IDENTIFICAÇÃO DE MUTAÇÕES NO LOCUS GLYMA20G21080 EM
VARIEDADES DE SOJA COM ALTO TEOR DE PROTEÍNA
Danyelle Barbosa Mayrink¹; Larissa Martins Mota 2; Leticia Assis Barony Valadares Fonseca 2;
Luiz Cláudio Costa Silva3; Rafael Delmond Bueno4; Newton Deniz Piovesan5; Carlos Sigueyuki
Sediyama6; Maximiller Dal Bianco Lamas Costa7
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Graduanda em Agronomia – UFV/Viçosa-MG/Brasil – Bolsista CNPq – e-mail:
[email protected]; ²Graduandas em Agronomia– UFV/Viçosa-MG/Brasil; 3Doutorando
em Genética e Melhoramento – UFV/Viçosa-MG/Brasil; 4Pós-doutorando –UFV/ViçosaMG/Brasil; 5Técnico de nível superior – UFV/Viçosa-MG/Brasil; 6Professor Titular –
Departamento do Fitotecnia – UFV/Viçosa-MG/Brasil; 7Professor Adjunto – Departamento de
Bioquímica e Biologia Molecular – UFV/Viçosa-MG/Brasil.
A soja (Glycine max (L.) Merril) é a cultura agrícola que mais cresceu nas últimas décadas e
corresponde a cerca de 49% da área de grãos plantadas no país. O Brasil é atualmente o segundo
maior produtor mundial de soja sendo que na safra 2013/2014 produziu mais de 85 milhões de
toneladas. O país transforma por ano 5,7 milhões de toneladas em óleo comestível e 23,5
milhões de toneladas em farelo proteico, competindo com a produtividade de carnes, ovos e
leites. Por possuir alto teor proteico, a soja vem sendo utilizada na alimentação humana como
uma diferente fonte para veicular grande parte dos aminoácidos essenciais ao consumidor, sendo
este, portanto, um dos focos atuais do Programa de Melhoramento da Qualidade da Soja do
BIOAGRO/UFV. O Glyma20g21080 foi identificado em trabalhos anteriores como um locus
contido em uma região caracterizada por conter grande número de diferentes QTLs associados
ao teor de proteínas nos grãos. O objetivo do presente trabalho foi sequenciar e caracterizar
mutações presentes no Glyma20g21080 em diferentes variedades do nosso programa e verificar
se alguma seria responsável pela diferença de acúmulo de proteínas no grão de soja. As
sequências gênicas foram obtidas a partir dos bancos de dados Phytozome, SoyBase e NCBI.
Foram desenhados três conjuntos de primers para amplificar todo o locus e sequenciá-lo. Para o
desenho dos primers foi utilizado o programa “Primer3 Input Program”, com os seguintes
parâmetros: i) amplicon variando de 600-1000 pb; ii) primer com 19-25 pb; iii) temperatura de
anelamento entre 54-64ºC; iv) conteúdo de CG% entre 40-60%. Foram selecionadas as
variedades BR8014887, BAR8, CS94731 e NTI2 (alto teor proteico), CD219 e SUPREMA
(baixo teor de proteínas) para o sequenciamento. Foram realizadas PCR’s para amplificação dos
fragmentos a partir de DNA extraído de folhas e os produtos das reações submetidos a
eletroforese, testados em diferentes temperaturas para obtenção de banda única e estas enviadas
para sequenciamento. As sequências obtidas foram editadas utilizando o programa
SEQUENCER4.1.4 e alinhadas pelo ClustalW para identificação dos polimorfismos. O
alinhamento da CS94731 com a Willians encontrou seis mutações no Glyma20g21080 das quais
quatro promoveram alteração na sequência de aminoácidos. A primeira mutação alterou o códon
de iniciação da proteína; duas mutações levaram a trocas de aminoácidos, e uma deleção de três
nucleotídeos levou a deleção de um aminoácido. Ainda não foi possível associar estas mutações
diretamente com o teor de proteínas entre as variedades do nosso programa, o que não inviabiliza
este gene estar associado neste processo. As próximas etapas do programa visam comparar as
mutações encontradas com SNPs descritas na literatura para o banco de germoplasma do USDA
e selecionar os melhores marcadores para utilização em melhoramento assistido dentro do nosso
programa.
Palavras chave: melhoramento assistido; teor de proteína; QTL; Glycine max
Apoio financeiro: FAPEMIG e CNPq
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identificação de mutações no locus glyma20g21080 em