Implementação do Alelo
Animal/ Animal GRIN no Brasil
Samuel Rezende Paiva
Embrapa Labex EUA – Recursos Genéticos
O Que é o Alelo Animal?
 PORTAL ALELO, lançamento final 2013:
https://www.embrapa.br/alelo
O Que é o Alelo Animal?
Produto para fazendeiros, associações de raças e pesquisadores
que tenham interesse em depositar e obter informação e material
biológico sobre recursos genéticos animais
O Que é o Alelo Animal?
 Iniciativa conjunta entre EUA, Canada e Brasil;
 http://aleloanimal.cenargen.embrapa.br/
Programas de Conservação
EUA x Brasil
Atividades
In vivo – In Situ
In vivo – Ex Situ
In vitro - semen
ARS-NAGP
Embrapa
✔
✔
✔
✔
In vitro - embryos
In vitro – DNA and blood cells
Pesquisa Reprodução
✔
✔
✔
✔
✔
✔
Pesquisa em Genética
✔
✔
Comitê Espécies
✔
5
O Que é o Alelo Animal?
 Embrapa e o USDA-ARS (EUA) assinaram
um Acordo de Cooperação (Diário Oficial
da União – D.O.U.: 3 de março 2015;
 Modificação Orientação Técnica n°10
Conselho Gestão Patrimônio genético
(D.O.U. em 31 de outubro de 2014):

“...Informações de origem genética podem ser depositadas
em bancos de dados nacionais e internacionais de domínio
público e serem acessadas in silico sem que isso sujeite à
autorização de acesso ao patrimônio genético...”
O Que é o Alelo Animal?
O Que é o Alelo Animal?
O Que é o Alelo Animal?
Capacidade para armazenar até 100.000 animais (80 Tb atuais com
capacidade para 780 Tb) genotipados para Chips de marcadores SNPs
Média densidade
Escopo Inicial Alelo Animal
PORTFÓLIO RECURSOS GENÉTICOS PARA A
ALIMENTAÇÃO, A AGRICULTURA E A
BIOINDÚSTRIA
ANIMAIS
MICROOGANISMOS
VEGETAIS
Escopo Inicial Alelo Animal
15 Unidades
Escopo Inicial - Banco Genético: 2014
Espécies
Sêmen/
Animais
Embriões/
Animais
DNA/
Animais
Bovinos
63,202/ 131
251/ 39
465,236/ 3247
Caprinos
3,710/ 55
26/ 4
173,914/ 1,205
Equinos
993/ 15
9/ 5
97,897/ 799
Ovinos
16,132/ 98
163/ 35
333,369/ 4,519
372/ 4
-
38,681/ 151
Suínos
1,004/ 42
-
43,715/ 607
Peixes
7,941/ 265
-
3,891/ 224
Búfalos
-
-
88,434/ 638
TOTAL
93,354/ 610
449/ 83
1,260,971/ 11,578
Asininos
Localização física; 80% Cenargen (6 Bancos); N° raças: 25 sêmen/
12 12 embriões/ 67
DNA
Sistemas de Informacão
 Planejamento;
 Construção/ Desenvolvimento;
 Implementação;
 Manutenção/ Avaliação;
Fonte: http://depts.washington.edu/pgist/drupal/sites/default/files/
Implementação Alelo Animal
 Documentação;
 Treinamento;
 Migração Dados;
 Enriquecimento e Uso;
Fonte: http://www.ists.dartmouth.edu/images/sismatwordlecrop.jpg&imgrefurl
Documentação (Descritores)
Núcleo Conservação/
Banco Genético
Bovinos/ Bubalinos
Equinos/ Asininos
Caprinos/ Ovinos
Suínos
Aves
Aquáticos (Peixes)
Sêmen/Embriões/DNA
Lista Mínima
Descritores
Novos
19
16
25
15
38
13
41
5
1
11
3
32
2
15
Documentação (Tradução)
 Código do Sistema todo Inglês;
 Processo tradução de todas as
páginas públicas para Português;
 Implementação Primeiro trimestre
2016;
Documentação (Manual)
 Inglês e Português, livro eletrônico (Epub):
Animal GRIN
Introduction
distribuição gratuita – Primeiro semestre 2016
Figure 3: Graphical representation of Animal GRIN within the information system
Treinamento
 2 Workshops Treinamento para Curadores
Brasileiros 2014;
 Pelo menos 25 funcionários Embrapa
treinados nas principais regiões do país;
 Validação do Manual;
Migração Dados
15 Unidades
Migração Dados
Migração dos dados
 Duas formas principais de envio dados:
 (A) Digitação direta no sistema;
 (B) Planilhas eletrônicas (carregamento inicial);
 Customizado para cada “cliente”;
 2014 - 2015 (Banco DNA);
 2015 – 2017 (Núcleos de Conservação);
Enriquecimento e Uso
(Material Biológico depositado)
 Principais atores nesse processo:
 A) Proprietários/ Doadores;
 B) Banco Genético Embrapa;
 C) Usuários;
 D) Comitê Gestor Banco;
Enriquecimento e Uso
Proprietário A
Proprietário n...
Instituição Responsável pelo Banco
Usuário 1
Usuário
n...
Comitê Gestor
Banco
Evento depósito amostra
biológica
 Uso para rebanhos In situ: acordo de colaboração
simples entre Embrapa e Proprietário;
 Depósito Ex situ, amostra poderá entrar como:
 Doação direta;
 Doação com uso condicionado;
 Doação com uso restrito;
 Em todos os casos Acordos de Transferência de
Material serão celebrados;
Proprietário
 Doação da amostra (sêmen/ sangue/
embriões, etc) para o Banco;
 Recebe gratuitamente qualquer informação
molecular gerada em suas amostras;
 Não tem direito a Propriedade Intelectual (nos
casos material livre para uso);
 Beneficiário indireto, as soluções
desenvolvidas visam impulsionar o setor que
o mesmo atua;
Banco Genético Embrapa
 Organiza e mantém a amostra biológica
(sem processamento e extração de DNA);
 Encaminha as amostras aos usuários,
mediante decisão do Comitê gestor;
 Não tem direito a Propriedade Intelectual;
Comitê Gestor
 Recebe e avalia os pedidos dos usuários:
- Critérios técnico-científicos;
- Critérios estratégicos;
 Composição Comitê Gestor:
- representantes técnicos
(Genética/Genômica/Melhoramento/Reprodução);
- representantes do Setor (Associações, MAPA, etc);
- Coordenador da Vertente Animal do Portfólio
Recursos Genéticos;
 Não tem direito a Propriedade Intelectual;
Usuários
 Submete pedido via Alelo Animal;
 Recebe as amostras via “Termo Transferência de
Material” e fica responsável por extrair o DNA do
material e usar o mesmo apenas para atividades
contidas na proposta;
 Repassa as informações para os proprietários após o
estudo;
 Tem direito a propriedade intelectual;
 Todas as identidades dos animais terão de ser
codificadas no momento de publicação ou depósito de
patente.
Considerações Finais
 Alelo Animal - Animal GRIN NÃO é um software de
manejo de rebanhos;
 Base de dados poderosa que poderá ser acessada de
qualquer computador/ tablet no mundo inteiro;
 Sistema apenas irá funcionar com seu USO por parte de
todos curadores e demais usuários;
 Agora todas essas ações estão cobertas oficialmente na
nova fase do Portfólio de Recursos Genéticos que se
inicia em Janeiro de 2016;
Thank you for your attention!
Muito Obrigado!
Muchas Gracias!
Source: http://www.ars.usda.gov/Main/docs.htm?docid=17892
[email protected]
Embrapa Labex – U.S. – Genetic Resources