UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
FILIAL-ILO
Escuela Profesional De Ingeniería Ambiental
CURSO:
BIOTECNOLOGIA
INFORME DE LA PRACTICA N° 03
MONTAJE DE LA ESTRUCTURA DEL ADN EN PAPEL Y
VERIFICACION DE LA SECUENCIA GENETICA EN EL
BLASTn
PRESENTADO POR:
DEYSY MAGALI INCACUTIPA LAYME
DOCENTE:
Dr. HEBERT HERNAN SOTO GONZALES
15/09/2021
ILO-PERU
Contenido
I.
INTRODUCCIÓN ................................................................................................................. 3
II. OBJETIVOS .......................................................................................................................... 4
2.1 OBJETIVO GENERAL ..................................................................................................... 4
2.2 OBJETIVOS ESPECIFICOS ............................................................................................ 4
III.
MARCO TEORICO .......................................................................................................... 5
3.1 Ácido fosfórico...................................................................................................................... 5
3-2 Azúcar: ................................................................................................................................. 5
3-3 Bases nitrogenadas: ............................................................................................................. 5
3.4 Estructuras secundaria y terciaria de la molécula –Conformación tridimensional del
ADN ............................................................................................................................................ 6
3.5 Puentes de hidrógeno: emparejamiento entre las bases .................................................. 7
IV.
MATERIALES Y METODOLOGIA .............................................................................. 8
4.1. Materiales ............................................................................................................................ 8
4.2. Metodología ......................................................................................................................... 9
V . RESULTADOS...................................................................................................................... 11
VI . CONCLUSIONES ............................................................................................................... 12
VII . CUESTIONARIO .............................................................................................................. 13
VIII. BIBLIOGRAFIA ............................................................................................................... 15
I.
INTRODUCCIÓN
Los Ácidos Nucleicos son las biomoléculas portadoras de la información genética. Son
biopolímeros, de elevado peso molecular, formados por otras subunidades estructurales o
monómeros, denominados Nucleótidos.
El ADN es una de las moléculas más importantes para la vida. Consiste de una doble hélice donde cada una
de las cadenas es un polímero integrado por miles o incluso millones de nucleótidos.
Cada nucleótido, está formado por un azúcar (desoxirribosa), una base nitrogenada que puede ser adenina
(A), timina (T), citosina (C) o guanina (G) y un grupo fosfato. El orden que tienen los nucleótidos en el
ADN es lo que se denomina secuencia y las técnicas y métodos que se utilizan para conocer esa secuencia
son llamados de secuenciación (de Necochea y Canul 2004). Conocer el orden de los nucleótidos es una
herramienta con infinidad de aplicaciones porque la diferencia fundamental entre todas las moléculas de
ADN que forman el material genético de los seres vivos es la secuencia de estas cuatro bases nitrogenadas.
(Valdelamar, s.f.)
En la práctica que se desarrollara conoceremos la estructura del ADN y los componentes de la molécula
del ADN mediante la elaboración en papel y posteriormente identificar el organismo de dicha secuencia
en el banco genético NCBI.
II.
OBJETIVOS
2.1 OBJETIVO GENERAL
o Conocer la estructura del ADN aplicando los conocimientos básicos de bioquímica.
2.2 OBJETIVOS ESPECIFICOS
o Determinar los principales componentes de la molécula del ADN mediante la
elaboración en papel.
o Ubicar la secuencia obtenida del ADN, identificar el organismo al cual pertenece en el
banco genético NCBI en BlastN.
III.
MARCO TEORICO
Estructura primaria de la molécula: esqueleto covalente y bases laterales.
Un nucleósido está hecho de un azúcar + una base nitrogenada.
Un nucleótido está hecho de un grupo fosfato + un azúcar + una base nitrogenada. En el ADN, el
nucleotide es un desoxirribonucleótido (en el ARN, el nucleótido es un ribonucleótido).
3.1 Ácido fosfórico
Suministra un grupo fosfato
Figura 1. Grupo fosfato
3-2 Azúcar:
Desoxirribosa, que es una pentosa cíclica (azúcar de 5 carbonos). Nota: el azúcar en el ARN es una ribosa.
Los carbonos del azúcar se numeran de 1' a 5'. El a´tomo de nitrógeno de la base nitrogenada se une a C1'
(por un enlace glicosídico), y el grupo fosfato se une al C5' (enlace éster) para formar el nucleótido. El
nucleotide es, por lo tanto: fosfato - C5' azúcar C1' – base nitrogenada.
3-3 Bases nitrogenadas:
Son heterociclos aromáticos; hay purinas y pirimidinas.
- Purinas: adenina (A) y guanina (G).
- Pirimidinas: citosina (C) y timina (T) (Nota: la timina es reemplazadas
por uracilo (U) en el ARN).
Nota: pueden existir otras bases nitrogenadas, en particular bases metiladas
derivadas de las anteriores; este tipo de bases tienen un papel funcional. (Haematology, s.f.)
Figura 2. Bases Nitrogenadas
3.4 Estructuras secundaria y terciaria de la molécula –Conformación tridimensional
del ADN
3.4.1 Dinucleótidos
Los dinucleótidos se forman a través de un enlace fosfodiéster entre dos mononucléotidos. Este enlace se
forma entre el grupo fosfato de un mononucleótido (en C5' de su azúcar) y el C3' del azúcar del anterior
mononucleótido. Así, comenzando con un grupo fosfato, tenemos un azúcar en 5' (+ su base) y cuyo
extremo en 3', está unido a un segundo grupo fosfato en 5' de otro azúcar, cuyo extremo 3' está libre para
un siguiente enlace. La unión – y la orientación de la molécula es, por tanto 5' -> 3'.
Los polinucleótidos están formados por la sucesiva adición de monómeros en una configuración general
5' -> 3'. El esqueleto de la molécula está hecho por una sucesión de grupo fosfato-azúcar (n nucleótidos)
– fosfato - azúcar (nucleótido n+1), y así sucesivamente, unidos covalentemente, con las bases
nitrogenadas situadas lateralmente.
Figura 3. Dinucleotidos
3.5 Puentes de hidrógeno: emparejamiento entre las bases
Las bases nitrogenadas (hidrofóbicas) se encuentran apiladas en el interior de la doble hélice, en
planos perpendiculares a su eje. La parte exterior (grupos fosfato y azúcares) es hidrofílica.
Las bases de una de las cadenas o hebras están unidas mediante puentes de hidrógeno con las
bases nitrogenadas de la otra cadena o hebra, uniendo ambas cadenas.
De esta manera, una purina de una de las cadenas se encuentra enfrentada y unida a una
pirimidina en la otra cadena. Por ello, el número de purinas es igual al número de pirimidinas.
A se une a T (con dos puentes de hidrógeno).
G se une a C (con tres puentes de hidrógeno: enlace más estable: 5,5 kcal vs 3,5 kcal).
Nota: el contenido de A en el ADN es por lo tanto igual al contenido en T, y el contenido en G
es igual al contenido en C.
Esta correspondencia estricta (A<->T y G<->C) hace a las dos cadenas o hebras
complementarias. Una es el molde para la otra, y recíprocamente también: esta propiedad
permitirá una replicación exacta (replicación semi-conservativa: una cadena -la molde- se
conserva, mientras que la otra se sintetiza de nuevo por completo, y lo mismo ocurre con la otra
cadena complementaria, se conserva, que hace de molde también para la síntesis de otra nueva.
Figura 4. Puentes de hidrogeno
IV.
MATERIALES Y METODOLOGIA
4.1. Materiales
Tijeras
Plumones
Impresora
Papel
4.2. Metodología
Paso 1 primero debemos de imprimir el ADN, este archivo fue proporcionado con el docente a cargo
del curso.
Figura 5. Practica del ADN
Paso 2 debemos descargar el archivo y luego se tiene que imprimir. Así como se muestra en la imagen
Figura 6. Archivo impreso del ADN
Paso 3, procedemos a enlazar timina con adenina y citosina con guanina, así como se muestra en
la imagen.
Figura 7. Primera hoja de la secuencia
Paso4 después de haber enlazado las 2 hojas que se ha impreso, vamos a proceder a cortar la hoja dando
forma al ADN.
Figura 8. Formación de la estructura
Paso5 una vez cortado las 2 hojas de ADN, vamos a unirlos, para asi formar el ADN.
Figura 9. Hojas del ADN completamente unidos
V . RESULTADOS
Después haber cortado y enlazado en se le dio esta forma al ADN.
VI . CONCLUSIONES
En conclusión, el ADN contiene la información genética de la mayor parte de los organismos y
está compuesto por unas unidades llamadas nucleótidos, concretamente cuatro: Adenina (A),
Guanina (G), Citosina (C) y Timina (T). Estas 4 letras se alternan entre sí formando largas
secuencias de ADN como si de un collar de perlas se tratara.
o Se logro desarrollar la práctica con gran éxito se pudo hacer el montaje de la estructura del
ADN con mucha facilidad.
o Se pudo conocer la estructura del ADN en el Blast que es el Trachymyrmex septentrionalis.
VII . CUESTIONARIO
1. Anotar la secuencia obtenida por usted y verificar a que orgasnismo pertenece o si
no existe, utilizar el banco genético NCBI en BlastN para la investigación.
Esta es la secuencia utilizada TATACGATCGTATACGATGC , esto es un ácido nucleico, este
organismos puede pertenecer
a las siguientes organismos
celulares ; Eucariota ; Opisthokonta ; Metazoos ; Eumetazoa ; Bilateria ; Protostomía ; Ecdysozo
a ; Panarthropoda ; Arthropoda ; Mandibulata ; Pancrustácea ; Hexapoda ; Insecta ; Dicondylia ;
Pterygota ; Neoptera ; Endopterygota ; Himenópteros ; Apocrita ; Aculeata ; Formicoidea ;Formi
cidae ; Myrmicinae ; Attini ; Traquimirmex
2. Diferencias entre el ADN y ARN
comparación
ADN
ARN
nombre
ácido desoxirribonucleico
ácido ribonucleico
completo
Función
El ADN se replica y almacena información
El ARN convierte la información genética
genética. Es un plano de toda la información
contenida en el ADN a un formato que se
genética contenida en un organismo
utiliza para construir proteínas y luego la
traslada a las fábricas de proteínas
ribosómicas.
Estructura
El ADN consta de dos hebras, dispuestas en una
El ARN solo tiene una hebra, pero al igual
doble hélice. Estas hebras están formadas por
que el ADN, está formado por nucleótidos.
subunidades llamadas nucleótidos. Cada
Las hebras de ARN son más cortas que las
nucleótido contiene un fosfato, una molécula de
de ADN. El ARN a veces forma una
azúcar de 5 carbonos y una base nitrogenada.
estructura secundaria de doble hélice, pero
solo de forma intermitente.
Longitud
Azúcar
Bases
El ADN es un polímero mucho más largo que el
Las moléculas de ARN son de longitud
ARN. Un cromosoma, por ejemplo, es una
variable, pero mucho más cortas que los
molécula de ADN única y larga, que tendría
polímeros de ADN largos. Una molécula de
varios centímetros de longitud cuando se
ARN grande puede tener solo unos pocos
desenmarañara.
miles de pares de bases de largo.
El azúcar en el ADN es desoxirribosa, que
El ARN contiene moléculas de azúcar
contiene un grupo hidroxilo menos que la ribosa
ribosa, sin las modificaciones hidroxílicas
del ARN.
de la desoxirribosa.
Las bases en el ADN son adenina 'A', timina 'T',
El ARN comparte adenina 'A', guanina 'G' y
guanina 'G' y citosina 'C'.
citosina 'C' con el ADN, pero contiene
uracilo 'U' en lugar de timina.
Pares de bases
Ubicación
reactividad
Sensibilidad
Pareja de adenina y timina AT
Pareja de adenina y uracilo AU
Par de citosina y guanina CG
Par de citosina y guanina CG
El ADN se encuentra en el núcleo, con una
El ARN se forma en el nucleolo y luego se
pequeña cantidad de ADN también presente en
mueve a regiones especializadas del
las mitocondrias.
citoplasma según el tipo de ARN formado.
Debido a su azúcar desoxirribosa, que contiene
El ARN, que contiene un azúcar ribosa, es
un grupo hidroxilo que contiene menos oxígeno,
más reactivo que el ADN y no es estable en
el ADN es una molécula más estable que el
condiciones alcalinas. Las ranuras
ARN, que es útil para una molécula que tiene la
helicoidales más grandes del ARN
tarea de mantener segura la información
significan que es más fácil de atacar por las
genética.
enzimas.
El ADN es vulnerable al daño de la luz
El ARN es más resistente al daño de la luz
ultravioleta
ultravioleta.
ultravioleta que el ADN.
UV
3. Dibujar la estructura del ADN con todos sus enlaces.
VIII. BIBLIOGRAFIA
-
Valdelamar, L. M. (s.f.). Secuenciación de. Obtenido de
http://www2.inecc.gob.mx/publicaciones2/libros/710/secuenciacion.pdf
-
Haematology, A. o. (s.f.). Obtenido de
http://atlasgeneticsoncology.org/Educ/DNASpID30001SS.html
-
Valdelamar, L. M. (s.f.). Secuenciación de. Obtenido de
http://www2.inecc.gob.mx/publicaciones2/libros/710/secuenciacion.pdf
- Stansfield W.D. 1992. Genética. Mc Graw Hill. México. Vogel T.M. y R. Nalin. 2003.
Sequencing the metagenome. ASM News 69(3):107