Instrumento MiSeq FGx™
Guia de preparação do local
PARA USO EXCLUSIVO EM PESQUISAS, ANÁLISES FORENSES OU DE PATERNIDADE
Introdução
Entrega e instalação
Requisitos do laboratório
Requisitos elétricos
No-break
Restrições ambientais
Considerações sobre rede
Software antivírus
Materiais de consumo e equipamentos fornecidos pelo usuário
Assistência técnica
PROPRIEDADE DA ILLUMINA
Nº da peça 15050525 Rev. A PTB
Setembro de 2014
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Este documento e seu conteúdo são propriedade da Illumina, Inc. e suas afiliadas ("Illumina"), e destinam-se exclusivamente
ao uso contratual de seu cliente com relação ao uso dos produtos descritos neste documento e para nenhuma outra finalidade.
Este documento e seu conteúdo não serão usados ou distribuídos para nenhuma outra finalidade e/ou comunicados,
divulgados ou reproduzidos em nenhuma forma sem o consentimento prévio por escrito da Illumina. A Illumina não transmite
nenhuma licença sob seus direitos de patente, marca registrada, direitos autorais ou lei comum nem direitos semelhantes de
terceiros por este documento.
As instruções neste documento devem ser estrita e explicitamente seguidas por pessoal devidamente treinado e qualificado
para garantir o uso adequado e seguro dos produtos descritos neste documento. Todo o conteúdo deste documento deve ser
inteiramente lido e entendido antes da utilização de tais produtos.
NÃO LER COMPLETAMENTE E NÃO SEGUIR EXPLICITAMENTE TODAS AS INSTRUÇÕES AQUI CONTIDAS PODE
RESULTAR EM DANOS AOS PRODUTOS, FERIMENTOS A PESSOAS, INCLUINDO USUÁRIOS OU OUTROS, E DANOS
A OUTROS BENS.
A ILLUMINA NÃO ASSUME NENHUMA RESPONSABILIDADE RESULTANTE DA UTILIZAÇÃO INDEVIDA DOS
PRODUTOS AQUI DESCRITOS (INCLUINDO SUAS PARTES OU SEU SOFTWARE) OU DE QUALQUER USO DE TAIS
PRODUTOS FORA DO ESCOPO DAS LICENÇAS EXPRESSAS POR ESCRITO OU PERMISSÕES CONCEDIDAS PELA
ILLUMINA EM CONEXÃO COM A AQUISIÇÃO DE TAIS PRODUTOS POR PARTE DO CLIENTE.
PARA USO EXCLUSIVO EM PESQUISAS, ANÁLISES FORENSES OU DE PATERNIDADE
© 2014 Illumina, Inc. Todos os direitos reservados.
Illumina, 24sure, BaseSpace, BeadArray, BlueFish, BlueFuse, BlueGnome, cBot, CSPro, CytoChip, DesignStudio,
Epicentre, GAIIx, Genetic Energy, Genome Analyzer, GenomeStudio, GoldenGate, HiScan, HiSeq, HiSeq X, Infinium,
iScan, iSelect, ForenSeq, MiSeq FGx, NeoPrep, Nextera, NextBio, NextSeq, Powered by Illumina, SeqMonitor,
SureMDA, TruGenome, TruSeq, TruSight, Understand Your Genome, UYG, VeraCode, verifi, VeriSeq, a cor de abóbora
e o desenho de sequências de DNA onduladas são marcas registradas da Illumina, Inc. e/ou de seus afiliados nos Estados
Unidos e/ou em outros países. Todos os outros nomes, logotipos e marcas são de propriedade de seus respectivos
proprietários.
Introdução
Introdução
Este guia fornece as informações de que você precisa para preparar seu local para a
instalação e operação do MiSeq FGx:
} Requisitos de espaço do laboratório
} Requisitos elétricos
} Restrições ambientais
} Requisitos de informatização
} Materiais de consumo e equipamentos fornecidos pelo usuário
Recursos adicionais
A documentação a seguir está disponível para download no site da Illumina:
} Guia de segurança e conformidade do instrumento MiSeq FGx (nº da peça 15050819_PTB):
fornece informações sobre a rotulagem de instrumentos, certificações de
conformidade e considerações de segurança.
} Guia de referência do instrumento MiSeq FGx (nº da peça 15050524_PTB): fornece uma
visão geral do software e dos componentes do instrumento, instruções para a
realização de execuções de sequenciamento e procedimentos para a manutenção
adequada do instrumento e para a solução de problemas.
} Guia de preparação de reagente do Kit de sequenciamento MiSeq ForenSeq (nº da peça
15055483): fornece uma descrição do conteúdo do kit e instruções para a preparação
do cartucho de reagentes antes do início da execução de sequenciamento.
} Guia do ForenSeq Universal Analysis Software (nº da peça 15053874): fornece uma visão
geral abrangente dos procedimentos de análise e dos requisitos de computação.
Visite a página de suporte do Instrumento MiSeq FGx no site da Illumina para obter
acesso à documentação, downloads de software, perguntas frequentes e cursos de
treinamento on-line.
Guia de preparação do local do instrumento MiSeq FGx
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Entrega e instalação
Um provedor de serviço autorizado pela Illumina entrega, retira das caixas e posiciona o
MiSeq FGx na bancada do laboratório. O espaço e a bancada devem estar prontos antes
da entrega.
CUIDADO
Apenas pessoal autorizado pela Illumina deve desencaixotar, instalar ou mover o MiSeq
FGx. O manuseio incorreto do instrumento pode afetar o alinhamento ou danificar
componentes do instrumento.
O instrumento é pesado. Retirar da caixa, instalar ou mover inadequadamente o MiSeq
FGx pode:
} Causar graves lesões se houver queda ou manuseio incorreto.
} Ser danificado ou quebrado.
Um representante da Illumina instalará e alinhará o instrumento. É necessário ter uma
conexão com o armazenamento de dados para que o sistema funcione adequadamente.
Consulte Considerações sobre rede na página 11 para obter etapas que devem ser
realizadas antes da instalação.
CUIDADO
Depois que o representante da Illumina instalar e alinhar o MiSeq FGx, não mude o
instrumento de lugar. Mover o instrumento incorretamente pode afetar o alinhamento
óptico e comprometer a integridade dos dados. Se você precisar mudar o MiSeq FGx de
lugar, entre em contato com o representante da Illumina.
Conteúdo e dimensões na caixa
O MiSeq FGx é enviado em uma caixa. Use as dimensões a seguir para determinar a
largura de porta mínima necessária para acomodar o recipiente de transporte.
Medida
Dimensões na caixa
Largura
72,4 cm (28,5 pol)
Altura
76,8 cm (30,25 pol)
Profundidade
83,8 cm (33 pol)
Peso
90,7 kg (200 lb)
A caixa contém o instrumento MiSeq FGx juntamente com os seguintes componentes:
} Frasco de resíduos, bandeja coletora e duas etiquetas para locais de limitação para
transporte.
} MiSeq FGx Kit de acessórios, que contém os seguintes componentes:
• Bandeja de limpeza
• Frasco de resíduos, 500 ml
• Tampa para frasco de resíduos (vermelha)
• Ferramenta de acionamento sextavada com alça em T, 6 mm
• Ferramenta de acionamento sextavada com alça em T, 5/64 pol
• Cabo de rede, blindado CAT6
} Cabo de alimentação
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Nº da peça 15050525 Rev. A PTB
Esta seção apresenta os requisitos e as orientações para configurar corretamente o espaço
do laboratório para o MiSeq FGx. Para obter mais informações, consulte Restrições
ambientais na página 10.
Dimensões do instrumento
Figura 1 MiSeq FGx Instrumento
O MiSeq FGx tem as seguintes dimensões após a instalação:
Medida
Dimensões do instrumento
Largura
68,6 cm (27 pol)
Altura
52,3 cm (20,6 pol)
Profundidade
56,5 cm (22,2 pol)
Peso
57,2 kg (126 lb)
Requisitos de posicionamento
O MiSeq FGx deve ser posicionado de forma a garantir o acesso ao interruptor e à
tomada, a ventilação adequada e a manutenção do instrumento.
} Verifique se você consegue alcançar o lado direito do instrumento para ligar ou
desligar o botão localizado no painel traseiro, ao lado do cabo de alimentação.
} Posicione o instrumento para que qualquer um possa desligar rapidamente o cabo
de alimentação da tomada.
} O instrumento deve ser acessível por todos os lados, com o uso das seguintes
dimensões de distância mínima:
Acesso
Laterais
Distância mínima
Deixe pelo menos 61 cm (24 pol) de cada lado do instrumento.
Posterior
Deixe pelo menos 10,2 cm (4 pol) de distância atrás do instrumento.
Superior
Deixe pelo menos 61 cm (24 pol) de distância acima do instrumento. Se o
instrumento estiver posicionado sob uma prateleira, verifique se a
distância mínima é respeitada.
Guia de preparação do local do instrumento MiSeq FGx
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Requisitos do laboratório
Requisitos do laboratório
CUIDADO
Se você precisar mudar o MiSeq FGx de lugar, entre em contato com o representante da
Illumina. Mover o instrumento incorretamente pode afetar o alinhamento óptico e
comprometer a integridade dos dados.
Dimensões do servidor, roteador e monitor
O servidor do ForenSeq Universal Analysis Software tem as seguintes dimensões após a
instalação:
Medida
Dimensões do instrumento
Largura
17,78 cm (7 pol)
Altura
Profundidade
45,72 cm (18 pol)
63,5 cm (25 pol)
O roteador tem as seguintes dimensões após a instalação:
Medida
Dimensões do instrumento
Largura
25,4 cm (10 pol)
Altura
4,1 cm (1,6 pol)
Profundidade
17,78 cm (7 pol)
Peso
590 g (1,3 lb)
O monitor, com o suporte de monitor, tem as seguintes dimensões após a instalação:
Medida
Dimensões do instrumento
Largura
51 cm (20,11 pol)
Altura
36 cm (14,37 pol)
Profundidade
Peso
24 cm (9,45 pol)
6,45 kg (14,22 lb)
Orientações para a bancada do laboratório
A Illumina recomenda colocar o instrumento em uma bancada de laboratório sem rodas.
A bancada deve conseguir suportar o peso do aparelho, que é de 57,2 kg (126 lb).
Largura
122 cm (48 pol)
Altura
91,4 cm (36 pol)
Profundidade
76,2 cm (30 pol)
Rodas
Não
Para os clientes dos EUA, a Illumina recomenda a seguinte bancada de laboratório:
Bench-Tek Solutions (www.bench-tek.com), nº do catálogo BT40CR-3048BS-PS
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Nº da peça 15050525 Rev. A PTB
CUIDADO
O MiSeq FGx é sensível a vibrações.
Use as seguintes orientações para minimizar as vibrações durante o sequenciamento e
garantir o melhor desempenho:
} Coloque o instrumento sobre uma bancada de laboratório forte e imobilizada.
} Não coloque na bancada nenhum outro equipamento que possa provocar vibrações,
como um agitador, centrifugador, ou instrumentos com ventiladores pesados.
} Não instale o instrumento perto de portas usadas com frequência. Abrir e fechar
portas pode provocar vibrações.
} Não instale um suporte para teclado que fique abaixo da bancada.
} Enquanto o instrumento estiver executando o sequenciamento, não toque nele, não
abra a porta do reagente e não coloque nada em cima dele.
Configuração de laboratório para procedimentos de PCR
O processo de reação em cadeia de polimerase (PCR) é usado para preparar bibliotecas
para sequenciamento de amplicon. A menos que você tenha bastante cuidado, os
produtos PCR podem contaminar reagentes, instrumentos e amostras, causando
resultados imprecisos e não confiáveis. A contaminação de produtos PCR pode afetar
negativamente os processos do laboratório e atrasar as operações normais.
CUIDADO
Antes começar a trabalhar no laboratório, é preciso estabelecer áreas dedicadas e
procedimentos de laboratório para evitar a contaminação de produtos PCR.
Aplicação de áreas separadas fisicamente
Verifique se o seu laboratório está configurado adequadamente para reduzir o risco de
contaminação por produtos PCR.
• Dedique um espaço do laboratório pré-PCR fisicamente separado no qual os
processos pré-PCR serão realizados (extração de DNA, quantificação e
normalização).
• Dedique um espaço do laboratório pós-PCR fisicamente separado no qual os
produtos PCR serão feitos e processados.
• Nunca utilize a mesma pia para limpar materiais pré-PCR e pós-PCR.
• Nunca compartilhe o mesmo sistema de purificação de água para processos préPCR e pós-PCR.
• Guarde todos os suprimentos usados nos protocolos pré-PCR na área pré-PCR, e
transfira-os para a área pós-PCR conforme necessário.
• O instrumento precisa estar localizado no laboratório pós-PCR.
Equipamentos e suprimentos dedicados
• Dedique conjuntos completos e separados de equipamentos e suprimentos
(pipetas, incubadora, bloco térmico, agitador, centrífuga etc.) para processos de
laboratório pré e pós-PCR, e nunca compartilhe entre processos.
• Dedique áreas de armazenamento separadas (congeladores e refrigeradores) para
materiais de consumo pré e pós-PCR.
Guia de preparação do local do instrumento MiSeq FGx
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Requisitos do laboratório
Orientações sobre vibração
Requisitos elétricos
Esta seção lista as especificações de energia e descreve os requisitos elétricos para a sua
instalação.
Especificações de energia
Tipo
Tensão de linha
Consumo de energia
Especificação
100–240 Volts CA a 50/60 Hz
400 Watts
Conexões
Sua instalação deve contar com os seguintes equipamentos:
} Para 100–110 Volts CA: é necessária uma linha dedicada de 10 amp aterrada e com
tensão adequada.
América do Norte e Japão—Tomada: NEMA 5-15
} Para 220-240 Volts CA: é necessária uma linha de 6 amp aterrada e com tensão
adequada.
} Se a tensão oscilar mais de 10%, será necessário um regulador de linha de energia.
Terra de proteção
O MiSeq FGx tem uma ligação à terra de proteção pelo seu compartimento.
O aterramento de segurança no cabo de alimentação retorna o terra de
proteção para uma referência segura. A conexão do terra de proteção no
cabo de alimentação deve estar em boas condições durante o uso deste
dispositivo.
Cabos de alimentação
O MiSeq FGx vem com uma conexão padrão internacional IEC 60320 C13 e é fornecido
com um cabo de alimentação específico da região.
As tensões perigosas são removidas do instrumento somente quando o cabo de
alimentação for desconectado da fonte de alimentação CA.
CUIDADO
Nunca use um cabo de extensão para ligar o instrumento a uma fonte de alimentação.
Fusíveis
O MiSeq FGx não contém fusíveis que podem ser substituídos pelo usuário.
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Nº da peça 15050525 Rev. A PTB
É recomendável o uso de um no-break fornecido pelo usuário. A Illumina não é
responsável por execuções afetadas por interrupções de energia, independentemente de
haver um no-break para o instrumento ou não. A energia fornecida por gerador padrão
muitas vezes não é ininterrupta e tem uma breve queda de energia antes de retomá-la, o
que causa a interrupção de uma execução de sequenciamento.
Guia de preparação do local do instrumento MiSeq FGx
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No-break
No-break
Restrições ambientais
Elemento
Especificação
Temperatura
Transporte e armazenamento: -10°C a 40°C (14°F a 104°F)
Condições operacionais: 19℃ a 25℃ (66°F a 77°F)
Umidade
Transporte e armazenamento: Umidade sem condensação
Condições operacionais: 30-75% de umidade relativa (sem
condensação)
Elevação
Abaixo de 2.000 metros (6.500 pés)
Qualidade do ar
Ventilação
Ambiente com grau de poluição II ou melhor
Observação: um ambiente com grau de poluição II é definido
como aquele que normalmente inclui somente poluentes não
condutores.
Consulte o seu departamento de instalações para obter
requisitos de ventilação para o nível de saída de calor
esperado do instrumento.
Saída de calor
Potência medida
400 Watts
Saída térmica
1.364 Btu/h
Saída de ruído
O MiSeq FGx é um instrumento refrigerado a ar. O ruído do ventilador é claramente
audível quando o instrumento está funcionando.
Saída de ruído (dB)
< 62 dB
Distância do instrumento
1 metro (3,3 pés)
Uma medição de < 62 dB é o nível de uma conversa normal a uma distância de
aproximadamente 1 metro (3,3 pés).
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Nº da peça 15050525 Rev. A PTB
Uma conexão de rede é exigida devido à quantidade de dados gerados pelo MiSeq FGx.
Essa conexão de rede pode ocorrer por meio de uma LAN do cliente ou de um roteador
fornecido pela Illumina.
} Um cabo de rede CAT6 blindado com 3 metros (9,8 pés) de comprimento é fornecido
com o instrumento.
Os clientes acessam uma interface da web no servidor para se comunicar com o MiSeq
FGx Forensic Genomics System. Se o servidor não estiver listado no DNS (Sistema de
Nomes de Domínio), certifique-se de que você tenha um endereço IP de servidor estático
ou uma concessão estática em um endereço de DHCP (Protocolo de Configuração
Dinâmica de Host) no momento da instalação.
Para usar os seguintes recursos, é necessário ter conexões de rede:
} Acessar arquivos de manifesto, planilhas de amostra e referências localizados em
um servidor de rede a partir da interface do MFCS.
} Mover facilmente dados de execução e análises anteriores para um local do servidor
para armazenamento e para gerenciar o espaço em disco no computador do MiSeq
FGx integrado.
} Monitorar e gerenciar a análise secundária utilizando o ForenSeq Universal Analysis
Software.
OBSERVAÇÃO
Após a conexão com uma rede, configure o Windows Update de modo que o
MiSeq FGx não seja atualizado automaticamente. Se as atualizações
automáticas permanecerem ativadas, talvez o MiSeq FGx reinicialize durante
uma execução. Se uma reinicialização ocorrer, inicie a execução desde o
princípio.
Use as seguintes recomendações para instalar e configurar uma conexão de rede:
} Use uma conexão de 1 gigabit entre o instrumento e seu sistema de gerenciamento
de dados. Essa conexão pode ser feita diretamente ou por meio de um switch de
rede.
} Após a conexão com uma rede, configure o Windows Update de modo que o
Instrumento não atualize automaticamente. A Illumina recomenda aguardar um mês
após um lançamento do Windows antes de permitir uma atualização.
Suporte de rede
A Illumina não fornece suporte para instalação ou suporte técnico para inclusão do
instrumento na rede.
Revise as atividades de manutenção de rede em busca de possíveis riscos de
compatibilidade com o sistema do Illumina, incluindo os seguintes riscos:
} Remoção dos GPOs (Objetos de Política de Grupo): os GPOs podem afetar o
sistema operacional (SO) dos recursos conectados da Illumina. Mudanças no SO
podem interromper o software proprietário nos sistemas da Illumina.
Os instrumentos da Illumina foram testados e tiveram sua operação correta
confirmada. Após a conexão com GPOs do domínio, algumas configurações podem
afetar o software do instrumento. Se o software do instrumento operar de forma
incorreta, consulte o administrador de TI de sua instalação sobre uma possível
interferência de GPO.
Guia de preparação do local do instrumento MiSeq FGx
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Considerações sobre rede
Considerações sobre rede
} Ativação do firewall do Windows e do Windows Defender: esses produtos do
Windows podem afetar os recursos do SO acessados pelo software da Illumina.
A Illumina recomenda a instalação de um software antivírus para proteger o
computador de controle do instrumento contra vírus. Para obter mais informações,
consulte Software antivírus na página 13.
} Mudanças nos privilégios de usuários pré-configurados: a Illumina recomenda a
manutenção de privilégios pré-existentes para usuários pré-configurados. No
entanto, os usuários pré-configurados podem ficar indisponíveis.
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Nº da peça 15050525 Rev. A PTB
O Illumina recomenda a compra e instalação de um software antivírus de sua
preferência a fim de proteger o computador de controle de instrumento contra vírus.
A Illumina testou o Symantec no Windows 7 com as configurações a seguir.
Para evitar perda de dados ou interferência na operação do instrumento, configure o
software antivírus da seguinte forma:
} Configure para verificações manuais. Não permita verificações manuais.
} Execute verificações manuais apenas quando o instrumento não estiver em uso.
} Configure as atualizações para que sejam baixadas sem a autorização do usuário,
mas não instaladas.
} Não reinicialize automaticamente o computador após a atualização.
} Exclua o diretório do aplicativo e as unidades de dados de qualquer proteção de
sistema de arquivos em tempo real, especificamente C:\Illumina, e as unidades D:\
e E:\
Guia de preparação do local do instrumento MiSeq FGx
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Software antivírus
Software antivírus
Materiais de consumo e equipamentos fornecidos
pelo usuário
Os materiais de consumo e equipamentos a seguir são necessários para a realização de
execuções de sequenciamento no MiSeq FGx. Para obter mais informações, consulte o
Guia de referência do instrumento MiSeq FGx (nº da peça 15050524_PTB).
Materiais de consumo fornecidos pelo usuário
Os materiais de consumo fornecidos pelo usuário a seguir devem estar disponíveis antes
do início de uma execução.
Material de consumo
Compressa com álcool,
70% isopropílico
ou
70% etílico
Luvas descartáveis, sem pó
Lenço de papel de
laboratório, poucos fiapos
Fornecedor
VWR, nº do catálogo
95041-714*
Fornecedor de itens de uso
comum do laboratório
Fornecedor de itens de uso
comum do laboratório
VWR, nº do catálogo
21905-026*
Lenço de papel para lentes,
4 x 6 pol.
Tubos de microcentrífuga
VWR, nº do catálogo
52846-001*
Fornecedor de itens de uso
comum do laboratório
Hipoclorito de sódio
Fornecedor de itens de uso
comum do laboratório
Sigma-Aldrich, nº do
catálogo P7949
McMaster-Carr, nº do
catálogo 7003A22*
Tween 20
Pinças, plásticas com ponta
quadrada (opcional)
Água, sem nuclease
Fornecedor de itens de uso
comum do laboratório
Finalidade
Limpeza do suporte da
lâmina de fluxo
Uso geral
Limpeza da plataforma da
lâmina de fluxo e a vedação
que cobre o reservatório de
amostras de carregamento
Limpeza da lâmina de fluxo
Desnaturação e diluição de
bibliotecas de amostras e
DNA de controle de PhiX
Limpeza do instrumento
Limpeza do instrumento
Remoção da lâmina de
fluxo do recipiente de
transporte da lâmina de
fluxo
Limpeza do instrumento
* ou equivalente
Orientações para água sem nuclease
Utilize sempre água sem nuclease para realizar os procedimentos com instrumentos.
Nunca use água da torneira ou água desionizada. Qualquer um dos exemplos a seguir
são aceitáveis:
} Illumina PW1
} Água de 18 Megohm (MΩ)
} Água Milli-Q
} Água Super-Q
} Água de qualidade de biologia molecular
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Nº da peça 15050525 Rev. A PTB
Materiais de consumo e equipamentos fornecidos pelo usuário
Equipamentos fornecidos pelo usuário
} Congelador, -25°C a -15°C, frost-free
} Balde de gelo
} Refrigerador, 2°C a 8°C
Guia de preparação do local do instrumento MiSeq FGx
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Observações
Para obter assistência técnica, entre em contato com o suporte ao cliente da Illumina.
Tabela 1 Informações de contato gerais da Illumina
Endereço
Site
E-mail
5200 Illumina Way
San Diego, CA 92122 EUA
www.illumina.com
[email protected]
Tabela 2 Números de telefone do suporte ao cliente da Illumina
Região
Número de contato
Região
América do Norte
1.800.809.4566
Holanda
Alemanha
0800.180.8994
Irlanda
Áustria
0800.296575
Itália
Bélgica
0800.81102
Noruega
Dinamarca
80882346
Reino Unido
Espanha
900.812168
Suécia
Finlândia
0800.918363
Suíça
França
0800.911850
Outros países
Número de contato
0800.0223859
1.800.812949
800.874909
800.16836
0800.917.0041
020790181
0800.563118
+44.1799.534000
Ficha de dados de segurança
As fichas de dados de segurança (SDSs) estão disponíveis no site da Illumina, no link
support.illumina.com/sds.html.
Documentação do produto
No site da Illumina, há documentação do produto em PDF disponível para download.
Acesse support.illumina.com, selecione um produto e clique em Documentation &
Literature (Documentação e literatura).
Guia de preparação do local do instrumento MiSeq FGx
Assistência técnica
Assistência técnica
Illumina
San Diego, Califórnia 92122 EUA
+1.800.809.ILMN (4566)
+1.858.202.4566 (fora da América do Norte)
[email protected]
www.illumina.com