Modelação Molecular Protocolo de TP Cálculo de orbitais moleculares Tarefas: 1. criar uma molécula de água e alinhá‐la segundo um eixo pré‐definido 2. calcular uma função de onda 3. representar graficamente potenciais electrostáticos 4. representar graficamente orbitais moleculares Tarefa 1: Construa uma molécula de água. Represente no monitor as cargas dos átomos da molécula. Alinhe a molécula da água: 1. Escolha Align molecules no menu Edit 2. Na caixa de diálogo escolha Secondary e Y axis. Tarefa 2: 1. Escolher Semi‐empirical no menu Setup 2. Escolher CNDO como método e depois Options 3. Escolher as opções RHF, carga total 0 e multiplicidade de spin 1 e estado Lowest 4. Escolher OK 5. Escolher Single point no menu Compute Tarefa 3: 1. Escolha Plot molecular graphs no menú Compute 2. Escolha uma propriedade molecular e um tipo de representação. 3. Escolha diferentes tipos de visualização escolhendo Isosurface no menu Display. 4. Experimente diferentes possibilidades de representação. Tarefa 4: 1. Escolha Orbitals no menu Compute 2. Escolha primeiro a opção HOMO, número 0 3. Assegure‐se que a opção Orbital squared não está seleccionada 4. Clique OK 5. Escolha as restantes orbitais moleculares. Repita o exercício escolhendo uma molécula maior à sua escolha.