestehend aus einem distalen Magen mit einer kleinen Kurvaturlänge von 9,5 cm und einer großen Kurvaturlänge von 13,5 cm, sowei einem duodenalen Anteil von 14 cm Länge. 2 cm aboral des Pylorus zeigt die Dünndarmwandung eine sanduhrartige Stenose. Im Lumen sowohl Histologisches des Magens Gutachten als auch des Duodenums reichlich zähflüssiger Schleim, sangoinolent; die Schleimhaut ist insgesamt livide. Anhängend ein 7,5 x 4 x 1,5 cm großes Pankreaskopfsegment sowie ein 4 cm langer derber und Makroskopie: bis 2,5 cm durchmessender "Resektat nach knotiger Whipple": Gewebsstrang, Ein noch nicht der eröffnetes an seinem Ende Resektat, einebestehend aus einem distalen Fadenmarkierung aufweist. MagenHier mit einer auf lamellierenden kleinen Kurvaturlänge Schnittenvon zähfestes 9,5 cmweißliches, und einer großen teilweise Kurvaturlänge nodulär von 13,5 cm, sowei einem konfiguriertes Gewebe, duodenalen ohne das Gallengänge Anteil von 14manifest cm Länge. werden. 2 cm Der aboral distale des Pylorus Anteil des zeigt Ductus die Dünndarmwandung pankreaticus ist eine sanduhrartige leicht erweitert und von Stenose. der Papilla Im Lumen vateri aus sowohl 4,5 cm desweit Magens sondierbar, als auchwobei des Duodenums er hier in einer reichlich peripankreatischen zähflüssiger Schleim, sangoinolent; Narbenzone abbricht.die DieSchleimhaut Mündung eines ist insgesamt Gallenganges livide.läßt Anhängend sich makroskopisch ein 7,5 x 4 nicht x 1,5 abgrenzen. cm großes Die Pankreaskopfsegment sowie ein 4 berichtete Stenose imcm Duodenum langer derber liegt 2,5 undcm bisoral 2,5 cm der durchmessender Papilla vateri undknotiger steht mitGewebsstrang, der beschriebenen der an seinem Ende eine Narbenzone in direktem Fadenmarkierung Zusammenhang. aufweist. Teilweise Hier istauf dielamellierenden Dünndarmschleimhaut Schnittenimzähfestes Stenosebereich weißliches, polypoid teilweise nodulär vorgewölbt. Der kleinen Kurvatur anhängend ein bis 4 Gallengänge cm durchmessendes einzelne konfiguriertes Gewebe, ohne das manifestFettgewebe. werden. DerDarin distale Anteil des Ductus pankreaticus ist knotige Indurationen von leicht biserweitert zu 1 cmund größe. von1.der Oraler Papilla Resektionsrand vateri aus 4,5Magenkorpus. cm weit sondierbar, 2. Magenantrum. wobei er hier 3. in einer peripankreatischen Bulbus duodeni. 4. Stenosezone Narbenzonemit abbricht. angrenzendem Die Mündung Pankreas eines undGallenganges tuschemarkierten läßt sich äußeren makroskopisch Resektionsrändern nicht abgrenzen. Die und einem Lymphknoten. berichtete 5. Papilla Stenose vateri im- Duodenum Mündung des liegt Ductus 2,5 cm pankreaticus. oral der Papilla 6. Distales vateri und Ende steht desmit Ductus der beschriebenen pankreaticus im Narbengebiet. Narbenzone 7. Intraparenchymaler in direktem Zusammenhang. Absetzungsrand Teilweise Pankreas. ist die Dünndarmschleimhaut 8. Peripankreatisches im Stenosebereich polypoid Gewebe. 9. bis 12. Fadenmarkierter vorgewölbt. Der Fortsatz kleinenanKurvatur der Arteria anhängend hepaticaein communis bis 4 cmvon durchmessendes Fettgewebe. Darin einzelne knotige Indurationen von bis zu 1 cm größe. 1. Oraler Resektionsrand Magenkorpus. 2. Magenantrum. 3. Bulbus duodeni. 4. Stenosezone mit angrenzendem Pankreas und tuschemarkierten äußeren Resektionsrändern und einem Lymphknoten. 5. Papilla vateri - Mündung des Ductus pankreaticus. 6. Distales Ende des Ductus pankreaticus im Narbengebiet. 7. Intraparenchymaler Absetzungsrand Pankreas. 8. Peripankreatisches Gewebe. 9. bis 12. Fadenmarkierter Fortsatz an der Arteria hepatica communis von • gramática + ortografias corretas • estrutura sintática complexa • normalmente em Inglês • muitos nomes não lexicalizados Estruturas Infra-estrutura de informação Infra-estrutura de conhecimento Exemplo 5: Vocabulário controlado representando publicações científicas Exemplo 5: Vocabulário controlado representando publicações científicas Linguagens Origem Profissionais de saúde Histologisches Gutachten Pacientes Makroskopie: "Resektat nach Whipple": Ein noch nicht eröffnetes Resektat, bestehend aus einem distalen Magen mit einer kleinen Kurvaturlänge von 9,5 cm und einer großen Kurvaturlänge von 13,5 cm, sowei einem duodenalen Anteil von 14 cm Länge. 2 cm aboral des Pylorus zeigt die Dünndarmwandung eine sanduhrartige Stenose. Im Lumen sowohl Histologisches des Magens Gutachten als auch des Duodenums reichlich zähflüssiger Schleim, sangoinolent; die Schleimhaut ist insgesamt livide. Anhängend ein 7,5 x 4 x 1,5 cm großes Pankreaskopfsegment sowie ein 4 cm langer derber und Makroskopie: bis 2,5 cm durchmessender "Resektat nach knotiger Whipple": Gewebsstrang, Ein noch nicht der eröffnetes an seinem Ende Resektat, einebestehend aus einem distalen Fadenmarkierung aufweist. MagenHier mit einer auf lamellierenden kleinen Kurvaturlänge Schnittenvon zähfestes 9,5 cmweißliches, und einer großen teilweise Kurvaturlänge nodulär von 13,5 cm, sowei einem konfiguriertes Gewebe, duodenalen ohne das Gallengänge Anteil von 14manifest cm Länge. werden. 2 cm Der aboral distale des Pylorus Anteil des zeigt Ductus die Dünndarmwandung pankreaticus ist eine sanduhrartige leicht erweitert und von Stenose. der Papilla Im Lumen vateri aus sowohl 4,5 cm desweit Magens sondierbar, als auchwobei des Duodenums er hier in einer reichlich peripankreatischen zähflüssiger Schleim, sangoinolent; Narbenzone abbricht.die DieSchleimhaut Mündung eines ist insgesamt Gallenganges livide.läßt Anhängend sich makroskopisch ein 7,5 x 4 nicht x 1,5 abgrenzen. cm großes Die Pankreaskopfsegment sowie ein 4 berichtete Stenose imcm Duodenum langer derber liegt 2,5 undcm bisoral 2,5 cm der durchmessender Papilla vateri undknotiger steht mitGewebsstrang, der beschriebenen der an seinem Ende eine Narbenzone in direktem Fadenmarkierung Zusammenhang. aufweist. Teilweise Hier istauf dielamellierenden Dünndarmschleimhaut Schnittenimzähfestes Stenosebereich weißliches, polypoid teilweise nodulär vorgewölbt. Der kleinen Kurvatur anhängend ein bis 4 Gallengänge cm durchmessendes einzelne konfiguriertes Gewebe, ohne das manifestFettgewebe. werden. DerDarin distale Anteil des Ductus pankreaticus ist knotige Indurationen von leicht biserweitert zu 1 cmund größe. von1.der Oraler Papilla Resektionsrand vateri aus 4,5Magenkorpus. cm weit sondierbar, 2. Magenantrum. wobei er hier 3. in einer peripankreatischen Bulbus duodeni. 4. Stenosezone Narbenzonemit abbricht. angrenzendem Die Mündung Pankreas eines undGallenganges tuschemarkierten läßt sich äußeren makroskopisch Resektionsrändern nicht abgrenzen. Die und einem Lymphknoten. berichtete 5. Papilla Stenose vateri im- Duodenum Mündung des liegt Ductus 2,5 cm pankreaticus. oral der Papilla 6. Distales vateri und Ende steht desmit Ductus der beschriebenen pankreaticus im Narbengebiet. Narbenzone 7. Intraparenchymaler in direktem Zusammenhang. Absetzungsrand Teilweise Pankreas. ist die Dünndarmschleimhaut 8. Peripankreatisches im Stenosebereich polypoid Gewebe. 9. bis 12. Fadenmarkierter vorgewölbt. Der Fortsatz kleinenanKurvatur der Arteria anhängend hepaticaein communis bis 4 cmvon durchmessendes Fettgewebe. Darin einzelne knotige Indurationen von bis zu 1 cm größe. 1. Oraler Resektionsrand Magenkorpus. 2. Magenantrum. 3. Bulbus duodeni. 4. Stenosezone mit angrenzendem Pankreas und tuschemarkierten äußeren Resektionsrändern und einem Lymphknoten. 5. Papilla vateri - Mündung des Ductus pankreaticus. 6. Distales Ende des Ductus pankreaticus im Narbengebiet. 7. Intraparenchymaler Absetzungsrand Pankreas. 8. Peripankreatisches Gewebe. 9. bis 12. Fadenmarkierter Fortsatz an der Arteria hepatica communis von Pesquisadores Estruturas Infra-estrutura de dados Infra-estrutura de informação Infra-estrutura de conhecimento Exemplo 5: Vocabulário controlado PubMed publicações científicas representando ID PMID- 20812602 descritores MeSH MH - Breast Neoplasms/*genetics/nursing/prevention & control/psychology MH - Female MH - *Genes, BRCA1 MH - *Genes, BRCA2 MH - Genetic Predisposition to Disease/*genetics/prevention & control MH - Genetic Testing MH - Health Behavior MH - Humans MH - Medical History Taking MH - Models, Nursing MH - Models, Psychological MH - Mutation/genetics MH - Nurse's Role MH - Nursing Assessment/methods MH - Oncologic Nursing MH - Risk Assessment/*methods MH - Risk Factors Exemplo 5: Vocabulário controlado representando publicações científicas Linguagens Origem Profissionais de saúde Histologisches Gutachten Pacientes Pesquisadores Makroskopie: "Resektat nach Whipple": Ein noch nicht eröffnetes Resektat, bestehend aus einem distalen Magen mit einer kleinen Kurvaturlänge von 9,5 cm und einer großen Kurvaturlänge von 13,5 cm, sowei einem duodenalen Anteil von 14 cm Länge. 2 cm aboral des Pylorus zeigt die Dünndarmwandung eine sanduhrartige Stenose. Im Lumen sowohl Histologisches des Magens Gutachten als auch des Duodenums reichlich zähflüssiger Schleim, sangoinolent; die Schleimhaut ist insgesamt livide. Anhängend ein 7,5 x 4 x 1,5 cm großes Pankreaskopfsegment sowie ein 4 cm langer derber und Makroskopie: bis 2,5 cm durchmessender "Resektat nach knotiger Whipple": Gewebsstrang, Ein noch nicht der eröffnetes an seinem Ende Resektat, einebestehend aus einem distalen Fadenmarkierung aufweist. MagenHier mit einer auf lamellierenden kleinen Kurvaturlänge Schnittenvon zähfestes 9,5 cmweißliches, und einer großen teilweise Kurvaturlänge nodulär von 13,5 cm, sowei einem konfiguriertes Gewebe, duodenalen ohne das Gallengänge Anteil von 14manifest cm Länge. werden. 2 cm Der aboral distale des Pylorus Anteil des zeigt Ductus die Dünndarmwandung pankreaticus ist eine sanduhrartige leicht erweitert und von Stenose. der Papilla Im Lumen vateri aus sowohl 4,5 cm desweit Magens sondierbar, als auchwobei des Duodenums er hier in einer reichlich peripankreatischen zähflüssiger Schleim, sangoinolent; Narbenzone abbricht.die DieSchleimhaut Mündung eines ist insgesamt Gallenganges livide.läßt Anhängend sich makroskopisch ein 7,5 x 4 nicht x 1,5 abgrenzen. cm großes Die Pankreaskopfsegment sowie ein 4 berichtete Stenose imcm Duodenum langer derber liegt 2,5 undcm bisoral 2,5 cm der durchmessender Papilla vateri undknotiger steht mitGewebsstrang, der beschriebenen der an seinem Ende eine Narbenzone in direktem Fadenmarkierung Zusammenhang. aufweist. Teilweise Hier istauf dielamellierenden Dünndarmschleimhaut Schnittenimzähfestes Stenosebereich weißliches, polypoid teilweise nodulär vorgewölbt. Der kleinen Kurvatur anhängend ein bis 4 Gallengänge cm durchmessendes einzelne konfiguriertes Gewebe, ohne das manifestFettgewebe. werden. DerDarin distale Anteil des Ductus pankreaticus ist knotige Indurationen von leicht biserweitert zu 1 cmund größe. von1.der Oraler Papilla Resektionsrand vateri aus 4,5Magenkorpus. cm weit sondierbar, 2. Magenantrum. wobei er hier 3. in einer peripankreatischen Bulbus duodeni. 4. Stenosezone Narbenzonemit abbricht. angrenzendem Die Mündung Pankreas eines undGallenganges tuschemarkierten läßt sich äußeren makroskopisch Resektionsrändern nicht abgrenzen. Die und einem Lymphknoten. berichtete 5. Papilla Stenose vateri im- Duodenum Mündung des liegt Ductus 2,5 cm pankreaticus. oral der Papilla 6. Distales vateri und Ende steht desmit Ductus der beschriebenen pankreaticus im Narbengebiet. Narbenzone 7. Intraparenchymaler in direktem Zusammenhang. Absetzungsrand Teilweise Pankreas. ist die Dünndarmschleimhaut 8. Peripankreatisches im Stenosebereich polypoid Gewebe. 9. bis 12. Fadenmarkierter vorgewölbt. Der Fortsatz kleinenanKurvatur der Arteria anhängend hepaticaein communis bis 4 cmvon durchmessendes Fettgewebe. Darin einzelne knotige Indurationen von bis zu 1 cm größe. 1. Oraler Resektionsrand Magenkorpus. 2. Magenantrum. 3. Bulbus duodeni. 4. Stenosezone mit angrenzendem Pankreas und tuschemarkierten äußeren Resektionsrändern und einem Lymphknoten. 5. Papilla vateri - Mündung des Ductus pankreaticus. 6. Distales Ende des Ductus pankreaticus im Narbengebiet. 7. Intraparenchymaler Absetzungsrand Pankreas. 8. Peripankreatisches Gewebe. 9. bis 12. Fadenmarkierter Fortsatz an der Arteria hepatica communis von • Codificação de boa qualidade (feita por indexadaores) • Escopo limitado • Granularidade limitada (MeSH) • Otimizado para RI Estruturas Infra-estrutura de dados Infra-estrutura de informação Infra-estrutura de conhecimento Problemas • Maior parte da informação relevante em texto livre – idiomas diferentes (Inglês, Português, ...) – estilos diferentes (elaborado vs. telegrama) – vocabulários diferentes (leigo vs. especialista) • Sistemas de codificação diferenciadas por – – – – domínios finalidades sistemas de saúde idiomas • Problemas de qualidade # HAS # DM # Miocardiopatia dilatada chagásica (FE 35%) # Ca de prostata - orquiectomia (2004) # Cardiopatia isquêmica - IAM em 2005, com colocação de stent em DA e lesão severa inoperável em CD Pct vem a emergência em 20/03 com quadro de dor torácica típica, sem elevação enzimática, com diagnóstico de angina instável e fibrilação atrial não identificada em avaliações prévias. Adicionalmente, apresentava descompensação do diabetes com sindrome hiperosmlar não cetótica. Recebe tratamento clínico para otimização do quadro e é submetido a novo cateterismo em 28/03, que demonstra CD ocluída no terço proximal, DA com stent rpoximal com lesão de 40% no seu interior e Mg de Cx com lesão de 60-65%. Recebe alta em bom estado geral, sem dor torácica, anticoagulado, com plano de retorno ambulatorial para equipe de cardiopatia isquêmica e para o ambluatório de anticoagulação. MH - Humans MH - Medical History Taking MH - Models, Nursing MH - Models, Psychological MH - Mutation/genetics MH - Nurse's Role MH - Nursing Assessment/methods MH - Oncologic Nursing MH - Risk Assessment/*methods MH - Risk Factors Thombomeres (r).These segments constitute units of lineage restriction and display specific gene expression patterns. The transcription factor gene Krox-20 is restricted to r3 and r5, and is required for the development of these rhombomeres. We present Interoperabilidade Semântica ? evidence that Krox-20 transcriptional activity is under the control of a negative feedback mechanism in the hindbrain, which involves two closely related proteins, Nabl and Nab2, previously identified as antagonists of Krox-20 transcriptional activity in cultured cells. Here we show that in the mouse hindbrain, Nab1 and Nab2 recapitulate the Krox-20 expression pattern and that their expression is dependent on Krox-20 function. Furthermore, misexpression of Nab1 or Nab2in zebrafish embryos leads to alterations in the expression patterns of several hindbrain markers. Soluções: recursos e tecnologias • Padrões terminológicos / ontológicos – SNOMED CT (termos clínicos) – Open Biomedical Ontologies (OBO) – WHO-FIC (Family of International Classification) • Tecnologias de linguagem natural (PLN) – extração de informação / text mining – mapeamento para terminologias – capazes de lidar com • idiomas diferentes • sublinguagens diferentes • textos com erros Estudo: codificação automatizada • Fontes – Sumários de alta do Hospital de Clínicas de Porto Alegre (em Português) • Destino – SNOMED CT (em Inglês e Espanhol) • Metodologia: – Pipeline PLN (openNLP) – Indexação Morfossemântica (MorphoSaurus) Oct 21, 15h30 -- Sessão Oral 51 Edson José Pacheco: Modelo para codificação de narrativas clínicas para uma ontologia de domínio utilizando SNOMED CT PLN (processamento de linguagem natural) A imagem não pode ser exibida. Talv ez o computador não tenha memória suficiente para abrir a imagem ou talv ez ela esteja corrompida. Reinicie o computador e abra o arquiv o nov amente. Se ainda assim aparecer o x v ermelho, poderá ser necessário excluir a imagem e inseri-la nov amente. A imagem não pode ser exibida. Talv ez o computador não tenha memória suficiente para abrir a imagem ou talv ez ela esteja corrompida. Reinicie o computador e abra o arquiv o nov amente. Se ainda assim aparecer o x v ermelho, poderá ser necessário excluir a imagem e inseri-la nov amente. expansão acrônimos identificação de nomes A imagem não pode ser exibida. Talv ez o computador não tenha memória suficiente para abrir a imagem ou talv ez ela esteja corrompida. Reinicie o computador e abra o arquiv o nov amente. Se ainda assim aparecer o x v ermelho, poderá ser necessário excluir a imagem e inseri-la nov amente. verificar ortografia A imagem não pode ser exibida. Talv ez o computador não tenha memória suficiente para abrir a imagem ou talv ez ela esteja corrompida. Reinicie o computador e abra o arquiv o nov amente. Se ainda assim aparecer o x v ermelho, poderá ser necessário excluir a imagem e inseri-la nov amente. etiquetador tipo de palavra SCT - EN A imagem não pode ser exibida. Talv ez o computador não tenha memória suficiente para abrir a imagem ou talv ez ela esteja corrompida. Reinicie o computador e abra o arquiv o nov amente. Se ainda assim aparecer o x v ermelho, poderá ser necessário excluir a imagem e inseri-la nov amente. identificar sentenças SCT - SP A imagem não pode ser exibida. Talv ez o computador não tenha memória suficiente para abrir a imagem ou talv ez ela esteja corrompida. Reinicie o computador e abra o arquiv o nov amente. Se ainda assim aparecer o x v ermelho, poderá ser necessário excluir a imagem e inseri-la nov amente. A imagem não pode ser exibida. Talv ez o computador não tenha memória suficiente para abrir a imagem ou talv ez ela esteja corrompida. Reinicie o computador e abra o arquiv o nov amente. Se ainda assim aparecer o x v ermelho, poderá ser necessário excluir a imagem e inseri-la nov amente. extração frases nominais criação subconjunto A imagem não pode ser exibida. Talv ez o computador não tenha memória suficiente para abrir a imagem ou talv ez ela esteja corrompida. Reinicie o computador e abra o arquiv o nov amente. Se ainda assim aparecer o x v ermelho, poderá ser necessário excluir a imagem e inseri-la nov amente. MIDrepresentação SNOMED CT Heurística de Mapeamento deteção de contexto abstração morfosemântica A imagem não pode ser exibida. Talv ez o computador não tenha memória suficiente para abrir a imagem ou talv ez ela esteja corrompida. Reinicie o computador e abra o arquiv o nov amente. Se ainda assim aparecer o x v ermelho, poderá ser necessário excluir a imagem e inseri-la nov amente. abstração morfosemântica A imagem não pode ser exibida. Talv ez o computador não tenha memória suficiente para abrir a imagem ou talv ez ela esteja corrompida. Reinicie o computador e abra o arquiv o nov amente. Se ainda assim aparecer o x v ermelho, poderá ser necessário excluir a imagem e inseri-la nov amente. MIDrepresentação candidatos a termo Heurística de mapeamento SNOMED CT Concept Description MIDs ENG: Congestive heart failure #abund #cardiac #deficien ENG: Congestive cardiac failure #abund #cardiac #disorder POR: Insuficiência cardíaca #insuff #cardiac SPA: Insuficiencia cardíaca #insuff #cardiac SPA: Insuficiencia cardíaca congestiva #insuff #cardiac #abund Resultados comparado com padrãoouro (kappa = 0,89) Number of tokens (MIDs) 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Correct Mappings 66% 71% 80% 89% 79% 80% 75% 45% 25% Total comparação: dificil! 78 % Franz 2000: ICD-9 (German): 50% Ruch ICD-10: 2008 (French): Precision :50%, Recall 63% Farkas 2008: ICD-9-CM: F-Value 89% Long 2005: SNOMED CT Diagnoses (English): P and R > 90% Conclusão • Interoperabilidade semântica vital para o funcionamento do ecossistema translacional • Desafios – mineração de textos de origens e qualidade distintas – Terminologias ontologias – mapeamento entre recursos terminológicos – identificar o contexto de expressões de linguagem e de códigos Agentes inteligentes no Dados Informação Ecossistema translacional Conhecimento Agradecimentos • German Research Foundation (DFG) • International Bureau of the German Ministry of Research (BMBF-IB) • Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) • Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR), Curitiba • Hospital de Clínicas de Porto Alegre (HCPA) • Averbis GmbH, Freiburg Exemplo Ontologia incisional hernia • instância herniorrhaphy operation • não instanciada • referência a um plano • referência a um suspenso plano operation room • instância liver transplant • referência a um plano de um paciente diferente operation • novo plano mas ainda não executado PACIENTE COM HÉRNIA INCISIONAL INTERNOU PARA REALIZAÇÃO DE HERNIOPLASTIA PORÉM A CIRURGIA FOI SUSPENSA DEVIDO A NECESSIDADE DE SALA COM URGÊNCIA PARA TRANSPLANTE HEPÁTICO. RECEBE ALTA COM ORIENTAÇÕES E CIRURGIA REMARCADA.