5915756 – Introdução à Neurociência Computacional – PGFAMB – USP – Prof. Antônio Roque
Roteiro da Disciplina
1. Docente: Antônio Carlos Roque da Silva Filho
2. E-mail: [email protected]
3. Homepage: www.sisne.org (link Ensino, link Introdução à
Neurociência Computacional)
4. Horário: 2a feira, 14:00 – 17:00 e 5a feira, 14:00 – 16:00
5. Início: 23/09/2013; Término: 02/12/2013
6. Local: Sala 220 (Bloco B2 superior)
7. Tópicos:
• Elementos básicos de neurociência;
• Disparos neurais e o “código” neural;
• Neurônios e modelos baseados em condutâncias;
i. Formalismo de Hodgkin-Huxley;
ii. Modelagem compartimental.
• Modelos de sinapses;
• Modelos simplificados de neurônios;
• Modelos de redes de neurônios;
• Modelos baseados em taxas de disparos.
8. Metodologia: Aulas expositivas em sala de aula. Exercícios e
problemas para casa.
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9. Critério de Avaliação: Listas de exercícios semanais (E) e
projetos computacionais (C) para casa. A nota final (NF) será
dada pela seguinte fórmula:
NF =
2 × E + 3× C
,
5
onde E é a média aritmética das notas das listas de exercícios e
C é a média aritmética das notas dos projetos computacionais.
10.
Conceito final: O conceito final será atribuído em função da
nota final segundo a regra:
• A: 10 ≤ NF ≤ 8,5;
• B: 8,5 < NF ≤ 6,5;
• C: 6,5 < NF ≤ 5,0;
• R: NF < 5,0
11.
As respostas das listas de exercícios e dos projetos
computacionais poderão ser entregues feitas à mão ou com
auxílio de editores de texto (Word, LaTeX, etc). Elas poderão
ser entregues em versões físicas (manuscritos originais ou
cópias impressas) ou eletrônicas (cópias escaneadas dos
manuscritos originais ou arquivos gerados pelos editores de
texto, em formato pdf) através de e-mails enviados ao professor
ou CDs gravados. As versões físicas ou os CDs gravados
deverão ser entregues diretamente ao professor em sala de aula
ou deixadas no seu escaninho no DFM (fica no fim do corredor
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onde está a secretaria). Os arquivos enviados por e-mail devem
ser identificados por nomes com o seguinte formato:
lista#_nome_do_aluno.ext.
12.
Sobre provas substitutivas e trabalhos extras: Espera-se que
todos os alunos compareçam às aulas e entreguem as listas e
projetos nas datas marcadas. Por favor, não peça ao professor
permissão para entregar uma lista ou projeto depois do prazo ou
para fazer uma prova substitutiva ou trabalho adicional para
repor ou melhorar uma nota, exceto em caso de urgência médica
(comprovado por atestado). Caso uma prova substitutiva seja
necessária, ela será feita oralmente na sala do professor.
13.
Bibliografia:
• Sterrat, D., Graham, B., Gillies, A. & Willshaw, D.,
Principles of Computational Modelling in Neuroscience,
Cambridge University Press, Cambridge, UK, 2011.
• Gerstner, W. & Kistler, W., Spiking Neuron Models,
Cambridge University Press, Cambridge, UK, 2002.
Disponível em formato html em:
http://icwww.epfl.ch/~gerstner/SPNM/SPNM.html
• Koch, C., Biophysics of Computation: Information
Processing in Single Neurons, Oxford University Press,
Oxford, 1999. Alguns capítulos do livro encontram-se a
disposição no site:
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http://www.klab.caltech.edu/~koch/biophysics-book/
• Dayan, P. & Abbott, L.F., Theoretical Neuroscience:
Computational and Mathematical Modeling of Neural
Systems, MIT Press, Cambridge, MA, 2001. Alguns
capítulos do livro e exercícios resolvidos encontram-se
disponíveis no site:
http://www.gatsby.ucl.ac.uk/~dayan/book/
• Notas de aula do professor e artigos científicos a serem
divulgados em sala de aula (disponíveis pela internet ou
em revistas existentes na Biblioteca).
14.
Livros-texto de Neurociência: úteis como material de apoio.
• Bear, M. F., Connors, B.W. & Paradiso, M. A.,
Neurociências: desvendando o sistema nervoso, 3a edição.
ARTMED, Porto Alegre-RS, 2007
• Purves, D., Hall, W.C. & McNamara, J.O., Neurociências,
4a edição. ARTMED, Porto Alegre-RS, 2010.
15.
Material de apoio na Web: Há muito material didático de
bom nível disponível na internet (mas também há muito lixo,
tomem cuidado). Em geral, verifiquem a procedência do
material (a instituição que está por trás, a afiliação de quem o
preparou, etc) antes de acessar. Alguns sites interessantes são:
Encyclopedia of Computational Neuroscience
http://www.scholarpedia.org/article/Encyclopedia_of_computati
onal_neuroscience
5915756 – Introdução à Neurociência Computacional – PGFAMB – USP – Prof. Antônio Roque
Brains, Minds and Media Special Issue on Realistic Neural
Modeling
http://www.brains-minds-media.org/archive/237/
The GENESIS website
http://genesis-sim.org/
Free Internet Edition of The Book of GENESIS
http://www.genesis-sim.org/GENESIS/bog/bog.html
The NEURON website
http://www.neuron.yale.edu/neuron/
Computational Neuroscience on the Web.
http://home.earthlink.net/~perlewitz/index.html
NEST
http://www.nest-initiative.org/index.php/About_Us