16/03/2015 Mapa genético, genômico ou cromossômico é a representação da posição e a ordem dos genes no cromossomo. Michelle Lopes Ribeiro Guimarães Mapa físico engloba diversos tipos de mapas, com maior ou menor resulução, mas que informam sempre a distância em bp entre genes e/ou marcadores moleculare. Disciplina: Biotecnologia Animal [email protected] [email protected] Está diretamente relacionada a taxa de crossing. Unidades de Recombinação (U.R.) ou Morganídeos (M) são as unidades usadas para determinar a posição dos genes no cromossomo e correspondem a taxa de crossing. Exemplo: Em um cromossomo há a seguinte freqüência de recombinação entre os genes A,B,C e D: A-B 45% A-C 20% C-B 25% B-D 5% C-D 20% A-D 40% 20M A 20M C 5M D B 40M 45M Qual a posição dos genes no cromossomo? 1 16/03/2015 Qual a posição dos genes no cromossomo? 2 16/03/2015 NÚMERO DE GENES EM BACTÉRIAS O tamanho do genoma é proporcional ao número de genes? Parasitas intracelulares obrigatórios: genoma de até 1,5 Mb Redução do nº de genes (metabolismo e regulação da expressão) Mycoplasma genitalium - ~ 470 genes ~ 60% dos genes podem ser identificados por homologia com genes conhecidos de outras espécies Genes relacionados com metabolismo, estrutura celular, transporte e regulação da expressão gênica ~ 25% dos genes não se conhece função 3 16/03/2015 Em eucariotos parece não existir uma relação entre o tamanho do genoma e o nº de genes dos organismos. ~ 60% dos genes podem ser identificados por homologia com genes conhecidos de outras espécies Genes relacionados com metabolismo, estrutura celular, transporte e regulação da expressão gênica ~ 25% dos genes não se conhece função Oryza sativa X Arabidopsis taliana Genoma 4x maior, porém apenas 50% mais genes 42-45% do genoma constituído por DNA repetitivo 80% dos genes de A. taliana estão presentes em Oryza sativa Destes, 8000 são encontrados apenas em plantas 4 16/03/2015 sexo masculino indivíduos que apresentam o caráter estudado Gene fragmento de DNA que pode ser transcrito na síntese de proteínas. filhos ou descendentes Locus local, no cromossomo, onde se encontra o gene. sexo feminino sexo desconhecido casamento ou cruzamento casamento ou cruzamento consangüíneo gêmeos dizigóticos gêmeos monozigóticos Alelos genes que ocupam o mesmo locus em cromossomos homólogos. Homólogos cromossomos que possuem mesmas características. genes para as Gene Genótipo: conjunto de genes de um indivíduo. Fenótipo: características observáveis de uma espécie, que são determinadas por genes e que podem ser alteradas pelo ambiente. Fenocópia: fenótipo modificado semelhante a um existente. Gene Letal: com efeito mortal. Dominante: aquele que sempre que está presente se manifesta. Gene Recessivo: aquele que só se manifesta na ausência do dominante. Homozigoto ou Puro: indivíduo que apresenta alelos iguais para um ou mais caracteres. Heterozigoto ou Híbrido: indivíduo que apresenta alelos diferentes para um ou mais caracteres. 5 16/03/2015 Genes Codominantes: os dois genes do par manifestam seu caráter. Polialelia: mais de dois alelos para um mesmo caráter. Pleiotropia: um par de genes determina vários caracteres. Polimeria: vários pares de genes determinam um só caráter. Epistasia: interação em que genes inibem a ação de outros não alelos. 6 16/03/2015 Gregor Mendel (1822-1884), monge austríaco, é considerado o “pai da genética”. Desenvolveu seus trabalhos com plantas de ervilha (Pisun sativum) tentando explicar o mecanismo de herança das características dos organismos. Em 1865 publicou o artigo "Experiments with Plant Hybrids" que foi ignorado. A partir de 1900 vários pesquisadores confirmaram seus resultados. Suas duas leis ainda hoje são base para os estudos genéticos. Por que ervilhas? Fácil cultivo em canteiros. características contrastantes e de fácil observação. Ciclo vital curto e grande número de descendentes (sementes). Predomina reprodução por autofecundação, portanto linhagens naturais são puras. Várias Mendel deduziu: esses híbridos tinham um fator genético latente para nanismo, mascarado pela expressão de outro fator para a altura elevada. Ele afirmou que o fator latente era recessivo e que o fator expresso era dominante. Também inferiu que esses fatores recessivo e dominante separaram-se quando as plantas híbridas se reproduziram. Isso tornou possível que explicasse o reaparecimento da característica anã na geração seguinte. 7 16/03/2015 “As características dos indivíduos são condicionadas por pares de fatores (genes), que se separam durante a formação dos gametas, indo apenas um fator do par para cada gameta”. Princípios: • Dominância • Segregação independente Herança condicionada por um par de alelos. Dois fenótipos possíveis em F2. Três genótipos possíveis em F2. Proporção fenotípica 3:1 Proporção genotípica 1:2:1 Ex.: cor das sementes em ervilhas. P amarelas x verdes VV F1 vv 100% amarelas Vv F1 amarelas x amarelas Vv F2 Vv 75% amarelas VV Vv 25% verdes vv 8 16/03/2015 Herança condicionada por um par de alelos. Três fenótipos possíveis em F2. Três genótipos possíveis em F2. Proporção fenotípica Ex.: cor das flores em Maravilha. P vermelhas x brancas VV BB F1 F1 rosas x rosas VB VB 1:2:1 F2 25% vermelhas VV VB 50% rosas 25% brancas BB Herança determinada por dois pares de alelos independentes que condicionam duas características. Quatro fenótipos diferentes são encontrados combinando os caracteres dominantes e recessivos. A proporção fenotípica clássica em F2 é 9:3:3:1. em F2 , Ex.: cruzamento de sementes de ervilhas amarelas/lisas (puras) com verdes/rugosas (puras). VVRR vvrr P amarelas/lisas x verdes/rugosas F1 100% amarelas/lisas (híbridas) F1 amarelas/lisas x amarelas/lisas VvRr VvRr “Na herança de duas ou mais características, os fatores, segregados na formação dos gametas, não se fundem no híbrido, mas se distribuem independentemente nos gametas segundo todas as combinações possíveis”. 100% rosas VB 1:2:1 Proporção genotípica VvRr Gametas da F1 VR Vr vR vr VR VVRR VVRr VvRR VvRr Vr VVRr VVrr VvRr Vvrr vR VvRR VvRr vvRR vvRr vr VvRr Vvrr vvRr vvrr Proporção Fenotípica em F2 9 16 amarelas/lisas 3 amarelas/rugosas 16 3 verdes/lisas 16 1 verdes/rugosas 16 9 16/03/2015 Quando são analisados mais de dois pares de alelos que condicionam mais de duas características, temos o triibridismo, tetraibridismo, etc, que constituem o poliibridismo. Para se calcular o número de gametas diferentes produzidos por um poliíbrido se utiliza a fórmula 2n, onde n é o número de pares de genes heterozigotos (híbridos). Ex.: Quantos gametas diferentes forma o genótipo AaBBCcddEe Número de híbridos: 3 Número de gametas = 23 = 8 gametas diferentes 10 16/03/2015 Autossômica recessiva Autossômica dominante Ligada ao X recessiva Ligada ao X dominante Ligada ao Y (holândrica) A espécie humana apresenta 23 pares de cromossomos. 22 pares são autossomos e não tem relação direta com a determinação do sexo. Um par, chamado de alossomos (X e Y), são os cromossomos sexuais. A mulher apresenta dois alossomos X e é chamada de sexo homogamético, pois seus gametas sempre terão o cromossomo X. O homem apresenta um X e um Y e é o sexo heterogamético, pois seus gametas serão metade com cromossomo X e metade com cromossomo Y. Na mulher, um dos cromossomos X em cada célula permanece inativo e se constitui na cromatina sexual ou corpúsculo de Barr. Genes localizados na porção não homóloga do cromossomo X. Quando dominantes, o caráter é transmitido pelas mães a todos os descendentes e pelos pais somente às filhas. Quando recessivos, o caráter é transmitido pelas mães aos filhos homens. As meninas só terão a característica se o pai também a tiver. Ex.: Daltonismo e Hemofilia. 11 16/03/2015 Anomalia visual recessiva em que o indivíduo tem deficiência na distinção das cores vermelha ou verde. Os homens daltônicos (8%) tem um gene Xd pois são hemizigotos e as mulheres daltônicas (0,64%) devem ser homozigotas recessivas. Anomalia que provoca a falta de coagulação do sangue. Homens hemofílicos são hemizigotos (1/10.000) e mulheres hemofílicas são homozigotas recessivas (1/100.000.000). Fenótipos Genótipos Mulher normal XHXH Mulher portadora XHXh Mulher daltônica XdXd Mulher hemofílica X hX h Homem normal XDY Homem normal XHY Homem daltônico XdY Homem hemofílico X hY Fenótipo Genótipo Mulher normal XDXD Mulher portadora XDXd Herança Restrita ao Sexo Genes localizados na porção não homóloga do cromossomo Y. Genes Holândricos. Só ocorrem no sexo masculino. Ex.: Hipertricose auricular. Herança Limitada pelo Sexo Genes autossômicos cujo efeito sofre influência dos hormônios sexuais. Só se manifestam em um dos sexos. Ex.: Produção de leite em bovinos. Genes autossômicos cujo efeito sofre influência dos hormônios sexuais. Comportamento diferente em cada sexo, agindo como dominante em um e como recessivo em outro (variação de dominância). Ex.: Calvície (alopecia). Genótipos Fenótipos CC Homem calvo Mulher calva Cc Homem calvo Mulher não-calva cc Homem não-calvo Mulher não-calva 12 16/03/2015 Determinado por proteínas presentes no plasma ou nas hemácias. Conhecimento importante nas transfusões, medicina legal, estudos étnicos, etc. Transfusões baseadas nas relações antígeno/anticorpo. A herança obedece os padrões mendelianos: Sistema ABO Polialelia e codominância. Sistema Rh Monoibridismo com dominância. Sistema MN Monoibridismo sem dominância. Grupo Sangüíneo Aglutinogênio nas hemácias A A B B AB AeB O - A Doações O Aglutinina no plasma Anti-B Anti-A Anti-A e Anti-B B AB Os grupos do sistema ABO são determinados por uma série de 3 alelos, IA, IB e i onde: IA = IB > i IA Gene determina a produção do aglutinogênio A. Gene IB determina a produção do aglutinogênio B. Gene i determina a não produção de aglutinogênios. Fenótipos Grupo A Grupo B Grupo AB Grupo O Genótipos IAIA ou IAi IBIB ou IBi IAIB ii Fator Rh Proteína encontrada nas hemácias que pode agir como antígeno se for inserida em indivíduos que não a possuam. Rh+ indivíduos que possuem a proteína. Rh- indivíduos que não possuem a proteína. Doações Rh- Rh+ Fenótipos Genótipos Rh+ RR ou Rr Rh- rr 13 16/03/2015 Condições: Mãe: Rh-; Pai: Rh+; Criança: Rh+ Proteínas presentes nas hemácias que não são levadas em conta nas transfusões sangüíneas. Geneticamente é um caso de codominância. Grupo M: produz a proteína M. Grupo N: produz a proteína N. Grupo MN: produz as duas proteínas. Fenótipos M N MN Heranças determinadas por genes localizados nos cromossomos sexuais (alossomos) ou por genes autossômicos mas cujo efeito sofre influência dos hormônios sexuais. As principais são: Herança ligada ao sexo: genes localizados na porção não homóloga do cromossomo X. Herança restrita ao sexo: localizada na porção não homóloga do cromossomo Y. Herança influenciada pelo sexo: genes localizados em cromossomos autossomos que sofrem influência dos hormônios sexuais. Genótipos LMLM LNLN LMLN Doações M N MN Heranças que se afastam, pouco ou muito, dos processos descritos por Mendel em seus trabalhos. As proporções fenotípicas podem variar em relação às proporções clássicas da genética mendeliana. Herança Qualitativa: O fenótipo depende de quais genes estão presentes no genótipo. Ex.: interações gênicas (genes complementares e epistasia) e pleiotropia. Herança Quantitativa: O fenótipo depende de quantos genes dominantes estão presentes no genótipo. Ex.: polimeria. 14 16/03/2015 Herança Quantitativa onde ocorre efeito cumulativo na ação de vários pares de genes. Há uma variação fenotípica gradual e contínua entre um valor mínimo e um valor máximo, devida a adição de genes dominantes no genótipo, seguindo uma curva normal de distribuição. Fenótipos Genótipos Negro SSTT Mulato Escuro SsTT SSTt Mulato Médio SsTt SStt ssTT Ex.: altura, peso, cor da pele, cor dos olhos, grau de inteligência, altura de plantas, produção de leite em bovinos, comprimento de pelos, etc. Para se saber o número de fenótipos ou quantos pares de genes estão envolvidos são utilizados modelos matemáticos. número de poligenes = número de fenótipos - 1 número de fenótipos = número de poligenes + 1 Provocam a morte ou não desenvolvimento do embrião. Determinam um desvio nas proporções fenotípicas esperadas, geralmente 2:1. Aa AA Aa Aa Aa Mulato Claro Sstt ssTt Branco sstt 3 2 Negro 2 Mulato Escuro Mulato Médio Mulato Claro 1 1 Branco Herança determinada por 3 ou mais alelos que condicionam um só caráter, obedecendo os padrões mendelianos. Cada indivíduo tem, no genótipo, apenas dois alelos, um de origem paterna e outro de origem materna. Novos alelos surgem por mutações que provocam alterações na proteína original. aa 15 16/03/2015 Ex.: Cor da pelagem em coelhos. 4 alelos C selvagem (aguti). cch chinchila. ch himalaia. ca albino. cch _ c ac a C_ C > cch > ch > ca ch _ Epistasia Interação em que um par de genes inibe que outro par, não alelo, manifeste seu caráter. A epistasia pode ser dominante ou recessiva. O gene inibidor é chamado de epistático e o inibido é o hipostático. Ex.: Cor da penas em galináceos. Gene C penas coloridas. Gene c penas brancas. Gene I epistático sobre gene C. Fenótipos Genótipos Penas coloridas C_ii Penas cc_ _ brancas C_I_ Genes complementares Genes com segregação independente que agem em conjunto para determinar um fenótipo. Ex.: forma das cristas em galináceos. Fenótipos Genótipos crista noz R_E_ crista rosa R_ee crista ervilha rrE_ crista simples rree Herança em que um único par de genes condiciona várias características simultaneamente. Efeito múltiplo de um gene. Exemplos: Síndrome de Lawrence-Moon: obesidade, oligofrenia, polidactilia e hipogonadismo. Síndrome de Marfan: defeitos cardíacos, problemas visuais, aracnodactilia. Fenilcetonúria: deficiência mental, convulsões, icterícia, queda de cabelo, urina muito concentrada. 16 16/03/2015 Quando dois ou mais genes, responsáveis por diferentes características, estão localizados em um mesmo cromossomo, a herança é chamada de Vinculação Gênica. Diibridismo (AaBb) A Nestes casos a quantidade de gametas e portanto a freqüência da descendência apresentarão diferenças em relação ao diibridismo já que a incidência do crossing-over será fundamental. A B 25% Linkage (AaBb) a B b Gametas A a B b Parentais B b Gametas Crossing-Over ou permuta é a troca de partes entre cromossomos homólogos durante a meiose e é um dos principais fatores para a variabilidade genética. A a A a b B A b 25% a B 25% a b 25% Na herança dos genes ligados, a freqüência dos gametas de um heterozigoto depende da taxa de crossing-over ou taxa de recombinação que ocorre entre os cromossomos homólogos. Os Gametas Parentais são formados mesmo que não haja recombinação e aparecem em maior quantidade. Os Gametas Recombinantes são formados apenas se houver permuta e aparecem em menor quantidade. A Taxa de Crossing é expressa em porcentagem e corresponde a freqüência de gametas recombinantes formados na gametogênese. Recombinantes 17 16/03/2015 Na vinculação gênica a posição dos genes no heterozigoto (AaBb) pode ser Cis ou Trans. Estas posições também podem ser utilizadas para se definir quem são os gametas parentais e os recombinantes. A B A b a b a B Posição CIS Posição TRANS 18