MÓDULO 4
Como
usar
PubMed
PubMed e o sistema Entrez - Instruções
PubMed, opções de mostrar na tela (display),
salvar, imprimir e enviar por email os resultados
de uma pesquisa.
Esta parte do curso é uma demonstração em
PowerPoint e um tour guiado sobre como
pesquisar no PubMed.
Esta parte é off-line e é para ser usada como
material de referência.
Bem-vindos à página eletrônica do PubMed
Esta parte do módulo mostrará a interface
de pesquisa, as opções de mostrar na tela
(display) as referências, as opções de
acesso às referências e como enviar por
email dos resultados.
Barra de bases de dados NCBI
A barra preta acima da caixa de pesquisa
contem links para outras bases de dados
NCBI. As bases de dados destacadas
acima são: PROTEIN, OMIM e revistas do
PubMed. Para mudar entre as bases de
dados clique no nome da base de dados.
NCBI – base de dados OMIM
Aqui esta a base de dados OMIM.
Para voltar ao PubMed clique no link que
está na barra de base de dados.
Menu do lado esquerdo do
PubMed
Do lado esquerdo da página
eletrônica do PubMed há links
para outros recursos do PubMed,
como por exemplo, uma visão geral
do PubMed (overview) ajuda e
perguntas mais frequentes (help &
FAQ), um Tutorial e notícias.
Abaixo, do lado esquerdo da
página do PubMed estão também
links para outras facilidades do
PubMed como a base de dados de
revistas, a base de dados MeSH
(Medical Subject Headings),
pesquisas clínicas, LinkOut e
funções de citações.
Caixa de pesquisa do PubMed
A caixa de pesquisa no PubMed está
ativada. Digite neste espaço o assunto de
sua busca.
Pesquisa simples no PubMed
Neste exemplo nós entramos com a busca
“malaria infections in Africa” na caixa de
pesquisa. Para processar a busca clique no
botão “Go”.
Resultados – display padrão
Os resultados da busca são listados no
corpo da página.
O link Details (detalhes)
Para ver como o PubMed processou a
busca, pode-se clicar no link “Details”
(detalhes) destacado abaixo da caixa de
pesquisa.
Página do Details (detalhes)
PubMed usa um mapeamento automático
de termos. O details (detalhes) mostra
como o software do PubMed divide em
partes o assunto da busca. Neste exemplo
o PubMed buscou por Malaria como uma
palavra do texto (text word) e como um
termo MeSH devido a identificação
automática de termos. Africa e Infections
são também buscadas como palavras do
texto e como termos MeSH (descritores de
assunto).
Resultados – opções de
apresentação (display)
Destacados abaixo da caixa de pesquisa
estão as opções de mostrar na tela os
resultados encontrados - display. Os
registros são apresentados em formato
resumido, de 20 em 20 de um total de
1599, mostrados e ordenados pelo número
de identificação do registro no PubMed –
PubMed ID number.
Há diferentes formatos
disponíveis para mostrar na tela
os resultados da busca. A partir
da lista de opções da função
display pode-se ver os possíveis
formatos de escolha.
Formato de apresentação (display)
No PubMed pode-se selecionar
tanto o formato Summary
(resumido), Brief (curto), Abstract
(resumo), Citation (citação), como
o formato Medline. Os demais
formatos são para outras bases
de dados do NCBI.
Normalmente, usa-se como
padrão, o formato Summary .
Para mudar o formato, clique no
botão “Display” e selecione o
formato desejado.
Formato Resumido – Summary
O formato resumido (Summary) mostra os
nomes dos autores, o título do artigo, a
fonte de publicação da citação mostrada e
o número de identificação do registro no
PubMed - PubMed ID number.
Formato curto (brief) 1
A partir das opções da função Display
pode-se selecionar o formato curto para
apresentação dos registros - “Brief”.
Formato curto (Brief) 2
O formato curto (brief) mostra o nome do
primeiro autor, parte do título do artigo e o
número de identificação do registro no
PubMed - ID number.
Formato Resumo (abstract) 1
O formato “Abstract” está destacado
dentre as opções de display.
Formato resumo (Abstract) – links
para o texto completo
A opção do formato resumo (abstract) traz links
para os sites das editoras que podem ter o texto
completo do artigo disponível.
Neste exemplo nós temos o link para a editora
Elsevier Science e ao lado deste está o ícone do
HINARI, que identifica o direito de acesso ao texto
completo para as instituições que são registradas
no HINARI.
Formato Resumo (abstract) –
informação de afiliação
O formato resumo (abstract) também mostra
informação da afiliação. Esta informação é
referente ao primeiro autor listado no artigo, e NÃO
de todos os autores.
Formato Citação 1
A opção de formato “Citation” (citação) é
similar ao formato resumo (abstract), mas
mostra algumas informações adicionais,
como termos MeSH e nomes de
substâncias.
Formato Citação – Informação
MeSH
Aqui pode-se ver os termos
MeSH (descritores de assunto)
designados para este registro na
indexação feita pela National
Library of Medicine (NLM).
Formato MEDLINE 1
Aqui, selecionou-se a opção do
formato “MEDLINE”.
Campos identificadores do
MEDLINE
O formato “MEDLINE” mostra
todos os campos de um
registro MEDLINE com o
identificador do campo em
cada linha.
Este formato é o melhor para
ser usado na exportação de
registros para um software de
gerenciamento de referências.
Número de registros listados
Há algumas opções de quantidade
de referências a serem mostradas
por página, ( de 5 a 500
referências).
É aconselhável listar o máximo de
referências possíveis por página
para economizar tempo na mostra
dos resultados, eliminando a
necessidade de passar por
inúmeras páginas.
Aqui o exemplo é a opção “200”
selecionada na caixa. Para re-listar
os resultados de registros por
página, clique no botão “Display”.
Páginas de Resultados
A página de resultados está agora listando os
registros de 1 a 200 dos 1599 registros
encontrados na busca. Agora tem-se somente 8
páginas de resultados para ver.
Opções de ordenamento (Sort)
A ordem padrão pré-determinada (default) de
apresentação dos resultados é pelo número de
identificação PubMed – que é o PubMed ID. Os
resultados podem ser ordenados alfabeticamente
por autor ou por título da revista, ou ainda pela
data de publicação. Neste exemplo usou-se a
opção “Journal” (revista). Para re-listar os
registros considerando o ordenamento por revista,
clique no botão da função “Display”.
Ordenando pelo título da revista
Pode-se ver os resultados de 1-200 mostrados em
ordem alfabética pelo título da revista.
Selecionando referências 1
Para selecionar referências a partir dos
resultados, marca-se o quadrado que aparece ao
lado esquerdo dos registros.
Selecionando referências 2
Os resultados de 1 a 4 desta página
foram marcados e estão selecionados.
Envio em formato de Texto 1
Os resultados selecionados podem agora ser
formatados para impressão selecionando a opção
“text” a partir das opções da função “send to”
(enviar para).
Envio em formato de Texto 2
Esta é uma boa opção de formato
de impressão.
Envio para um arquivo 1
Para salvar os resultados selecionados em um
disquete ou em seu computador, selecione a
opção “file” a partir do menu da função “send to”
Envio para um arquivo 2
Selecione um endereço para salvar o arquivo e
altere o tipo do arquivo de fcgi document para all
files (todos os arquivos).
Envio para um arquivo 3
Escolha um nome para seu arquivo e acrescente
a extensão .txt (de texto). Para salvar o arquivo
clique no botão save
Enviando por Email 1
Para enviar os resultados selecionados por email
escolha a opção email a partir do menu da função
“send to”.
Enviando por Email 2
A partir desta tela pode-se escolher um
formato e a forma de ordenar os
resultados selecionados, e ainda
acrescentar um texto de observação
na mensagem que será enviada com
os resultados.
Enviando por Email 3
Digite um endereço de email na linha
oferecida à frente do item E-mail.
Enviando por Email 4
Para processar o envio do email
clique no botão “Mail”
Enviando por Email 5
Ao retornar à tela dos resultados, aparecerá uma
barra de mensagem informando que o email foi
enviado do servidor do PubMed para o endereço
de email de um usuário.
Enviando para área de trabalho 1
Os resultados selecionados também podem ser
enviados para uma área de trabalho. Selecione a
opção “Clipboard” a partir do menu da função
“Send to”.
Enviando para área de trabalho 2
Uma barra de informação aparecerá indicando o
número de itens enviados para a área de trabalho,
o limite de tempo que ficarão disponíveis até
serem apagados e o número máximo de itens
permitidos na área de trabalho.
Enviando para área de trabalho 3
Para recuperar os itens colocados na sua área de
trabalho clique na opção Clipboard que está
abaixo da caixa de pesquisa.
Enviando para área de trabalho 4
Dentro da área de trabalho pode-se reformatar e
listar os resultados da mesma forma e com as
mesmas opções oferecidas a partir da página
principal dos resultados.
Enviando para área de trabalho 5
Para remover um item da área de trabalho,
selecione o item a ser removido e escolha a opção
“Clip Remove” a partir do menu da função “Send to”.
Enviando para área de trabalho 6
Uma barra de informação aparecerá confirmando
quantos itens foram removidos da área de
trabalho.
Fim do Módulo 4 Parte 1
Este e o fim do Tarefa 1 Parte 1.
Há um caderno de exercícios para
acompanhar esta parte do módulo. O
caderno de exercícios é dinâmico e
abrange os tópicos incluídos nesta parte do
módulo com exemplos práticos.
Download

Slide 1 - Ganesha Associates