BANCO DE ESTÁGIOS EXTRACURRICULARES
DAEICBAS 2015-2016
3D modelling of the physiology of microorganisms at the
molecular level
Tutor: Nuno Filipe Azevedo ([email protected])
Local: FEUP – departamento Engenharia Química
Vagas: 1
Horas de contacto semanal: 3h
Requisitos preferenciais de seriação de candidatos: Média de resultados referente às unidades curriculares
concluídas
Descrição do projeto: The student will be integrated in an interdisciplinary team that combines expertise on
Mathematics and Statistics, (Bio)informatics, Physics, Chemistry and Microbiology. The student is required to
have previous experience/background in at least one of the above areas and his tasks will be defined
accordingly.
Phytodisinfectants
Tutor: Manuel Simões
Local: FEUP
Vagas: 1
Horas de contacto semanal: 10h
Requisitos mínimos de colocação de candidatos: Aprovação às unidades curriculares de Microbiologia
Descrição do projeto: The aim of this project is to evaluate the potential of phytochemical products (molecules
from the plant secondary metabolism) to be used in hospital disinfection, as single products and in
combination with in-use biocides. Phytochemical products from the major chemical classes with recognized
antimicrobial potential and from emergent classes will be selected for this study. As bacterial biofilms are the
leading example of antimicrobial resistance, the phytochemical products will also be tested on their ability to
control biofilms. This information will be useful to prevent the spread of antimicrobial resistant
microorganisms, as well as, for the design of suitable biofilm control practices.
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UNIVERSIDADE DO PORTO
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Gulosibacter molinativorax ON4molATutor: Olga Nunes
Local: FEUP
Vagas: 1
Horas de contacto semanal: 10h
Requisitos mínimos de colocação de candidatos: Conhecimentos práticos referentes à técnica de PCR
Descrição do projeto: A estirpe G. molinativorax ON4 é, até hoje, a única descrita como capaz de hidrolizar o
herbicida molinato. Esta característica deve-se ao facto da estirpe ON4 sintetizar uma enzima nova, a
hidrolase do molinato (MolA). Recentemente foi isolada no nosso laboratório uma estirpe mutante que não
degrada o molinato. Com base na informação obtida pela sequenciação do genoma da estirpe ON4, sabemos
que o gene molA se encontra inserido num elemento genético móvel. Assim, este estudo tem por objectivo
determinar se a perda de capacidade para degradar o molinato se deve a alterações no gene molA ou no seu
ambiente genético. As referências abaixo indicadas são uma selecção dos artigos científicos publicados sobre
o estudo que temos vindo a desenvolver sobre a biodegradação do molinato, e a sua possível aplicação no
tratamento de locais contaminados.
Leite, J.P., Duarte, M., Paiva, A.M., Ferreira-da-Silva, F., Matias, P.M., Nunes, O.C., Gales, L. 2015. Structure-guided engineering
of molinate hydrolase for the degradation of thiocarbamate pesticides. PLoS ONE 10(4): e0123430. doi:10.1371/journal.
pone.0123430.
Nunes, O.C., Lopes, A.R., Manaia, C.M. 2013. Microbial degradation of the herbicide molinate by defined cultures and in the
environment. Appl. Microbiol. Biot., 97:10275-10291.
Lopes, A.R., Danko, A.S., Manaia, C.M., Nunes, O.C. 2013. Molinate biodegradation in soils: natural attenuation versus
bioaugmentation. Appl. Microbiol. Biot., 97(6):2691-2700.
Duarte, M., Ferreira-da-Silva, F., Lünsdorf, H. Junca, H., Gales, L. Pieper, D.H., Nunes, O.C. 2011. Gulosibacter molinativorax ON4T
molinate hydrolase, a novel cobalt dependent amidohydrolase. J. Bacteriol., 193(20):5810-5816.
Barreiros, L., Fernandes, A., Silva Ferreira, A.C., Pereira, H., Bastos, M.M.S.M., Manaia, C.M. and Nunes, O.C. 2008. New insights
into a bacterial metabolic and detoxifying association responsible for the mineralization of the thiocarbamate herbicide
molinate. Microbiology SGM, 154(4):1038-1046.
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Manaia, C.M., Nogales, B., Weiss, N., and Nunes, O.C. 2004. Gulosibacter molinativorax gen. nov., sp. nov., a molinate degrading
bacterium, and classification of “Brevibacterium helvolum” DSM 20419 as Pseudoclavibacter helvolus gen. nov., sp. nov. Int. J.
Syst. Evol. Microbiol., 54(3):783-789.
Castro, M., Silva Ferreira, A.C., Manaia, C.M., and Nunes, O.C. 2005. A case study of molinate application in a Portuguese rice
field: herbicide dissipation and proposal of a clean-up methodology. Chemosphere, 59(7):1059-1065.
Barreiros, L., Nogales, B., Manaia, C.M., Silva Ferreira, A.C., Pieper, D.H., Reis, M.A., and Nunes, O.C. 2003. A novel pathway for
mineralization of the thiocarbamate herbicide molinate by a defined bacterial mixed culture. Environ. Microbiol., 5 (10):944953.
Review article on Reproductive outcomes
Tutor: Mário Sousa
Vagas: 1
Horas de contacto semanal: 2 tardes por semana a partir das 14h
Preparation of optic microscopy material for classes: He-Eo and
Thricome Masson in mouse skin; He-EO and PAS in mouse liver
and small intestine
Tutor: Mário Sousa
Vagas: 1
Horas de contacto semanal: 2 tardes por semana a partir das 14h
Tipo de função: Full work
Human Genetics: computer and Sanger sequencing in rare
diseases
Tutor: Dr. Jorge Oliveira
Vagas: 1
Local: IGM/CHP
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Horas de contacto semanal: 2 tardes por semana a partir das 14h
Tipo de função: assistance to a PhD student
Physiology of human oocytes and follicular cells
Tutor: Prof. Rosália Sá
Vagas: 1
Horas de contacto semanal: 2 tardes por semana a partir das 14h
Tipo de função: assistance to a MSc student.
Physiology of human and mouse Sertoli cells
Tutor: Prof. Pedro Oliveira.
Vagas: 1
Horas de contacto semanal: 2 tardes por semana a partir das 14h
Tipo de função: assistance to a PhD student
Ocorrência de antibióticos utilizados na medicina veterinária
nos ecossistemas
Tutor: Lúcia Maria da Silveira Santos
Local: DEQ/LEPABE/FEUP
Vagas: 1
Horas de contacto semanal: 8h
Data de término do estágio: Final de Junho
Requisitos mínimos de colocação de candidatos: Ter obtido aprovação no mínimo 120 ECTs
Motivação: Conhecimentos em química orgânica; interesse pela química analítica; preocupação ambiental e
uso massivo de antibióticos.
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Competências a desenvolver: Compreender os fenómenos de resistência a antibióticos; Adquirir e aprofundar
conhecimentos de microbiologia básica e molecular; Interpretar e comunicar um resultado microbiológico;
Trabalhar eficientemente em equipa.
Descrição do projeto: Há mais de 60 anos que os antibióticos são utilizados na medicina veterinária para o
tratamento terapêutico de doenças infeciosas, promoção de crescimento e aumento da eficiência da ração.
No entanto, estes fármacos são atualmente considerados poluentes emergentes, existindo uma crescente
preocupação global sobre a ocorrência, o destino e os efeitos destes fármacos no meio ambiente. Neste
contexto, o principal objetivo deste projeto é analisar a ocorrência de antibióticos utilizados na medicina
veterinária em amostras de ambientais através de métodos instrumentais de análise.
Prevenção e controlo da tuberculose em grupos populacionais
vulneráveis de um centro urbano da região Norte de Portugal
Tutor: Raquel Duarte
Local: Instituto de Saúde Pública da Universidade do Porto
Vagas: 2
Horas de contacto semanal: 8h
Requisitos preferenciais de colocação de candidatos: Média de resultados referente às unidades curriculares
concluídas
Descrição do projeto: A tuberculose (TB) em Portugal tem vindo a diminuir nos últimos anos, concentrandose atualmente nos grandes centros urbanos como Porto e Lisboa. A dinâmica de transmissão da tuberculose
e desenvolvimento da doença ativa varia em diferentes populações geográficas e/ou demograficamente
definidos. O objetivo deste projeto é identificar a dinâmica de transmissão da tuberculose e o efeito dos
determinantes sociais na cidade do Porto; identificar estratégias de prevenção e controlo e avalia-las.
Análise de Risco de Desenvolvimento de Cancro
Tutor: Jorge Machado
Local: Laboratório de Fisiologia Aplicada, ICBAS
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Vagas: 4
Horas de contacto semanal: 2h
Término do estágio: 30 de Julho
Requisitos mínimos de colocação de candidatos: Aprovação ou a frequentar a cadeira de Fisiologia
Requisitos preferenciais: 2º ano concluído com aprovação
Descrição do projeto: com este trabalho pretende-se validar a relação entre o risco de desenvolvimento de
cancro e medidas biométricas convidadas com medições de condução bioelétricas ao nível dérmico.
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